MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_015061	TGC	2	6	3148962	3148967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833594
64002	NC_015061	GCA	3	9	3149050	3149058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833594
64003	NC_015061	CAT	2	6	3149073	3149078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833594
64004	NC_015061	CTG	2	6	3149204	3149209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833594
64005	NC_015061	TTG	2	6	3149213	3149218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833594
64006	NC_015061	TGG	2	6	3149298	3149303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833594
64007	NC_015061	TCG	3	9	3149309	3149317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833594
64008	NC_015061	TCA	2	6	3149333	3149338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833594
64009	NC_015061	ATG	2	6	3149341	3149346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833594
64010	NC_015061	TTC	2	6	3149368	3149373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833594
64011	NC_015061	CTG	2	6	3149390	3149395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833594
64012	NC_015061	TGGTG	2	10	3149433	3149442	0 %	40 %	60 %	0 %	322833594
64013	NC_015061	ACA	2	6	3149477	3149482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833594
64014	NC_015061	GCG	2	6	3149494	3149499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833594
64015	NC_015061	A	6	6	3149574	3149579	100 %	0 %	0 %	0 %	322833595
64016	NC_015061	GT	3	6	3149602	3149607	0 %	50 %	50 %	0 %	322833595
64017	NC_015061	GCTTCT	2	12	3149665	3149676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322833595
64018	NC_015061	CGT	2	6	3149694	3149699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833595
64019	NC_015061	ACG	2	6	3149716	3149721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833595
64020	NC_015061	GAA	2	6	3149811	3149816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833595
64021	NC_015061	CGA	2	6	3149840	3149845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833595
64022	NC_015061	TCT	2	6	3149908	3149913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833595
64023	NC_015061	CTG	2	6	3150018	3150023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833595
64024	NC_015061	CTA	2	6	3150029	3150034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833595
64025	NC_015061	A	6	6	3150054	3150059	100 %	0 %	0 %	0 %	322833595
64026	NC_015061	GCG	2	6	3150085	3150090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833595
64027	NC_015061	AC	3	6	3150165	3150170	50 %	0 %	0 %	50 %	322833595
64028	NC_015061	ACC	2	6	3150219	3150224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833595
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64030	NC_015061	CTG	2	6	3150279	3150284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833595
64031	NC_015061	GAA	2	6	3150311	3150316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833595
64032	NC_015061	ATC	2	6	3150333	3150338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833595
64033	NC_015061	CTT	2	6	3150344	3150349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833595
64034	NC_015061	T	6	6	3150429	3150434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64035	NC_015061	CTTTG	2	10	3150466	3150475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64036	NC_015061	TTGC	2	8	3150544	3150551	0 %	50 %	25 %	25 %	322833596
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64050	NC_015061	TAA	2	6	3150948	3150953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833596
64051	NC_015061	TTAAC	2	10	3151015	3151024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64052	NC_015061	CAA	2	6	3151057	3151062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64053	NC_015061	ATT	2	6	3151087	3151092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64054	NC_015061	CGC	2	6	3151224	3151229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833597
64055	NC_015061	GCCA	2	8	3151351	3151358	25 %	0 %	25 %	50 %	322833597
64056	NC_015061	CAT	2	6	3151362	3151367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833597
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64058	NC_015061	GC	4	8	3151412	3151419	0 %	0 %	50 %	50 %	322833597
64059	NC_015061	ATC	2	6	3151423	3151428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833597
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64061	NC_015061	CAT	2	6	3151566	3151571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833597
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64071	NC_015061	CAT	2	6	3151885	3151890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833598
