MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_014834	GAC	3	9	874702	874710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23003	NC_014834	GAC	2	6	874747	874752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23004	NC_014834	CTG	2	6	874777	874782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23005	NC_014834	GAC	2	6	874786	874791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23006	NC_014834	GCA	2	6	874815	874820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23007	NC_014834	GC	3	6	874838	874843	0 %	0 %	50 %	50 %	316932200
23008	NC_014834	GCCT	2	8	874874	874881	0 %	25 %	25 %	50 %	316932200
23009	NC_014834	GCCGC	2	10	874922	874931	0 %	0 %	40 %	60 %	316932200
23010	NC_014834	GCG	2	6	874965	874970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932200
23011	NC_014834	CGT	2	6	874974	874979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23012	NC_014834	TCGA	2	8	875015	875022	25 %	25 %	25 %	25 %	316932200
23013	NC_014834	GCGG	2	8	875075	875082	0 %	0 %	75 %	25 %	316932200
23014	NC_014834	GTC	2	6	875089	875094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932200
23015	NC_014834	GGCT	2	8	875161	875168	0 %	25 %	50 %	25 %	316932200
23016	NC_014834	GCG	2	6	875196	875201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932200
23017	NC_014834	CGC	2	6	875239	875244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23018	NC_014834	GCGCC	2	10	875258	875267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23019	NC_014834	CCG	3	9	875277	875285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23020	NC_014834	GCCG	2	8	875298	875305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23021	NC_014834	CCG	2	6	875326	875331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23022	NC_014834	TGC	2	6	875367	875372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23050	NC_014834	TGA	3	9	876471	876479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23052	NC_014834	TTC	2	6	876566	876571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23053	NC_014834	GGC	2	6	876573	876578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23054	NC_014834	CGC	2	6	876604	876609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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23056	NC_014834	CGG	2	6	876651	876656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23057	NC_014834	CGA	2	6	876660	876665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23058	NC_014834	CGG	2	6	876666	876671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23059	NC_014834	TCG	2	6	876699	876704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23061	NC_014834	GA	3	6	876799	876804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23062	NC_014834	GGC	2	6	876872	876877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932202
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23082	NC_014834	CAT	2	6	877938	877943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23085	NC_014834	TTCG	2	8	878059	878066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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23088	NC_014834	CG	3	6	878155	878160	0 %	0 %	50 %	50 %	316932204
23089	NC_014834	GACC	2	8	878245	878252	25 %	0 %	25 %	50 %	316932204
23090	NC_014834	TCCG	2	8	878413	878420	0 %	25 %	25 %	50 %	316932204
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23095	NC_014834	GC	3	6	878778	878783	0 %	0 %	50 %	50 %	316932204
23096	NC_014834	CAT	2	6	878843	878848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932204
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23102	NC_014834	CG	3	6	879030	879035	0 %	0 %	50 %	50 %	316932204
23103	NC_014834	ATT	2	6	879074	879079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316932204
23104	NC_014834	GGT	2	6	879107	879112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23105	NC_014834	TGA	2	6	879189	879194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932205
23106	NC_014834	GA	3	6	879223	879228	50 %	0 %	50 %	0 %	316932205
23107	NC_014834	CGA	2	6	879241	879246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932205
23108	NC_014834	GGCC	2	8	879324	879331	0 %	0 %	50 %	50 %	316932205
23109	NC_014834	TC	3	6	879484	879489	0 %	50 %	0 %	50 %	316932205
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23112	NC_014834	TC	3	6	879769	879774	0 %	50 %	0 %	50 %	316932205
23113	NC_014834	CAA	2	6	879832	879837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932205
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23118	NC_014834	GGC	2	6	880065	880070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23119	NC_014834	GGGGC	2	10	880144	880153	0 %	0 %	80 %	20 %	316932206
23120	NC_014834	CGG	2	6	880164	880169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932206
23121	NC_014834	TCA	2	6	880205	880210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932206
23122	NC_014834	TGC	2	6	880211	880216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932206
23123	NC_014834	ATC	2	6	880231	880236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932206
23124	NC_014834	GAT	2	6	880249	880254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932206
23125	NC_014834	GAT	2	6	880363	880368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932206
23126	NC_014834	CG	4	8	880396	880403	0 %	0 %	50 %	50 %	316932206
23127	NC_014834	AGA	2	6	880592	880597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932206
23128	NC_014834	TC	3	6	880610	880615	0 %	50 %	0 %	50 %	316932206
23129	NC_014834	GCAATC	2	12	880625	880636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316932206
23130	NC_014834	CG	3	6	880686	880691	0 %	0 %	50 %	50 %	316932206
23131	NC_014834	TG	3	6	880704	880709	0 %	50 %	50 %	0 %	316932206
23132	NC_014834	ATC	2	6	880747	880752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932206
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23134	NC_014834	TTG	2	6	880890	880895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932206
23135	NC_014834	TC	3	6	880910	880915	0 %	50 %	0 %	50 %	316932206
23136	NC_014834	CGCC	3	12	881017	881028	0 %	0 %	25 %	75 %	316932206
23137	NC_014834	GC	3	6	881079	881084	0 %	0 %	50 %	50 %	316932206
23138	NC_014834	AGC	2	6	881104	881109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932206
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23140	NC_014834	ATC	2	6	881179	881184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932206
23141	NC_014834	TCA	2	6	881280	881285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932206
23142	NC_014834	ACA	2	6	881427	881432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932207
23143	NC_014834	GC	3	6	881467	881472	0 %	0 %	50 %	50 %	316932207
23144	NC_014834	GCTT	2	8	881546	881553	0 %	50 %	25 %	25 %	316932207
23145	NC_014834	GGC	2	6	881789	881794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932207
23146	NC_014834	TGC	2	6	881829	881834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
23147	NC_014834	CTC	2	6	881902	881907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932207
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23149	NC_014834	CTG	2	6	882058	882063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
23150	NC_014834	C	6	6	882086	882091	0 %	0 %	0 %	100 %	316932207
23151	NC_014834	GTA	2	6	882220	882225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932207
23152	NC_014834	TCG	3	9	882236	882244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
23153	NC_014834	TCC	2	6	882257	882262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932207
23154	NC_014834	CTG	2	6	882326	882331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
23155	NC_014834	TCGC	2	8	882344	882351	0 %	25 %	25 %	50 %	316932207
23156	NC_014834	A	6	6	882370	882375	100 %	0 %	0 %	0 %	316932207
