MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_015061	TAA	2	6	2851011	2851016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833324
58002	NC_015061	TGC	2	6	2851028	2851033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833324
58003	NC_015061	TACA	2	8	2851114	2851121	50 %	25 %	0 %	25 %	322833325
58004	NC_015061	TCG	2	6	2851125	2851130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833325
58005	NC_015061	GTG	2	6	2851157	2851162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833325
58006	NC_015061	ATT	2	6	2851193	2851198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833325
58007	NC_015061	CAGC	2	8	2851207	2851214	25 %	0 %	25 %	50 %	322833325
58008	NC_015061	GGTGCT	2	12	2851225	2851236	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322833325
58009	NC_015061	GCT	2	6	2851282	2851287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833325
58010	NC_015061	TCA	2	6	2851333	2851338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833325
58011	NC_015061	CGG	2	6	2851357	2851362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833325
58012	NC_015061	TCG	2	6	2851365	2851370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833325
58013	NC_015061	GAA	2	6	2851553	2851558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833325
58014	NC_015061	GCAAAC	2	12	2851668	2851679	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322833326
58015	NC_015061	GAA	2	6	2851729	2851734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833326
58016	NC_015061	CAG	2	6	2851738	2851743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833326
58017	NC_015061	GCC	2	6	2851846	2851851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833326
58018	NC_015061	CGG	2	6	2851920	2851925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833326
58019	NC_015061	GCG	3	9	2851972	2851980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833326
58020	NC_015061	GCT	2	6	2852050	2852055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833326
58021	NC_015061	GAA	2	6	2852083	2852088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833326
58022	NC_015061	GAT	2	6	2852104	2852109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833326
58023	NC_015061	GT	4	8	2852114	2852121	0 %	50 %	50 %	0 %	322833326
58024	NC_015061	CGC	2	6	2852132	2852137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833326
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58026	NC_015061	CGG	3	9	2852334	2852342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833326
58027	NC_015061	CTG	2	6	2852461	2852466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833326
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58032	NC_015061	GCA	2	6	2852685	2852690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833327
58033	NC_015061	CA	3	6	2853009	2853014	50 %	0 %	0 %	50 %	322833327
58034	NC_015061	CTGTG	2	10	2853017	2853026	0 %	40 %	40 %	20 %	322833327
58035	NC_015061	TAT	2	6	2853036	2853041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833327
58036	NC_015061	CGC	2	6	2853135	2853140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833327
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58038	NC_015061	GTC	2	6	2853226	2853231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833327
58039	NC_015061	CG	3	6	2853296	2853301	0 %	0 %	50 %	50 %	322833327
58040	NC_015061	TCA	2	6	2853320	2853325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833327
58041	NC_015061	TCG	2	6	2853435	2853440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833327
58042	NC_015061	TGC	2	6	2853443	2853448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833327
58043	NC_015061	TTG	2	6	2853536	2853541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833327
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58049	NC_015061	GC	3	6	2853787	2853792	0 %	0 %	50 %	50 %	322833327
58050	NC_015061	CGCA	2	8	2854050	2854057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58051	NC_015061	GACA	2	8	2854072	2854079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58052	NC_015061	GGC	2	6	2854125	2854130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833328
58053	NC_015061	GAA	2	6	2854173	2854178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833328
58054	NC_015061	GCC	2	6	2854249	2854254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833328
58055	NC_015061	TGC	2	6	2854327	2854332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833328
58056	NC_015061	CGG	2	6	2854334	2854339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833328
58057	NC_015061	ATC	2	6	2854404	2854409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833328
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58064	NC_015061	CGG	3	9	2854781	2854789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833328
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58068	NC_015061	GC	3	6	2854891	2854896	0 %	0 %	50 %	50 %	322833328
58069	NC_015061	GAT	2	6	2854943	2854948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833328
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58075	NC_015061	GA	3	6	2855272	2855277	50 %	0 %	50 %	0 %	322833328
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58087	NC_015061	GAAA	2	8	2855941	2855948	75 %	0 %	25 %	0 %	322833329
58088	NC_015061	ATC	2	6	2855999	2856004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833329
58089	NC_015061	ATCAGC	2	12	2856012	2856023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322833329
