MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_015061	CTG	2	6	2611041	2611046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833094
53002	NC_015061	CG	3	6	2611088	2611093	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53003	NC_015061	GC	3	6	2611114	2611119	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53004	NC_015061	CAA	2	6	2611122	2611127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833094
53005	NC_015061	GAG	2	6	2611138	2611143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322833094
53006	NC_015061	TGC	2	6	2611219	2611224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833094
53007	NC_015061	CGC	2	6	2611305	2611310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833094
53008	NC_015061	GGC	2	6	2611419	2611424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833094
53009	NC_015061	CTC	2	6	2611461	2611466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322833094
53010	NC_015061	GCA	2	6	2611534	2611539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833094
53011	NC_015061	CTGA	2	8	2611608	2611615	25 %	25 %	25 %	25 %	322833094
53012	NC_015061	CCA	2	6	2611620	2611625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833094
53013	NC_015061	TCACC	2	10	2611634	2611643	20 %	20 %	0 %	60 %	322833094
53014	NC_015061	GCAG	2	8	2611648	2611655	25 %	0 %	50 %	25 %	322833094
53015	NC_015061	CCCAG	2	10	2611715	2611724	20 %	0 %	20 %	60 %	322833094
53016	NC_015061	GCAG	2	8	2611730	2611737	25 %	0 %	50 %	25 %	322833094
53017	NC_015061	GGT	2	6	2611752	2611757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833094
53018	NC_015061	GC	3	6	2611800	2611805	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53019	NC_015061	CTT	2	6	2611886	2611891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833094
53020	NC_015061	CG	3	6	2611896	2611901	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53021	NC_015061	AAC	2	6	2611903	2611908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833094
53022	NC_015061	TG	3	6	2611933	2611938	0 %	50 %	50 %	0 %	322833094
53023	NC_015061	CCG	2	6	2612023	2612028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833094
53024	NC_015061	TAA	2	6	2612120	2612125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833094
53025	NC_015061	TGAT	2	8	2612158	2612165	25 %	50 %	25 %	0 %	322833094
53026	NC_015061	GCTG	2	8	2612192	2612199	0 %	25 %	50 %	25 %	322833094
53027	NC_015061	CGG	2	6	2612255	2612260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833094
53028	NC_015061	GCC	2	6	2612284	2612289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833094
53029	NC_015061	CAC	2	6	2612372	2612377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833094
53030	NC_015061	AAT	2	6	2612463	2612468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833094
53031	NC_015061	CCGG	2	8	2612477	2612484	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53032	NC_015061	ACC	2	6	2612515	2612520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833094
53033	NC_015061	CG	3	6	2612613	2612618	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53034	NC_015061	CAC	2	6	2612628	2612633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833094
53035	NC_015061	TCA	2	6	2612693	2612698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833094
53036	NC_015061	ATA	2	6	2612712	2612717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833094
53037	NC_015061	TCAG	2	8	2612722	2612729	25 %	25 %	25 %	25 %	322833094
53038	NC_015061	TCG	2	6	2612773	2612778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833094
53039	NC_015061	AAC	2	6	2612857	2612862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833094
53040	NC_015061	GC	3	6	2612891	2612896	0 %	0 %	50 %	50 %	322833094
53041	NC_015061	GTC	2	6	2612912	2612917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833094
53042	NC_015061	CAC	2	6	2612942	2612947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833094
53043	NC_015061	CGC	2	6	2612996	2613001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833094
53044	NC_015061	CGT	2	6	2613157	2613162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
53045	NC_015061	CGT	2	6	2613175	2613180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
53046	NC_015061	GCG	2	6	2613205	2613210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833095
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53048	NC_015061	CCA	2	6	2613241	2613246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833095
53049	NC_015061	CTG	2	6	2613305	2613310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
53050	NC_015061	AGCC	2	8	2613350	2613357	25 %	0 %	25 %	50 %	322833095
53051	NC_015061	GCC	2	6	2613360	2613365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
53052	NC_015061	CTG	2	6	2613491	2613496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
53053	NC_015061	TCACCA	2	12	2613505	2613516	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322833095
53054	NC_015061	GCT	2	6	2613533	2613538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
53055	NC_015061	ACGG	2	8	2613547	2613554	25 %	0 %	50 %	25 %	322833095
53056	NC_015061	ACC	2	6	2613615	2613620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833095
53057	NC_015061	CAC	2	6	2613671	2613676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833095
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53059	NC_015061	ATCC	2	8	2613710	2613717	25 %	25 %	0 %	50 %	322833095
53060	NC_015061	GCC	2	6	2613842	2613847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
53061	NC_015061	CTTTG	2	10	2613901	2613910	0 %	60 %	20 %	20 %	322833095
53062	NC_015061	ATTTTG	2	12	2613948	2613959	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	322833095
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53066	NC_015061	GGCG	2	8	2614147	2614154	0 %	0 %	75 %	25 %	322833095
