MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015061	ATC	2	6	2516744	2516749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833004
51002	NC_015061	CAT	2	6	2516755	2516760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833004
51003	NC_015061	CGA	2	6	2516775	2516780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51004	NC_015061	CGG	2	6	2516934	2516939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51005	NC_015061	CAG	2	6	2516956	2516961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51006	NC_015061	T	6	6	2517084	2517089	0 %	100 %	0 %	0 %	322833004
51007	NC_015061	TGG	2	6	2517102	2517107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833004
51008	NC_015061	GCA	2	6	2517144	2517149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51009	NC_015061	CAG	2	6	2517202	2517207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51010	NC_015061	GAT	2	6	2517280	2517285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833004
51011	NC_015061	GCCA	2	8	2517353	2517360	25 %	0 %	25 %	50 %	322833004
51012	NC_015061	CCG	2	6	2517393	2517398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833004
51013	NC_015061	GTT	2	6	2517459	2517464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833004
51014	NC_015061	AGGT	2	8	2517509	2517516	25 %	25 %	50 %	0 %	322833004
51015	NC_015061	TCA	2	6	2517573	2517578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833004
51016	NC_015061	TCG	2	6	2517584	2517589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51017	NC_015061	GCCA	2	8	2517629	2517636	25 %	0 %	25 %	50 %	322833004
51018	NC_015061	TGCG	2	8	2517659	2517666	0 %	25 %	50 %	25 %	322833004
51019	NC_015061	GCT	2	6	2517682	2517687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51020	NC_015061	CAG	2	6	2517694	2517699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51021	NC_015061	CTGG	2	8	2517829	2517836	0 %	25 %	50 %	25 %	322833004
51022	NC_015061	GGC	2	6	2517971	2517976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51023	NC_015061	GGA	2	6	2518041	2518046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322833004
51024	NC_015061	GCG	2	6	2518116	2518121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51025	NC_015061	CAG	2	6	2518132	2518137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51026	NC_015061	GGCAA	2	10	2518145	2518154	40 %	0 %	40 %	20 %	322833004
51027	NC_015061	CGG	2	6	2518165	2518170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51028	NC_015061	CGG	2	6	2518179	2518184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51029	NC_015061	CAG	2	6	2518210	2518215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51030	NC_015061	GCC	2	6	2518320	2518325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833004
51031	NC_015061	AAC	2	6	2518401	2518406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833004
51032	NC_015061	GCG	2	6	2518453	2518458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51033	NC_015061	TTG	2	6	2518466	2518471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833004
51034	NC_015061	ACC	3	9	2518493	2518501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833004
51035	NC_015061	AGC	2	6	2518508	2518513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51036	NC_015061	CCAG	2	8	2518530	2518537	25 %	0 %	25 %	50 %	322833004
51037	NC_015061	A	6	6	2518569	2518574	100 %	0 %	0 %	0 %	322833004
51038	NC_015061	CAG	2	6	2518582	2518587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
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51040	NC_015061	CCAG	2	8	2518695	2518702	25 %	0 %	25 %	50 %	322833004
51041	NC_015061	CAG	2	6	2518828	2518833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51042	NC_015061	CGT	2	6	2518896	2518901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51043	NC_015061	GATA	2	8	2518944	2518951	50 %	25 %	25 %	0 %	322833004
51044	NC_015061	GGA	2	6	2518954	2518959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322833004
51045	NC_015061	CGA	2	6	2518963	2518968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
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51050	NC_015061	GAT	2	6	2519106	2519111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833004
51051	NC_015061	GGC	2	6	2519128	2519133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833004
51052	NC_015061	GCA	2	6	2519160	2519165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
51053	NC_015061	TG	3	6	2519216	2519221	0 %	50 %	50 %	0 %	322833004
51054	NC_015061	CGC	2	6	2519253	2519258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833004
51055	NC_015061	CATT	2	8	2519328	2519335	25 %	50 %	0 %	25 %	322833004
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51057	NC_015061	CTG	2	6	2519407	2519412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833004
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51074	NC_015061	CCGG	2	8	2520086	2520093	0 %	0 %	50 %	50 %	322833004
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51085	NC_015061	GCA	2	6	2520525	2520530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833004
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51088	NC_015061	CCGG	2	8	2520785	2520792	0 %	0 %	50 %	50 %	322833004
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51097	NC_015061	T	6	6	2521238	2521243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51098	NC_015061	TG	3	6	2521261	2521266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51099	NC_015061	CGG	2	6	2521290	2521295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51100	NC_015061	GGC	2	6	2521350	2521355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51101	NC_015061	AAT	2	6	2521364	2521369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51102	NC_015061	A	7	7	2521410	2521416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51103	NC_015061	GAC	2	6	2521420	2521425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833005
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51116	NC_015061	GAA	2	6	2522008	2522013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833005
51117	NC_015061	CGC	2	6	2522018	2522023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833005
