MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015061	GCG	2	6	312826	312831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831005
6502	NC_015061	CAG	2	6	312872	312877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831005
6503	NC_015061	T	6	6	312933	312938	0 %	100 %	0 %	0 %	322831005
6504	NC_015061	A	6	6	312946	312951	100 %	0 %	0 %	0 %	322831005
6505	NC_015061	ATA	2	6	312970	312975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_015061	GGC	2	6	312984	312989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_015061	GAAT	2	8	313013	313020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_015061	CGC	2	6	313026	313031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_015061	GGC	2	6	313037	313042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_015061	TGG	2	6	313082	313087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831006
6511	NC_015061	T	6	6	313188	313193	0 %	100 %	0 %	0 %	322831006
6512	NC_015061	TCA	2	6	313300	313305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831006
6513	NC_015061	CTG	2	6	313329	313334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831006
6514	NC_015061	GCAG	3	12	313359	313370	25 %	0 %	50 %	25 %	322831006
6515	NC_015061	ATA	2	6	313408	313413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831006
6516	NC_015061	TCC	2	6	313416	313421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831007
6517	NC_015061	CGA	2	6	313489	313494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6518	NC_015061	GCTG	2	8	313513	313520	0 %	25 %	50 %	25 %	322831007
6519	NC_015061	GCC	2	6	313551	313556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6520	NC_015061	GAT	2	6	313652	313657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831007
6521	NC_015061	GCC	2	6	313679	313684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6522	NC_015061	TCCA	2	8	313695	313702	25 %	25 %	0 %	50 %	322831007
6523	NC_015061	CAT	2	6	313745	313750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831007
6524	NC_015061	GCC	2	6	313794	313799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6525	NC_015061	GCC	2	6	313826	313831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6526	NC_015061	TGC	2	6	314026	314031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6527	NC_015061	GC	3	6	314134	314139	0 %	0 %	50 %	50 %	322831007
6528	NC_015061	TGC	2	6	314325	314330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6529	NC_015061	CAG	2	6	314352	314357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6530	NC_015061	CAG	2	6	314363	314368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6531	NC_015061	CGGT	2	8	314377	314384	0 %	25 %	50 %	25 %	322831007
6532	NC_015061	TATT	2	8	314415	314422	25 %	75 %	0 %	0 %	322831007
6533	NC_015061	GTC	2	6	314429	314434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6534	NC_015061	GAT	2	6	314506	314511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831007
6535	NC_015061	GCC	2	6	314576	314581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6536	NC_015061	GCC	2	6	314616	314621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6537	NC_015061	TGA	2	6	314650	314655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831007
6538	NC_015061	GC	3	6	314692	314697	0 %	0 %	50 %	50 %	322831007
6539	NC_015061	CTGC	2	8	314736	314743	0 %	25 %	25 %	50 %	322831007
6540	NC_015061	GCA	2	6	314806	314811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6541	NC_015061	AGC	2	6	314853	314858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6542	NC_015061	ACC	2	6	314877	314882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831007
6543	NC_015061	TGCG	2	8	314926	314933	0 %	25 %	50 %	25 %	322831007
6544	NC_015061	CAGTTT	2	12	314984	314995	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322831007
6545	NC_015061	CCA	2	6	315079	315084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831007
6546	NC_015061	CG	3	6	315178	315183	0 %	0 %	50 %	50 %	322831007
6547	NC_015061	GC	3	6	315206	315211	0 %	0 %	50 %	50 %	322831007
6548	NC_015061	CGGA	2	8	315224	315231	25 %	0 %	50 %	25 %	322831007
6549	NC_015061	AAGG	2	8	315263	315270	50 %	0 %	50 %	0 %	322831007
6550	NC_015061	GCC	2	6	315308	315313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6551	NC_015061	GCTG	2	8	315382	315389	0 %	25 %	50 %	25 %	322831007
6552	NC_015061	GTT	2	6	315406	315411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831007
6553	NC_015061	CGG	2	6	315475	315480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831007
6554	NC_015061	CCG	3	9	315498	315506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831007
6555	NC_015061	ACG	2	6	315527	315532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6556	NC_015061	CGG	2	6	315608	315613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831007
6557	NC_015061	GCT	2	6	315671	315676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831007
6558	NC_015061	GAAT	2	8	315678	315685	50 %	25 %	25 %	0 %	322831007
6559	NC_015061	TTC	2	6	315779	315784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831007
6560	NC_015061	ATG	2	6	315791	315796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831007
6561	NC_015061	CG	3	6	315835	315840	0 %	0 %	50 %	50 %	322831007
6562	NC_015061	AAT	2	6	315932	315937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831007
