MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_014834	CAT	2	6	1026560	1026565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932342
26503	NC_014834	GC	4	8	1026640	1026647	0 %	0 %	50 %	50 %	316932342
26504	NC_014834	GCA	2	6	1026689	1026694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932342
26505	NC_014834	CGG	3	9	1026700	1026708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932342
26506	NC_014834	GCA	2	6	1026712	1026717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932342
26507	NC_014834	CAAA	2	8	1026793	1026800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26508	NC_014834	GTCG	2	8	1026829	1026836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26509	NC_014834	GCG	2	6	1026839	1026844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26510	NC_014834	CGA	2	6	1026862	1026867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932343
26511	NC_014834	TGG	2	6	1026922	1026927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932343
26512	NC_014834	GGT	2	6	1026956	1026961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932343
26513	NC_014834	GCCGGC	2	12	1027046	1027057	0 %	0 %	50 %	50 %	316932343
26514	NC_014834	TGG	2	6	1027072	1027077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932343
26515	NC_014834	CGG	2	6	1027141	1027146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932343
26516	NC_014834	CGAGC	2	10	1027163	1027172	20 %	0 %	40 %	40 %	316932343
26517	NC_014834	CG	4	8	1027189	1027196	0 %	0 %	50 %	50 %	316932343
26518	NC_014834	CGT	2	6	1027219	1027224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932343
26519	NC_014834	CCG	2	6	1027231	1027236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26520	NC_014834	GC	3	6	1027251	1027256	0 %	0 %	50 %	50 %	316932343
26521	NC_014834	CCG	3	9	1027338	1027346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26522	NC_014834	AAG	2	6	1027347	1027352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932343
26523	NC_014834	CG	3	6	1027413	1027418	0 %	0 %	50 %	50 %	316932343
26524	NC_014834	GCC	2	6	1027424	1027429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26525	NC_014834	GCC	2	6	1027436	1027441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26526	NC_014834	GCG	2	6	1027468	1027473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932343
26527	NC_014834	GCC	2	6	1027493	1027498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26528	NC_014834	CG	3	6	1027534	1027539	0 %	0 %	50 %	50 %	316932343
26529	NC_014834	GAA	2	6	1027565	1027570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932343
26530	NC_014834	CGAGAT	2	12	1027585	1027596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316932343
26531	NC_014834	CCG	2	6	1027626	1027631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26532	NC_014834	TGT	2	6	1027681	1027686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932343
26533	NC_014834	GCC	2	6	1027700	1027705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26534	NC_014834	GTC	2	6	1027716	1027721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932343
26535	NC_014834	CCG	2	6	1027743	1027748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26536	NC_014834	TGG	2	6	1027831	1027836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932343
26537	NC_014834	CCG	2	6	1027956	1027961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932343
26538	NC_014834	GCCGAC	2	12	1028042	1028053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316932343
26539	NC_014834	CGG	3	9	1028152	1028160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932343
26540	NC_014834	GCCA	2	8	1028162	1028169	25 %	0 %	25 %	50 %	316932343
26541	NC_014834	GAC	2	6	1028171	1028176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932343
26542	NC_014834	GCCG	2	8	1028236	1028243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26543	NC_014834	GTC	2	6	1028248	1028253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26544	NC_014834	CG	3	6	1028260	1028265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26545	NC_014834	ATTG	2	8	1028296	1028303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26546	NC_014834	GCG	2	6	1028337	1028342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26547	NC_014834	TCG	2	6	1028345	1028350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26548	NC_014834	CGC	2	6	1028364	1028369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26549	NC_014834	GGT	2	6	1028437	1028442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26550	NC_014834	CGC	2	6	1028477	1028482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26551	NC_014834	GA	3	6	1028524	1028529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26552	NC_014834	GCG	2	6	1028605	1028610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26553	NC_014834	GGC	2	6	1028755	1028760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26554	NC_014834	CGA	2	6	1028793	1028798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932344
26555	NC_014834	TGG	2	6	1028840	1028845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932344
26556	NC_014834	AGG	2	6	1028849	1028854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932344
26557	NC_014834	GCTC	2	8	1028873	1028880	0 %	25 %	25 %	50 %	316932344
26558	NC_014834	CGG	2	6	1028897	1028902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26559	NC_014834	AAG	2	6	1028923	1028928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932344
26560	NC_014834	CTG	2	6	1028941	1028946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932344
26561	NC_014834	GAA	2	6	1028976	1028981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932344
26562	NC_014834	CCGA	2	8	1029016	1029023	25 %	0 %	25 %	50 %	316932344
26563	NC_014834	CGT	2	6	1029045	1029050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932344
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26565	NC_014834	AAG	2	6	1029127	1029132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932344
