MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_014834	GCCG	2	8	1044331	1044338	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27003	NC_014834	GGC	2	6	1044344	1044349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932355
27004	NC_014834	CGG	2	6	1044447	1044452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932355
27005	NC_014834	AGCAGA	2	12	1044477	1044488	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	316932355
27006	NC_014834	CGGC	2	8	1044639	1044646	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27007	NC_014834	ACA	2	6	1044663	1044668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932355
27008	NC_014834	CATC	2	8	1044670	1044677	25 %	25 %	0 %	50 %	316932355
27009	NC_014834	GC	3	6	1044699	1044704	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27010	NC_014834	CCG	2	6	1044705	1044710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932355
27011	NC_014834	GTG	2	6	1044734	1044739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932355
27012	NC_014834	TCGA	2	8	1044800	1044807	25 %	25 %	25 %	25 %	316932355
27013	NC_014834	ACG	2	6	1044852	1044857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932355
27014	NC_014834	GGCT	2	8	1044866	1044873	0 %	25 %	50 %	25 %	316932355
27015	NC_014834	TGA	3	9	1044912	1044920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932355
27016	NC_014834	CGAC	2	8	1045038	1045045	25 %	0 %	25 %	50 %	316932355
27017	NC_014834	GCCG	2	8	1045048	1045055	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27018	NC_014834	ATC	2	6	1045061	1045066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932355
27019	NC_014834	CCG	2	6	1045081	1045086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932355
27020	NC_014834	CG	3	6	1045085	1045090	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27021	NC_014834	CTG	2	6	1045091	1045096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932355
27022	NC_014834	GC	3	6	1045102	1045107	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27023	NC_014834	GGC	2	6	1045117	1045122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932355
27024	NC_014834	CCG	2	6	1045197	1045202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932355
27025	NC_014834	ATC	2	6	1045206	1045211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932355
27026	NC_014834	TGA	2	6	1045218	1045223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932355
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27028	NC_014834	CAG	2	6	1045280	1045285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932355
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27032	NC_014834	CGG	2	6	1045420	1045425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932355
27033	NC_014834	TTC	2	6	1045442	1045447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932355
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27038	NC_014834	CTCG	2	8	1045522	1045529	0 %	25 %	25 %	50 %	316932355
27039	NC_014834	CCA	2	6	1045545	1045550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932355
27040	NC_014834	TGA	3	9	1045557	1045565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932355
27041	NC_014834	GCC	3	9	1045595	1045603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932355
27042	NC_014834	TCG	2	6	1045629	1045634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932355
27043	NC_014834	CCGG	2	8	1045728	1045735	0 %	0 %	50 %	50 %	316932355
27044	NC_014834	TTC	2	6	1045736	1045741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932355
27045	NC_014834	CGG	2	6	1045818	1045823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932355
27046	NC_014834	CGG	2	6	1045887	1045892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27047	NC_014834	ATG	2	6	1045909	1045914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27048	NC_014834	GAGG	2	8	1045976	1045983	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27049	NC_014834	CG	3	6	1046025	1046030	0 %	0 %	50 %	50 %	316932356
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27052	NC_014834	CGA	2	6	1046137	1046142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932356
27053	NC_014834	CGT	2	6	1046143	1046148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932356
27054	NC_014834	CG	3	6	1046191	1046196	0 %	0 %	50 %	50 %	316932356
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27059	NC_014834	ACG	2	6	1046478	1046483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932356
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27081	NC_014834	CTCC	2	8	1047239	1047246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27082	NC_014834	C	6	6	1047245	1047250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27083	NC_014834	G	6	6	1047270	1047275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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27086	NC_014834	CGC	2	6	1047354	1047359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27087	NC_014834	GCT	2	6	1047369	1047374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27088	NC_014834	CCGACG	2	12	1047424	1047435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316932357
27089	NC_014834	ACG	2	6	1047492	1047497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932357
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27100	NC_014834	GATCA	2	10	1047945	1047954	40 %	20 %	20 %	20 %	316932357
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27102	NC_014834	GGT	2	6	1047992	1047997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932357
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27107	NC_014834	CGGC	2	8	1048132	1048139	0 %	0 %	50 %	50 %	316932357
27108	NC_014834	TCG	2	6	1048151	1048156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932357
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27111	NC_014834	GCG	3	9	1048287	1048295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932357
27112	NC_014834	GC	4	8	1048339	1048346	0 %	0 %	50 %	50 %	316932357
27113	NC_014834	GCC	2	6	1048361	1048366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932357
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27115	NC_014834	CAT	2	6	1048388	1048393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932357
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27117	NC_014834	GATC	2	8	1048460	1048467	25 %	25 %	25 %	25 %	316932357
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27222	NC_014834	TCA	2	6	1052326	1052331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27230	NC_014834	GCTG	2	8	1052567	1052574	0 %	25 %	50 %	25 %	316932361
27231	NC_014834	ACC	2	6	1052580	1052585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932361
27232	NC_014834	CGA	2	6	1052666	1052671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932361
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27453	NC_014834	CG	3	6	1061521	1061526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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27467	NC_014834	ACCTAC	2	12	1062124	1062135	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	316932373
27468	NC_014834	GAC	2	6	1062139	1062144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932373
27469	NC_014834	CGA	2	6	1062174	1062179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932373
27470	NC_014834	GCC	2	6	1062204	1062209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932373
27471	NC_014834	GCT	2	6	1062213	1062218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932373
27472	NC_014834	TGG	2	6	1062236	1062241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932373
27473	NC_014834	GGT	2	6	1062255	1062260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932373
27474	NC_014834	ACC	2	6	1062271	1062276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932373
27475	NC_014834	AGG	2	6	1062374	1062379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932373
27476	NC_014834	TAC	2	6	1062385	1062390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932373
27477	NC_014834	TCG	2	6	1062437	1062442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932373
27478	NC_014834	TCGTG	2	10	1062444	1062453	0 %	40 %	40 %	20 %	316932373
27479	NC_014834	GAA	2	6	1062477	1062482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932373
27480	NC_014834	CAG	3	9	1062484	1062492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932373
27481	NC_014834	CG	3	6	1062506	1062511	0 %	0 %	50 %	50 %	316932373
27482	NC_014834	GCC	2	6	1062535	1062540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932373
27483	NC_014834	GCG	2	6	1062552	1062557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27484	NC_014834	ACG	2	6	1062661	1062666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932374
27485	NC_014834	ACCA	2	8	1062714	1062721	50 %	0 %	0 %	50 %	316932374
27486	NC_014834	CAT	2	6	1062767	1062772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932374
27487	NC_014834	GCG	2	6	1062777	1062782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932374
27488	NC_014834	TCT	2	6	1062886	1062891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932374
27489	NC_014834	GAT	2	6	1062908	1062913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932374
27490	NC_014834	GGT	2	6	1062915	1062920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932374
27491	NC_014834	AAC	2	6	1062981	1062986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932374
27492	NC_014834	GCT	2	6	1062998	1063003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932374
27493	NC_014834	CGG	2	6	1063006	1063011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932374
27494	NC_014834	TCG	2	6	1063039	1063044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932374
27495	NC_014834	CGT	2	6	1063054	1063059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932374
27496	NC_014834	ACC	2	6	1063104	1063109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932374
27497	NC_014834	CGG	2	6	1063123	1063128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932374
27498	NC_014834	CGT	2	6	1063165	1063170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932374
27499	NC_014834	TCA	2	6	1063192	1063197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932374
27500	NC_014834	CCA	2	6	1063198	1063203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932374

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