53067	NC_015061	CCG	2	6	2614176	2614181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
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53069	NC_015061	CAC	2	6	2614271	2614276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833095
53070	NC_015061	TGC	2	6	2614341	2614346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
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53078	NC_015061	T	7	7	2614900	2614906	0 %	100 %	0 %	0 %	322833095
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53082	NC_015061	CGGA	2	8	2615240	2615247	25 %	0 %	50 %	25 %	322833095
53083	NC_015061	CGG	2	6	2615251	2615256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833095
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53086	NC_015061	CGC	2	6	2615399	2615404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
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53089	NC_015061	C	6	6	2615514	2615519	0 %	0 %	0 %	100 %	322833095
53090	NC_015061	ACC	2	6	2615520	2615525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833095
53091	NC_015061	CGC	2	6	2615561	2615566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
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53108	NC_015061	ACA	2	6	2616383	2616388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833095
53109	NC_015061	CAGTC	2	10	2616456	2616465	20 %	20 %	20 %	40 %	322833095
53110	NC_015061	CGG	2	6	2616466	2616471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833095
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53112	NC_015061	ACC	2	6	2616510	2616515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833095
53113	NC_015061	CG	3	6	2616625	2616630	0 %	0 %	50 %	50 %	322833095
53114	NC_015061	GCTG	2	8	2616673	2616680	0 %	25 %	50 %	25 %	322833095
53115	NC_015061	CCG	2	6	2616765	2616770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
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53117	NC_015061	CTG	3	9	2616827	2616835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833095
53118	NC_015061	CGC	3	9	2616977	2616985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833095
53119	NC_015061	CAT	2	6	2617027	2617032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833095
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53218	NC_015061	CGG	2	6	2621302	2621307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833099
53219	NC_015061	GTGC	2	8	2621327	2621334	0 %	25 %	50 %	25 %	322833099
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53221	NC_015061	GCA	2	6	2621401	2621406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833099
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53223	NC_015061	CTG	2	6	2621504	2621509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833099
53224	NC_015061	CTCA	2	8	2621549	2621556	25 %	25 %	0 %	50 %	322833099
53225	NC_015061	GTT	2	6	2621557	2621562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833099
53226	NC_015061	GCA	2	6	2621620	2621625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833099
53227	NC_015061	GCTG	2	8	2621635	2621642	0 %	25 %	50 %	25 %	322833099
53228	NC_015061	CAG	2	6	2621669	2621674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833099
53229	NC_015061	TTG	2	6	2621675	2621680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833099
53230	NC_015061	GAT	2	6	2621687	2621692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833099
53231	NC_015061	T	7	7	2621698	2621704	0 %	100 %	0 %	0 %	322833099
53232	NC_015061	CAGA	2	8	2621756	2621763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53233	NC_015061	AAG	2	6	2621781	2621786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53234	NC_015061	CG	3	6	2621826	2621831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53235	NC_015061	TGA	2	6	2621835	2621840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53236	NC_015061	TGC	2	6	2621905	2621910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833100
53237	NC_015061	GGC	2	6	2621978	2621983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833100
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53311	NC_015061	A	8	8	2625942	2625949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53312	NC_015061	TTTC	2	8	2625990	2625997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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53340	NC_015061	A	7	7	2627356	2627362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53345	NC_015061	ATTA	2	8	2627470	2627477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53352	NC_015061	CAT	2	6	2627876	2627881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833105
53353	NC_015061	GCCCCA	2	12	2627915	2627926	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322833105
53354	NC_015061	CGC	2	6	2627972	2627977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833105
53355	NC_015061	GCT	2	6	2627978	2627983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833105
53356	NC_015061	GTT	2	6	2627984	2627989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833105
53357	NC_015061	CTG	2	6	2628001	2628006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833105
53358	NC_015061	ACGCG	2	10	2628014	2628023	20 %	0 %	40 %	40 %	322833105
53359	NC_015061	GTC	2	6	2628065	2628070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833105
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53362	NC_015061	GAA	2	6	2628161	2628166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833105
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53364	NC_015061	GCCA	2	8	2628239	2628246	25 %	0 %	25 %	50 %	322833105
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53370	NC_015061	TCT	2	6	2628729	2628734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833105
53371	NC_015061	AATC	2	8	2628751	2628758	50 %	25 %	0 %	25 %	322833105
