MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_015061	ATT	2	6	2634588	2634593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53502	NC_015061	CCCG	2	8	2634603	2634610	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53503	NC_015061	CTT	2	6	2634619	2634624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53504	NC_015061	ATTT	2	8	2634667	2634674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53505	NC_015061	AATATC	2	12	2634759	2634770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53506	NC_015061	A	6	6	2634775	2634780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53507	NC_015061	ACA	2	6	2635015	2635020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833109
53508	NC_015061	CTGC	2	8	2635043	2635050	0 %	25 %	25 %	50 %	322833109
53509	NC_015061	GCC	2	6	2635083	2635088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833109
53510	NC_015061	CCG	2	6	2635096	2635101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833109
53511	NC_015061	GAA	3	9	2635118	2635126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833109
53512	NC_015061	CGC	2	6	2635276	2635281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833109
53513	NC_015061	GC	3	6	2635285	2635290	0 %	0 %	50 %	50 %	322833109
53514	NC_015061	CG	3	6	2635347	2635352	0 %	0 %	50 %	50 %	322833109
53515	NC_015061	GTT	2	6	2635423	2635428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833109
53516	NC_015061	CCG	2	6	2635459	2635464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833109
53517	NC_015061	GCTG	2	8	2635473	2635480	0 %	25 %	50 %	25 %	322833109
53518	NC_015061	ACG	2	6	2635524	2635529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833109
53519	NC_015061	CGC	2	6	2635558	2635563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833109
53520	NC_015061	AAG	2	6	2635575	2635580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833109
53521	NC_015061	TTTC	2	8	2635625	2635632	0 %	75 %	0 %	25 %	322833109
53522	NC_015061	ATG	3	9	2635641	2635649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833109
53523	NC_015061	TGA	2	6	2635663	2635668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833109
53524	NC_015061	CCG	2	6	2635675	2635680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833110
53525	NC_015061	CGCTGG	2	12	2635786	2635797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322833110
53526	NC_015061	GCT	2	6	2635904	2635909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833110
53527	NC_015061	GAT	2	6	2635958	2635963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833110
53528	NC_015061	TCA	2	6	2636036	2636041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833110
53529	NC_015061	A	6	6	2636052	2636057	100 %	0 %	0 %	0 %	322833110
53530	NC_015061	CGG	2	6	2636147	2636152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833110
53531	NC_015061	TGA	2	6	2636167	2636172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833110
53532	NC_015061	CGA	2	6	2636213	2636218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833110
53533	NC_015061	ACC	2	6	2636223	2636228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833110
53534	NC_015061	CAG	2	6	2636280	2636285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833110
53535	NC_015061	TTG	2	6	2636301	2636306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833110
53536	NC_015061	GTG	2	6	2636328	2636333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833110
53537	NC_015061	TCG	2	6	2636377	2636382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833110
53538	NC_015061	AAT	2	6	2636409	2636414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833110
53539	NC_015061	GCA	2	6	2636417	2636422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833110
53540	NC_015061	GC	3	6	2636476	2636481	0 %	0 %	50 %	50 %	322833110
53541	NC_015061	CCA	2	6	2636485	2636490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833110
53542	NC_015061	GTGCC	2	10	2636497	2636506	0 %	20 %	40 %	40 %	322833110
53543	NC_015061	CCA	2	6	2636573	2636578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833110
53544	NC_015061	GC	3	6	2636594	2636599	0 %	0 %	50 %	50 %	322833110
53545	NC_015061	CGC	2	6	2636611	2636616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833110
53546	NC_015061	CCG	2	6	2636665	2636670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833110
53547	NC_015061	GCC	2	6	2636714	2636719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833111
53548	NC_015061	GT	3	6	2636790	2636795	0 %	50 %	50 %	0 %	322833111
53549	NC_015061	ATC	2	6	2636978	2636983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833111
53550	NC_015061	CTCA	2	8	2637001	2637008	25 %	25 %	0 %	50 %	322833111
53551	NC_015061	GAA	2	6	2637026	2637031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833111
53552	NC_015061	TCG	2	6	2637033	2637038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833111
