MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60003	NC_015061	AAG	2	6	2946827	2946832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833412
60004	NC_015061	TGG	2	6	2946836	2946841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833412
60005	NC_015061	CCA	2	6	2946899	2946904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833412
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60007	NC_015061	AT	3	6	2946928	2946933	50 %	50 %	0 %	0 %	322833412
60008	NC_015061	TGC	2	6	2946966	2946971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833412
60009	NC_015061	GAT	2	6	2947080	2947085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833412
60010	NC_015061	CAG	2	6	2947161	2947166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833412
60011	NC_015061	GATG	2	8	2947176	2947183	25 %	25 %	50 %	0 %	322833412
60012	NC_015061	ACG	2	6	2947184	2947189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833412
60013	NC_015061	GAT	2	6	2947305	2947310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833413
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60015	NC_015061	CCA	2	6	2947382	2947387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833413
60016	NC_015061	GCCC	2	8	2947434	2947441	0 %	0 %	25 %	75 %	322833413
60017	NC_015061	GC	4	8	2947473	2947480	0 %	0 %	50 %	50 %	322833413
60018	NC_015061	TGA	2	6	2947482	2947487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833413
60019	NC_015061	ACG	2	6	2947553	2947558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833413
60020	NC_015061	CTG	2	6	2947570	2947575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833413
60021	NC_015061	GCC	2	6	2947579	2947584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833413
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60054	NC_015061	GAA	2	6	2948993	2948998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833414
60055	NC_015061	T	7	7	2949058	2949064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60118	NC_015061	CAA	2	6	2951964	2951969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833417
60119	NC_015061	CA	3	6	2951979	2951984	50 %	0 %	0 %	50 %	322833417
60120	NC_015061	GCT	2	6	2952012	2952017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833417
60121	NC_015061	CTG	2	6	2952022	2952027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833417
60122	NC_015061	GTG	2	6	2952073	2952078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833417
60123	NC_015061	CGC	2	6	2952139	2952144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833417
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60189	NC_015061	CTG	2	6	2955304	2955309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833421
60190	NC_015061	ATA	2	6	2955321	2955326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833421
60191	NC_015061	ACG	2	6	2955331	2955336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60192	NC_015061	TAA	2	6	2955366	2955371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833422
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60194	NC_015061	GTG	2	6	2955433	2955438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833422
60195	NC_015061	ACA	2	6	2955632	2955637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833422
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60197	NC_015061	CTG	2	6	2955703	2955708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833422
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60200	NC_015061	GCA	3	9	2955765	2955773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833422
60201	NC_015061	CCG	2	6	2955808	2955813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833422
60202	NC_015061	TGT	2	6	2955818	2955823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833422
60203	NC_015061	TGA	2	6	2955825	2955830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833422
60204	NC_015061	ATG	2	6	2955910	2955915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833422
60205	NC_015061	CA	3	6	2955921	2955926	50 %	0 %	0 %	50 %	322833422
60206	NC_015061	CTT	2	6	2956011	2956016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833422
60207	NC_015061	ATC	2	6	2956019	2956024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833422
60208	NC_015061	ATTA	2	8	2956070	2956077	50 %	50 %	0 %	0 %	322833422
60209	NC_015061	AT	3	6	2956176	2956181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60210	NC_015061	AGC	2	6	2956212	2956217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833423
60211	NC_015061	CAG	2	6	2956238	2956243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833423
60212	NC_015061	CCGG	2	8	2956333	2956340	0 %	0 %	50 %	50 %	322833423
60213	NC_015061	TCA	2	6	2956405	2956410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833423
60214	NC_015061	TGA	2	6	2956437	2956442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833423
60215	NC_015061	CG	3	6	2956506	2956511	0 %	0 %	50 %	50 %	322833423
60216	NC_015061	CT	3	6	2956526	2956531	0 %	50 %	0 %	50 %	322833423
60217	NC_015061	TCG	2	6	2956551	2956556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833424
