MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_014834	CG	4	8	1007017	1007024	0 %	0 %	50 %	50 %	316932325
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26004	NC_014834	CCG	2	6	1007084	1007089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932325
26005	NC_014834	GCA	2	6	1007094	1007099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932325
26006	NC_014834	AGC	2	6	1007132	1007137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932325
26007	NC_014834	GAT	2	6	1007203	1007208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932325
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26009	NC_014834	CAG	2	6	1007350	1007355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932325
26010	NC_014834	GTC	2	6	1007377	1007382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932325
26011	NC_014834	CCG	2	6	1007390	1007395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932325
26012	NC_014834	CGT	2	6	1007401	1007406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932325
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26016	NC_014834	GCC	2	6	1007548	1007553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932325
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26027	NC_014834	GAT	2	6	1007866	1007871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932325
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26101	NC_014834	CAC	3	9	1010542	1010550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932327
26102	NC_014834	CGGC	2	8	1010565	1010572	0 %	0 %	50 %	50 %	316932327
26103	NC_014834	GCTCG	2	10	1010581	1010590	0 %	20 %	40 %	40 %	316932327
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26117	NC_014834	AAC	2	6	1011152	1011157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932328
26118	NC_014834	GC	3	6	1011245	1011250	0 %	0 %	50 %	50 %	316932328
26119	NC_014834	TGG	2	6	1011251	1011256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932328
26120	NC_014834	GCG	2	6	1011257	1011262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932328
26121	NC_014834	CGA	2	6	1011282	1011287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932328
26122	NC_014834	GCG	2	6	1011300	1011305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932328
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26124	NC_014834	CAC	3	9	1011487	1011495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932328
26125	NC_014834	TCG	2	6	1011545	1011550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932328
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26128	NC_014834	CCGC	2	8	1011637	1011644	0 %	0 %	25 %	75 %	316932328
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26132	NC_014834	TGG	2	6	1011744	1011749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932328
26133	NC_014834	TTTC	2	8	1011798	1011805	0 %	75 %	0 %	25 %	316932328
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26142	NC_014834	CGGC	2	8	1012147	1012154	0 %	0 %	50 %	50 %	316932329
26143	NC_014834	CGG	2	6	1012202	1012207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932329
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26171	NC_014834	CGG	2	6	1013512	1013517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932330
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26174	NC_014834	CG	3	6	1013686	1013691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26175	NC_014834	GCA	2	6	1013716	1013721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932331
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26219	NC_014834	CGGG	2	8	1015488	1015495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26220	NC_014834	CCG	2	6	1015505	1015510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26221	NC_014834	ACAGA	2	10	1015551	1015560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26222	NC_014834	CGCC	2	8	1015562	1015569	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26223	NC_014834	GGCAG	2	10	1015680	1015689	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26224	NC_014834	GCG	2	6	1015769	1015774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26225	NC_014834	AGA	2	6	1015801	1015806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26226	NC_014834	CTGAAC	2	12	1015819	1015830	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26227	NC_014834	CGA	2	6	1015841	1015846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26228	NC_014834	GC	4	8	1015853	1015860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26229	NC_014834	CGG	2	6	1015906	1015911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932332
26230	NC_014834	TGG	2	6	1015934	1015939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932332
26231	NC_014834	CGT	2	6	1015941	1015946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932332
26232	NC_014834	GCG	2	6	1015969	1015974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932332
26233	NC_014834	CCG	2	6	1015997	1016002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932332
26234	NC_014834	GCG	2	6	1016144	1016149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932332
26235	NC_014834	ACG	2	6	1016156	1016161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932332
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26341	NC_014834	GAT	2	6	1020049	1020054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932336
26342	NC_014834	AGCG	2	8	1020131	1020138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26343	NC_014834	CGCT	2	8	1020221	1020228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26344	NC_014834	CA	3	6	1020255	1020260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26345	NC_014834	GC	3	6	1020280	1020285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26346	NC_014834	GC	3	6	1020383	1020388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26347	NC_014834	TCGC	2	8	1020434	1020441	0 %	25 %	25 %	50 %	316932337
26348	NC_014834	TTC	2	6	1020560	1020565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932337
26349	NC_014834	CGT	2	6	1020609	1020614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932337
26350	NC_014834	GCG	3	9	1020617	1020625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932337
26351	NC_014834	CGC	2	6	1020651	1020656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932337