51118	NC_015061	CCGG	2	8	2522077	2522084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51119	NC_015061	TGA	2	6	2522119	2522124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51120	NC_015061	TAT	2	6	2522136	2522141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51121	NC_015061	ATA	2	6	2522238	2522243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51122	NC_015061	TTTA	2	8	2522253	2522260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51123	NC_015061	A	8	8	2522260	2522267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51124	NC_015061	AAG	2	6	2522366	2522371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833006
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51126	NC_015061	TATT	2	8	2522429	2522436	25 %	75 %	0 %	0 %	322833006
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51130	NC_015061	T	6	6	2522550	2522555	0 %	100 %	0 %	0 %	322833006
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51194	NC_015061	A	7	7	2526102	2526108	100 %	0 %	0 %	0 %	322833009
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51221	NC_015061	GTC	2	6	2527457	2527462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833010
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51231	NC_015061	ACC	2	6	2527879	2527884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833011
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51234	NC_015061	GTG	2	6	2528080	2528085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833011
51235	NC_015061	CTGC	2	8	2528108	2528115	0 %	25 %	25 %	50 %	322833011
51236	NC_015061	CGC	2	6	2528147	2528152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833011
51237	NC_015061	GCA	2	6	2528230	2528235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833012
51238	NC_015061	CTG	2	6	2528257	2528262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833012
51239	NC_015061	CTTAC	2	10	2528275	2528284	20 %	40 %	0 %	40 %	322833012
51240	NC_015061	GCT	2	6	2528292	2528297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833012
51241	NC_015061	ATC	2	6	2528317	2528322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833012
51242	NC_015061	TTC	2	6	2528425	2528430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833012
51243	NC_015061	CGG	2	6	2528451	2528456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833012
51244	NC_015061	GGC	2	6	2528469	2528474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833012
51245	NC_015061	GCAC	2	8	2528566	2528573	25 %	0 %	25 %	50 %	322833012
51246	NC_015061	GCTG	2	8	2528588	2528595	0 %	25 %	50 %	25 %	322833012
51247	NC_015061	GTG	2	6	2528598	2528603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833012
51248	NC_015061	CGC	2	6	2528681	2528686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833012
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51250	NC_015061	ACG	2	6	2528750	2528755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833012
51251	NC_015061	CTG	2	6	2528791	2528796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833012
51252	NC_015061	GGA	2	6	2528843	2528848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322833012
51253	NC_015061	GGCA	2	8	2528863	2528870	25 %	0 %	50 %	25 %	322833013
51254	NC_015061	GCG	2	6	2528934	2528939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833013
51255	NC_015061	TGC	2	6	2529010	2529015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833013
51256	NC_015061	CTG	2	6	2529048	2529053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833013
51257	NC_015061	TTAT	2	8	2529058	2529065	25 %	75 %	0 %	0 %	322833013
51258	NC_015061	CGC	2	6	2529109	2529114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833013
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51261	NC_015061	GTG	2	6	2529255	2529260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833013
51262	NC_015061	TGA	2	6	2529304	2529309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833013
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51265	NC_015061	CGC	2	6	2529400	2529405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833013
51266	NC_015061	CTGG	2	8	2529461	2529468	0 %	25 %	50 %	25 %	322833013
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51271	NC_015061	GGT	2	6	2529648	2529653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833014
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51273	NC_015061	CCAG	2	8	2529761	2529768	25 %	0 %	25 %	50 %	322833014
51274	NC_015061	CGT	2	6	2529844	2529849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833014
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51278	NC_015061	CAGGGC	2	12	2530108	2530119	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322833014
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51281	NC_015061	AGA	2	6	2530217	2530222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51282	NC_015061	TGGG	2	8	2530277	2530284	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51283	NC_015061	CTAAGC	2	12	2530300	2530311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51284	NC_015061	TCT	2	6	2530349	2530354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322833015
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51292	NC_015061	AAC	2	6	2530878	2530883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833015
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51294	NC_015061	AAT	2	6	2531027	2531032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51295	NC_015061	CCA	2	6	2531057	2531062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51296	NC_015061	AAAC	2	8	2531070	2531077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51297	NC_015061	AACA	2	8	2531078	2531085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51298	NC_015061	GCG	2	6	2531156	2531161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833016
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51326	NC_015061	ATC	2	6	2532613	2532618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51327	NC_015061	GAAG	2	8	2532707	2532714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51328	NC_015061	T	8	8	2532735	2532742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51329	NC_015061	GTTG	2	8	2532845	2532852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51330	NC_015061	TCA	2	6	2532999	2533004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51331	NC_015061	T	6	6	2533024	2533029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51332	NC_015061	TAA	2	6	2533131	2533136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51333	NC_015061	TAT	2	6	2533356	2533361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51334	NC_015061	TAA	2	6	2533389	2533394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51335	NC_015061	ATG	2	6	2533511	2533516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51336	NC_015061	A	7	7	2533545	2533551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51337	NC_015061	TAT	2	6	2533672	2533677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833018
