MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015061	TGC	2	6	2541318	2541323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51502	NC_015061	GTG	2	6	2541391	2541396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833022
51503	NC_015061	CTG	2	6	2541490	2541495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51504	NC_015061	A	6	6	2541582	2541587	100 %	0 %	0 %	0 %	322833022
51505	NC_015061	GAA	2	6	2541615	2541620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833022
51506	NC_015061	ATG	2	6	2541638	2541643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833022
51507	NC_015061	CGTC	2	8	2541648	2541655	0 %	25 %	25 %	50 %	322833022
51508	NC_015061	GCCAAA	2	12	2541790	2541801	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322833022
51509	NC_015061	CCG	2	6	2541858	2541863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833022
51510	NC_015061	GGTC	2	8	2541950	2541957	0 %	25 %	50 %	25 %	322833022
51511	NC_015061	CAG	2	6	2541964	2541969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51512	NC_015061	CTG	2	6	2542108	2542113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51513	NC_015061	CAG	2	6	2542116	2542121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51514	NC_015061	GCA	2	6	2542161	2542166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51515	NC_015061	CAG	2	6	2542171	2542176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51516	NC_015061	GCCA	2	8	2542183	2542190	25 %	0 %	25 %	50 %	322833022
51517	NC_015061	AGA	2	6	2542215	2542220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833022
51518	NC_015061	CGC	2	6	2542338	2542343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833023
51519	NC_015061	CTC	2	6	2542362	2542367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322833023
51520	NC_015061	GCT	2	6	2542403	2542408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51521	NC_015061	CAT	2	6	2542479	2542484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833023
51522	NC_015061	CTG	2	6	2542485	2542490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51523	NC_015061	TGG	2	6	2542555	2542560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833023
51524	NC_015061	GCG	2	6	2542581	2542586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833023
51525	NC_015061	CGG	2	6	2542625	2542630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833023
51526	NC_015061	CTG	2	6	2542689	2542694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51527	NC_015061	TCAC	2	8	2542725	2542732	25 %	25 %	0 %	50 %	322833023
51528	NC_015061	TGC	2	6	2542867	2542872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51529	NC_015061	TGC	2	6	2542879	2542884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51530	NC_015061	TGA	2	6	2542891	2542896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833023
51531	NC_015061	TGC	2	6	2542909	2542914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51532	NC_015061	GCC	2	6	2542982	2542987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833023
51533	NC_015061	TGC	2	6	2543032	2543037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51534	NC_015061	CTG	2	6	2543115	2543120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833023
51535	NC_015061	TGC	2	6	2543150	2543155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51536	NC_015061	CAGT	2	8	2543179	2543186	25 %	25 %	25 %	25 %	322833024
51537	NC_015061	GCT	2	6	2543208	2543213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51538	NC_015061	T	6	6	2543216	2543221	0 %	100 %	0 %	0 %	322833024
51539	NC_015061	ATG	2	6	2543257	2543262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833024
51540	NC_015061	CCG	2	6	2543263	2543268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833024
51541	NC_015061	CCAG	2	8	2543273	2543280	25 %	0 %	25 %	50 %	322833024
51542	NC_015061	CAGC	2	8	2543394	2543401	25 %	0 %	25 %	50 %	322833024
51543	NC_015061	CTG	3	9	2543440	2543448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51544	NC_015061	TGC	2	6	2543486	2543491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51545	NC_015061	AC	3	6	2543519	2543524	50 %	0 %	0 %	50 %	322833024
51546	NC_015061	CTG	2	6	2543545	2543550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51547	NC_015061	CTG	3	9	2543590	2543598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51548	NC_015061	ATC	2	6	2543599	2543604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833024
51549	NC_015061	CGG	2	6	2543637	2543642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833024
51550	NC_015061	TGCC	2	8	2543669	2543676	0 %	25 %	25 %	50 %	322833024
51551	NC_015061	TAT	2	6	2543692	2543697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833024
51552	NC_015061	CAA	2	6	2543746	2543751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833024
51553	NC_015061	CCGC	2	8	2543765	2543772	0 %	0 %	25 %	75 %	322833024
51554	NC_015061	GCT	2	6	2543868	2543873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51555	NC_015061	TCGCC	2	10	2543922	2543931	0 %	20 %	20 %	60 %	322833024
51556	NC_015061	TGC	2	6	2543978	2543983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833024
51557	NC_015061	CGC	2	6	2543985	2543990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833024
51558	NC_015061	CAGC	2	8	2544146	2544153	25 %	0 %	25 %	50 %	322833025
51559	NC_015061	CAGC	2	8	2544224	2544231	25 %	0 %	25 %	50 %	322833025
51560	NC_015061	ACG	2	6	2544235	2544240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833025
51561	NC_015061	CGC	3	9	2544247	2544255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833025
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51565	NC_015061	CGG	2	6	2544362	2544367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833025
51566	NC_015061	CGGTG	2	10	2544389	2544398	0 %	20 %	60 %	20 %	322833025
51567	NC_015061	GGCA	2	8	2544437	2544444	25 %	0 %	50 %	25 %	322833025
51568	NC_015061	TG	3	6	2544466	2544471	0 %	50 %	50 %	0 %	322833025
51569	NC_015061	GAA	2	6	2544519	2544524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833025
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51572	NC_015061	CGG	3	9	2544617	2544625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833025
51573	NC_015061	GCG	2	6	2544661	2544666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833025
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51581	NC_015061	GCCT	2	8	2544933	2544940	0 %	25 %	25 %	50 %	322833025
