MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_014834	GGT	2	6	1120474	1120479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29002	NC_014834	CG	4	8	1120523	1120530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29003	NC_014834	GC	3	6	1120699	1120704	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29004	NC_014834	CGG	2	6	1120730	1120735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29005	NC_014834	CCG	2	6	1120751	1120756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29006	NC_014834	GCC	2	6	1120792	1120797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29007	NC_014834	CG	3	6	1120817	1120822	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29008	NC_014834	GCG	2	6	1120835	1120840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29009	NC_014834	CGCGG	2	10	1120924	1120933	0 %	0 %	60 %	40 %	316932431
29010	NC_014834	CTT	2	6	1120992	1120997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932431
29011	NC_014834	GCC	2	6	1121008	1121013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29012	NC_014834	GC	3	6	1121057	1121062	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29013	NC_014834	CG	3	6	1121072	1121077	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29014	NC_014834	CAT	2	6	1121106	1121111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29015	NC_014834	CCGA	2	8	1121164	1121171	25 %	0 %	25 %	50 %	316932431
29016	NC_014834	CTCG	2	8	1121178	1121185	0 %	25 %	25 %	50 %	316932431
29017	NC_014834	CTA	2	6	1121343	1121348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29018	NC_014834	GAC	2	6	1121437	1121442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29019	NC_014834	GC	3	6	1121450	1121455	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29020	NC_014834	GGC	2	6	1121577	1121582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29021	NC_014834	GCG	2	6	1121702	1121707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29022	NC_014834	TGA	4	12	1121729	1121740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932431
29023	NC_014834	CG	3	6	1121785	1121790	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29024	NC_014834	GCC	2	6	1121858	1121863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29025	NC_014834	GC	3	6	1121902	1121907	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29026	NC_014834	GAC	2	6	1121923	1121928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29027	NC_014834	GGC	2	6	1121993	1121998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29028	NC_014834	TGC	2	6	1122014	1122019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29029	NC_014834	CGA	2	6	1122051	1122056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29030	NC_014834	GCCA	2	8	1122079	1122086	25 %	0 %	25 %	50 %	316932431
29031	NC_014834	GAAG	2	8	1122135	1122142	50 %	0 %	50 %	0 %	316932431
29032	NC_014834	GCT	2	6	1122174	1122179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29033	NC_014834	GCA	2	6	1122186	1122191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29034	NC_014834	CTG	2	6	1122226	1122231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29035	NC_014834	CGC	2	6	1122284	1122289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29036	NC_014834	GCT	2	6	1122315	1122320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29037	NC_014834	CGAT	2	8	1122365	1122372	25 %	25 %	25 %	25 %	316932431
29038	NC_014834	GAA	2	6	1122382	1122387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932431
29039	NC_014834	TGA	2	6	1122392	1122397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932431
29040	NC_014834	ATC	2	6	1122409	1122414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29041	NC_014834	ACC	2	6	1122565	1122570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932431
29042	NC_014834	CGA	2	6	1122612	1122617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29043	NC_014834	CAT	3	9	1122660	1122668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29044	NC_014834	CGC	2	6	1122681	1122686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29045	NC_014834	GCT	2	6	1122714	1122719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29046	NC_014834	CAT	3	9	1122736	1122744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29047	NC_014834	TCGG	2	8	1122769	1122776	0 %	25 %	50 %	25 %	316932431
29048	NC_014834	CG	3	6	1122800	1122805	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29049	NC_014834	GCCT	2	8	1122820	1122827	0 %	25 %	25 %	50 %	316932431
29050	NC_014834	CAT	2	6	1122876	1122881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29051	NC_014834	CGA	2	6	1122912	1122917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29052	NC_014834	GCG	2	6	1123010	1123015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29053	NC_014834	CGG	2	6	1123185	1123190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29054	NC_014834	CGG	2	6	1123232	1123237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29055	NC_014834	GCA	2	6	1123254	1123259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29056	NC_014834	GCT	2	6	1123305	1123310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29057	NC_014834	CAG	2	6	1123318	1123323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29058	NC_014834	GCT	2	6	1123329	1123334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29059	NC_014834	GCC	2	6	1123414	1123419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29060	NC_014834	CG	3	6	1123469	1123474	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29061	NC_014834	CAC	2	6	1123482	1123487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932431
29062	NC_014834	CGG	2	6	1123512	1123517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29063	NC_014834	GCG	2	6	1123538	1123543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
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29067	NC_014834	CGC	4	12	1123778	1123789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