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26567	NC_014834	CGG	2	6	1029147	1029152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26568	NC_014834	GGT	2	6	1029162	1029167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932344
26569	NC_014834	CGA	2	6	1029197	1029202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932344
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26573	NC_014834	CTG	2	6	1029325	1029330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932344
26574	NC_014834	CGC	2	6	1029363	1029368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932344
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26576	NC_014834	GGC	2	6	1029534	1029539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26577	NC_014834	GCG	2	6	1029558	1029563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26578	NC_014834	GCG	2	6	1029566	1029571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932344
26579	NC_014834	GAC	2	6	1029670	1029675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932344
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26581	NC_014834	CGCC	2	8	1029787	1029794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26582	NC_014834	CGG	2	6	1029799	1029804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26583	NC_014834	CTG	2	6	1029929	1029934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932345
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26585	NC_014834	GC	3	6	1029962	1029967	0 %	0 %	50 %	50 %	316932345
26586	NC_014834	CG	3	6	1029978	1029983	0 %	0 %	50 %	50 %	316932345
26587	NC_014834	TCA	2	6	1029985	1029990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932345
26588	NC_014834	ATT	2	6	1029997	1030002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316932345
26589	NC_014834	CTG	2	6	1030031	1030036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932345
26590	NC_014834	GC	3	6	1030098	1030103	0 %	0 %	50 %	50 %	316932345
26591	NC_014834	CTC	2	6	1030120	1030125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932345
26592	NC_014834	CGGC	2	8	1030146	1030153	0 %	0 %	50 %	50 %	316932345
26593	NC_014834	CGGT	2	8	1030159	1030166	0 %	25 %	50 %	25 %	316932345
26594	NC_014834	TGA	2	6	1030180	1030185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932345
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26596	NC_014834	G	6	6	1030275	1030280	0 %	0 %	100 %	0 %	316932345
26597	NC_014834	CGG	2	6	1030300	1030305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932345
26598	NC_014834	CGC	2	6	1030326	1030331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932345
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26601	NC_014834	CGA	2	6	1030513	1030518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932345
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26603	NC_014834	GCG	2	6	1030543	1030548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932345
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26605	NC_014834	GCG	2	6	1030590	1030595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932345
26606	NC_014834	CTG	2	6	1030598	1030603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932345
26607	NC_014834	CG	3	6	1030690	1030695	0 %	0 %	50 %	50 %	316932345
26608	NC_014834	TCG	3	9	1030740	1030748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932345
26609	NC_014834	GGCGC	2	10	1030754	1030763	0 %	0 %	60 %	40 %	316932345
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26612	NC_014834	ACG	2	6	1030935	1030940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932345
26613	NC_014834	GGC	2	6	1031011	1031016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932345
26614	NC_014834	GCG	2	6	1031028	1031033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932345
26615	NC_014834	TCG	2	6	1031045	1031050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932345
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26617	NC_014834	GC	3	6	1031100	1031105	0 %	0 %	50 %	50 %	316932345
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26846	NC_014834	CG	3	6	1039004	1039009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26847	NC_014834	GCGG	2	8	1039040	1039047	0 %	0 %	75 %	25 %	316932352
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26964	NC_014834	CGA	2	6	1042988	1042993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932353
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26967	NC_014834	GGCC	2	8	1043117	1043124	0 %	0 %	50 %	50 %	316932353
26968	NC_014834	GGCG	2	8	1043159	1043166	0 %	0 %	75 %	25 %	316932353
26969	NC_014834	CG	4	8	1043196	1043203	0 %	0 %	50 %	50 %	316932353
26970	NC_014834	GT	3	6	1043247	1043252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26971	NC_014834	GC	3	6	1043268	1043273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26972	NC_014834	GAT	2	6	1043302	1043307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26973	NC_014834	GCT	2	6	1043315	1043320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26974	NC_014834	GCC	2	6	1043329	1043334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26975	NC_014834	ATC	2	6	1043339	1043344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26976	NC_014834	GGA	2	6	1043350	1043355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26977	NC_014834	GCC	3	9	1043407	1043415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26978	NC_014834	GC	3	6	1043456	1043461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26979	NC_014834	GAT	2	6	1043492	1043497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26980	NC_014834	CCGCC	2	10	1043508	1043517	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26981	NC_014834	CGC	2	6	1043527	1043532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26982	NC_014834	ATG	2	6	1043610	1043615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932354
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26991	NC_014834	GA	3	6	1044033	1044038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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