MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_014834	GCC	2	6	1196595	1196600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31002	NC_014834	CGA	2	6	1196623	1196628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31003	NC_014834	CGC	2	6	1196635	1196640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31004	NC_014834	ACG	2	6	1196691	1196696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31005	NC_014834	GGTGCG	2	12	1196716	1196727	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	316932500
31006	NC_014834	CGA	2	6	1196761	1196766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31007	NC_014834	GCC	2	6	1196785	1196790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31008	NC_014834	CTG	2	6	1196798	1196803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31009	NC_014834	GC	3	6	1196848	1196853	0 %	0 %	50 %	50 %	316932500
31010	NC_014834	CTT	2	6	1196863	1196868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932500
31011	NC_014834	CTGCG	2	10	1196886	1196895	0 %	20 %	40 %	40 %	316932500
31012	NC_014834	CGC	2	6	1196914	1196919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31013	NC_014834	GCAGGC	2	12	1196953	1196964	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316932500
31014	NC_014834	GCG	2	6	1196981	1196986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31015	NC_014834	TG	3	6	1197005	1197010	0 %	50 %	50 %	0 %	316932500
31016	NC_014834	GATG	2	8	1197067	1197074	25 %	25 %	50 %	0 %	316932500
31017	NC_014834	GCC	2	6	1197122	1197127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31018	NC_014834	CGA	2	6	1197142	1197147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31019	NC_014834	GAG	2	6	1197212	1197217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932500
31020	NC_014834	CTG	2	6	1197218	1197223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31021	NC_014834	TGT	2	6	1197294	1197299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932500
31022	NC_014834	GCA	2	6	1197313	1197318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31023	NC_014834	GGCG	2	8	1197457	1197464	0 %	0 %	75 %	25 %	316932500
31024	NC_014834	TCT	2	6	1197612	1197617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932500
31025	NC_014834	TCC	2	6	1197622	1197627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932500
31026	NC_014834	TGA	2	6	1197672	1197677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932500
31027	NC_014834	TGG	3	9	1197684	1197692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932500
31028	NC_014834	TCG	2	6	1197696	1197701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31029	NC_014834	GCG	2	6	1197766	1197771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31030	NC_014834	CCG	2	6	1197787	1197792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31031	NC_014834	GCG	2	6	1197833	1197838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31032	NC_014834	GC	3	6	1197860	1197865	0 %	0 %	50 %	50 %	316932500
31033	NC_014834	GTG	2	6	1197872	1197877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932500
31034	NC_014834	CTG	2	6	1197878	1197883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31035	NC_014834	CGG	2	6	1197885	1197890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31036	NC_014834	CGA	2	6	1197892	1197897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31037	NC_014834	GGC	3	9	1197907	1197915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31038	NC_014834	GCC	2	6	1197919	1197924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31039	NC_014834	GCG	3	9	1197941	1197949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31040	NC_014834	GC	3	6	1197959	1197964	0 %	0 %	50 %	50 %	316932500
31041	NC_014834	GGCACC	2	12	1197992	1198003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316932500
31042	NC_014834	CAA	2	6	1198084	1198089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932500
31043	NC_014834	CG	3	6	1198118	1198123	0 %	0 %	50 %	50 %	316932500
31044	NC_014834	GCT	2	6	1198234	1198239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31045	NC_014834	CGC	2	6	1198266	1198271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31046	NC_014834	CTCGG	2	10	1198283	1198292	0 %	20 %	40 %	40 %	316932500
31047	NC_014834	CGA	2	6	1198293	1198298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31048	NC_014834	GCC	2	6	1198328	1198333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31049	NC_014834	CTG	2	6	1198346	1198351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31050	NC_014834	CGA	2	6	1198381	1198386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31051	NC_014834	CTG	2	6	1198400	1198405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31052	NC_014834	CGCGG	2	10	1198471	1198480	0 %	0 %	60 %	40 %	316932500
31053	NC_014834	AGC	2	6	1198483	1198488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31054	NC_014834	GGC	2	6	1198489	1198494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31055	NC_014834	CCG	2	6	1198495	1198500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932500
31056	NC_014834	CAA	3	9	1198511	1198519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932500
31057	NC_014834	CAA	2	6	1198600	1198605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932500
31058	NC_014834	CGAT	2	8	1198641	1198648	25 %	25 %	25 %	25 %	316932500
31059	NC_014834	GTC	2	6	1198657	1198662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31060	NC_014834	GAC	2	6	1198688	1198693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932500
31061	NC_014834	CGG	2	6	1198710	1198715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31062	NC_014834	GCCG	2	8	1198753	1198760	0 %	0 %	50 %	50 %	316932500