6563	NC_015061	CG	3	6	315998	316003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_015061	ATG	2	6	316167	316172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_015061	AGAT	2	8	316246	316253	50 %	25 %	25 %	0 %	322831008
6566	NC_015061	GGC	2	6	316260	316265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831008
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6570	NC_015061	CAGC	2	8	316398	316405	25 %	0 %	25 %	50 %	322831008
6571	NC_015061	TGT	2	6	316465	316470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831008
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6573	NC_015061	CAT	2	6	316658	316663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831008
6574	NC_015061	CGT	2	6	316718	316723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831008
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6580	NC_015061	ATG	3	9	317119	317127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831008
6581	NC_015061	TGTC	2	8	317192	317199	0 %	50 %	25 %	25 %	322831008
6582	NC_015061	TCA	2	6	317239	317244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831008
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6586	NC_015061	TGA	2	6	317432	317437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831008
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6588	NC_015061	AAT	2	6	317496	317501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_015061	TAAA	2	8	317523	317530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_015061	TGT	2	6	317580	317585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_015061	GAA	2	6	317595	317600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_015061	GCT	2	6	317643	317648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831009
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6595	NC_015061	ACA	3	9	317798	317806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831009
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6602	NC_015061	TATT	2	8	318243	318250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_015061	TGA	2	6	318261	318266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_015061	AATGA	2	10	318313	318322	60 %	20 %	20 %	0 %	322831010
6605	NC_015061	ATGA	2	8	318349	318356	50 %	25 %	25 %	0 %	322831010
6606	NC_015061	TCCT	2	8	318383	318390	0 %	50 %	0 %	50 %	322831010
6607	NC_015061	ACCGGT	2	12	318427	318438	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6608	NC_015061	GCA	2	6	318611	318616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6609	NC_015061	ATCCG	2	10	318650	318659	20 %	20 %	20 %	40 %	322831010
6610	NC_015061	CG	3	6	318658	318663	0 %	0 %	50 %	50 %	322831010
6611	NC_015061	GCT	3	9	318684	318692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831010
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6614	NC_015061	CGA	2	6	318756	318761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831010
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6617	NC_015061	TTC	2	6	318925	318930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831010
6618	NC_015061	TGA	2	6	318959	318964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831010
6619	NC_015061	TAT	2	6	318987	318992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831010
6620	NC_015061	CTG	2	6	318997	319002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6621	NC_015061	CTG	2	6	319048	319053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6622	NC_015061	GCT	2	6	319056	319061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6623	NC_015061	AGC	2	6	319103	319108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6624	NC_015061	TTC	2	6	319120	319125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831010
6625	NC_015061	CTG	2	6	319141	319146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831010
6626	NC_015061	GCT	2	6	319167	319172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831010
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6630	NC_015061	CGA	3	9	319506	319514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831010
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6639	NC_015061	CCTG	2	8	319897	319904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6641	NC_015061	T	6	6	319945	319950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6642	NC_015061	A	6	6	320089	320094	100 %	0 %	0 %	0 %	322831011
6643	NC_015061	T	6	6	320123	320128	0 %	100 %	0 %	0 %	322831011
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6993	NC_015061	TCA	2	6	338356	338361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831027
6994	NC_015061	CAG	2	6	338369	338374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831027
6995	NC_015061	AGTC	2	8	338414	338421	25 %	25 %	25 %	25 %	322831027
6996	NC_015061	GCG	2	6	338470	338475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831027
6997	NC_015061	CAG	2	6	338541	338546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831027
6998	NC_015061	CGG	2	6	338575	338580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6999	NC_015061	CTTTTT	2	12	338582	338593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7000	NC_015061	ATG	2	6	338612	338617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831028

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