MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_014834	TGT	2	6	916143	916148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932241
24002	NC_014834	CG	3	6	916252	916257	0 %	0 %	50 %	50 %	316932241
24003	NC_014834	GCA	2	6	916264	916269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24004	NC_014834	GTT	2	6	916285	916290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932241
24005	NC_014834	GAAA	2	8	916314	916321	75 %	0 %	25 %	0 %	316932241
24006	NC_014834	TCT	2	6	916358	916363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932241
24007	NC_014834	GAG	2	6	916381	916386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932241
24008	NC_014834	CGATC	2	10	916392	916401	20 %	20 %	20 %	40 %	316932241
24009	NC_014834	TGC	2	6	916406	916411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24010	NC_014834	CCG	2	6	916430	916435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932241
24011	NC_014834	ATC	2	6	916459	916464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932241
24012	NC_014834	CTG	2	6	916475	916480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24013	NC_014834	CAG	2	6	916487	916492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24014	NC_014834	GA	3	6	916493	916498	50 %	0 %	50 %	0 %	316932241
24015	NC_014834	CGA	2	6	916506	916511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24016	NC_014834	CGC	2	6	916519	916524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932241
24017	NC_014834	TTC	2	6	916534	916539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932241
24018	NC_014834	GGA	2	6	916611	916616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932241
24019	NC_014834	CCA	2	6	916678	916683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932241
24020	NC_014834	ACA	2	6	916995	917000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932241
24021	NC_014834	AATC	2	8	917005	917012	50 %	25 %	0 %	25 %	316932241
24022	NC_014834	GCG	2	6	917075	917080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932241
24023	NC_014834	CGC	2	6	917094	917099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932241
24024	NC_014834	TGC	2	6	917147	917152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24025	NC_014834	TCA	2	6	917184	917189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932241
24026	NC_014834	TGC	2	6	917247	917252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24027	NC_014834	TGC	2	6	917327	917332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932241
24028	NC_014834	GAT	2	6	917350	917355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932241
24029	NC_014834	GCC	2	6	917490	917495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24030	NC_014834	GCC	2	6	917527	917532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24031	NC_014834	TG	3	6	917607	917612	0 %	50 %	50 %	0 %	316932242
24032	NC_014834	CGG	2	6	917645	917650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932242
24033	NC_014834	CGA	2	6	917671	917676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932242
24034	NC_014834	CGC	2	6	917703	917708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932242
24035	NC_014834	CGC	3	9	917717	917725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932242
24036	NC_014834	CGA	2	6	917770	917775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932242
24037	NC_014834	GGC	2	6	917867	917872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932242
24038	NC_014834	GTC	2	6	918016	918021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932243
24039	NC_014834	GCT	2	6	918213	918218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932243
24040	NC_014834	GAG	2	6	918303	918308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932244
24041	NC_014834	CGG	2	6	918412	918417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932244
24042	NC_014834	TGC	2	6	918430	918435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932244
24043	NC_014834	CAT	3	9	918437	918445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932244
24044	NC_014834	GC	3	6	918491	918496	0 %	0 %	50 %	50 %	316932244
24045	NC_014834	GC	3	6	918694	918699	0 %	0 %	50 %	50 %	316932245
24046	NC_014834	CGA	2	6	918720	918725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24047	NC_014834	CCA	2	6	918840	918845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932245
24048	NC_014834	TGT	2	6	918910	918915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932245
24049	NC_014834	CTT	2	6	918937	918942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932245
24050	NC_014834	CGA	2	6	919027	919032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24051	NC_014834	ATG	2	6	919046	919051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932245
24052	NC_014834	CGA	2	6	919072	919077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24053	NC_014834	GC	3	6	919111	919116	0 %	0 %	50 %	50 %	316932245
24054	NC_014834	GC	3	6	919152	919157	0 %	0 %	50 %	50 %	316932245
24055	NC_014834	GCC	2	6	919159	919164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932245
24056	NC_014834	TCG	2	6	919179	919184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24057	NC_014834	AGC	2	6	919191	919196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24058	NC_014834	AAG	3	9	919211	919219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932245
24059	NC_014834	CGG	2	6	919357	919362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932245
24060	NC_014834	CAC	2	6	919402	919407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932245
24061	NC_014834	GAA	2	6	919456	919461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932245
24062	NC_014834	GCC	2	6	919492	919497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932245
24063	NC_014834	GAT	2	6	919498	919503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932245
24064	NC_014834	ATG	2	6	919556	919561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932245
24065	NC_014834	CGG	2	6	919663	919668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932245
24066	NC_014834	CTA	2	6	919678	919683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932245
24067	NC_014834	CGA	2	6	919692	919697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24068	NC_014834	CGA	2	6	919753	919758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
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24070	NC_014834	GAG	2	6	919841	919846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932245
24071	NC_014834	CGAGC	2	10	919847	919856	20 %	0 %	40 %	40 %	316932245
24072	NC_014834	GCC	2	6	919857	919862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932245
