MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_015061	CTT	2	6	2680808	2680813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833149
54503	NC_015061	CGC	2	6	2680823	2680828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833149
54504	NC_015061	ATC	2	6	2680842	2680847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833149
54505	NC_015061	CAG	2	6	2680872	2680877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833149
54506	NC_015061	CAG	2	6	2680917	2680922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833149
54507	NC_015061	ACGC	2	8	2680989	2680996	25 %	0 %	25 %	50 %	322833149
54508	NC_015061	CTG	2	6	2681027	2681032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833149
54509	NC_015061	CGG	2	6	2681042	2681047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833149
54510	NC_015061	TGT	2	6	2681056	2681061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833149
54511	NC_015061	GCG	2	6	2681090	2681095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833149
54512	NC_015061	CAGC	2	8	2681103	2681110	25 %	0 %	25 %	50 %	322833149
54513	NC_015061	GC	3	6	2681122	2681127	0 %	0 %	50 %	50 %	322833149
54514	NC_015061	TGC	2	6	2681144	2681149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833149
54515	NC_015061	GCG	2	6	2681174	2681179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833149
54516	NC_015061	ACA	2	6	2681180	2681185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833149
54517	NC_015061	GCG	2	6	2681192	2681197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833149
54518	NC_015061	CTGG	2	8	2681217	2681224	0 %	25 %	50 %	25 %	322833149
54519	NC_015061	AGA	2	6	2681234	2681239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833149
54520	NC_015061	GCG	2	6	2681261	2681266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833149
54521	NC_015061	GCC	2	6	2681349	2681354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833149
54522	NC_015061	AGA	2	6	2681378	2681383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833149
54523	NC_015061	CGA	2	6	2681447	2681452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833149
54524	NC_015061	ATC	2	6	2681455	2681460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833149
54525	NC_015061	TTG	2	6	2681476	2681481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833149
54526	NC_015061	CTG	2	6	2681520	2681525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833149
54527	NC_015061	T	6	6	2681540	2681545	0 %	100 %	0 %	0 %	322833149
54528	NC_015061	GT	3	6	2681558	2681563	0 %	50 %	50 %	0 %	322833149
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54539	NC_015061	GC	3	6	2682161	2682166	0 %	0 %	50 %	50 %	322833149
54540	NC_015061	GCCA	2	8	2682187	2682194	25 %	0 %	25 %	50 %	322833149
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54545	NC_015061	CG	3	6	2682463	2682468	0 %	0 %	50 %	50 %	322833149
54546	NC_015061	ATA	2	6	2682517	2682522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833149
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54551	NC_015061	TGC	2	6	2682952	2682957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833149
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54553	NC_015061	AGCT	2	8	2683032	2683039	25 %	25 %	25 %	25 %	322833149
54554	NC_015061	CG	3	6	2683173	2683178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54555	NC_015061	TATT	2	8	2683220	2683227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54556	NC_015061	GAAA	2	8	2683304	2683311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54557	NC_015061	CCG	2	6	2683478	2683483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833150
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54561	NC_015061	TCAATC	2	12	2683628	2683639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833150
54562	NC_015061	GCA	2	6	2683718	2683723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833150
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54598	NC_015061	AC	3	6	2685157	2685162	50 %	0 %	0 %	50 %	322833151
54599	NC_015061	ACG	2	6	2685192	2685197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833151
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54603	NC_015061	ACG	2	6	2685276	2685281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833151
54604	NC_015061	ATCA	2	8	2685310	2685317	50 %	25 %	0 %	25 %	322833151
54605	NC_015061	GCG	2	6	2685342	2685347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833151
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54614	NC_015061	CCGC	2	8	2685701	2685708	0 %	0 %	25 %	75 %	322833151
54615	NC_015061	GGC	2	6	2685709	2685714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833151
54616	NC_015061	ATA	2	6	2685722	2685727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833151
54617	NC_015061	CTGA	2	8	2685729	2685736	25 %	25 %	25 %	25 %	322833151
54618	NC_015061	ACC	2	6	2685823	2685828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833151
54619	NC_015061	CGA	2	6	2685847	2685852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833151
54620	NC_015061	GCA	2	6	2685861	2685866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833151
