MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014834	GCC	2	6	727480	727485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932067
19002	NC_014834	GGC	2	6	727554	727559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932067
19003	NC_014834	CGGC	2	8	727562	727569	0 %	0 %	50 %	50 %	316932067
19004	NC_014834	ATG	2	6	727603	727608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932067
19005	NC_014834	CATC	2	8	727701	727708	25 %	25 %	0 %	50 %	316932067
19006	NC_014834	GC	3	6	727731	727736	0 %	0 %	50 %	50 %	316932067
19007	NC_014834	GC	3	6	727746	727751	0 %	0 %	50 %	50 %	316932067
19008	NC_014834	ACG	2	6	727934	727939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932067
19009	NC_014834	CGT	2	6	727982	727987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932067
19010	NC_014834	CGG	2	6	728000	728005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932067
19011	NC_014834	TGC	3	9	728042	728050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932067
19012	NC_014834	CG	3	6	728056	728061	0 %	0 %	50 %	50 %	316932067
19013	NC_014834	GCT	2	6	728072	728077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932067
19014	NC_014834	CGC	2	6	728085	728090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932067
19015	NC_014834	GGC	2	6	728098	728103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932067
19016	NC_014834	ATC	2	6	728143	728148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932067
19017	NC_014834	GTG	2	6	728161	728166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932067
19018	NC_014834	GGC	2	6	728176	728181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932067
19019	NC_014834	TCA	2	6	728195	728200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932067
19020	NC_014834	GC	3	6	728233	728238	0 %	0 %	50 %	50 %	316932067
19021	NC_014834	GCA	2	6	728256	728261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932067
19022	NC_014834	GCC	2	6	728264	728269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932067
19023	NC_014834	CATCTG	2	12	728305	728316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316932067
19024	NC_014834	TCG	2	6	728388	728393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932068
19025	NC_014834	TCG	2	6	728482	728487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932068
19026	NC_014834	CG	3	6	728505	728510	0 %	0 %	50 %	50 %	316932068
19027	NC_014834	GCC	2	6	728523	728528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932068
19028	NC_014834	CGC	2	6	728534	728539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932068
19029	NC_014834	GTT	2	6	728585	728590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932068
19030	NC_014834	GC	3	6	728612	728617	0 %	0 %	50 %	50 %	316932068
19031	NC_014834	CCG	2	6	728653	728658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932068
19032	NC_014834	GC	4	8	728688	728695	0 %	0 %	50 %	50 %	316932068
19033	NC_014834	CCGA	2	8	728745	728752	25 %	0 %	25 %	50 %	316932068
19034	NC_014834	CGA	2	6	728768	728773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932068
19035	NC_014834	CGC	2	6	728788	728793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932068
19036	NC_014834	TGC	2	6	728800	728805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932068
19037	NC_014834	GC	3	6	728853	728858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19038	NC_014834	GA	3	6	728942	728947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_014834	GGGCG	2	10	728990	728999	0 %	0 %	80 %	20 %	316932069
19040	NC_014834	GC	3	6	729005	729010	0 %	0 %	50 %	50 %	316932069
19041	NC_014834	CTC	2	6	729061	729066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932069
19042	NC_014834	CGG	2	6	729092	729097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932069
19043	NC_014834	GTG	3	9	729178	729186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932069
19044	NC_014834	CGG	2	6	729198	729203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932069
19045	NC_014834	GCT	2	6	729204	729209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932069
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19047	NC_014834	CGT	2	6	729296	729301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932069
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19049	NC_014834	GTG	2	6	729370	729375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932069
19050	NC_014834	TGG	3	9	729377	729385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932069
19051	NC_014834	GGATCG	2	12	729431	729442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316932069
19052	NC_014834	CGC	2	6	729450	729455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932069
19053	NC_014834	ATC	2	6	729466	729471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932069
19054	NC_014834	CAG	2	6	729496	729501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19055	NC_014834	GAT	2	6	729532	729537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932070
19056	NC_014834	GCT	2	6	729555	729560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19057	NC_014834	AGT	2	6	729567	729572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932070
19058	NC_014834	GGC	3	9	729625	729633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932070
19059	NC_014834	GCA	2	6	729726	729731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19060	NC_014834	GCG	2	6	729735	729740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932070
19061	NC_014834	CAG	2	6	729748	729753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19062	NC_014834	CGG	2	6	729810	729815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932070
19063	NC_014834	CAC	2	6	729835	729840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932070
19064	NC_014834	GAT	2	6	729841	729846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932070
19065	NC_014834	CGC	2	6	729849	729854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932070
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19068	NC_014834	GCG	2	6	729935	729940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932070
19069	NC_014834	GAC	3	9	729958	729966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
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19071	NC_014834	ACGA	2	8	730085	730092	50 %	0 %	25 %	25 %	316932070
19072	NC_014834	CGC	2	6	730105	730110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932070
19073	NC_014834	CAT	2	6	730114	730119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932070
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19077	NC_014834	CGC	2	6	730204	730209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932070
19078	NC_014834	GAA	2	6	730222	730227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932070
