MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_014834	CGG	2	6	1101509	1101514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932414
28503	NC_014834	CGT	2	6	1101560	1101565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932414
28504	NC_014834	CCG	2	6	1101616	1101621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932414
28505	NC_014834	TCG	4	12	1101655	1101666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932414
28506	NC_014834	CTT	2	6	1101669	1101674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932414
28507	NC_014834	GAT	2	6	1101738	1101743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932414
28508	NC_014834	CAC	2	6	1101807	1101812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932414
28509	NC_014834	CCT	2	6	1101821	1101826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932414
28510	NC_014834	GCC	3	9	1101846	1101854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932414
28511	NC_014834	GCT	2	6	1101950	1101955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932414
28512	NC_014834	CGGCGC	2	12	1102070	1102081	0 %	0 %	50 %	50 %	316932414
28513	NC_014834	CG	4	8	1102124	1102131	0 %	0 %	50 %	50 %	316932414
28514	NC_014834	TCT	2	6	1102133	1102138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932414
28515	NC_014834	CGG	2	6	1102145	1102150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932414
28516	NC_014834	GC	4	8	1102189	1102196	0 %	0 %	50 %	50 %	316932414
28517	NC_014834	CTT	2	6	1102209	1102214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932414
28518	NC_014834	CGAGC	2	10	1102302	1102311	20 %	0 %	40 %	40 %	316932414
28519	NC_014834	CAG	2	6	1102317	1102322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932414
28520	NC_014834	CGA	2	6	1102427	1102432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932414
28521	NC_014834	GCG	2	6	1102464	1102469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932414
28522	NC_014834	CG	3	6	1102575	1102580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28523	NC_014834	GCG	2	6	1102589	1102594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28524	NC_014834	TTGG	2	8	1102629	1102636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28525	NC_014834	CCCG	2	8	1102644	1102651	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28526	NC_014834	A	6	6	1102718	1102723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28527	NC_014834	CGT	2	6	1102732	1102737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28528	NC_014834	GTCA	2	8	1102792	1102799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28529	NC_014834	AG	3	6	1102808	1102813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28530	NC_014834	GA	4	8	1102839	1102846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28531	NC_014834	TCG	2	6	1102855	1102860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28532	NC_014834	GGC	2	6	1102897	1102902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28533	NC_014834	TACC	2	8	1102923	1102930	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28534	NC_014834	AC	3	6	1102936	1102941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28535	NC_014834	T	8	8	1103006	1103013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28536	NC_014834	CCG	2	6	1103033	1103038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28537	NC_014834	TCG	2	6	1103039	1103044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28538	NC_014834	CCA	2	6	1103060	1103065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28539	NC_014834	ACG	2	6	1103110	1103115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28540	NC_014834	CGG	2	6	1103129	1103134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28541	NC_014834	GC	3	6	1103172	1103177	0 %	0 %	50 %	50 %	316932415
28542	NC_014834	GAA	2	6	1103180	1103185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932415
28543	NC_014834	CGAA	2	8	1103208	1103215	50 %	0 %	25 %	25 %	316932415
28544	NC_014834	CAC	2	6	1103228	1103233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932415
28545	NC_014834	CCG	2	6	1103310	1103315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932415
28546	NC_014834	TGA	2	6	1103362	1103367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932415
28547	NC_014834	TGA	2	6	1103371	1103376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932415
28548	NC_014834	GGCG	2	8	1103446	1103453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28549	NC_014834	GAT	2	6	1103492	1103497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28550	NC_014834	CAG	2	6	1103510	1103515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28551	NC_014834	A	6	6	1103573	1103578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28552	NC_014834	GGAT	2	8	1103625	1103632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28553	NC_014834	AG	3	6	1103640	1103645	50 %	0 %	50 %	0 %	316932416
28554	NC_014834	GCT	2	6	1103685	1103690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28555	NC_014834	GCC	2	6	1103692	1103697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932416
28556	NC_014834	CGC	2	6	1103717	1103722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932416
28557	NC_014834	CGC	2	6	1103784	1103789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932416
28558	NC_014834	CCGA	2	8	1103815	1103822	25 %	0 %	25 %	50 %	316932416
28559	NC_014834	ACA	2	6	1103834	1103839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932416
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28561	NC_014834	CTG	2	6	1103929	1103934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28562	NC_014834	CGA	2	6	1103940	1103945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
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28564	NC_014834	GCT	2	6	1104069	1104074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28565	NC_014834	GCCGGC	2	12	1104103	1104114	0 %	0 %	50 %	50 %	316932416
28566	NC_014834	CGA	2	6	1104117	1104122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
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28568	NC_014834	CAT	2	6	1104187	1104192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932416
28569	NC_014834	CGA	2	6	1104201	1104206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28570	NC_014834	GAT	2	6	1104216	1104221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932416
28571	NC_014834	CGGCGA	2	12	1104228	1104239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316932416
28572	NC_014834	GC	4	8	1104274	1104281	0 %	0 %	50 %	50 %	316932416