54621	NC_015061	ACC	2	6	2685875	2685880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833151
54622	NC_015061	AGCGC	2	10	2685948	2685957	20 %	0 %	40 %	40 %	322833151
54623	NC_015061	CAGGAT	2	12	2685958	2685969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322833151
54624	NC_015061	CGC	2	6	2685984	2685989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833151
54625	NC_015061	AAT	2	6	2686123	2686128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833151
54626	NC_015061	CGG	2	6	2686131	2686136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833151
54627	NC_015061	CAG	2	6	2686147	2686152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833151
54628	NC_015061	TCA	2	6	2686266	2686271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833152
54629	NC_015061	TTG	2	6	2686309	2686314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833152
54630	NC_015061	CCG	2	6	2686328	2686333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833152
54631	NC_015061	CGC	2	6	2686359	2686364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833152
54632	NC_015061	GC	3	6	2686385	2686390	0 %	0 %	50 %	50 %	322833152
54633	NC_015061	AAC	2	6	2686461	2686466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54634	NC_015061	CGTT	2	8	2686500	2686507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54635	NC_015061	CAA	2	6	2686572	2686577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54636	NC_015061	C	7	7	2686810	2686816	0 %	0 %	0 %	100 %	322833153
54637	NC_015061	T	6	6	2686864	2686869	0 %	100 %	0 %	0 %	322833153
54638	NC_015061	GGAA	2	8	2686877	2686884	50 %	0 %	50 %	0 %	322833153
54639	NC_015061	TTTAC	2	10	2687029	2687038	20 %	60 %	0 %	20 %	322833154
54640	NC_015061	AAC	2	6	2687126	2687131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833154
54641	NC_015061	GATG	2	8	2687251	2687258	25 %	25 %	50 %	0 %	322833154
54642	NC_015061	GCA	2	6	2687313	2687318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54643	NC_015061	CTG	2	6	2687347	2687352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54644	NC_015061	CCA	2	6	2687500	2687505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833155
54645	NC_015061	CCA	2	6	2687524	2687529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833155
54646	NC_015061	CCG	3	9	2687602	2687610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833155
54647	NC_015061	GTTT	2	8	2687619	2687626	0 %	75 %	25 %	0 %	322833155
54648	NC_015061	GC	4	8	2687767	2687774	0 %	0 %	50 %	50 %	322833155
54649	NC_015061	CCA	2	6	2687797	2687802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833155
54650	NC_015061	CAC	2	6	2687810	2687815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833155
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54652	NC_015061	TGGCTT	2	12	2687938	2687949	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322833155
54653	NC_015061	CGT	2	6	2687956	2687961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833155
54654	NC_015061	TGA	2	6	2688015	2688020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833155
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54656	NC_015061	GGT	2	6	2688119	2688124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833155
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54662	NC_015061	TGAACG	2	12	2688404	2688415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322833155
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54674	NC_015061	ACC	2	6	2688909	2688914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833155
54675	NC_015061	CGC	2	6	2688932	2688937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833155
54676	NC_015061	GCC	2	6	2688951	2688956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833155
54677	NC_015061	GGAA	2	8	2688977	2688984	50 %	0 %	50 %	0 %	322833155
54678	NC_015061	TAA	2	6	2689088	2689093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54679	NC_015061	CTCC	2	8	2689115	2689122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54680	NC_015061	CA	3	6	2689181	2689186	50 %	0 %	0 %	50 %	322833156
54681	NC_015061	GCT	2	6	2689236	2689241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833156
54682	NC_015061	TCA	2	6	2689309	2689314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833156
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54684	NC_015061	TCA	2	6	2689403	2689408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833156
54685	NC_015061	GCA	2	6	2689502	2689507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833156
54686	NC_015061	CGTCG	2	10	2689559	2689568	0 %	20 %	40 %	40 %	322833156
54687	NC_015061	TGA	2	6	2689603	2689608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833156
54688	NC_015061	CAG	2	6	2689662	2689667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833156
54689	NC_015061	TTG	2	6	2689717	2689722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833156
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54692	NC_015061	TGA	2	6	2690034	2690039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833157
54693	NC_015061	TCG	2	6	2690129	2690134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833157
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54701	NC_015061	ATTTG	2	10	2690659	2690668	20 %	60 %	20 %	0 %	322833157
