MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014834	CGG	2	6	690455	690460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932036
18002	NC_014834	CGG	2	6	690467	690472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932036
18003	NC_014834	GACC	2	8	690498	690505	25 %	0 %	25 %	50 %	316932036
18004	NC_014834	CGT	2	6	690521	690526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932036
18005	NC_014834	AGC	2	6	690529	690534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932036
18006	NC_014834	CGT	2	6	690541	690546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932036
18007	NC_014834	CGA	2	6	690557	690562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932036
18008	NC_014834	GTG	2	6	690576	690581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932036
18009	NC_014834	GACCG	2	10	690663	690672	20 %	0 %	40 %	40 %	316932036
18010	NC_014834	ATC	2	6	690708	690713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932036
18011	NC_014834	TCGGCC	2	12	690724	690735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18012	NC_014834	ACG	2	6	690748	690753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_014834	GGC	2	6	690771	690776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_014834	GCC	3	9	690892	690900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932037
18015	NC_014834	GGT	2	6	690906	690911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932037
18016	NC_014834	CAGC	2	8	690926	690933	25 %	0 %	25 %	50 %	316932037
18017	NC_014834	TGC	2	6	690946	690951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932037
18018	NC_014834	ACA	2	6	691181	691186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932037
18019	NC_014834	CCT	2	6	691196	691201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932037
18020	NC_014834	CAC	2	6	691215	691220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932037
18021	NC_014834	CAG	2	6	691263	691268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932037
18022	NC_014834	ACC	2	6	691282	691287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932037
18023	NC_014834	GCG	2	6	691289	691294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932037
18024	NC_014834	GTT	2	6	691299	691304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932037
18025	NC_014834	CGC	2	6	691305	691310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932037
18026	NC_014834	AGC	2	6	691348	691353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932037
18027	NC_014834	GC	3	6	691373	691378	0 %	0 %	50 %	50 %	316932037
18028	NC_014834	GCA	2	6	691391	691396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932037
18029	NC_014834	GAT	2	6	691449	691454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932037
18030	NC_014834	GGT	2	6	691479	691484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932037
18031	NC_014834	GGCC	2	8	691511	691518	0 %	0 %	50 %	50 %	316932037
18032	NC_014834	CG	3	6	691534	691539	0 %	0 %	50 %	50 %	316932037
18033	NC_014834	TGC	2	6	691622	691627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932037
18034	NC_014834	GCC	3	9	691642	691650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932037
18035	NC_014834	CCA	2	6	691658	691663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932037
18036	NC_014834	TTC	2	6	691701	691706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316932037
18037	NC_014834	GTG	2	6	691714	691719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932037
18038	NC_014834	GA	3	6	691738	691743	50 %	0 %	50 %	0 %	316932037
18039	NC_014834	CA	3	6	691791	691796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18040	NC_014834	AG	3	6	691882	691887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_014834	CAATG	2	10	691897	691906	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18042	NC_014834	CCGC	2	8	691916	691923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18043	NC_014834	GCG	2	6	691949	691954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_014834	GAGGCG	2	12	691989	692000	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18045	NC_014834	GCA	2	6	692102	692107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932038
18046	NC_014834	GCGTG	2	10	692132	692141	0 %	20 %	60 %	20 %	316932038
18047	NC_014834	GCC	2	6	692145	692150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932038
18048	NC_014834	CCGA	2	8	692167	692174	25 %	0 %	25 %	50 %	316932038
18049	NC_014834	GAA	2	6	692223	692228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932038
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18051	NC_014834	CGT	2	6	692303	692308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932038
18052	NC_014834	CGC	2	6	692339	692344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932038
18053	NC_014834	GAC	2	6	692370	692375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932038
18054	NC_014834	TCG	2	6	692395	692400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932038
18055	NC_014834	GAT	2	6	692412	692417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932038
18056	NC_014834	GCG	2	6	692446	692451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932038
18057	NC_014834	CGC	2	6	692543	692548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932038
18058	NC_014834	ACC	3	9	692557	692565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932038
18059	NC_014834	GCGG	2	8	692571	692578	0 %	0 %	75 %	25 %	316932038
18060	NC_014834	CAC	2	6	692584	692589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932038
18061	NC_014834	AGC	2	6	692590	692595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932038
18062	NC_014834	CTG	2	6	692604	692609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932038
18063	NC_014834	AAT	2	6	692625	692630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316932038
18064	NC_014834	TGT	2	6	692730	692735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_014834	GAG	2	6	692790	692795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316932039
18066	NC_014834	GCT	2	6	692842	692847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932039
18067	NC_014834	GC	3	6	692882	692887	0 %	0 %	50 %	50 %	316932039
18068	NC_014834	ATC	2	6	692889	692894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932039
18069	NC_014834	GCG	2	6	692910	692915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932039
18070	NC_014834	GCT	2	6	692917	692922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932039
18071	NC_014834	CGGC	2	8	692923	692930	0 %	0 %	50 %	50 %	316932039
18072	NC_014834	GC	4	8	692932	692939	0 %	0 %	50 %	50 %	316932039
18073	NC_014834	TCC	2	6	692955	692960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316932039
18074	NC_014834	GCCG	2	8	692983	692990	0 %	0 %	50 %	50 %	316932039
18075	NC_014834	CGC	3	9	693013	693021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932039
