MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015061	GAAC	2	8	2703667	2703674	50 %	0 %	25 %	25 %	322833169
55002	NC_015061	AAC	2	6	2703706	2703711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55003	NC_015061	T	7	7	2703801	2703807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55004	NC_015061	TCAGG	2	10	2703838	2703847	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55005	NC_015061	TAT	2	6	2703932	2703937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833170
55006	NC_015061	TTCCGC	2	12	2703939	2703950	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322833170
55007	NC_015061	CGG	3	9	2703971	2703979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833170
55008	NC_015061	CGA	2	6	2704100	2704105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833170
55009	NC_015061	TGCC	2	8	2704109	2704116	0 %	25 %	25 %	50 %	322833170
55010	NC_015061	TGC	2	6	2704176	2704181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833170
55011	NC_015061	CAGC	2	8	2704238	2704245	25 %	0 %	25 %	50 %	322833170
55012	NC_015061	AC	3	6	2704362	2704367	50 %	0 %	0 %	50 %	322833170
55013	NC_015061	TCA	2	6	2704391	2704396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833170
55014	NC_015061	CCG	2	6	2704397	2704402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833170
55015	NC_015061	ATT	2	6	2704512	2704517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833170
55016	NC_015061	GAA	2	6	2704536	2704541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833170
55017	NC_015061	ATC	2	6	2704573	2704578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833170
55018	NC_015061	GC	4	8	2704596	2704603	0 %	0 %	50 %	50 %	322833170
55019	NC_015061	GCC	2	6	2704627	2704632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833170
55020	NC_015061	GC	3	6	2704638	2704643	0 %	0 %	50 %	50 %	322833170
55021	NC_015061	CCCAG	2	10	2704676	2704685	20 %	0 %	20 %	60 %	322833170
55022	NC_015061	CCA	2	6	2704700	2704705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833170
55023	NC_015061	CAT	2	6	2704758	2704763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833170
55024	NC_015061	ATC	2	6	2704825	2704830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833170
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55026	NC_015061	ATG	2	6	2704891	2704896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833170
55027	NC_015061	CGC	3	9	2704899	2704907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833170
55028	NC_015061	GAA	2	6	2704998	2705003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833170
55029	NC_015061	GCA	2	6	2705033	2705038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833170
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55032	NC_015061	CAGC	2	8	2705229	2705236	25 %	0 %	25 %	50 %	322833170
55033	NC_015061	CAC	2	6	2705271	2705276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833170
55034	NC_015061	ATC	2	6	2705307	2705312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833170
55035	NC_015061	ATC	2	6	2705353	2705358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833170
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55037	NC_015061	CATTC	2	10	2705406	2705415	20 %	40 %	0 %	40 %	322833170
55038	NC_015061	CTT	2	6	2705420	2705425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55039	NC_015061	T	6	6	2705427	2705432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55040	NC_015061	TGT	2	6	2705437	2705442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55041	NC_015061	CTGT	2	8	2705450	2705457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55042	NC_015061	CCA	2	6	2705469	2705474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55043	NC_015061	GAT	2	6	2705504	2705509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55044	NC_015061	GCA	2	6	2705530	2705535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55045	NC_015061	T	6	6	2705548	2705553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55046	NC_015061	TG	3	6	2705570	2705575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55047	NC_015061	TTATT	2	10	2705775	2705784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55048	NC_015061	AGA	2	6	2705855	2705860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55049	NC_015061	T	6	6	2705896	2705901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55050	NC_015061	GAC	2	6	2705927	2705932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833171
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55052	NC_015061	CAGT	2	8	2706183	2706190	25 %	25 %	25 %	25 %	322833171
55053	NC_015061	GCC	2	6	2706210	2706215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833171
55054	NC_015061	CGC	2	6	2706219	2706224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833171
55055	NC_015061	CCTGAA	2	12	2706225	2706236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322833171
55056	NC_015061	TGC	2	6	2706247	2706252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833171
55057	NC_015061	TGCC	2	8	2706268	2706275	0 %	25 %	25 %	50 %	322833171
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55062	NC_015061	TC	3	6	2706385	2706390	0 %	50 %	0 %	50 %	322833171
55063	NC_015061	TCT	2	6	2706393	2706398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833171
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55073	NC_015061	TGAT	2	8	2707159	2707166	25 %	50 %	25 %	0 %	322833171
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55119	NC_015061	CGA	2	6	2709089	2709094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833171
55120	NC_015061	GCA	2	6	2709113	2709118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833171
55121	NC_015061	TGG	2	6	2709154	2709159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833171
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55123	NC_015061	CTG	2	6	2709246	2709251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833171
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55130	NC_015061	ATA	2	6	2709799	2709804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833171