31063	NC_014834	TCGCCA	2	12	1198803	1198814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316932500
31064	NC_014834	CAT	2	6	1198819	1198824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932500
31065	NC_014834	GGC	2	6	1198825	1198830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31066	NC_014834	GGC	2	6	1198835	1198840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31067	NC_014834	GCG	2	6	1198875	1198880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932500
31068	NC_014834	CG	3	6	1198934	1198939	0 %	0 %	50 %	50 %	316932501
31069	NC_014834	TGG	2	6	1198943	1198948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932501
31070	NC_014834	CGA	3	9	1198950	1198958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932501
31071	NC_014834	GGCC	2	8	1198982	1198989	0 %	0 %	50 %	50 %	316932501
31072	NC_014834	CGC	2	6	1199052	1199057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932501
31073	NC_014834	TGC	2	6	1199075	1199080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932501
31074	NC_014834	CGATGG	2	12	1199097	1199108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316932501
31075	NC_014834	CAT	2	6	1199151	1199156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932501
31076	NC_014834	GC	3	6	1199167	1199172	0 %	0 %	50 %	50 %	316932501
31077	NC_014834	CGA	2	6	1199214	1199219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932501
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31079	NC_014834	GC	3	6	1199265	1199270	0 %	0 %	50 %	50 %	316932501
31080	NC_014834	GCG	2	6	1199289	1199294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932501
31081	NC_014834	CGT	2	6	1199355	1199360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932501
31082	NC_014834	AGTTGA	2	12	1199375	1199386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932501
31083	NC_014834	GCT	2	6	1199403	1199408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932501
31084	NC_014834	GCCG	2	8	1199428	1199435	0 %	0 %	50 %	50 %	316932501
31085	NC_014834	CGG	2	6	1199462	1199467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932501
31086	NC_014834	AGA	2	6	1199531	1199536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932501
31087	NC_014834	CGA	2	6	1199550	1199555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932501
31088	NC_014834	ATC	2	6	1199563	1199568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932501
31089	NC_014834	CGA	3	9	1199604	1199612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932501
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31091	NC_014834	CTT	2	6	1199762	1199767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932502
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31093	NC_014834	CGGC	2	8	1199908	1199915	0 %	0 %	50 %	50 %	316932502
31094	NC_014834	GC	3	6	1199917	1199922	0 %	0 %	50 %	50 %	316932502
31095	NC_014834	GGC	2	6	1199933	1199938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932502
31096	NC_014834	CAC	2	6	1199972	1199977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932502
31097	NC_014834	GC	3	6	1200048	1200053	0 %	0 %	50 %	50 %	316932502
31098	NC_014834	TGG	2	6	1200054	1200059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932502
31099	NC_014834	GCG	2	6	1200070	1200075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932502
31100	NC_014834	CAG	2	6	1200077	1200082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932502
31101	NC_014834	CGG	2	6	1200139	1200144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932502
31102	NC_014834	ACG	2	6	1200156	1200161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932502
31103	NC_014834	GTG	2	6	1200180	1200185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932502
31104	NC_014834	CCGATC	2	12	1200186	1200197	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316932502
31105	NC_014834	CGG	2	6	1200211	1200216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932502
31106	NC_014834	GTCG	2	8	1200257	1200264	0 %	25 %	50 %	25 %	316932502
31107	NC_014834	CCG	2	6	1200265	1200270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932502
31108	NC_014834	GC	3	6	1200280	1200285	0 %	0 %	50 %	50 %	316932502
31109	NC_014834	TCG	2	6	1200315	1200320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932502
31110	NC_014834	CGG	2	6	1200331	1200336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932502
31111	NC_014834	GCC	2	6	1200350	1200355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932502
31112	NC_014834	TTC	2	6	1200444	1200449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932502
31113	NC_014834	GCG	2	6	1200573	1200578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31114	NC_014834	GAA	2	6	1200677	1200682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932503
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31116	NC_014834	CG	3	6	1200730	1200735	0 %	0 %	50 %	50 %	316932503
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31230	NC_014834	GC	3	6	1204289	1204294	0 %	0 %	50 %	50 %	316932504
31231	NC_014834	GTC	3	9	1204382	1204390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932504
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31233	NC_014834	GC	3	6	1204405	1204410	0 %	0 %	50 %	50 %	316932504
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31328	NC_014834	GTC	2	6	1207853	1207858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932507
31329	NC_014834	CG	3	6	1207924	1207929	0 %	0 %	50 %	50 %	316932507
31330	NC_014834	GCGCTC	2	12	1207946	1207957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316932507
31331	NC_014834	CGTG	2	8	1208026	1208033	0 %	25 %	50 %	25 %	316932507