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54707	NC_015061	ATG	2	6	2690895	2690900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833158
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54710	NC_015061	CAC	2	6	2690924	2690929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833158
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54715	NC_015061	CGG	2	6	2691062	2691067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833158
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54719	NC_015061	GCGCCA	2	12	2691130	2691141	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322833158
54720	NC_015061	GCC	2	6	2691203	2691208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833158
54721	NC_015061	CAG	2	6	2691233	2691238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833158
54722	NC_015061	GC	4	8	2691290	2691297	0 %	0 %	50 %	50 %	322833158
54723	NC_015061	CCAG	2	8	2691343	2691350	25 %	0 %	25 %	50 %	322833158
54724	NC_015061	TGG	2	6	2691362	2691367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833158
54725	NC_015061	CAG	2	6	2691368	2691373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833158
54726	NC_015061	GCCA	2	8	2691411	2691418	25 %	0 %	25 %	50 %	322833158
54727	NC_015061	AGC	2	6	2691426	2691431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833158
54728	NC_015061	ACCAGC	2	12	2691453	2691464	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322833158
54729	NC_015061	GTG	2	6	2691477	2691482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833158
54730	NC_015061	GCCGG	2	10	2691487	2691496	0 %	0 %	60 %	40 %	322833158
54731	NC_015061	TTCGGC	2	12	2691512	2691523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833158
54732	NC_015061	GTT	2	6	2691538	2691543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833158
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54823	NC_015061	TG	3	6	2695895	2695900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54851	NC_015061	TTTA	2	8	2696811	2696818	25 %	75 %	0 %	0 %	322833163
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54969	NC_015061	CGGTAT	2	12	2702051	2702062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322833168
54970	NC_015061	TGG	2	6	2702093	2702098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833168
54971	NC_015061	T	6	6	2702160	2702165	0 %	100 %	0 %	0 %	322833168
54972	NC_015061	ATC	2	6	2702172	2702177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833168
54973	NC_015061	TGC	2	6	2702192	2702197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833168
54974	NC_015061	CTT	2	6	2702292	2702297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833168
54975	NC_015061	CCA	2	6	2702327	2702332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833168
54976	NC_015061	CTG	2	6	2702343	2702348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833168
54977	NC_015061	CGG	2	6	2702426	2702431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833168
54978	NC_015061	CAGT	2	8	2702435	2702442	25 %	25 %	25 %	25 %	322833168
54979	NC_015061	T	6	6	2702510	2702515	0 %	100 %	0 %	0 %	322833168
54980	NC_015061	TTC	2	6	2702544	2702549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833168
54981	NC_015061	CAC	2	6	2702550	2702555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833168
54982	NC_015061	TGT	2	6	2702597	2702602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833168
54983	NC_015061	CGG	2	6	2702627	2702632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833168
54984	NC_015061	TTGT	2	8	2702658	2702665	0 %	75 %	25 %	0 %	322833168
54985	NC_015061	CAG	2	6	2702696	2702701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833168
54986	NC_015061	GAT	2	6	2702804	2702809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54987	NC_015061	CGT	2	6	2702829	2702834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833169
54988	NC_015061	T	6	6	2702836	2702841	0 %	100 %	0 %	0 %	322833169
54989	NC_015061	GAACAG	2	12	2702891	2702902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322833169
54990	NC_015061	CAGC	2	8	2703088	2703095	25 %	0 %	25 %	50 %	322833169
54991	NC_015061	CGG	2	6	2703097	2703102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833169
54992	NC_015061	GAA	2	6	2703134	2703139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833169
54993	NC_015061	TAA	2	6	2703168	2703173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833169
54994	NC_015061	CTG	2	6	2703245	2703250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833169
54995	NC_015061	GCC	2	6	2703255	2703260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833169
54996	NC_015061	A	6	6	2703302	2703307	100 %	0 %	0 %	0 %	322833169
54997	NC_015061	CAA	2	6	2703442	2703447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833169
54998	NC_015061	CGA	2	6	2703451	2703456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833169
54999	NC_015061	CTG	2	6	2703473	2703478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833169
55000	NC_015061	TGA	2	6	2703508	2703513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833169

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