28573	NC_014834	CGG	2	6	1104311	1104316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932416
28574	NC_014834	GTC	2	6	1104333	1104338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28575	NC_014834	CAACGG	2	12	1104417	1104428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28576	NC_014834	ACA	2	6	1104434	1104439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932416
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28579	NC_014834	CG	3	6	1104706	1104711	0 %	0 %	50 %	50 %	316932416
28580	NC_014834	CGA	2	6	1104717	1104722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
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28584	NC_014834	CAG	2	6	1104958	1104963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28585	NC_014834	ATC	2	6	1104991	1104996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932416
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28590	NC_014834	TGC	2	6	1105205	1105210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28591	NC_014834	CGA	2	6	1105251	1105256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28592	NC_014834	GCT	2	6	1105329	1105334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
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28595	NC_014834	TCT	2	6	1105466	1105471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932416
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28597	NC_014834	GAG	2	6	1105549	1105554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932416
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28600	NC_014834	CG	3	6	1105622	1105627	0 %	0 %	50 %	50 %	316932416
28601	NC_014834	GGA	2	6	1105632	1105637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932416
28602	NC_014834	GCT	2	6	1105680	1105685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932416
28603	NC_014834	GCC	2	6	1105688	1105693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932416
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28605	NC_014834	CCG	2	6	1105806	1105811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932417
28606	NC_014834	CGA	2	6	1105839	1105844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932417
28607	NC_014834	CGA	2	6	1105903	1105908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932417
28608	NC_014834	CGG	2	6	1106044	1106049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932417
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28610	NC_014834	TAT	2	6	1106081	1106086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316932417
28611	NC_014834	CTT	2	6	1106119	1106124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932417
28612	NC_014834	GTCG	2	8	1106161	1106168	0 %	25 %	50 %	25 %	316932417
28613	NC_014834	TCGT	2	8	1106201	1106208	0 %	50 %	25 %	25 %	316932417
28614	NC_014834	GAA	2	6	1106212	1106217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932417
28615	NC_014834	GC	3	6	1106235	1106240	0 %	0 %	50 %	50 %	316932417
28616	NC_014834	ACG	2	6	1106274	1106279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932417
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28618	NC_014834	CAA	2	6	1106356	1106361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932417
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28687	NC_014834	GGCC	2	8	1108811	1108818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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28716	NC_014834	TGGT	2	8	1110121	1110128	0 %	50 %	50 %	0 %	316932421
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28727	NC_014834	CGG	2	6	1110412	1110417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932421
28728	NC_014834	TGACGG	2	12	1110430	1110441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316932421
28729	NC_014834	TGA	2	6	1110469	1110474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28730	NC_014834	GTG	2	6	1110482	1110487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28731	NC_014834	CTGGAG	2	12	1110559	1110570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316932422
28732	NC_014834	CAGA	2	8	1110587	1110594	50 %	0 %	25 %	25 %	316932422
28733	NC_014834	GAG	2	6	1110602	1110607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932422
28734	NC_014834	CGA	2	6	1110649	1110654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932422
28735	NC_014834	GTC	2	6	1110662	1110667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932422
28736	NC_014834	GGC	2	6	1110716	1110721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932422
28737	NC_014834	CGG	2	6	1110794	1110799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932422
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28755	NC_014834	ATC	2	6	1111416	1111421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28756	NC_014834	CG	4	8	1111428	1111435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28757	NC_014834	CGAC	2	8	1111489	1111496	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28758	NC_014834	GCG	2	6	1111528	1111533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28759	NC_014834	GCC	2	6	1111562	1111567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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28761	NC_014834	G	8	8	1111691	1111698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28762	NC_014834	GCA	2	6	1111783	1111788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932423
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28769	NC_014834	TCA	2	6	1111945	1111950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932423
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28846	NC_014834	GAG	2	6	1115071	1115076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28847	NC_014834	GTTC	2	8	1115106	1115113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28848	NC_014834	TCT	2	6	1115232	1115237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932426
28849	NC_014834	AAGA	2	8	1115248	1115255	75 %	0 %	25 %	0 %	316932426
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28851	NC_014834	TGG	2	6	1115291	1115296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932426
28852	NC_014834	TGC	2	6	1115345	1115350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932426
28853	NC_014834	GCG	2	6	1115358	1115363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932426
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28859	NC_014834	CGAT	2	8	1115513	1115520	25 %	25 %	25 %	25 %	316932426
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28951	NC_014834	GGCG	2	8	1118870	1118877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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