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31334	NC_014834	GC	3	6	1208113	1208118	0 %	0 %	50 %	50 %	316932507
31335	NC_014834	TCG	2	6	1208127	1208132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932507
31336	NC_014834	AGC	2	6	1208133	1208138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932507
31337	NC_014834	GCGCCA	2	12	1208167	1208178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316932507
31338	NC_014834	GCT	2	6	1208182	1208187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932507
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31341	NC_014834	AGC	2	6	1208250	1208255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932507
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31343	NC_014834	GCCG	2	8	1208299	1208306	0 %	0 %	50 %	50 %	316932507
31344	NC_014834	AGC	2	6	1208307	1208312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932507
31345	NC_014834	CGC	2	6	1208395	1208400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932507
31346	NC_014834	GGC	2	6	1208428	1208433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932507
31347	NC_014834	AGC	2	6	1208475	1208480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932507
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31349	NC_014834	CGA	2	6	1208527	1208532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932507
31350	NC_014834	GC	3	6	1208535	1208540	0 %	0 %	50 %	50 %	316932507
31351	NC_014834	TTCC	2	8	1208588	1208595	0 %	50 %	0 %	50 %	316932507
31352	NC_014834	CAC	2	6	1208713	1208718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932508
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31354	NC_014834	GCA	2	6	1208877	1208882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932508
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31357	NC_014834	GCA	2	6	1209060	1209065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932508
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31360	NC_014834	AGC	2	6	1209110	1209115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932508
31361	NC_014834	CGGC	2	8	1209123	1209130	0 %	0 %	50 %	50 %	316932508
31362	NC_014834	GCA	2	6	1209303	1209308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932508
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31367	NC_014834	GCCG	2	8	1209483	1209490	0 %	0 %	50 %	50 %	316932509
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31465	NC_014834	CG	3	6	1213281	1213286	0 %	0 %	50 %	50 %	316932510
31466	NC_014834	TGC	2	6	1213287	1213292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932510
31467	NC_014834	GGCG	2	8	1213293	1213300	0 %	0 %	75 %	25 %	316932510
31468	NC_014834	TGAG	2	8	1213331	1213338	25 %	25 %	50 %	0 %	316932510
31469	NC_014834	CAT	2	6	1213361	1213366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932511
31470	NC_014834	CTT	2	6	1213378	1213383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932511
31471	NC_014834	GCA	2	6	1213396	1213401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31472	NC_014834	ATC	2	6	1213419	1213424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932511
31473	NC_014834	GGT	2	6	1213430	1213435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932511
31474	NC_014834	GGC	3	9	1213463	1213471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932511
31475	NC_014834	CGT	2	6	1213483	1213488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31476	NC_014834	GCG	2	6	1213490	1213495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932511
31477	NC_014834	GAT	2	6	1213571	1213576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932511
31478	NC_014834	TCG	2	6	1213645	1213650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31479	NC_014834	TGT	2	6	1213663	1213668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932511
31480	NC_014834	AGC	2	6	1213680	1213685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31481	NC_014834	CCGA	2	8	1213692	1213699	25 %	0 %	25 %	50 %	316932511
31482	NC_014834	GCCG	2	8	1213736	1213743	0 %	0 %	50 %	50 %	316932511
31483	NC_014834	GC	4	8	1213764	1213771	0 %	0 %	50 %	50 %	316932511
31484	NC_014834	GGC	3	9	1213823	1213831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932511
31485	NC_014834	GCA	2	6	1213855	1213860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31486	NC_014834	CGAGG	2	10	1213892	1213901	20 %	0 %	60 %	20 %	316932511
31487	NC_014834	CG	3	6	1213909	1213914	0 %	0 %	50 %	50 %	316932511
31488	NC_014834	GTC	2	6	1213934	1213939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31489	NC_014834	GCT	2	6	1213940	1213945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31490	NC_014834	CAG	2	6	1213970	1213975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31491	NC_014834	CG	4	8	1213991	1213998	0 %	0 %	50 %	50 %	316932511
31492	NC_014834	TCGG	2	8	1214109	1214116	0 %	25 %	50 %	25 %	316932511
31493	NC_014834	TCG	2	6	1214121	1214126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932511
31494	NC_014834	GCG	2	6	1214127	1214132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932511
31495	NC_014834	GGTA	2	8	1214154	1214161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31496	NC_014834	GCA	2	6	1214287	1214292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31497	NC_014834	CGAA	2	8	1214349	1214356	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31498	NC_014834	ATG	2	6	1214392	1214397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31499	NC_014834	GCT	2	6	1214433	1214438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31500	NC_014834	CCG	2	6	1214443	1214448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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