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58091	NC_015061	CAGA	2	8	2856097	2856104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58092	NC_015061	T	8	8	2856152	2856159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58093	NC_015061	AAT	2	6	2856188	2856193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58094	NC_015061	GA	4	8	2856232	2856239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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58104	NC_015061	T	6	6	2856665	2856670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58105	NC_015061	TGC	2	6	2856750	2856755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833331
58106	NC_015061	CAC	2	6	2856757	2856762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833331
58107	NC_015061	ATCC	2	8	2856791	2856798	25 %	25 %	0 %	50 %	322833331
58108	NC_015061	CAGA	2	8	2856801	2856808	50 %	0 %	25 %	25 %	322833331
58109	NC_015061	TTAA	2	8	2856813	2856820	50 %	50 %	0 %	0 %	322833331
58110	NC_015061	CGG	2	6	2857022	2857027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833331
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58112	NC_015061	ACCCAG	2	12	2857178	2857189	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322833331
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58115	NC_015061	TGC	2	6	2857310	2857315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833331
58116	NC_015061	TCCCT	2	10	2857324	2857333	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58117	NC_015061	TG	3	6	2857335	2857340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58118	NC_015061	CG	3	6	2857355	2857360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58119	NC_015061	AAT	2	6	2857361	2857366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58120	NC_015061	GAG	2	6	2857491	2857496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58121	NC_015061	TGT	2	6	2857501	2857506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58122	NC_015061	A	8	8	2857535	2857542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58123	NC_015061	TGC	2	6	2857546	2857551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58125	NC_015061	TTTGG	2	10	2857576	2857585	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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58134	NC_015061	CGG	2	6	2858037	2858042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58135	NC_015061	TGA	2	6	2858264	2858269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833333
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58185	NC_015061	TTC	2	6	2860927	2860932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58186	NC_015061	CTTT	2	8	2860942	2860949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58187	NC_015061	TTG	2	6	2860971	2860976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58188	NC_015061	TG	3	6	2860980	2860985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58189	NC_015061	GGGCG	2	10	2861116	2861125	0 %	0 %	80 %	20 %	322833336
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58205	NC_015061	GGC	3	9	2862074	2862082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833337
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58212	NC_015061	TTAT	2	8	2862494	2862501	25 %	75 %	0 %	0 %	322833338
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58218	NC_015061	T	6	6	2862911	2862916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58219	NC_015061	AAAG	2	8	2862962	2862969	75 %	0 %	25 %	0 %	322833339
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58225	NC_015061	GC	3	6	2863484	2863489	0 %	0 %	50 %	50 %	322833340
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58227	NC_015061	TGA	2	6	2863565	2863570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58228	NC_015061	CCAG	2	8	2863620	2863627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58229	NC_015061	TTCA	2	8	2863691	2863698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58230	NC_015061	GCT	2	6	2863721	2863726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58231	NC_015061	CTT	2	6	2863742	2863747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58232	NC_015061	TCC	2	6	2863828	2863833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58233	NC_015061	TTA	2	6	2863873	2863878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58234	NC_015061	TGAT	2	8	2863904	2863911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58235	NC_015061	AGTT	2	8	2863923	2863930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58236	NC_015061	ACA	2	6	2863996	2864001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833341
58237	NC_015061	TCT	2	6	2864022	2864027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833341
58238	NC_015061	TGA	2	6	2864075	2864080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833341
58239	NC_015061	TCCG	2	8	2864094	2864101	0 %	25 %	25 %	50 %	322833341
58240	NC_015061	ATGGC	2	10	2864104	2864113	20 %	20 %	40 %	20 %	322833341
58241	NC_015061	ATC	2	6	2864119	2864124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833341
58242	NC_015061	CAT	2	6	2864127	2864132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833341
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58248	NC_015061	ACC	2	6	2864365	2864370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833341
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58250	NC_015061	GAT	2	6	2864391	2864396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833341
