MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014834	AGCC	2	8	819558	819565	25 %	0 %	25 %	50 %	316932157
21502	NC_014834	CGCGG	2	10	819618	819627	0 %	0 %	60 %	40 %	316932157
21503	NC_014834	CGA	2	6	819665	819670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932157
21504	NC_014834	GCC	2	6	819691	819696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932157
21505	NC_014834	GCC	2	6	819702	819707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932157
21506	NC_014834	GCTGC	2	10	819750	819759	0 %	20 %	40 %	40 %	316932157
21507	NC_014834	GCC	2	6	819798	819803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932157
21508	NC_014834	TGC	2	6	819811	819816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932157
21509	NC_014834	GCG	2	6	819818	819823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932157
21510	NC_014834	CGA	2	6	819875	819880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932157
21511	NC_014834	TCT	2	6	819890	819895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932157
21512	NC_014834	GTC	2	6	819912	819917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932157
21513	NC_014834	AGCC	2	8	819937	819944	25 %	0 %	25 %	50 %	316932157
21514	NC_014834	CAC	2	6	819963	819968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932157
21515	NC_014834	ACG	2	6	820036	820041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932157
21516	NC_014834	CAG	2	6	820044	820049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932157
21517	NC_014834	CGC	2	6	820134	820139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932158
21518	NC_014834	CGG	2	6	820177	820182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932158
21519	NC_014834	CAG	2	6	820258	820263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21520	NC_014834	CCA	2	6	820281	820286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932158
21521	NC_014834	CGAG	2	8	820293	820300	25 %	0 %	50 %	25 %	316932158
21522	NC_014834	GCC	2	6	820306	820311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932158
21523	NC_014834	GC	3	6	820312	820317	0 %	0 %	50 %	50 %	316932158
21524	NC_014834	CAG	2	6	820360	820365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21525	NC_014834	GCCGC	2	10	820399	820408	0 %	0 %	40 %	60 %	316932158
21526	NC_014834	GCA	2	6	820416	820421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21527	NC_014834	GCTT	2	8	820445	820452	0 %	50 %	25 %	25 %	316932158
21528	NC_014834	GC	3	6	820454	820459	0 %	0 %	50 %	50 %	316932158
21529	NC_014834	CGAT	2	8	820482	820489	25 %	25 %	25 %	25 %	316932158
21530	NC_014834	AGA	2	6	820514	820519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932158
21531	NC_014834	TCG	2	6	820550	820555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21532	NC_014834	CGA	2	6	820578	820583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21533	NC_014834	CG	3	6	820611	820616	0 %	0 %	50 %	50 %	316932158
21534	NC_014834	CG	3	6	820618	820623	0 %	0 %	50 %	50 %	316932158
21535	NC_014834	GCC	2	6	820636	820641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932158
21536	NC_014834	TCAGCA	2	12	820659	820670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316932158
21537	NC_014834	CGC	3	9	820705	820713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932158
21538	NC_014834	GGC	2	6	820714	820719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932158
21539	NC_014834	CAG	2	6	820789	820794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21540	NC_014834	ACC	2	6	820823	820828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932158
21541	NC_014834	GCA	2	6	820850	820855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932158
21542	NC_014834	ATC	2	6	820880	820885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932158
21543	NC_014834	GCC	2	6	820900	820905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21544	NC_014834	TGG	2	6	820930	820935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21545	NC_014834	TGA	2	6	820946	820951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932159
21546	NC_014834	CGG	2	6	820956	820961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
21547	NC_014834	GCG	2	6	820972	820977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
21548	NC_014834	GGC	2	6	820990	820995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
21549	NC_014834	GCC	4	12	820996	821007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932159
21550	NC_014834	CGA	2	6	821100	821105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932159
21551	NC_014834	CG	3	6	821124	821129	0 %	0 %	50 %	50 %	316932159
21552	NC_014834	TCG	2	6	821162	821167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932159
21553	NC_014834	GCC	2	6	821170	821175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932159
21554	NC_014834	TCG	2	6	821234	821239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932159
21555	NC_014834	CTGGC	2	10	821263	821272	0 %	20 %	40 %	40 %	316932159
21556	NC_014834	GGT	3	9	821340	821348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932159
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21559	NC_014834	GCG	2	6	821404	821409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
21560	NC_014834	CGGCG	2	10	821419	821428	0 %	0 %	60 %	40 %	316932159
21561	NC_014834	CGA	2	6	821442	821447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932159
