MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_014834	CAC	2	6	964380	964385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932283
25003	NC_014834	CTGA	2	8	964431	964438	25 %	25 %	25 %	25 %	316932283
25004	NC_014834	GAC	2	6	964461	964466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932283
25005	NC_014834	GC	4	8	964514	964521	0 %	0 %	50 %	50 %	316932283
25006	NC_014834	CGC	2	6	964549	964554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932283
25007	NC_014834	TA	3	6	964601	964606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25008	NC_014834	TATT	2	8	964617	964624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25009	NC_014834	GTAT	2	8	964628	964635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_014834	CAC	2	6	964651	964656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25011	NC_014834	AGCA	2	8	964708	964715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25012	NC_014834	CG	3	6	964748	964753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25013	NC_014834	CTCG	2	8	964865	964872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25014	NC_014834	GCG	2	6	964877	964882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25015	NC_014834	CAA	2	6	964898	964903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25016	NC_014834	GAA	2	6	965026	965031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932284
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25018	NC_014834	GAT	2	6	965127	965132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932284
25019	NC_014834	GTT	2	6	965152	965157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932284
25020	NC_014834	GGAT	2	8	965349	965356	25 %	25 %	50 %	0 %	316932285
25021	NC_014834	GGC	2	6	965412	965417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932285
25022	NC_014834	GC	3	6	965422	965427	0 %	0 %	50 %	50 %	316932285
25023	NC_014834	TCGA	2	8	965442	965449	25 %	25 %	25 %	25 %	316932285
25024	NC_014834	GAT	2	6	965454	965459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932285
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25028	NC_014834	CGG	3	9	965669	965677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25029	NC_014834	GGC	2	6	965704	965709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932286
25030	NC_014834	GCC	2	6	965860	965865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932286
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25034	NC_014834	GCG	2	6	966145	966150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932286
25035	NC_014834	GGAAG	2	10	966182	966191	40 %	0 %	60 %	0 %	316932286
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25038	NC_014834	CTT	2	6	966275	966280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932286
25039	NC_014834	CGGG	2	8	966314	966321	0 %	0 %	75 %	25 %	316932286
25040	NC_014834	G	6	6	966319	966324	0 %	0 %	100 %	0 %	316932286
25041	NC_014834	GCA	2	6	966344	966349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932286
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25043	NC_014834	GAT	2	6	966447	966452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932286
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25046	NC_014834	CCCGAG	2	12	966561	966572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316932286
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25053	NC_014834	GC	3	6	966874	966879	0 %	0 %	50 %	50 %	316932286
25054	NC_014834	AGA	2	6	966897	966902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932286
25055	NC_014834	AATA	2	8	966985	966992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25056	NC_014834	TA	3	6	967006	967011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25057	NC_014834	GC	3	6	967051	967056	0 %	0 %	50 %	50 %	316932287
25058	NC_014834	GGT	2	6	967066	967071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932287
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25062	NC_014834	ACGCG	2	10	967233	967242	20 %	0 %	40 %	40 %	316932287
25063	NC_014834	CTG	2	6	967244	967249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932287
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25066	NC_014834	CGG	2	6	967351	967356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932287
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25070	NC_014834	GCT	2	6	967501	967506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932287
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25073	NC_014834	TCAT	2	8	967593	967600	25 %	50 %	0 %	25 %	316932287
25074	NC_014834	TGA	2	6	967645	967650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932287
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25081	NC_014834	GT	3	6	968092	968097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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25090	NC_014834	CAT	2	6	968368	968373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932288
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25093	NC_014834	GC	3	6	968468	968473	0 %	0 %	50 %	50 %	316932288
25094	NC_014834	ACTG	2	8	968482	968489	25 %	25 %	25 %	25 %	316932288
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25101	NC_014834	TCCGA	2	10	968969	968978	20 %	20 %	20 %	40 %	316932288
25102	NC_014834	CGC	2	6	969001	969006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932288
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25107	NC_014834	GTC	2	6	969152	969157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932288
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25123	NC_014834	ACC	2	6	969865	969870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932288
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25145	NC_014834	TGG	2	6	970679	970684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25146	NC_014834	CGC	2	6	970834	970839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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25235	NC_014834	CCG	2	6	975723	975728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932294
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25238	NC_014834	GAA	2	6	975750	975755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932294
25239	NC_014834	ACGCT	2	10	975905	975914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25240	NC_014834	ATC	2	6	975964	975969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25241	NC_014834	TCACA	2	10	976025	976034	40 %	20 %	0 %	40 %	316932295
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25243	NC_014834	TGC	2	6	976065	976070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932295
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25482	NC_014834	CAG	2	6	985266	985271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932304
25483	NC_014834	GAC	2	6	985412	985417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25485	NC_014834	GC	3	6	985468	985473	0 %	0 %	50 %	50 %	316932305
25486	NC_014834	CAG	2	6	985505	985510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932305
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25491	NC_014834	TTCCA	2	10	985935	985944	20 %	40 %	0 %	40 %	316932306
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