60218	NC_015061	TCC	2	6	2956668	2956673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60219	NC_015061	GTT	2	6	2956724	2956729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60220	NC_015061	CGG	2	6	2956730	2956735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60221	NC_015061	CGAA	2	8	2956797	2956804	50 %	0 %	25 %	25 %	322833425
60222	NC_015061	CAG	2	6	2956864	2956869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833425
60223	NC_015061	CAT	2	6	2956898	2956903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833425
60224	NC_015061	AGCC	2	8	2956919	2956926	25 %	0 %	25 %	50 %	322833425
60225	NC_015061	GTAA	2	8	2956982	2956989	50 %	25 %	25 %	0 %	322833425
60226	NC_015061	GTCGC	2	10	2957096	2957105	0 %	20 %	40 %	40 %	322833425
60227	NC_015061	CG	3	6	2957137	2957142	0 %	0 %	50 %	50 %	322833425
60228	NC_015061	ATCA	2	8	2957144	2957151	50 %	25 %	0 %	25 %	322833425
60229	NC_015061	CGCC	2	8	2957158	2957165	0 %	0 %	25 %	75 %	322833425
60230	NC_015061	TGG	2	6	2957254	2957259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833425
60231	NC_015061	CAG	2	6	2957438	2957443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833425
60232	NC_015061	CGACG	2	10	2957480	2957489	20 %	0 %	40 %	40 %	322833425
60233	NC_015061	CAGC	2	8	2957581	2957588	25 %	0 %	25 %	50 %	322833425
60234	NC_015061	CGC	2	6	2957763	2957768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60235	NC_015061	CGT	2	6	2957799	2957804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60236	NC_015061	GTT	2	6	2957880	2957885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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60352	NC_015061	ATG	2	6	2964471	2964476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833431
60353	NC_015061	GAT	2	6	2964625	2964630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833431
60354	NC_015061	T	6	6	2964692	2964697	0 %	100 %	0 %	0 %	322833431
60355	NC_015061	GTC	2	6	2964719	2964724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833431
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60372	NC_015061	ACTT	2	8	2965750	2965757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60373	NC_015061	TA	3	6	2965800	2965805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60374	NC_015061	TGG	2	6	2965818	2965823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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60376	NC_015061	A	6	6	2966004	2966009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60382	NC_015061	ATA	2	6	2966264	2966269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833432
60383	NC_015061	TCA	2	6	2966319	2966324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833432
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60419	NC_015061	ACA	2	6	2968102	2968107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833434
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60434	NC_015061	CGCA	2	8	2968718	2968725	25 %	0 %	25 %	50 %	322833434
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60454	NC_015061	CTGA	2	8	2969511	2969518	25 %	25 %	25 %	25 %	322833435
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60459	NC_015061	CATT	2	8	2969922	2969929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60460	NC_015061	TAA	2	6	2969935	2969940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60461	NC_015061	GTC	2	6	2970099	2970104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833436
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60468	NC_015061	GAA	2	6	2970447	2970452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833436
60469	NC_015061	CCG	2	6	2970514	2970519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833436
60470	NC_015061	CTT	2	6	2970608	2970613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833436
60471	NC_015061	CACGC	2	10	2970615	2970624	20 %	0 %	20 %	60 %	322833436
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60473	NC_015061	GAT	2	6	2970684	2970689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833436
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60475	NC_015061	GAT	2	6	2970717	2970722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833436
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60477	NC_015061	GTC	2	6	2970750	2970755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833436
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60488	NC_015061	GCAC	2	8	2971510	2971517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60489	NC_015061	CTT	2	6	2971548	2971553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60490	NC_015061	GCG	2	6	2971554	2971559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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60492	NC_015061	GAT	2	6	2971581	2971586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60493	NC_015061	ACT	2	6	2971598	2971603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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60497	NC_015061	TGA	2	6	2971784	2971789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833437
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60499	NC_015061	AC	3	6	2971868	2971873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60500	NC_015061	TAA	2	6	2971959	2971964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833438

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