53553	NC_015061	CAGA	2	8	2637078	2637085	50 %	0 %	25 %	25 %	322833111
53554	NC_015061	CTG	2	6	2637104	2637109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833111
53555	NC_015061	CGC	2	6	2637127	2637132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833111
53556	NC_015061	CGG	2	6	2637163	2637168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833111
53557	NC_015061	CAGCGC	2	12	2637170	2637181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322833111
53558	NC_015061	CTG	3	9	2637218	2637226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833111
53559	NC_015061	GGT	2	6	2637271	2637276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833111
53560	NC_015061	CTG	2	6	2637281	2637286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833111
53561	NC_015061	ACA	2	6	2637298	2637303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833111
53562	NC_015061	GAT	2	6	2637316	2637321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833111
53563	NC_015061	CGC	2	6	2637468	2637473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833111
53564	NC_015061	CGA	2	6	2637583	2637588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833111
53565	NC_015061	GTC	2	6	2637591	2637596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833111
53566	NC_015061	TGG	2	6	2637597	2637602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833111
53567	NC_015061	TGG	2	6	2637636	2637641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833111
53568	NC_015061	CCG	3	9	2637692	2637700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833111
53569	NC_015061	CCG	2	6	2637702	2637707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833111
53570	NC_015061	CTGC	2	8	2637818	2637825	0 %	25 %	25 %	50 %	322833112
53571	NC_015061	GC	3	6	2637928	2637933	0 %	0 %	50 %	50 %	322833112
53572	NC_015061	TG	3	6	2637965	2637970	0 %	50 %	50 %	0 %	322833112
53573	NC_015061	TGG	2	6	2637977	2637982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833112
53574	NC_015061	CGA	2	6	2638038	2638043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833112
53575	NC_015061	ATG	2	6	2638088	2638093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833112
53576	NC_015061	TTC	2	6	2638176	2638181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833112
53577	NC_015061	ACTG	2	8	2638260	2638267	25 %	25 %	25 %	25 %	322833112
53578	NC_015061	CG	3	6	2638270	2638275	0 %	0 %	50 %	50 %	322833112
53579	NC_015061	ATG	2	6	2638282	2638287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833112
53580	NC_015061	GGC	2	6	2638317	2638322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833112
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53582	NC_015061	GTG	2	6	2638435	2638440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833112
53583	NC_015061	TGCG	2	8	2638481	2638488	0 %	25 %	50 %	25 %	322833112
53584	NC_015061	GCC	2	6	2638516	2638521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833112
53585	NC_015061	ACC	2	6	2638570	2638575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833112
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53587	NC_015061	CGC	2	6	2638634	2638639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833112
53588	NC_015061	GGT	2	6	2638704	2638709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833112
53589	NC_015061	GCT	2	6	2638812	2638817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833112
53590	NC_015061	GCC	3	9	2638819	2638827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833112
53591	NC_015061	CAA	2	6	2638866	2638871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833112
53592	NC_015061	CAG	2	6	2638882	2638887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833112
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53598	NC_015061	A	6	6	2639242	2639247	100 %	0 %	0 %	0 %	322833112
53599	NC_015061	TGG	2	6	2639341	2639346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833113
53600	NC_015061	GTT	2	6	2639375	2639380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833113
53601	NC_015061	GGCG	2	8	2639444	2639451	0 %	0 %	75 %	25 %	322833113
53602	NC_015061	ATC	2	6	2639494	2639499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833113
53603	NC_015061	CCAG	2	8	2639515	2639522	25 %	0 %	25 %	50 %	322833113
53604	NC_015061	GCG	2	6	2639551	2639556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833113
53605	NC_015061	GCT	2	6	2639636	2639641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833113
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53608	NC_015061	GATA	2	8	2639711	2639718	50 %	25 %	25 %	0 %	322833113
53609	NC_015061	CTGG	2	8	2639765	2639772	0 %	25 %	50 %	25 %	322833113
53610	NC_015061	TGC	2	6	2639776	2639781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833113
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53612	NC_015061	AGA	2	6	2639843	2639848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833113