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29069	NC_014834	GAA	2	6	1123839	1123844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932431
29070	NC_014834	CGG	2	6	1123907	1123912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29071	NC_014834	GC	4	8	1123924	1123931	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29072	NC_014834	GGC	2	6	1123960	1123965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29073	NC_014834	CGC	2	6	1123976	1123981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
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29077	NC_014834	CGA	2	6	1124139	1124144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29078	NC_014834	CGGC	2	8	1124174	1124181	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29079	NC_014834	CAT	2	6	1124184	1124189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
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29082	NC_014834	TCT	2	6	1124294	1124299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932431
29083	NC_014834	TCG	2	6	1124300	1124305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29084	NC_014834	GAA	2	6	1124308	1124313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932431
29085	NC_014834	TGG	2	6	1124396	1124401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932431
29086	NC_014834	TTC	2	6	1124440	1124445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932431
29087	NC_014834	ATC	3	9	1124495	1124503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29088	NC_014834	GGC	2	6	1124544	1124549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29089	NC_014834	TCGAGA	2	12	1124576	1124587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316932431
29090	NC_014834	CAA	2	6	1124589	1124594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932431
29091	NC_014834	ACCG	2	8	1124596	1124603	25 %	0 %	25 %	50 %	316932431
29092	NC_014834	CGGC	2	8	1124606	1124613	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29093	NC_014834	CTGG	2	8	1124718	1124725	0 %	25 %	50 %	25 %	316932431
29094	NC_014834	CG	3	6	1124726	1124731	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29095	NC_014834	CGAAGG	2	12	1124748	1124759	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	316932431
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29097	NC_014834	ATC	2	6	1124797	1124802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29098	NC_014834	GCC	2	6	1124808	1124813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29099	NC_014834	ATC	2	6	1124845	1124850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932431
29100	NC_014834	GGT	2	6	1124949	1124954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932431
29101	NC_014834	TGC	2	6	1124974	1124979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29102	NC_014834	CGG	2	6	1124991	1124996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29103	NC_014834	TCG	2	6	1124999	1125004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29104	NC_014834	CGGC	2	8	1125035	1125042	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29105	NC_014834	GCG	2	6	1125050	1125055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932431
29106	NC_014834	TCGAGC	2	12	1125113	1125124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316932431
29107	NC_014834	GAT	2	6	1125141	1125146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932431
29108	NC_014834	CGCCA	2	10	1125256	1125265	20 %	0 %	20 %	60 %	316932431
29109	NC_014834	GC	3	6	1125282	1125287	0 %	0 %	50 %	50 %	316932431
29110	NC_014834	CGC	2	6	1125355	1125360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29111	NC_014834	CGC	2	6	1125384	1125389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932431
29112	NC_014834	GAG	2	6	1125391	1125396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932431
29113	NC_014834	CG	3	6	1125446	1125451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29114	NC_014834	GC	3	6	1125458	1125463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29115	NC_014834	CG	3	6	1125484	1125489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29116	NC_014834	GAG	2	6	1125530	1125535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29238	NC_014834	GAG	2	6	1130134	1130139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29239	NC_014834	GGA	2	6	1130153	1130158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29240	NC_014834	CCT	2	6	1130242	1130247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29241	NC_014834	GTTG	2	8	1130271	1130278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29242	NC_014834	GAA	2	6	1130300	1130305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932435
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29246	NC_014834	CGG	3	9	1130351	1130359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932435
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29333	NC_014834	A	6	6	1133019	1133024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29334	NC_014834	CGG	2	6	1133037	1133042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29335	NC_014834	CG	4	8	1133079	1133086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29336	NC_014834	ACC	2	6	1133090	1133095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29337	NC_014834	TTTCGA	2	12	1133117	1133128	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29338	NC_014834	GGC	3	9	1133129	1133137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29339	NC_014834	AAT	2	6	1133141	1133146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29340	NC_014834	GCG	2	6	1133150	1133155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29341	NC_014834	GA	3	6	1133188	1133193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29342	NC_014834	GCCG	2	8	1133203	1133210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29343	NC_014834	AGC	2	6	1133237	1133242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29344	NC_014834	GC	3	6	1133298	1133303	0 %	0 %	50 %	50 %	316932437
