MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_014834	CGGTG	2	10	802332	802341	0 %	20 %	60 %	20 %	316932139
21002	NC_014834	CCG	3	9	802416	802424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932139
21003	NC_014834	GTG	2	6	802464	802469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932139
21004	NC_014834	ACG	2	6	802481	802486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932139
21005	NC_014834	GCG	2	6	802573	802578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932139
21006	NC_014834	GCA	2	6	802591	802596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932139
21007	NC_014834	CAG	2	6	802600	802605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932139
21008	NC_014834	GGC	2	6	802635	802640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932140
21009	NC_014834	CGA	2	6	802655	802660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21010	NC_014834	CGG	2	6	802688	802693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932140
21011	NC_014834	CGG	2	6	802702	802707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932140
21012	NC_014834	CCA	2	6	802714	802719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932140
21013	NC_014834	CGC	2	6	802727	802732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932140
21014	NC_014834	GC	3	6	802746	802751	0 %	0 %	50 %	50 %	316932140
21015	NC_014834	CTG	2	6	802755	802760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21016	NC_014834	TCG	2	6	802774	802779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21017	NC_014834	GAT	2	6	802808	802813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932140
21018	NC_014834	CGA	2	6	803048	803053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21019	NC_014834	CCG	2	6	803075	803080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932140
21020	NC_014834	CGA	2	6	803180	803185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21021	NC_014834	GC	3	6	803217	803222	0 %	0 %	50 %	50 %	316932140
21022	NC_014834	CGA	2	6	803225	803230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21023	NC_014834	CGC	2	6	803255	803260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932140
21024	NC_014834	CG	4	8	803264	803271	0 %	0 %	50 %	50 %	316932140
21025	NC_014834	CGATGC	2	12	803278	803289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21026	NC_014834	ACG	3	9	803296	803304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21027	NC_014834	CAC	2	6	803363	803368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932140
21028	NC_014834	CG	4	8	803378	803385	0 %	0 %	50 %	50 %	316932140
21029	NC_014834	GTG	2	6	803430	803435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932140
21030	NC_014834	CGG	2	6	803438	803443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932140
21031	NC_014834	GGC	2	6	803465	803470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932140
21032	NC_014834	ACT	3	9	803512	803520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932140
21033	NC_014834	GCT	2	6	803531	803536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21034	NC_014834	CGC	2	6	803537	803542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932140
21035	NC_014834	GC	4	8	803610	803617	0 %	0 %	50 %	50 %	316932140
21036	NC_014834	GC	3	6	803657	803662	0 %	0 %	50 %	50 %	316932140
21037	NC_014834	TGC	2	6	803668	803673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21038	NC_014834	CGA	2	6	803678	803683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21039	NC_014834	TCGCG	2	10	803684	803693	0 %	20 %	40 %	40 %	316932140
21040	NC_014834	TCG	2	6	803707	803712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21041	NC_014834	CGG	2	6	803723	803728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932140
21042	NC_014834	CGA	2	6	803744	803749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932140
21043	NC_014834	CGC	2	6	803798	803803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932140
21044	NC_014834	ATC	2	6	803817	803822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21045	NC_014834	GCG	2	6	803899	803904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932141
21046	NC_014834	GTC	2	6	803920	803925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932141
21047	NC_014834	CGC	2	6	804098	804103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932141
21048	NC_014834	GCA	2	6	804186	804191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932141
21049	NC_014834	TGCG	2	8	804205	804212	0 %	25 %	50 %	25 %	316932141
21050	NC_014834	CGG	2	6	804242	804247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932141
21051	NC_014834	GCTC	2	8	804362	804369	0 %	25 %	25 %	50 %	316932141
21052	NC_014834	ACG	2	6	804383	804388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932141
21053	NC_014834	GCT	2	6	804399	804404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932141
21054	NC_014834	TGC	2	6	804461	804466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932141
21055	NC_014834	CG	4	8	804474	804481	0 %	0 %	50 %	50 %	316932141
21056	NC_014834	GCC	2	6	804548	804553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932142
21057	NC_014834	GAGCC	2	10	804561	804570	20 %	0 %	40 %	40 %	316932142
21058	NC_014834	CCCGG	2	10	804601	804610	0 %	0 %	40 %	60 %	316932142
21059	NC_014834	GGC	2	6	804701	804706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932142
21060	NC_014834	GC	3	6	804725	804730	0 %	0 %	50 %	50 %	316932142
21061	NC_014834	CAC	2	6	804734	804739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932142
21062	NC_014834	GGA	2	6	804776	804781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932142
21063	NC_014834	AGT	2	6	804793	804798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932142
21064	NC_014834	GCG	2	6	804823	804828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932142
21065	NC_014834	CGT	2	6	804838	804843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932142
21066	NC_014834	TGC	3	9	804900	804908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932142
21067	NC_014834	ATC	2	6	804930	804935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932142
21068	NC_014834	CGC	2	6	804973	804978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932142
21069	NC_014834	CGG	2	6	804994	804999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932142
21070	NC_014834	CCG	2	6	805024	805029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932142
21071	NC_014834	CTT	2	6	805066	805071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932142
21072	NC_014834	GCA	2	6	805081	805086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932142
21073	NC_014834	GCC	2	6	805094	805099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932142
21074	NC_014834	CGG	2	6	805111	805116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932142