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53614	NC_015061	GCG	2	6	2639883	2639888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833113
53615	NC_015061	GCG	2	6	2639934	2639939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833113
53616	NC_015061	CCGC	2	8	2639974	2639981	0 %	0 %	25 %	75 %	322833113
53617	NC_015061	GCT	2	6	2639990	2639995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833113
53618	NC_015061	CAC	2	6	2640056	2640061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833113
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53621	NC_015061	GTG	2	6	2640183	2640188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833113
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53623	NC_015061	CTG	2	6	2640210	2640215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833113
53624	NC_015061	CTG	2	6	2640222	2640227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833113
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53632	NC_015061	TGA	2	6	2640803	2640808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833114
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53639	NC_015061	T	6	6	2641165	2641170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53640	NC_015061	GAA	2	6	2641174	2641179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53651	NC_015061	CA	3	6	2641844	2641849	50 %	0 %	0 %	50 %	322833115
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53674	NC_015061	AAAC	2	8	2642888	2642895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53675	NC_015061	ACCCC	2	10	2642921	2642930	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
53676	NC_015061	GGGA	2	8	2642948	2642955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53677	NC_015061	CTTCC	2	10	2642975	2642984	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
53678	NC_015061	C	6	6	2643123	2643128	0 %	0 %	0 %	100 %	322833116
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53712	NC_015061	TA	3	6	2644986	2644991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53713	NC_015061	TGAT	2	8	2645069	2645076	25 %	50 %	25 %	0 %	322833118
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53720	NC_015061	A	6	6	2645403	2645408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53721	NC_015061	CCTG	2	8	2645409	2645416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53722	NC_015061	ATT	2	6	2645457	2645462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53723	NC_015061	ATA	2	6	2645466	2645471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53724	NC_015061	ATT	2	6	2645490	2645495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53725	NC_015061	ATG	2	6	2645539	2645544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833119
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53729	NC_015061	TCG	2	6	2645597	2645602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833119
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53734	NC_015061	CTG	2	6	2645833	2645838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833119
53735	NC_015061	GCCGC	2	10	2645896	2645905	0 %	0 %	40 %	60 %	322833119
53736	NC_015061	GCGG	2	8	2645944	2645951	0 %	0 %	75 %	25 %	322833119
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53738	NC_015061	CTG	2	6	2646136	2646141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833119
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53740	NC_015061	TTG	2	6	2646203	2646208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833119
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53747	NC_015061	TGG	2	6	2646395	2646400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833119
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53751	NC_015061	TGC	2	6	2646527	2646532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833119
53752	NC_015061	TGC	2	6	2646536	2646541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833119
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53773	NC_015061	GC	3	6	2647665	2647670	0 %	0 %	50 %	50 %	322833120
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53793	NC_015061	CTG	2	6	2648629	2648634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833121
53794	NC_015061	CGA	2	6	2648652	2648657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833121
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53797	NC_015061	ATTA	2	8	2648863	2648870	50 %	50 %	0 %	0 %	322833121