29345	NC_014834	TGC	2	6	1133343	1133348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932437
29346	NC_014834	GCT	2	6	1133397	1133402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932437
29347	NC_014834	GCC	2	6	1133470	1133475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932437
29348	NC_014834	GCCG	2	8	1133584	1133591	0 %	0 %	50 %	50 %	316932437
29349	NC_014834	CAG	2	6	1133596	1133601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932437
29350	NC_014834	CTG	2	6	1133659	1133664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932437
29351	NC_014834	GCG	3	9	1133686	1133694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932437
29352	NC_014834	CGC	2	6	1133751	1133756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932437
29353	NC_014834	CTT	2	6	1133770	1133775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932437
29354	NC_014834	GTT	2	6	1133779	1133784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932437
29355	NC_014834	CGA	2	6	1133817	1133822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932437
29356	NC_014834	CGG	2	6	1133828	1133833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932437
29357	NC_014834	CCGTCG	2	12	1133834	1133845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316932437
29358	NC_014834	GCT	2	6	1133922	1133927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932437
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29385	NC_014834	GAG	2	6	1134703	1134708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29386	NC_014834	CGG	2	6	1134771	1134776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29387	NC_014834	CGGCG	2	10	1134778	1134787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29388	NC_014834	CCGC	2	8	1134795	1134802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29389	NC_014834	TCG	2	6	1134882	1134887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932438
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29456	NC_014834	GT	3	6	1136765	1136770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29457	NC_014834	TGTA	2	8	1136789	1136796	25 %	50 %	25 %	0 %	316932441
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29463	NC_014834	ACC	2	6	1136953	1136958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932441
29464	NC_014834	GTC	2	6	1136991	1136996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932441
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29467	NC_014834	TCG	2	6	1137051	1137056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932441
29468	NC_014834	GCT	3	9	1137122	1137130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932441
29469	NC_014834	CGC	2	6	1137260	1137265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932441
29470	NC_014834	GCG	2	6	1137297	1137302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932441
29471	NC_014834	GGC	2	6	1137318	1137323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932441
29472	NC_014834	TGC	2	6	1137346	1137351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932441
29473	NC_014834	GCG	2	6	1137371	1137376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932441
29474	NC_014834	CCG	2	6	1137381	1137386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29475	NC_014834	CGG	2	6	1137443	1137448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932442
29476	NC_014834	GAT	2	6	1137450	1137455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932442
29477	NC_014834	GCC	2	6	1137459	1137464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932442
29478	NC_014834	GGT	2	6	1137489	1137494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932442
29479	NC_014834	GAT	2	6	1137495	1137500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932442
29480	NC_014834	GCC	2	6	1137501	1137506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932442
29481	NC_014834	TGA	2	6	1137515	1137520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932442
29482	NC_014834	GCG	2	6	1137532	1137537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932442
29483	NC_014834	CGT	2	6	1137539	1137544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932442
29484	NC_014834	GCC	2	6	1137586	1137591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932442
29485	NC_014834	CGC	2	6	1137614	1137619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932442
29486	NC_014834	GCCTGG	2	12	1137637	1137648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316932442
29487	NC_014834	TCGG	2	8	1137666	1137673	0 %	25 %	50 %	25 %	316932442
29488	NC_014834	CGT	2	6	1137674	1137679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932442
29489	NC_014834	TCA	2	6	1137680	1137685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932442
29490	NC_014834	GCG	2	6	1137689	1137694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932442
29491	NC_014834	ACAGC	2	10	1137704	1137713	40 %	0 %	20 %	40 %	316932442
29492	NC_014834	CGC	2	6	1137723	1137728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932442
29493	NC_014834	CAT	2	6	1137825	1137830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932442
29494	NC_014834	GCA	2	6	1137854	1137859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932442
29495	NC_014834	GATCG	2	10	1137915	1137924	20 %	20 %	40 %	20 %	316932442
29496	NC_014834	TTC	2	6	1137966	1137971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932442
29497	NC_014834	GAT	2	6	1137975	1137980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932442
29498	NC_014834	CGC	2	6	1138012	1138017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932442
29499	NC_014834	CGG	2	6	1138028	1138033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932442
29500	NC_014834	TCGG	2	8	1138035	1138042	0 %	25 %	50 %	25 %	316932442

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