MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_015061	ACCTG	2	10	3199841	3199850	20 %	20 %	20 %	40 %	322833642
65002	NC_015061	TGGAA	2	10	3199880	3199889	40 %	20 %	40 %	0 %	322833642
65003	NC_015061	GCC	2	6	3199976	3199981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833642
65004	NC_015061	GGC	2	6	3200015	3200020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833642
65005	NC_015061	CCAGA	2	10	3200058	3200067	40 %	0 %	20 %	40 %	322833642
65006	NC_015061	GAT	2	6	3200068	3200073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833642
65007	NC_015061	GAA	2	6	3200095	3200100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833642
65008	NC_015061	GAT	2	6	3200167	3200172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833642
65009	NC_015061	TTC	2	6	3200215	3200220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833642
65010	NC_015061	ATG	2	6	3200270	3200275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833642
65011	NC_015061	CGT	2	6	3200310	3200315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833642
65012	NC_015061	ACC	2	6	3200377	3200382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833642
65013	NC_015061	CAGC	2	8	3200416	3200423	25 %	0 %	25 %	50 %	322833642
65014	NC_015061	GCA	2	6	3200481	3200486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833642
65015	NC_015061	ATTG	2	8	3200537	3200544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65016	NC_015061	TAAC	2	8	3200593	3200600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65017	NC_015061	AAT	2	6	3200674	3200679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65018	NC_015061	CCA	2	6	3200745	3200750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65019	NC_015061	ATTA	2	8	3200824	3200831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65020	NC_015061	AAAT	2	8	3200841	3200848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65021	NC_015061	GAA	3	9	3200884	3200892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833643
65022	NC_015061	AAT	2	6	3200902	3200907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833643
65023	NC_015061	GTT	2	6	3200939	3200944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833643
65024	NC_015061	TTTCC	2	10	3201008	3201017	0 %	60 %	0 %	40 %	322833643
65025	NC_015061	CAG	2	6	3201060	3201065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833643
65026	NC_015061	ACC	2	6	3201207	3201212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833643
65027	NC_015061	TCT	2	6	3201229	3201234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833643
65028	NC_015061	CTG	2	6	3201333	3201338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833643
65029	NC_015061	CTT	2	6	3201356	3201361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833643
65030	NC_015061	AAT	2	6	3201371	3201376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833643
65031	NC_015061	CCA	2	6	3201398	3201403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833643
65032	NC_015061	GGC	2	6	3201414	3201419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833643
65033	NC_015061	TCG	2	6	3201451	3201456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833643
65034	NC_015061	GTT	2	6	3201541	3201546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833643
65035	NC_015061	ATA	2	6	3201667	3201672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833643
65036	NC_015061	CAG	2	6	3201776	3201781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65037	NC_015061	CAG	3	9	3201791	3201799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65038	NC_015061	GC	3	6	3201886	3201891	0 %	0 %	50 %	50 %	322833644
65039	NC_015061	AGCAA	2	10	3201897	3201906	60 %	0 %	20 %	20 %	322833644
65040	NC_015061	GCT	2	6	3201913	3201918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65041	NC_015061	ATG	2	6	3201930	3201935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833644
65042	NC_015061	TGC	2	6	3201951	3201956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65043	NC_015061	CAG	2	6	3201971	3201976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65044	NC_015061	GCCA	2	8	3201984	3201991	25 %	0 %	25 %	50 %	322833644
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65046	NC_015061	CTG	3	9	3202049	3202057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833644
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65049	NC_015061	TTC	2	6	3202223	3202228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833644
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65051	NC_015061	TCG	2	6	3202267	3202272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65052	NC_015061	CAG	2	6	3202318	3202323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65053	NC_015061	GCT	2	6	3202359	3202364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833644
65054	NC_015061	TCTG	2	8	3202377	3202384	0 %	50 %	25 %	25 %	322833644
65055	NC_015061	GCC	2	6	3202406	3202411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833644
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65058	NC_015061	T	6	6	3202558	3202563	0 %	100 %	0 %	0 %	322833644
65059	NC_015061	TCA	2	6	3202617	3202622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833644
65060	NC_015061	GCAT	2	8	3202638	3202645	25 %	25 %	25 %	25 %	322833644
