MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_014834	CAG	2	6	896482	896487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23502	NC_014834	TCG	3	9	896536	896544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23503	NC_014834	GGC	2	6	896554	896559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23504	NC_014834	GC	3	6	896576	896581	0 %	0 %	50 %	50 %	316932223
23505	NC_014834	CGCGG	2	10	896599	896608	0 %	0 %	60 %	40 %	316932223
23506	NC_014834	GC	3	6	896616	896621	0 %	0 %	50 %	50 %	316932223
23507	NC_014834	GGC	2	6	896635	896640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23508	NC_014834	GC	3	6	896651	896656	0 %	0 %	50 %	50 %	316932223
23509	NC_014834	CGT	3	9	896670	896678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23510	NC_014834	CCG	2	6	896720	896725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23511	NC_014834	CG	3	6	896759	896764	0 %	0 %	50 %	50 %	316932223
23512	NC_014834	TCG	2	6	896822	896827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23513	NC_014834	GCGCG	2	10	896829	896838	0 %	0 %	60 %	40 %	316932223
23514	NC_014834	CCA	2	6	896847	896852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932223
23515	NC_014834	TGA	2	6	896921	896926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932223
23516	NC_014834	ACC	2	6	896975	896980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932223
23517	NC_014834	ACA	2	6	896981	896986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932223
23518	NC_014834	GCATGT	2	12	896997	897008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	316932223
23519	NC_014834	TCA	2	6	897047	897052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932223
23520	NC_014834	GCGA	2	8	897088	897095	25 %	0 %	50 %	25 %	316932223
23521	NC_014834	CCG	2	6	897152	897157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23522	NC_014834	CCG	2	6	897242	897247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23523	NC_014834	CTGCGC	2	12	897274	897285	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316932223
23524	NC_014834	GAGC	2	8	897348	897355	25 %	0 %	50 %	25 %	316932223
23525	NC_014834	GCG	2	6	897389	897394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23526	NC_014834	ACG	2	6	897467	897472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23527	NC_014834	CGT	2	6	897501	897506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23528	NC_014834	CGA	2	6	897522	897527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23529	NC_014834	CGT	2	6	897546	897551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23530	NC_014834	CACC	2	8	897573	897580	25 %	0 %	0 %	75 %	316932223
23531	NC_014834	CCCG	2	8	897598	897605	0 %	0 %	25 %	75 %	316932223
23532	NC_014834	CGT	2	6	897630	897635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23533	NC_014834	CCGT	2	8	897663	897670	0 %	25 %	25 %	50 %	316932223
23534	NC_014834	GCG	2	6	897701	897706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23535	NC_014834	CGG	2	6	897759	897764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23536	NC_014834	ACG	2	6	897770	897775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23537	NC_014834	GCGCC	2	10	897813	897822	0 %	0 %	40 %	60 %	316932223
23538	NC_014834	GCCGC	2	10	897878	897887	0 %	0 %	40 %	60 %	316932223
23539	NC_014834	CCG	2	6	897935	897940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23540	NC_014834	CAG	2	6	897952	897957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23541	NC_014834	CCG	2	6	897987	897992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23542	NC_014834	CAG	2	6	898039	898044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23543	NC_014834	CCG	2	6	898062	898067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23544	NC_014834	CGG	2	6	898113	898118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23545	NC_014834	GCGCGA	2	12	898152	898163	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316932223
23546	NC_014834	CGG	2	6	898176	898181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23547	NC_014834	GCC	3	9	898216	898224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932223
23548	NC_014834	GGC	2	6	898325	898330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932223
23549	NC_014834	CGT	2	6	898368	898373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932223
23550	NC_014834	TAGC	2	8	898426	898433	25 %	25 %	25 %	25 %	316932223
23551	NC_014834	ACGC	2	8	898513	898520	25 %	0 %	25 %	50 %	316932224
23552	NC_014834	TGA	2	6	898543	898548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932224
23553	NC_014834	GCG	2	6	898622	898627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932224
23554	NC_014834	GC	4	8	898702	898709	0 %	0 %	50 %	50 %	316932224
23555	NC_014834	CGG	2	6	898726	898731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932224
23556	NC_014834	GATCA	2	10	898742	898751	40 %	20 %	20 %	20 %	316932224
23557	NC_014834	A	6	6	898781	898786	100 %	0 %	0 %	0 %	316932224
23558	NC_014834	CAC	2	6	898787	898792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932224
23559	NC_014834	TC	3	6	898834	898839	0 %	50 %	0 %	50 %	316932224
23560	NC_014834	CAC	2	6	898842	898847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932224
23561	NC_014834	GGC	2	6	898916	898921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932224