58251	NC_015061	GGC	2	6	2864490	2864495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833341
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58253	NC_015061	ATG	2	6	2864575	2864580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833341
58254	NC_015061	GT	3	6	2864630	2864635	0 %	50 %	50 %	0 %	322833341
58255	NC_015061	GGAT	2	8	2864645	2864652	25 %	25 %	50 %	0 %	322833341
58256	NC_015061	GCA	2	6	2864705	2864710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833341
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58258	NC_015061	GTGG	2	8	2864760	2864767	0 %	25 %	75 %	0 %	322833341
58259	NC_015061	GC	3	6	2864776	2864781	0 %	0 %	50 %	50 %	322833341
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58271	NC_015061	CTG	2	6	2865196	2865201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833341
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58273	NC_015061	GAT	2	6	2865322	2865327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833341
58274	NC_015061	TCG	2	6	2865413	2865418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833341
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58278	NC_015061	AAT	2	6	2865543	2865548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833342
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58286	NC_015061	GCT	2	6	2865893	2865898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58287	NC_015061	G	6	6	2865921	2865926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58288	NC_015061	AGAAA	2	10	2865935	2865944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58289	NC_015061	T	7	7	2865962	2865968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58290	NC_015061	ACGG	2	8	2866049	2866056	25 %	0 %	50 %	25 %	322833343
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58300	NC_015061	GC	4	8	2866465	2866472	0 %	0 %	50 %	50 %	322833343
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58304	NC_015061	ATC	2	6	2866681	2866686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833343
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58306	NC_015061	T	6	6	2866971	2866976	0 %	100 %	0 %	0 %	322833343
58307	NC_015061	TGT	2	6	2867018	2867023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833343
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58319	NC_015061	T	7	7	2867632	2867638	0 %	100 %	0 %	0 %	322833344
58320	NC_015061	GA	3	6	2867690	2867695	50 %	0 %	50 %	0 %	322833344
58321	NC_015061	ATC	2	6	2867715	2867720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833344
58322	NC_015061	GC	3	6	2867733	2867738	0 %	0 %	50 %	50 %	322833344
58323	NC_015061	TGT	3	9	2867751	2867759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833344
58324	NC_015061	CCG	2	6	2867799	2867804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833344
58325	NC_015061	AAACA	2	10	2868116	2868125	80 %	0 %	0 %	20 %	322833345
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58329	NC_015061	CAAA	2	8	2868264	2868271	75 %	0 %	0 %	25 %	322833345
58330	NC_015061	CAG	2	6	2868286	2868291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833345
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58333	NC_015061	CCAG	2	8	2868441	2868448	25 %	0 %	25 %	50 %	322833345
58334	NC_015061	CAG	2	6	2868475	2868480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833345
58335	NC_015061	GAA	2	6	2868493	2868498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833345
58336	NC_015061	CAG	2	6	2868505	2868510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833345
58337	NC_015061	GAA	2	6	2868517	2868522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833345
58338	NC_015061	CAG	2	6	2868550	2868555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833345
58339	NC_015061	CAT	2	6	2868559	2868564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833345
58340	NC_015061	CCG	2	6	2868671	2868676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833345
58341	NC_015061	GTG	2	6	2868727	2868732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833345
58342	NC_015061	CAT	2	6	2868757	2868762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833345
58343	NC_015061	ATC	2	6	2868775	2868780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833345
58344	NC_015061	CCG	2	6	2868855	2868860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833345
58345	NC_015061	ACG	2	6	2868877	2868882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833345
58346	NC_015061	ACG	2	6	2868941	2868946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833345
58347	NC_015061	CTTA	2	8	2868958	2868965	25 %	50 %	0 %	25 %	322833345
58348	NC_015061	CAT	2	6	2868967	2868972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833345
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58350	NC_015061	CGA	2	6	2869029	2869034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833346
58351	NC_015061	AAT	2	6	2869043	2869048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833346
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58353	NC_015061	AACA	2	8	2869117	2869124	75 %	0 %	0 %	25 %	322833346
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58473	NC_015061	TGC	2	6	2874908	2874913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833349
58474	NC_015061	GGC	2	6	2874958	2874963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833349
58475	NC_015061	CGC	2	6	2874969	2874974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833349
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