MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74002	NC_015061	CGC	2	6	3640424	3640429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834057
74003	NC_015061	CTG	2	6	3640450	3640455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74004	NC_015061	GCT	2	6	3640500	3640505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74005	NC_015061	ATT	2	6	3640526	3640531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322834057
74006	NC_015061	TCG	2	6	3640533	3640538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74007	NC_015061	CGG	2	6	3640563	3640568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834057
74008	NC_015061	CTG	2	6	3640570	3640575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74009	NC_015061	CCA	2	6	3640590	3640595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834057
74010	NC_015061	TGA	2	6	3640604	3640609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834057
74011	NC_015061	GCGTG	2	10	3640689	3640698	0 %	20 %	60 %	20 %	322834057
74012	NC_015061	GTG	2	6	3640951	3640956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834057
74013	NC_015061	TGAAA	2	10	3640980	3640989	60 %	20 %	20 %	0 %	322834057
74014	NC_015061	TCG	2	6	3640991	3640996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74015	NC_015061	GCA	2	6	3641039	3641044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74016	NC_015061	GGC	2	6	3641116	3641121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834057
74017	NC_015061	GGC	2	6	3641125	3641130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834057
74018	NC_015061	GAC	2	6	3641173	3641178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834057
74019	NC_015061	CGC	2	6	3641190	3641195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834057
74020	NC_015061	TC	3	6	3641244	3641249	0 %	50 %	0 %	50 %	322834057
74021	NC_015061	T	6	6	3641347	3641352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74022	NC_015061	TTGATT	2	12	3641359	3641370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74023	NC_015061	ATG	2	6	3641372	3641377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74024	NC_015061	GCTT	2	8	3641379	3641386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74025	NC_015061	T	6	6	3641485	3641490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74026	NC_015061	TCA	2	6	3641528	3641533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74027	NC_015061	GTC	2	6	3641541	3641546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74028	NC_015061	TTG	2	6	3641664	3641669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834058
74029	NC_015061	CAGC	2	8	3641728	3641735	25 %	0 %	25 %	50 %	322834058
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74031	NC_015061	GCA	2	6	3641883	3641888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834058
74032	NC_015061	CTG	3	9	3641895	3641903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834058
74033	NC_015061	TTC	2	6	3642032	3642037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834058
74034	NC_015061	GGC	2	6	3642099	3642104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834058
74035	NC_015061	CG	3	6	3642154	3642159	0 %	0 %	50 %	50 %	322834058
74036	NC_015061	CAG	2	6	3642179	3642184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834058
74037	NC_015061	TGGT	2	8	3642198	3642205	0 %	50 %	50 %	0 %	322834058
74038	NC_015061	CTG	2	6	3642263	3642268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834058
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74042	NC_015061	CTT	2	6	3642518	3642523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834058
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74045	NC_015061	TTA	2	6	3642679	3642684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74046	NC_015061	GTA	2	6	3642716	3642721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74047	NC_015061	ATC	2	6	3642806	3642811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834059
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74050	NC_015061	T	7	7	3643089	3643095	0 %	100 %	0 %	0 %	322834059
74051	NC_015061	ATA	2	6	3643269	3643274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74052	NC_015061	TAA	2	6	3643382	3643387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834060
74053	NC_015061	CAG	2	6	3643398	3643403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834060
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74056	NC_015061	CTA	2	6	3643623	3643628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834061
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74058	NC_015061	CTG	2	6	3643745	3643750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834061
74059	NC_015061	TGA	2	6	3643771	3643776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834061
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74061	NC_015061	CG	3	6	3643893	3643898	0 %	0 %	50 %	50 %	322834061
74062	NC_015061	GCG	2	6	3643901	3643906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834061
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74069	NC_015061	GCGG	2	8	3644414	3644421	0 %	0 %	75 %	25 %	322834062
74070	NC_015061	GCT	2	6	3644473	3644478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834062
74071	NC_015061	CG	3	6	3644479	3644484	0 %	0 %	50 %	50 %	322834062
74072	NC_015061	GCGT	2	8	3644485	3644492	0 %	25 %	50 %	25 %	322834062
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74078	NC_015061	TCT	2	6	3644789	3644794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834062
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74082	NC_015061	GTT	2	6	3645033	3645038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834063
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74104	NC_015061	TGCC	2	8	3646148	3646155	0 %	25 %	25 %	50 %	322834063
74105	NC_015061	TCA	2	6	3646159	3646164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834063
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74112	NC_015061	A	6	6	3646483	3646488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74114	NC_015061	TAT	2	6	3646525	3646530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74115	NC_015061	AAT	2	6	3646572	3646577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74117	NC_015061	GCA	2	6	3646631	3646636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74118	NC_015061	GCC	2	6	3646684	3646689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74119	NC_015061	ATC	2	6	3646701	3646706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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74214	NC_015061	CA	3	6	3652596	3652601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74215	NC_015061	GCTCA	2	10	3652836	3652845	20 %	20 %	20 %	40 %	322834070
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74222	NC_015061	TGT	2	6	3653461	3653466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834071
74223	NC_015061	CTGAC	2	10	3653472	3653481	20 %	20 %	20 %	40 %	322834071
74224	NC_015061	AG	3	6	3653510	3653515	50 %	0 %	50 %	0 %	322834071
74225	NC_015061	CG	4	8	3653563	3653570	0 %	0 %	50 %	50 %	322834071
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74227	NC_015061	G	6	6	3653651	3653656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74228	NC_015061	GAG	2	6	3653715	3653720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74229	NC_015061	TGC	2	6	3653814	3653819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834072
74230	NC_015061	CA	3	6	3653833	3653838	50 %	0 %	0 %	50 %	322834072
74231	NC_015061	TCA	2	6	3653889	3653894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834072
74232	NC_015061	TAA	2	6	3653909	3653914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834072
74233	NC_015061	CAT	2	6	3653978	3653983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834072
74234	NC_015061	CAG	2	6	3653984	3653989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834072
74235	NC_015061	GCCA	2	8	3654075	3654082	25 %	0 %	25 %	50 %	322834072
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74237	NC_015061	GGC	2	6	3654308	3654313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834072
74238	NC_015061	TGAC	2	8	3654465	3654472	25 %	25 %	25 %	25 %	322834072
74239	NC_015061	TTTG	2	8	3654484	3654491	0 %	75 %	25 %	0 %	322834072
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74245	NC_015061	GTG	2	6	3654774	3654779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834072
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74252	NC_015061	CGGA	2	8	3655442	3655449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74253	NC_015061	TCAA	2	8	3655594	3655601	50 %	25 %	0 %	25 %	322834074
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74262	NC_015061	A	8	8	3656068	3656075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74263	NC_015061	TTTTC	2	10	3656097	3656106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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74342	NC_015061	CATC	2	8	3661220	3661227	25 %	25 %	0 %	50 %	322834079
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74344	NC_015061	CGG	2	6	3661341	3661346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834079
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74346	NC_015061	GC	3	6	3661428	3661433	0 %	0 %	50 %	50 %	322834079
74347	NC_015061	TCT	2	6	3661453	3661458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834079
74348	NC_015061	AGC	2	6	3661468	3661473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834079
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74468	NC_015061	GTT	2	6	3666876	3666881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834083
74469	NC_015061	CTT	2	6	3666885	3666890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834083
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