23562	NC_014834	GAT	2	6	898969	898974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932224
23563	NC_014834	CAT	2	6	899123	899128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932224
23564	NC_014834	CGG	2	6	899149	899154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932224
23565	NC_014834	TGT	2	6	899161	899166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932224
23566	NC_014834	TGA	2	6	899218	899223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932225
23567	NC_014834	GTC	2	6	899278	899283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932225
23568	NC_014834	TCA	2	6	899366	899371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932225
23569	NC_014834	CTG	2	6	899389	899394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932225
23570	NC_014834	AAG	2	6	899433	899438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932225
23571	NC_014834	GA	3	6	899458	899463	50 %	0 %	50 %	0 %	316932225
23572	NC_014834	GGGCAA	2	12	899478	899489	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	316932225
23573	NC_014834	CCAG	2	8	899518	899525	25 %	0 %	25 %	50 %	316932225
23574	NC_014834	TTA	2	6	899544	899549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316932225
23575	NC_014834	GC	3	6	899581	899586	0 %	0 %	50 %	50 %	316932225
23576	NC_014834	TCG	2	6	899597	899602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932225
23577	NC_014834	TTC	2	6	899701	899706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932225
23578	NC_014834	ATT	2	6	899801	899806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23579	NC_014834	CCT	2	6	899840	899845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23580	NC_014834	GCG	3	9	899870	899878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23581	NC_014834	TGA	2	6	899900	899905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23582	NC_014834	TGC	2	6	899917	899922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932226
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23584	NC_014834	GGA	2	6	900047	900052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932226
23585	NC_014834	TCC	2	6	900064	900069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932226
23586	NC_014834	GGC	2	6	900182	900187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932226
23587	NC_014834	TGA	2	6	900272	900277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932226
23588	NC_014834	GC	3	6	900338	900343	0 %	0 %	50 %	50 %	316932226
23589	NC_014834	CGG	2	6	900402	900407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932226
23590	NC_014834	TCG	2	6	900424	900429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932226
23591	NC_014834	CGG	2	6	900515	900520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932226
23592	NC_014834	CTG	2	6	900549	900554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932226
23593	NC_014834	TCC	2	6	900586	900591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932226
23594	NC_014834	GC	3	6	900605	900610	0 %	0 %	50 %	50 %	316932226
23595	NC_014834	CGA	2	6	900710	900715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932226
23596	NC_014834	CGCTG	2	10	900764	900773	0 %	20 %	40 %	40 %	316932226
23597	NC_014834	CGC	2	6	900850	900855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23598	NC_014834	CGT	2	6	900992	900997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932227
23599	NC_014834	TGA	2	6	901015	901020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932227
23600	NC_014834	GCG	2	6	901026	901031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932227
23601	NC_014834	GGC	2	6	901048	901053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932227
23602	NC_014834	TAT	2	6	901110	901115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316932227
23603	NC_014834	CCGC	2	8	901116	901123	0 %	0 %	25 %	75 %	316932227
23604	NC_014834	CTT	2	6	901124	901129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932227
23605	NC_014834	TGG	3	9	901131	901139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932227
23606	NC_014834	CAT	2	6	901184	901189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932227
23607	NC_014834	CGG	2	6	901199	901204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932227
23608	NC_014834	TCG	2	6	901216	901221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932227
23609	NC_014834	ATG	2	6	901230	901235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932227
23610	NC_014834	ATC	2	6	901239	901244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932227
23611	NC_014834	CG	3	6	901249	901254	0 %	0 %	50 %	50 %	316932227
23612	NC_014834	GC	3	6	901284	901289	0 %	0 %	50 %	50 %	316932227
23613	NC_014834	CGC	2	6	901313	901318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932227
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23615	NC_014834	GCT	2	6	901451	901456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932227
23616	NC_014834	CGG	2	6	901513	901518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932227
23617	NC_014834	CTG	2	6	901545	901550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932227
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23619	NC_014834	GTC	2	6	901571	901576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932227
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