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51341	NC_015061	CAA	2	6	2533834	2533839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322833018
51342	NC_015061	TTG	2	6	2533875	2533880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322833018
51343	NC_015061	CT	3	6	2534007	2534012	0 %	50 %	0 %	50 %	322833018
51344	NC_015061	AC	3	6	2534064	2534069	50 %	0 %	0 %	50 %	322833018
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51348	NC_015061	GC	3	6	2534238	2534243	0 %	0 %	50 %	50 %	322833018
51349	NC_015061	CGC	2	6	2534337	2534342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833018
51350	NC_015061	GGT	2	6	2534365	2534370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833018
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51352	NC_015061	GAA	2	6	2534450	2534455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833018
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51432	NC_015061	TTAA	2	8	2537876	2537883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51433	NC_015061	ATTT	2	8	2537922	2537929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51434	NC_015061	GTT	2	6	2537975	2537980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51435	NC_015061	ATG	2	6	2538022	2538027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51436	NC_015061	A	6	6	2538058	2538063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51437	NC_015061	ATT	2	6	2538139	2538144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51438	NC_015061	ATAA	3	12	2538148	2538159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51439	NC_015061	GAAA	2	8	2538294	2538301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51440	NC_015061	A	7	7	2538441	2538447	100 %	0 %	0 %	0 %	322833020
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51442	NC_015061	TGG	2	6	2538476	2538481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833020
51443	NC_015061	CTG	2	6	2538493	2538498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833020
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51453	NC_015061	CCG	2	6	2539028	2539033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833020
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51457	NC_015061	CTG	3	9	2539294	2539302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833020
51458	NC_015061	TG	3	6	2539308	2539313	0 %	50 %	50 %	0 %	322833020
51459	NC_015061	GCT	2	6	2539320	2539325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833020
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51463	NC_015061	CTGG	2	8	2539515	2539522	0 %	25 %	50 %	25 %	322833020
51464	NC_015061	AAG	2	6	2539526	2539531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322833020
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51468	NC_015061	CTG	2	6	2539597	2539602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833020
51469	NC_015061	ACC	2	6	2539633	2539638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833020
51470	NC_015061	GCG	2	6	2539666	2539671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833020
51471	NC_015061	TGA	2	6	2539706	2539711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833020
51472	NC_015061	ATC	2	6	2539738	2539743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833020
51473	NC_015061	TTA	2	6	2539773	2539778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322833020
51474	NC_015061	CCAA	2	8	2539795	2539802	50 %	0 %	0 %	50 %	322833020
51475	NC_015061	CGG	2	6	2539845	2539850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833020
51476	NC_015061	ATG	2	6	2539852	2539857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833020
51477	NC_015061	TGA	2	6	2539891	2539896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833020
51478	NC_015061	CCT	2	6	2539934	2539939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51479	NC_015061	AAT	2	6	2539973	2539978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322833021
51480	NC_015061	TCA	2	6	2540002	2540007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322833021
51481	NC_015061	CCA	2	6	2540060	2540065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833021
51482	NC_015061	GAAAC	2	10	2540205	2540214	60 %	0 %	20 %	20 %	322833021
51483	NC_015061	CGC	2	6	2540259	2540264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833021
51484	NC_015061	GC	3	6	2540435	2540440	0 %	0 %	50 %	50 %	322833021
51485	NC_015061	CCG	2	6	2540441	2540446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322833021
51486	NC_015061	GCA	2	6	2540456	2540461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833021
51487	NC_015061	CG	3	6	2540524	2540529	0 %	0 %	50 %	50 %	322833021
51488	NC_015061	CTTTT	2	10	2540653	2540662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51489	NC_015061	TA	3	6	2540695	2540700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51490	NC_015061	AT	3	6	2540703	2540708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51491	NC_015061	GGC	2	6	2540785	2540790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322833022
51492	NC_015061	GAC	2	6	2540862	2540867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51493	NC_015061	GCT	2	6	2540872	2540877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51494	NC_015061	CAGC	2	8	2540902	2540909	25 %	0 %	25 %	50 %	322833022
51495	NC_015061	TGG	2	6	2540957	2540962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322833022
51496	NC_015061	TGC	2	6	2540984	2540989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833022
51497	NC_015061	GAT	2	6	2541043	2541048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322833022
51498	NC_015061	ACC	2	6	2541049	2541054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833022
51499	NC_015061	CAC	2	6	2541231	2541236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322833022
51500	NC_015061	GCT	2	6	2541249	2541254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322833022

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