24073	NC_014834	ACG	2	6	919926	919931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24074	NC_014834	CAAT	2	8	920059	920066	50 %	25 %	0 %	25 %	316932245
24075	NC_014834	GGC	2	6	920132	920137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932245
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24078	NC_014834	GCT	2	6	920221	920226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932245
24079	NC_014834	GGGA	2	8	920248	920255	25 %	0 %	75 %	0 %	316932245
24080	NC_014834	CGG	2	6	920259	920264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932245
24081	NC_014834	GTG	2	6	920477	920482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24083	NC_014834	CCG	2	6	920550	920555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932246
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24085	NC_014834	GC	3	6	920717	920722	0 %	0 %	50 %	50 %	316932246
24086	NC_014834	AGC	2	6	920811	920816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932246
24087	NC_014834	GGC	2	6	920867	920872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932246
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24089	NC_014834	CAT	2	6	920926	920931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932246
24090	NC_014834	TCG	2	6	920937	920942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932246
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24092	NC_014834	AAT	2	6	920981	920986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316932246
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24099	NC_014834	AAGG	2	8	921386	921393	50 %	0 %	50 %	0 %	316932246
24100	NC_014834	CTT	2	6	921430	921435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932246
24101	NC_014834	CGA	2	6	921487	921492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932246
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24103	NC_014834	ACG	2	6	921689	921694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932246
24104	NC_014834	CGG	2	6	921782	921787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932246
24105	NC_014834	TGG	2	6	921832	921837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932246
24106	NC_014834	GTTTG	2	10	921843	921852	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24107	NC_014834	CTT	2	6	922019	922024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932247
24108	NC_014834	CCAG	2	8	922057	922064	25 %	0 %	25 %	50 %	316932247
24109	NC_014834	TCG	2	6	922080	922085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932247
24110	NC_014834	AGC	2	6	922115	922120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932247
24111	NC_014834	CGAC	2	8	922150	922157	25 %	0 %	25 %	50 %	316932247
24112	NC_014834	GCC	2	6	922169	922174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932247
24113	NC_014834	TTCGG	2	10	922184	922193	0 %	40 %	40 %	20 %	316932247
24114	NC_014834	GCG	2	6	922209	922214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932247
24115	NC_014834	TCG	2	6	922260	922265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932247
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24117	NC_014834	CGC	2	6	922325	922330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932247
24118	NC_014834	CGT	2	6	922341	922346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932247
24119	NC_014834	CG	3	6	922358	922363	0 %	0 %	50 %	50 %	316932247
24120	NC_014834	CAT	2	6	922376	922381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932247
24121	NC_014834	CCG	3	9	922405	922413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932247
24122	NC_014834	CCGC	2	8	922419	922426	0 %	0 %	25 %	75 %	316932247
24123	NC_014834	ACC	2	6	922441	922446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932247
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24125	NC_014834	GCG	2	6	922457	922462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932247
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24127	NC_014834	GTT	2	6	922604	922609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932247
24128	NC_014834	GCC	2	6	922655	922660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932247
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24143	NC_014834	TCGACG	2	12	923355	923366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316932247
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24148	NC_014834	CAG	2	6	923525	923530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932247
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24150	NC_014834	CGCC	2	8	923584	923591	0 %	0 %	25 %	75 %	316932247
24151	NC_014834	CAGG	2	8	923594	923601	25 %	0 %	50 %	25 %	316932247
24152	NC_014834	CGG	2	6	923605	923610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932247
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24184	NC_014834	TCG	2	6	924669	924674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932247
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24223	NC_014834	CAGC	2	8	926811	926818	25 %	0 %	25 %	50 %	316932249
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24230	NC_014834	GC	4	8	927025	927032	0 %	0 %	50 %	50 %	316932250
24231	NC_014834	CTG	2	6	927033	927038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932250
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24234	NC_014834	TTC	2	6	927093	927098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932250
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24236	NC_014834	GGC	2	6	927181	927186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932250
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24358	NC_014834	GGCG	2	8	933295	933302	0 %	0 %	75 %	25 %	316932251
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24361	NC_014834	CGG	2	6	933415	933420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932252
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24363	NC_014834	CGCGG	2	10	933460	933469	0 %	0 %	60 %	40 %	316932252
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24478	NC_014834	GAG	2	6	938975	938980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932253
24479	NC_014834	TCA	2	6	939069	939074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932253
24480	NC_014834	AACG	2	8	939080	939087	50 %	0 %	25 %	25 %	316932253
24481	NC_014834	CGA	2	6	939094	939099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932253
24482	NC_014834	GGAC	2	8	939106	939113	25 %	0 %	50 %	25 %	316932253
24483	NC_014834	GC	3	6	939245	939250	0 %	0 %	50 %	50 %	316932253
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24486	NC_014834	TC	3	6	939451	939456	0 %	50 %	0 %	50 %	316932253
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