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64085	NC_015061	CTG	2	6	3152638	3152643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64097	NC_015061	T	7	7	3153444	3153450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64104	NC_015061	CA	3	6	3153826	3153831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64105	NC_015061	T	6	6	3153988	3153993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64106	NC_015061	CAAA	2	8	3154019	3154026	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64107	NC_015061	ATT	2	6	3154046	3154051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64109	NC_015061	AAT	2	6	3154276	3154281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64110	NC_015061	AAAC	2	8	3154313	3154320	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64111	NC_015061	CCTG	2	8	3154363	3154370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64112	NC_015061	ATA	2	6	3154371	3154376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64113	NC_015061	T	6	6	3154438	3154443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64114	NC_015061	GTG	2	6	3154447	3154452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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64116	NC_015061	GCC	2	6	3154523	3154528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64117	NC_015061	ATTA	2	8	3154565	3154572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64119	NC_015061	GCAG	2	8	3154685	3154692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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64242	NC_015061	CGG	2	6	3159922	3159927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833606
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64269	NC_015061	T	7	7	3161389	3161395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64343	NC_015061	A	7	7	3165024	3165030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64344	NC_015061	TA	4	8	3165049	3165056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64346	NC_015061	A	7	7	3165258	3165264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64347	NC_015061	ATG	2	6	3165291	3165296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64348	NC_015061	G	6	6	3165347	3165352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64349	NC_015061	CAT	2	6	3165414	3165419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64350	NC_015061	GCA	2	6	3165423	3165428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64351	NC_015061	A	6	6	3165435	3165440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64352	NC_015061	CAG	2	6	3165441	3165446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64353	NC_015061	TAAA	2	8	3165458	3165465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64354	NC_015061	TGA	2	6	3165490	3165495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64355	NC_015061	AGC	2	6	3165518	3165523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64356	NC_015061	ATC	2	6	3165680	3165685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833613
64357	NC_015061	ATA	2	6	3165713	3165718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833613
64358	NC_015061	T	6	6	3165795	3165800	0 %	100 %	0 %	0 %	322833613
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64360	NC_015061	GAT	2	6	3165933	3165938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833613
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64477	NC_015061	GCT	2	6	3171600	3171605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833619
64478	NC_015061	CCA	2	6	3171638	3171643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833619
64479	NC_015061	CT	3	6	3171810	3171815	0 %	50 %	0 %	50 %	322833619
64480	NC_015061	AGC	2	6	3171959	3171964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833619
64481	NC_015061	TTC	2	6	3171987	3171992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833619
64482	NC_015061	GCA	2	6	3172068	3172073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833619
64483	NC_015061	TACTG	2	10	3172125	3172134	20 %	40 %	20 %	20 %	322833619
64484	NC_015061	CGAA	2	8	3172229	3172236	50 %	0 %	25 %	25 %	322833619
64485	NC_015061	CGT	2	6	3172285	3172290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833619
64486	NC_015061	TGC	2	6	3172350	3172355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833619
64487	NC_015061	CCA	3	9	3172448	3172456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833619
64488	NC_015061	AAGT	2	8	3172471	3172478	50 %	25 %	25 %	0 %	322833619
64489	NC_015061	T	6	6	3172544	3172549	0 %	100 %	0 %	0 %	322833620
64490	NC_015061	T	6	6	3172566	3172571	0 %	100 %	0 %	0 %	322833620
64491	NC_015061	TCACGC	2	12	3172592	3172603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322833620
64492	NC_015061	AAC	2	6	3172694	3172699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833620
64493	NC_015061	ATC	2	6	3172778	3172783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833620
64494	NC_015061	CAG	2	6	3172807	3172812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833620
64495	NC_015061	GGC	2	6	3172948	3172953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833620
64496	NC_015061	CGCAT	2	10	3172961	3172970	20 %	20 %	20 %	40 %	322833620
64497	NC_015061	CGG	2	6	3173015	3173020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833620
64498	NC_015061	TTC	2	6	3173038	3173043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833620
64499	NC_015061	AC	3	6	3173119	3173124	50 %	0 %	0 %	50 %	322833620
64500	NC_015061	GCG	2	6	3173151	3173156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833620

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