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55135	NC_015061	A	7	7	2709934	2709940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55136	NC_015061	A	6	6	2709946	2709951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55137	NC_015061	CGCA	2	8	2710092	2710099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55138	NC_015061	GCG	2	6	2710148	2710153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55139	NC_015061	CTCG	2	8	2710172	2710179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55140	NC_015061	GC	3	6	2710202	2710207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55141	NC_015061	G	7	7	2710220	2710226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55142	NC_015061	G	6	6	2710231	2710236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55143	NC_015061	CGG	2	6	2710237	2710242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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55208	NC_015061	A	7	7	2713854	2713860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55211	NC_015061	GCCAG	2	10	2713930	2713939	20 %	0 %	40 %	40 %	322833176
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55226	NC_015061	GCATC	2	10	2715013	2715022	20 %	20 %	20 %	40 %	322833177
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55228	NC_015061	ATC	2	6	2715071	2715076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833177
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55231	NC_015061	CCG	2	6	2715326	2715331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55232	NC_015061	A	6	6	2715354	2715359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55233	NC_015061	A	7	7	2715438	2715444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55234	NC_015061	CCG	2	6	2715447	2715452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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55236	NC_015061	GCA	2	6	2715512	2715517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833178
55237	NC_015061	CTG	2	6	2715573	2715578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833178
55238	NC_015061	AGA	2	6	2715648	2715653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833178
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55267	NC_015061	CCTT	2	8	2716929	2716936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55268	NC_015061	TGT	2	6	2716964	2716969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55312	NC_015061	TTTC	2	8	2719408	2719415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55313	NC_015061	AG	3	6	2719451	2719456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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55338	NC_015061	CA	3	6	2720499	2720504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55339	NC_015061	TTATT	2	10	2720546	2720555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55340	NC_015061	GAGT	2	8	2720565	2720572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55341	NC_015061	TGG	2	6	2720583	2720588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833183
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55343	NC_015061	TAT	2	6	2720690	2720695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833183
55344	NC_015061	GTC	2	6	2720724	2720729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833183
55345	NC_015061	CTTCT	2	10	2720730	2720739	0 %	60 %	0 %	40 %	322833183
55346	NC_015061	CT	3	6	2720738	2720743	0 %	50 %	0 %	50 %	322833183
55347	NC_015061	CTG	2	6	2720793	2720798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55348	NC_015061	CAG	2	6	2720917	2720922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833184
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55350	NC_015061	CAAT	2	8	2720946	2720953	50 %	25 %	0 %	25 %	322833184
55351	NC_015061	GGC	2	6	2720963	2720968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833184
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55353	NC_015061	TGG	2	6	2721165	2721170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833185
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55355	NC_015061	GCA	2	6	2721247	2721252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833185
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55474	NC_015061	CCTT	2	8	2727693	2727700	0 %	50 %	0 %	50 %	322833196
55475	NC_015061	A	7	7	2727715	2727721	100 %	0 %	0 %	0 %	322833196
55476	NC_015061	GTG	2	6	2727843	2727848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833196
55477	NC_015061	CTG	2	6	2727864	2727869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833196
55478	NC_015061	AAC	2	6	2727882	2727887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833196
55479	NC_015061	CGT	2	6	2727948	2727953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833196
55480	NC_015061	GGT	2	6	2727974	2727979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833196
55481	NC_015061	GATT	2	8	2728016	2728023	25 %	50 %	25 %	0 %	322833196
55482	NC_015061	ACAG	2	8	2728037	2728044	50 %	0 %	25 %	25 %	322833196
55483	NC_015061	TCGG	2	8	2728131	2728138	0 %	25 %	50 %	25 %	322833196
55484	NC_015061	CA	3	6	2728226	2728231	50 %	0 %	0 %	50 %	322833196
55485	NC_015061	AAT	2	6	2728245	2728250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833196
55486	NC_015061	CCA	2	6	2728264	2728269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833196
55487	NC_015061	CGT	3	9	2728296	2728304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833196
55488	NC_015061	ACC	2	6	2728311	2728316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833196
55489	NC_015061	GCGCCG	2	12	2728357	2728368	0 %	0 %	50 %	50 %	322833196
55490	NC_015061	GTCT	2	8	2728375	2728382	0 %	50 %	25 %	25 %	322833196
55491	NC_015061	GCG	2	6	2728383	2728388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833196
55492	NC_015061	CTGA	2	8	2728434	2728441	25 %	25 %	25 %	25 %	322833196
55493	NC_015061	GAA	2	6	2728451	2728456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833196
55494	NC_015061	TGA	2	6	2728460	2728465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833196
55495	NC_015061	TC	3	6	2728489	2728494	0 %	50 %	0 %	50 %	322833196
55496	NC_015061	GTG	2	6	2728518	2728523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833196
55497	NC_015061	ACA	2	6	2728577	2728582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833196
55498	NC_015061	TTC	2	6	2728587	2728592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833196
55499	NC_015061	TGT	2	6	2728645	2728650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833196
55500	NC_015061	TGC	2	6	2728672	2728677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833196

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