19079	NC_014834	CAG	2	6	730228	730233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19080	NC_014834	TGG	2	6	730266	730271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932070
19081	NC_014834	CGGTC	2	10	730288	730297	0 %	20 %	40 %	40 %	316932070
19082	NC_014834	GC	3	6	730318	730323	0 %	0 %	50 %	50 %	316932070
19083	NC_014834	CGA	2	6	730341	730346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19084	NC_014834	GAC	2	6	730369	730374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932070
19085	NC_014834	AGG	2	6	730396	730401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19086	NC_014834	CGC	2	6	730404	730409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19087	NC_014834	TCG	2	6	730513	730518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19088	NC_014834	CCG	2	6	730660	730665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932071
19089	NC_014834	GCG	2	6	730686	730691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932071
19090	NC_014834	CGGG	2	8	730757	730764	0 %	0 %	75 %	25 %	316932071
19091	NC_014834	CGAC	2	8	730775	730782	25 %	0 %	25 %	50 %	316932071
19092	NC_014834	CCAC	2	8	730844	730851	25 %	0 %	0 %	75 %	316932071
19093	NC_014834	TGC	2	6	730886	730891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932071
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19096	NC_014834	CGA	2	6	730989	730994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932071
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19098	NC_014834	ATCTTC	2	12	731029	731040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	316932071
19099	NC_014834	CAC	2	6	731082	731087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932071
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19101	NC_014834	CGC	2	6	731106	731111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932071
19102	NC_014834	CGGC	2	8	731115	731122	0 %	0 %	50 %	50 %	316932071
19103	NC_014834	GC	3	6	731199	731204	0 %	0 %	50 %	50 %	316932071
19104	NC_014834	GGT	2	6	731208	731213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932071
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19106	NC_014834	GGA	2	6	731244	731249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932071
19107	NC_014834	CGG	2	6	731265	731270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932071
19108	NC_014834	CGAT	2	8	731279	731286	25 %	25 %	25 %	25 %	316932071
19109	NC_014834	CAGCG	2	10	731287	731296	20 %	0 %	40 %	40 %	316932071
19110	NC_014834	CG	3	6	731315	731320	0 %	0 %	50 %	50 %	316932071
19111	NC_014834	ATC	2	6	731347	731352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932071
19112	NC_014834	GT	3	6	731360	731365	0 %	50 %	50 %	0 %	316932071
19113	NC_014834	ACCC	2	8	731402	731409	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19114	NC_014834	GC	3	6	731448	731453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19115	NC_014834	ACCC	2	8	731456	731463	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19116	NC_014834	CAT	2	6	731493	731498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932072
19117	NC_014834	CGGTGA	2	12	731570	731581	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316932072
19118	NC_014834	TGC	2	6	731599	731604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932072
19119	NC_014834	CG	3	6	731648	731653	0 %	0 %	50 %	50 %	316932072
19120	NC_014834	CAGC	2	8	731655	731662	25 %	0 %	25 %	50 %	316932072
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19231	NC_014834	CCG	3	9	736305	736313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19232	NC_014834	GTC	2	6	736318	736323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19241	NC_014834	CGC	2	6	736764	736769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932075
19242	NC_014834	CGG	2	6	736818	736823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932075
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19362	NC_014834	GTG	2	6	740840	740845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932079
19363	NC_014834	CGA	3	9	740917	740925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932079
19364	NC_014834	GAT	2	6	740995	741000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932079
19365	NC_014834	GCT	2	6	741010	741015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932079
19366	NC_014834	GAC	2	6	741035	741040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932079
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19368	NC_014834	CGA	2	6	741168	741173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932079
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19385	NC_014834	CTG	2	6	741729	741734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932080
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19387	NC_014834	GC	3	6	741795	741800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19388	NC_014834	CTCA	2	8	741895	741902	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19389	NC_014834	GC	3	6	741924	741929	0 %	0 %	50 %	50 %	316932081
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19394	NC_014834	GCC	2	6	742013	742018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932081
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19426	NC_014834	GCAG	2	8	743222	743229	25 %	0 %	50 %	25 %	316932082
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19456	NC_014834	TGC	2	6	744510	744515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19458	NC_014834	CCGGT	2	10	744569	744578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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19481	NC_014834	GC	3	6	745538	745543	0 %	0 %	50 %	50 %	316932084
19482	NC_014834	GGT	3	9	745603	745611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932084
19483	NC_014834	CGC	2	6	745723	745728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932084
19484	NC_014834	TGC	2	6	745767	745772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932084
19485	NC_014834	CCCG	2	8	745803	745810	0 %	0 %	25 %	75 %	316932084
19486	NC_014834	GCC	4	12	745811	745822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932084
19487	NC_014834	TGGTGC	2	12	745827	745838	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	316932084
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19490	NC_014834	GCG	2	6	745932	745937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932084
19491	NC_014834	CAG	2	6	745939	745944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932084
19492	NC_014834	CGG	2	6	745951	745956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932084
19493	NC_014834	CCG	2	6	745962	745967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932084
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