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51587	NC_015061	GC	3	6	2545219	2545224	0 %	0 %	50 %	50 %	322833025
51588	NC_015061	GGC	2	6	2545302	2545307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833025
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51591	NC_015061	AAT	2	6	2545438	2545443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833025
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51599	NC_015061	TGCC	2	8	2545682	2545689	0 %	25 %	25 %	50 %	322833026
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51603	NC_015061	GGTGCT	2	12	2545784	2545795	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322833026
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51613	NC_015061	CGG	2	6	2546306	2546311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833026
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51615	NC_015061	TGG	2	6	2546401	2546406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833026
51616	NC_015061	GGC	2	6	2546454	2546459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833026
51617	NC_015061	CGG	2	6	2546553	2546558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833027
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51708	NC_015061	C	6	6	2551140	2551145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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51733	NC_015061	GCAG	2	8	2552943	2552950	25 %	0 %	50 %	25 %	322833032
51734	NC_015061	CT	3	6	2552959	2552964	0 %	50 %	0 %	50 %	322833032
51735	NC_015061	CTGCC	2	10	2553047	2553056	0 %	20 %	20 %	60 %	322833032
51736	NC_015061	TGC	2	6	2553080	2553085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833032
51737	NC_015061	TGTCT	2	10	2553115	2553124	0 %	60 %	20 %	20 %	322833032
51738	NC_015061	TCT	2	6	2553142	2553147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833032
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51742	NC_015061	GCC	2	6	2553410	2553415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833033
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51750	NC_015061	CTCTG	2	10	2554035	2554044	0 %	40 %	20 %	40 %	322833033
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51753	NC_015061	GAA	2	6	2554177	2554182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51754	NC_015061	CGT	2	6	2554432	2554437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833034
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51766	NC_015061	C	6	6	2555126	2555131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51767	NC_015061	CGCT	2	8	2555204	2555211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51768	NC_015061	CTG	2	6	2555258	2555263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51769	NC_015061	AGC	2	6	2555292	2555297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51770	NC_015061	CGGA	2	8	2555304	2555311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51771	NC_015061	TTA	2	6	2555344	2555349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833035
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51831	NC_015061	G	6	6	2558925	2558930	0 %	0 %	100 %	0 %	322833040
51832	NC_015061	CT	3	6	2558981	2558986	0 %	50 %	0 %	50 %	322833040
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51842	NC_015061	A	6	6	2559217	2559222	100 %	0 %	0 %	0 %	322833040
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51847	NC_015061	CGGTA	2	10	2559717	2559726	20 %	20 %	40 %	20 %	322833041
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51849	NC_015061	CAT	2	6	2559885	2559890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833041
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51853	NC_015061	CGA	2	6	2559955	2559960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833041
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51880	NC_015061	AATA	2	8	2561438	2561445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51913	NC_015061	A	6	6	2562473	2562478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51971	NC_015061	CCT	2	6	2565559	2565564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322833048
51972	NC_015061	CGG	2	6	2565582	2565587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833048
51973	NC_015061	TCA	2	6	2565599	2565604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833048
51974	NC_015061	CT	3	6	2565670	2565675	0 %	50 %	0 %	50 %	322833048
51975	NC_015061	GC	3	6	2565712	2565717	0 %	0 %	50 %	50 %	322833048
51976	NC_015061	GA	3	6	2565896	2565901	50 %	0 %	50 %	0 %	322833048
51977	NC_015061	GCG	2	6	2566005	2566010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833048
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51980	NC_015061	TGC	2	6	2566077	2566082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833048
51981	NC_015061	TTC	2	6	2566230	2566235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833048
51982	NC_015061	GCT	2	6	2566317	2566322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833048
51983	NC_015061	ATT	2	6	2566351	2566356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833048
51984	NC_015061	TTA	2	6	2566428	2566433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833048
51985	NC_015061	GCA	2	6	2566448	2566453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833048
51986	NC_015061	AGC	2	6	2566525	2566530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833048
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51988	NC_015061	ATC	3	9	2566646	2566654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833048
51989	NC_015061	TCT	2	6	2566803	2566808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51990	NC_015061	TGA	2	6	2566818	2566823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51991	NC_015061	CCG	2	6	2567085	2567090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833049
51992	NC_015061	GAAC	2	8	2567125	2567132	50 %	0 %	25 %	25 %	322833049
51993	NC_015061	TGA	2	6	2567153	2567158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833049
51994	NC_015061	AT	3	6	2567221	2567226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51995	NC_015061	AGC	2	6	2567247	2567252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51996	NC_015061	GCCGC	2	10	2567312	2567321	0 %	0 %	40 %	60 %	322833050
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51999	NC_015061	TAC	2	6	2567503	2567508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833050
52000	NC_015061	ACAAA	2	10	2567530	2567539	80 %	0 %	0 %	20 %	322833050

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