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21564	NC_014834	CGGCG	2	10	821585	821594	0 %	0 %	60 %	40 %	316932159
21565	NC_014834	CG	3	6	821687	821692	0 %	0 %	50 %	50 %	316932159
21566	NC_014834	GGC	2	6	821709	821714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
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21568	NC_014834	GGCC	2	8	821739	821746	0 %	0 %	50 %	50 %	316932159
21569	NC_014834	CGG	2	6	821757	821762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
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21572	NC_014834	TCGA	2	8	821903	821910	25 %	25 %	25 %	25 %	316932159
21573	NC_014834	CGG	2	6	821915	821920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932159
21574	NC_014834	CGC	2	6	821925	821930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932159
21575	NC_014834	GGC	2	6	821942	821947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21576	NC_014834	CGC	2	6	821978	821983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932160
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21578	NC_014834	CGT	2	6	822050	822055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932160
21579	NC_014834	GCG	2	6	822118	822123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932160
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21582	NC_014834	CGAG	2	8	822215	822222	25 %	0 %	50 %	25 %	316932160
21583	NC_014834	TCG	2	6	822232	822237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932160
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21586	NC_014834	GCG	2	6	822383	822388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932160
21587	NC_014834	CAA	2	6	822434	822439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932160
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21589	NC_014834	CGC	2	6	822536	822541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932160
21590	NC_014834	GC	3	6	822583	822588	0 %	0 %	50 %	50 %	316932160
21591	NC_014834	AGC	2	6	822589	822594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932160
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21594	NC_014834	GCA	2	6	822668	822673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932160
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21601	NC_014834	CGG	2	6	822859	822864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932161
21602	NC_014834	AGC	3	9	822867	822875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932161
21603	NC_014834	GC	3	6	822889	822894	0 %	0 %	50 %	50 %	316932161
21604	NC_014834	GCA	2	6	822898	822903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932161
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21606	NC_014834	GCC	2	6	822995	823000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932161
21607	NC_014834	GGC	2	6	823039	823044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932161
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21609	NC_014834	CAG	2	6	823118	823123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932161
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21611	NC_014834	CGA	2	6	823135	823140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932161
21612	NC_014834	CGAGC	2	10	823187	823196	20 %	0 %	40 %	40 %	316932161
21613	NC_014834	TCA	2	6	823243	823248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932161
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21615	NC_014834	CAG	4	12	823301	823312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932161
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21617	NC_014834	AGC	2	6	823338	823343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932161
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21619	NC_014834	GAT	2	6	823421	823426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932161
21620	NC_014834	GCG	2	6	823453	823458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932161
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21742	NC_014834	GCC	2	6	827808	827813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21862	NC_014834	GAT	2	6	831990	831995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932168
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21981	NC_014834	TCT	2	6	836682	836687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932171
21982	NC_014834	CCGA	2	8	836764	836771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21983	NC_014834	CTC	2	6	836792	836797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21984	NC_014834	GAG	2	6	836837	836842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21985	NC_014834	GCG	2	6	836854	836859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21986	NC_014834	CCT	2	6	836884	836889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21987	NC_014834	GCAGC	2	10	836964	836973	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21988	NC_014834	TCA	3	9	837002	837010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21989	NC_014834	TCT	2	6	837015	837020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21990	NC_014834	CGC	2	6	837064	837069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21991	NC_014834	GAC	2	6	837071	837076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21992	NC_014834	CATTG	2	10	837178	837187	20 %	40 %	20 %	20 %	316932172
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