21075	NC_014834	CAG	2	6	805154	805159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932142
21076	NC_014834	CCT	2	6	805168	805173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932142
21077	NC_014834	GCG	2	6	805198	805203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932142
21078	NC_014834	AGC	2	6	805222	805227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932142
21079	NC_014834	GCC	2	6	805249	805254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932142
21080	NC_014834	CG	3	6	805258	805263	0 %	0 %	50 %	50 %	316932142
21081	NC_014834	TCG	2	6	805300	805305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932142
21082	NC_014834	GAT	2	6	805363	805368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932142
21083	NC_014834	GCC	2	6	805478	805483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932142
21084	NC_014834	ACC	2	6	805489	805494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932142
21085	NC_014834	GC	3	6	805498	805503	0 %	0 %	50 %	50 %	316932142
21086	NC_014834	GTCA	2	8	805517	805524	25 %	25 %	25 %	25 %	316932142
21087	NC_014834	CAA	2	6	805550	805555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932142
21088	NC_014834	GTT	2	6	805681	805686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21089	NC_014834	CGAAGC	2	12	805733	805744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21090	NC_014834	CGC	2	6	805753	805758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21091	NC_014834	CGA	2	6	805815	805820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932143
21092	NC_014834	CGC	3	9	805833	805841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932143
21093	NC_014834	TGC	2	6	805937	805942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932143
21094	NC_014834	TCAG	2	8	805943	805950	25 %	25 %	25 %	25 %	316932143
21095	NC_014834	GGCG	2	8	806006	806013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21096	NC_014834	CGC	2	6	806035	806040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932144
21097	NC_014834	CCCGGC	2	12	806057	806068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932144
21098	NC_014834	TGG	2	6	806076	806081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932144
21099	NC_014834	TCGCGG	2	12	806085	806096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316932144
21100	NC_014834	CGG	3	9	806116	806124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932144
21101	NC_014834	GGCCG	2	10	806142	806151	0 %	0 %	60 %	40 %	316932144
21102	NC_014834	CGGC	2	8	806203	806210	0 %	0 %	50 %	50 %	316932144
21103	NC_014834	CGGC	2	8	806259	806266	0 %	0 %	50 %	50 %	316932144
21104	NC_014834	GCG	2	6	806295	806300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932144
21105	NC_014834	TGG	2	6	806313	806318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932144
21106	NC_014834	GC	3	6	806370	806375	0 %	0 %	50 %	50 %	316932144
21107	NC_014834	CTG	2	6	806390	806395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932144
21108	NC_014834	CG	3	6	806406	806411	0 %	0 %	50 %	50 %	316932144
21109	NC_014834	GC	4	8	806417	806424	0 %	0 %	50 %	50 %	316932144
21110	NC_014834	CGC	2	6	806440	806445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932144
21111	NC_014834	CCG	2	6	806456	806461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932144
21112	NC_014834	GAT	2	6	806547	806552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932145
21113	NC_014834	CAG	3	9	806628	806636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932145
21114	NC_014834	AAT	2	6	806672	806677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316932145
21115	NC_014834	GGC	2	6	806706	806711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932145
21116	NC_014834	GTT	2	6	806855	806860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21117	NC_014834	CAA	2	6	806927	806932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932146
21118	NC_014834	CTG	2	6	806955	806960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932146
21119	NC_014834	GT	3	6	806979	806984	0 %	50 %	50 %	0 %	316932146
21120	NC_014834	GGGC	2	8	807044	807051	0 %	0 %	75 %	25 %	316932146
21121	NC_014834	GCG	2	6	807085	807090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932146
21122	NC_014834	GCT	2	6	807091	807096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932146
21123	NC_014834	CG	3	6	807178	807183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21124	NC_014834	CGT	2	6	807189	807194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21226	NC_014834	CGT	2	6	810964	810969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21227	NC_014834	CGGGG	2	10	810970	810979	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21228	NC_014834	CGGA	2	8	810985	810992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21229	NC_014834	CG	3	6	811020	811025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21230	NC_014834	GAT	2	6	811052	811057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21236	NC_014834	GC	3	6	811182	811187	0 %	0 %	50 %	50 %	316932151
21237	NC_014834	TGC	2	6	811191	811196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932151
21238	NC_014834	CCGCG	2	10	811204	811213	0 %	0 %	40 %	60 %	316932151
21239	NC_014834	GGCG	2	8	811216	811223	0 %	0 %	75 %	25 %	316932151
21240	NC_014834	GC	3	6	811240	811245	0 %	0 %	50 %	50 %	316932151
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21242	NC_014834	GCGG	2	8	811298	811305	0 %	0 %	75 %	25 %	316932151
21243	NC_014834	GCG	2	6	811341	811346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932151
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21251	NC_014834	CGG	2	6	811524	811529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932152
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21253	NC_014834	ATCT	2	8	811591	811598	25 %	50 %	0 %	25 %	316932152
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21353	NC_014834	CGAT	2	8	814658	814665	25 %	25 %	25 %	25 %	316932154
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21364	NC_014834	CGA	2	6	815004	815009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932154
21365	NC_014834	GGC	2	6	815019	815024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932154
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21367	NC_014834	CAT	2	6	815064	815069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932154
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21432	NC_014834	CGA	2	6	817352	817357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932155
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21480	NC_014834	GAT	2	6	819075	819080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932156
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