53798	NC_015061	T	6	6	2648872	2648877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53799	NC_015061	T	7	7	2648973	2648979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53800	NC_015061	GC	3	6	2648984	2648989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53801	NC_015061	TC	3	6	2649057	2649062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53802	NC_015061	TCAG	2	8	2649164	2649171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53803	NC_015061	CCG	2	6	2649208	2649213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53804	NC_015061	GGGA	2	8	2649263	2649270	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53805	NC_015061	TGA	2	6	2649309	2649314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53806	NC_015061	AGCG	2	8	2649324	2649331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53807	NC_015061	GC	3	6	2649334	2649339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53808	NC_015061	GC	4	8	2649366	2649373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53809	NC_015061	GCG	2	6	2649399	2649404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53810	NC_015061	GACCTT	2	12	2649412	2649423	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53811	NC_015061	CCCT	2	8	2649444	2649451	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53812	NC_015061	AAATCA	2	12	2649456	2649467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	322833122
53813	NC_015061	CCTC	2	8	2649468	2649475	0 %	25 %	0 %	75 %	322833122
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53820	NC_015061	GGCG	2	8	2649792	2649799	0 %	0 %	75 %	25 %	322833122
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53823	NC_015061	ATA	2	6	2649911	2649916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833122
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53826	NC_015061	AGAA	2	8	2650000	2650007	75 %	0 %	25 %	0 %	322833122
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53835	NC_015061	GCA	2	6	2650386	2650391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833122
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53842	NC_015061	TGT	2	6	2650795	2650800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833123
53843	NC_015061	GCA	2	6	2650871	2650876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833123
53844	NC_015061	TCA	2	6	2650900	2650905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833123
53845	NC_015061	CTGC	2	8	2650913	2650920	0 %	25 %	25 %	50 %	322833123
53846	NC_015061	AGC	2	6	2650951	2650956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833123
53847	NC_015061	GC	3	6	2651075	2651080	0 %	0 %	50 %	50 %	322833123
53848	NC_015061	GCC	2	6	2651179	2651184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833123
53849	NC_015061	CTT	2	6	2651201	2651206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833123
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53851	NC_015061	TCGG	2	8	2651290	2651297	0 %	25 %	50 %	25 %	322833123
53852	NC_015061	AAT	2	6	2651312	2651317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833123
53853	NC_015061	TTCC	2	8	2651513	2651520	0 %	50 %	0 %	50 %	322833123
53854	NC_015061	GCC	3	9	2651589	2651597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833123
53855	NC_015061	GCATCT	2	12	2651669	2651680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322833123
53856	NC_015061	AT	3	6	2651689	2651694	50 %	50 %	0 %	0 %	322833123
53857	NC_015061	GTCT	2	8	2651715	2651722	0 %	50 %	25 %	25 %	322833123
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53862	NC_015061	TAA	2	6	2652004	2652009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833124
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53953	NC_015061	T	6	6	2655590	2655595	0 %	100 %	0 %	0 %	322833127
53954	NC_015061	TG	3	6	2655619	2655624	0 %	50 %	50 %	0 %	322833127
53955	NC_015061	ACC	2	6	2655650	2655655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833127
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53959	NC_015061	GCG	2	6	2655835	2655840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833127
53960	NC_015061	TGCCG	2	10	2655851	2655860	0 %	20 %	40 %	40 %	322833127
53961	NC_015061	CAA	2	6	2655871	2655876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833127
53962	NC_015061	CA	4	8	2655899	2655906	50 %	0 %	0 %	50 %	322833127
53963	NC_015061	GACG	2	8	2655919	2655926	25 %	0 %	50 %	25 %	322833127
53964	NC_015061	GAC	2	6	2655984	2655989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833127
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53991	NC_015061	CCGG	2	8	2656992	2656999	0 %	0 %	50 %	50 %	322833128
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53993	NC_015061	TGCC	2	8	2657028	2657035	0 %	25 %	25 %	50 %	322833128
53994	NC_015061	TGG	2	6	2657061	2657066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833128
53995	NC_015061	CTGA	2	8	2657110	2657117	25 %	25 %	25 %	25 %	322833128
53996	NC_015061	TTC	2	6	2657269	2657274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833128
53997	NC_015061	GCG	2	6	2657284	2657289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833128
53998	NC_015061	CAG	2	6	2657296	2657301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833128
53999	NC_015061	G	7	7	2657393	2657399	0 %	0 %	100 %	0 %	322833128
54000	NC_015061	GC	3	6	2657414	2657419	0 %	0 %	50 %	50 %	322833128

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