53372	NC_015061	GC	3	6	2628835	2628840	0 %	0 %	50 %	50 %	322833105
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53378	NC_015061	ATTT	2	8	2628980	2628987	25 %	75 %	0 %	0 %	322833106
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53405	NC_015061	ATTTT	2	10	2630156	2630165	20 %	80 %	0 %	0 %	322833106
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53417	NC_015061	T	7	7	2630541	2630547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53418	NC_015061	A	7	7	2630617	2630623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53419	NC_015061	GTT	2	6	2630630	2630635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53420	NC_015061	TGA	2	6	2630645	2630650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53421	NC_015061	TC	3	6	2630654	2630659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53422	NC_015061	CAT	2	6	2630717	2630722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53445	NC_015061	TTG	2	6	2631823	2631828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53447	NC_015061	TTA	2	6	2631935	2631940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53448	NC_015061	GTTA	2	8	2631973	2631980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53449	NC_015061	GGAC	2	8	2632156	2632163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53450	NC_015061	A	6	6	2632192	2632197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53451	NC_015061	AGA	2	6	2632246	2632251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833108
53452	NC_015061	GAA	2	6	2632334	2632339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833108
53453	NC_015061	GAA	2	6	2632373	2632378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833108
53454	NC_015061	GACA	2	8	2632379	2632386	50 %	0 %	25 %	25 %	322833108
53455	NC_015061	ATT	3	9	2632490	2632498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833108
53456	NC_015061	ATC	2	6	2632523	2632528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833108
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53460	NC_015061	CTG	2	6	2632712	2632717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53461	NC_015061	CTG	2	6	2632739	2632744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53462	NC_015061	TAA	2	6	2632816	2632821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833108
53463	NC_015061	GC	3	6	2632840	2632845	0 %	0 %	50 %	50 %	322833108
53464	NC_015061	AGC	2	6	2632866	2632871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53465	NC_015061	ACC	2	6	2632907	2632912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833108
53466	NC_015061	TGA	3	9	2632953	2632961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833108
53467	NC_015061	TGA	2	6	2632966	2632971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833108
53468	NC_015061	GCC	2	6	2632988	2632993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833108
53469	NC_015061	CAC	2	6	2633006	2633011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833108
53470	NC_015061	CAGC	2	8	2633059	2633066	25 %	0 %	25 %	50 %	322833108
53471	NC_015061	CCA	2	6	2633167	2633172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833108
53472	NC_015061	CTG	2	6	2633186	2633191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53473	NC_015061	CG	3	6	2633192	2633197	0 %	0 %	50 %	50 %	322833108
53474	NC_015061	GAC	2	6	2633231	2633236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53475	NC_015061	CGG	2	6	2633251	2633256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833108
53476	NC_015061	GTG	2	6	2633270	2633275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833108
53477	NC_015061	TGC	2	6	2633433	2633438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53478	NC_015061	GATG	2	8	2633509	2633516	25 %	25 %	50 %	0 %	322833108
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53480	NC_015061	CG	3	6	2633521	2633526	0 %	0 %	50 %	50 %	322833108
53481	NC_015061	GGT	2	6	2633536	2633541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833108
53482	NC_015061	TAC	2	6	2633588	2633593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833108
53483	NC_015061	CAT	2	6	2633654	2633659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833108
53484	NC_015061	GAA	2	6	2633705	2633710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833108
53485	NC_015061	GCT	2	6	2633833	2633838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53486	NC_015061	GGT	2	6	2633842	2633847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833108
53487	NC_015061	TCG	2	6	2634008	2634013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53488	NC_015061	CAAAAT	2	12	2634043	2634054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	322833108
53489	NC_015061	TCAT	2	8	2634062	2634069	25 %	50 %	0 %	25 %	322833108
53490	NC_015061	CGA	2	6	2634172	2634177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833108
53491	NC_015061	AGA	2	6	2634196	2634201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833108
53492	NC_015061	GTT	2	6	2634211	2634216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833108
53493	NC_015061	CT	3	6	2634276	2634281	0 %	50 %	0 %	50 %	322833108
53494	NC_015061	GAT	2	6	2634282	2634287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833108
53495	NC_015061	GAT	2	6	2634314	2634319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53496	NC_015061	TA	3	6	2634334	2634339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53497	NC_015061	CTC	2	6	2634368	2634373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53498	NC_015061	ACCCC	2	10	2634459	2634468	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
53499	NC_015061	AGGGG	2	10	2634484	2634493	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53500	NC_015061	CTGAA	2	10	2634495	2634504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

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