26352	NC_014834	GAA	2	6	1020697	1020702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932337
26353	NC_014834	CCG	2	6	1020707	1020712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932337
26354	NC_014834	GAC	2	6	1020724	1020729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932337
26355	NC_014834	TGG	2	6	1020813	1020818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932337
26356	NC_014834	GGA	2	6	1020820	1020825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932337
26357	NC_014834	CGG	2	6	1020874	1020879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932337
26358	NC_014834	CGCTTG	2	12	1020899	1020910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932337
26359	NC_014834	CCG	2	6	1020944	1020949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932337
26360	NC_014834	ATCAGG	2	12	1020974	1020985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316932337
26361	NC_014834	CTGT	2	8	1021193	1021200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26362	NC_014834	GC	3	6	1021244	1021249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26363	NC_014834	GAT	2	6	1021253	1021258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26364	NC_014834	GC	3	6	1021272	1021277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26365	NC_014834	CGC	2	6	1021331	1021336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932338
26366	NC_014834	ACC	2	6	1021339	1021344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932338
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26368	NC_014834	TCC	2	6	1021450	1021455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932338
26369	NC_014834	TTC	2	6	1021456	1021461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932338
26370	NC_014834	GGA	2	6	1021463	1021468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932338
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26372	NC_014834	GAC	2	6	1021674	1021679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932338
26373	NC_014834	CCGC	2	8	1021772	1021779	0 %	0 %	25 %	75 %	316932338
26374	NC_014834	GCG	2	6	1021780	1021785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932338
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26376	NC_014834	GCG	2	6	1021861	1021866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932338
26377	NC_014834	CG	3	6	1021906	1021911	0 %	0 %	50 %	50 %	316932338
26378	NC_014834	AG	3	6	1021921	1021926	50 %	0 %	50 %	0 %	316932338
26379	NC_014834	CCG	2	6	1021948	1021953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932338
26380	NC_014834	CGC	2	6	1021976	1021981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932338
26381	NC_014834	TC	3	6	1022005	1022010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26382	NC_014834	TTC	2	6	1022074	1022079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26383	NC_014834	GCG	2	6	1022113	1022118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26384	NC_014834	TGA	2	6	1022127	1022132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26385	NC_014834	AGCGC	2	10	1022175	1022184	20 %	0 %	40 %	40 %	316932339
26386	NC_014834	CCG	2	6	1022192	1022197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932339
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26388	NC_014834	CAG	2	6	1022290	1022295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932339
26389	NC_014834	CG	3	6	1022313	1022318	0 %	0 %	50 %	50 %	316932339
26390	NC_014834	GCGAAC	2	12	1022351	1022362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932339
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26397	NC_014834	CG	4	8	1022550	1022557	0 %	0 %	50 %	50 %	316932339
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26402	NC_014834	CGC	2	6	1022667	1022672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932339
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26423	NC_014834	CGA	2	6	1023357	1023362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932339
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26426	NC_014834	GGC	2	6	1023468	1023473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26427	NC_014834	CG	3	6	1023484	1023489	0 %	0 %	50 %	50 %	316932340
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26429	NC_014834	GATCAC	2	12	1023524	1023535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316932340
26430	NC_014834	CAG	2	6	1023605	1023610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932340
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26434	NC_014834	GCC	2	6	1023716	1023721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932340
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26437	NC_014834	CG	4	8	1023791	1023798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26438	NC_014834	CAT	2	6	1023808	1023813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26449	NC_014834	ACG	2	6	1024232	1024237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932341
26450	NC_014834	GAT	2	6	1024281	1024286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932341
26451	NC_014834	CCA	2	6	1024308	1024313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932341
26452	NC_014834	GGC	2	6	1024325	1024330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932341
26453	NC_014834	CGC	2	6	1024351	1024356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932341
26454	NC_014834	CAGCGC	2	12	1024394	1024405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316932341
26455	NC_014834	GC	3	6	1024419	1024424	0 %	0 %	50 %	50 %	316932341
26456	NC_014834	GTC	2	6	1024443	1024448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932341
26457	NC_014834	GCG	2	6	1024518	1024523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932341
26458	NC_014834	TCG	2	6	1024552	1024557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932341
26459	NC_014834	GC	3	6	1024579	1024584	0 %	0 %	50 %	50 %	316932341
26460	NC_014834	GCT	2	6	1024640	1024645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932341
26461	NC_014834	GCA	2	6	1024646	1024651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932341
26462	NC_014834	CAG	2	6	1024686	1024691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932341
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