65061	NC_015061	GTG	2	6	3202655	3202660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833644
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65064	NC_015061	GCA	2	6	3202847	3202852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833645
65065	NC_015061	ACGCGT	2	12	3202864	3202875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322833645
65066	NC_015061	AAAG	2	8	3202882	3202889	75 %	0 %	25 %	0 %	322833645
65067	NC_015061	CACGGG	2	12	3202923	3202934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322833645
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65077	NC_015061	ATTCTT	2	12	3203375	3203386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	322833645
65078	NC_015061	TA	3	6	3203396	3203401	50 %	50 %	0 %	0 %	322833646
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65112	NC_015061	TTG	2	6	3205352	3205357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65113	NC_015061	ACA	2	6	3205382	3205387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65114	NC_015061	CCG	2	6	3205467	3205472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833648
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65116	NC_015061	CGG	2	6	3205580	3205585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833648
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65143	NC_015061	CTT	2	6	3206835	3206840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65144	NC_015061	CTT	2	6	3206865	3206870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65145	NC_015061	GA	3	6	3206899	3206904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65146	NC_015061	GTC	2	6	3206917	3206922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65230	NC_015061	CAT	2	6	3211012	3211017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833653
65231	NC_015061	ACG	2	6	3211022	3211027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833653
65232	NC_015061	GGTT	2	8	3211046	3211053	0 %	50 %	50 %	0 %	322833653
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65468	NC_015061	GAC	2	6	3222058	3222063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833665
65469	NC_015061	CGA	2	6	3222070	3222075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833665
65470	NC_015061	AGC	2	6	3222104	3222109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833665
65471	NC_015061	A	7	7	3222195	3222201	100 %	0 %	0 %	0 %	322833665
65472	NC_015061	TCA	2	6	3222215	3222220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65473	NC_015061	GCC	2	6	3222291	3222296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833666
65474	NC_015061	AAT	2	6	3222443	3222448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833666
65475	NC_015061	TGA	2	6	3222466	3222471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833666
65476	NC_015061	CGG	2	6	3222536	3222541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833666
65477	NC_015061	CAC	2	6	3222662	3222667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833666
65478	NC_015061	AGC	2	6	3222792	3222797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833666
65479	NC_015061	TCA	2	6	3222811	3222816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833666
65480	NC_015061	CGC	2	6	3222884	3222889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833666
65481	NC_015061	CAG	2	6	3223028	3223033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833666
65482	NC_015061	TGG	2	6	3223036	3223041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833666
65483	NC_015061	CAT	2	6	3223052	3223057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833666
65484	NC_015061	CCA	2	6	3223075	3223080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833666
65485	NC_015061	GAT	2	6	3223178	3223183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833666
65486	NC_015061	GCA	2	6	3223188	3223193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833666
65487	NC_015061	CAT	2	6	3223229	3223234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833666
65488	NC_015061	ACA	2	6	3223236	3223241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833666
65489	NC_015061	TC	3	6	3223285	3223290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65490	NC_015061	CGT	2	6	3223381	3223386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833667
65491	NC_015061	GAT	2	6	3223420	3223425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833667
65492	NC_015061	TCA	2	6	3223497	3223502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833667
65493	NC_015061	CTCTT	2	10	3223561	3223570	0 %	60 %	0 %	40 %	322833667
65494	NC_015061	CAA	2	6	3223587	3223592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833667
65495	NC_015061	CGC	2	6	3223609	3223614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833667
65496	NC_015061	CGT	2	6	3223653	3223658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833667
65497	NC_015061	GCC	2	6	3223681	3223686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833667
65498	NC_015061	ATC	2	6	3223718	3223723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833667
65499	NC_015061	CCA	2	6	3223758	3223763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833667
65500	NC_015061	CAG	2	6	3223780	3223785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833667

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