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23159	NC_014834	GCT	2	6	882540	882545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
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23163	NC_014834	TGC	2	6	882841	882846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
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23177	NC_014834	TCG	2	6	883466	883471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932207
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23180	NC_014834	CT	3	6	883606	883611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23181	NC_014834	TCGAT	2	10	883617	883626	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23182	NC_014834	CGC	2	6	883665	883670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23183	NC_014834	CTT	2	6	883693	883698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23184	NC_014834	GC	4	8	883788	883795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23185	NC_014834	GCG	2	6	883804	883809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23186	NC_014834	CGC	2	6	883815	883820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23187	NC_014834	GGT	2	6	883827	883832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23188	NC_014834	CGGG	2	8	883921	883928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23189	NC_014834	CGC	2	6	883945	883950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23190	NC_014834	CCTTGC	2	12	883951	883962	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23191	NC_014834	GCAGC	2	10	883992	884001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23192	NC_014834	CAA	2	6	884099	884104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23194	NC_014834	GAA	2	6	884120	884125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23195	NC_014834	GGC	2	6	884168	884173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23198	NC_014834	CGG	2	6	884230	884235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23200	NC_014834	GCT	2	6	884248	884253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23202	NC_014834	AAG	2	6	884317	884322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23203	NC_014834	ACCGA	2	10	884323	884332	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23204	NC_014834	ACG	2	6	884357	884362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23209	NC_014834	ATC	2	6	884668	884673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23211	NC_014834	GACCAA	2	12	884685	884696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23212	NC_014834	GGC	2	6	884700	884705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23213	NC_014834	GC	3	6	884715	884720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23214	NC_014834	TCG	2	6	884726	884731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23215	NC_014834	GC	3	6	884732	884737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23216	NC_014834	GGC	2	6	884755	884760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23217	NC_014834	CAT	2	6	884763	884768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23219	NC_014834	GGA	2	6	884964	884969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23220	NC_014834	CGC	3	9	884973	884981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23221	NC_014834	ACG	2	6	884984	884989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23222	NC_014834	GCA	2	6	884994	884999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23223	NC_014834	GGA	2	6	885027	885032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23224	NC_014834	CCG	2	6	885049	885054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23225	NC_014834	CGA	2	6	885129	885134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23226	NC_014834	CG	3	6	885140	885145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23227	NC_014834	GCG	3	9	885143	885151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23228	NC_014834	GGC	2	6	885304	885309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23229	NC_014834	GAG	3	9	885343	885351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23230	NC_014834	GGA	2	6	885357	885362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23231	NC_014834	AGC	2	6	885443	885448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23232	NC_014834	GGC	2	6	885505	885510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23233	NC_014834	CGA	2	6	885539	885544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23234	NC_014834	CGG	3	9	885584	885592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23235	NC_014834	CG	3	6	885638	885643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23236	NC_014834	CGC	2	6	885763	885768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23237	NC_014834	CGG	2	6	885779	885784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23238	NC_014834	CGG	2	6	885797	885802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23239	NC_014834	CGC	2	6	885879	885884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23240	NC_014834	CGA	2	6	885903	885908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23241	NC_014834	GGC	2	6	885909	885914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23242	NC_014834	GCC	2	6	885955	885960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23243	NC_014834	AGC	2	6	885962	885967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23244	NC_014834	GCC	2	6	885990	885995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23245	NC_014834	TGC	2	6	885998	886003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23246	NC_014834	GCC	2	6	886060	886065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23247	NC_014834	TGA	2	6	886089	886094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23250	NC_014834	CG	3	6	886187	886192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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23353	NC_014834	AG	3	6	890605	890610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23369	NC_014834	CGCC	2	8	891213	891220	0 %	0 %	25 %	75 %	316932214
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23371	NC_014834	GAT	2	6	891342	891347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932214
23372	NC_014834	GGC	2	6	891352	891357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932214
23373	NC_014834	CTG	3	9	891364	891372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932214
23374	NC_014834	GCC	2	6	891417	891422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932215
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23376	NC_014834	GC	3	6	891485	891490	0 %	0 %	50 %	50 %	316932215
23377	NC_014834	GGC	2	6	891515	891520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932215
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23379	NC_014834	TCC	2	6	891529	891534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932215
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23381	NC_014834	CAG	2	6	891603	891608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932215
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23392	NC_014834	GC	3	6	892237	892242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23393	NC_014834	ACG	2	6	892247	892252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23493	NC_014834	GCA	2	6	896011	896016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932222
23494	NC_014834	GC	4	8	896025	896032	0 %	0 %	50 %	50 %	316932222
23495	NC_014834	CAGG	2	8	896099	896106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23496	NC_014834	A	6	6	896149	896154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23497	NC_014834	GCG	3	9	896188	896196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23498	NC_014834	CGA	3	9	896376	896384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932223
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23500	NC_014834	CG	3	6	896475	896480	0 %	0 %	50 %	50 %	316932223

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