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18077	NC_014834	TTG	2	6	693054	693059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932039
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18081	NC_014834	GGCC	2	8	693152	693159	0 %	0 %	50 %	50 %	316932039
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18093	NC_014834	TTG	2	6	693480	693485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316932039
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18102	NC_014834	GC	3	6	693832	693837	0 %	0 %	50 %	50 %	316932039
18103	NC_014834	TGA	2	6	693862	693867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_014834	CG	3	6	694042	694047	0 %	0 %	50 %	50 %	316932040
18105	NC_014834	GC	3	6	694080	694085	0 %	0 %	50 %	50 %	316932040
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18109	NC_014834	TGG	2	6	694165	694170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932040
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18111	NC_014834	GTC	2	6	694211	694216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932040
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18118	NC_014834	GCG	2	6	694519	694524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_014834	GC	3	6	694638	694643	0 %	0 %	50 %	50 %	316932041
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18121	NC_014834	CGG	3	9	694775	694783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932041
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18227	NC_014834	GTC	2	6	698639	698644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932045
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18240	NC_014834	GGC	2	6	699209	699214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932045
18241	NC_014834	GCCA	2	8	699237	699244	25 %	0 %	25 %	50 %	316932045
18242	NC_014834	GGC	2	6	699323	699328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932045
18243	NC_014834	CGC	2	6	699341	699346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932045
18244	NC_014834	CAA	2	6	699361	699366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932045
18245	NC_014834	GCC	2	6	699371	699376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932045
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18247	NC_014834	TCA	2	6	699483	699488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932045
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18253	NC_014834	CGT	2	6	699970	699975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18254	NC_014834	GAT	2	6	699994	699999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18255	NC_014834	TGA	3	9	700008	700016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18256	NC_014834	TGC	2	6	700022	700027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18257	NC_014834	GTC	2	6	700047	700052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18258	NC_014834	AGT	2	6	700098	700103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18259	NC_014834	GGC	2	6	700249	700254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932046
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18261	NC_014834	CGA	2	6	700342	700347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932046
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18265	NC_014834	GGC	2	6	700547	700552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932046
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18275	NC_014834	GC	3	6	701067	701072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18276	NC_014834	CGT	2	6	701175	701180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18278	NC_014834	TG	3	6	701198	701203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18279	NC_014834	GCG	2	6	701211	701216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18280	NC_014834	CGA	2	6	701217	701222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18281	NC_014834	GCTC	2	8	701228	701235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18282	NC_014834	GTGAG	2	10	701260	701269	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18283	NC_014834	CAGC	2	8	701347	701354	25 %	0 %	25 %	50 %	316932047
18284	NC_014834	GC	3	6	701390	701395	0 %	0 %	50 %	50 %	316932047
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18305	NC_014834	CAC	2	6	701959	701964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316932047
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18319	NC_014834	GATC	2	8	702510	702517	25 %	25 %	25 %	25 %	316932047
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18321	NC_014834	TCG	2	6	702560	702565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932047
18322	NC_014834	CGGT	2	8	702612	702619	0 %	25 %	50 %	25 %	316932047
18323	NC_014834	GGCCTG	2	12	702649	702660	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316932047
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18333	NC_014834	TCG	2	6	703108	703113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932047
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18345	NC_014834	GTC	2	6	703459	703464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932047
18346	NC_014834	GCG	2	6	703485	703490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932047
18347	NC_014834	CATCG	2	10	703570	703579	20 %	20 %	20 %	40 %	316932047
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18349	NC_014834	GCC	2	6	703683	703688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18350	NC_014834	GCT	2	6	703794	703799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932048
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18352	NC_014834	CCAGC	2	10	703863	703872	20 %	0 %	20 %	60 %	316932048
18353	NC_014834	GAC	2	6	703873	703878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932048
18354	NC_014834	AGCC	2	8	703923	703930	25 %	0 %	25 %	50 %	316932048
18355	NC_014834	TGA	2	6	703952	703957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932048
18356	NC_014834	GCG	2	6	704062	704067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932049
18357	NC_014834	CAGC	2	8	704087	704094	25 %	0 %	25 %	50 %	316932049
18358	NC_014834	TCG	2	6	704142	704147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932049
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18360	NC_014834	GCCG	2	8	704156	704163	0 %	0 %	50 %	50 %	316932049
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18369	NC_014834	CGT	2	6	704450	704455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932050
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18480	NC_014834	CGC	2	6	708171	708176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932053
18481	NC_014834	CGA	2	6	708218	708223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932053
18482	NC_014834	GGT	2	6	708227	708232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316932053
18483	NC_014834	CGC	2	6	708239	708244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932053
18484	NC_014834	GC	3	6	708247	708252	0 %	0 %	50 %	50 %	316932053
18485	NC_014834	AGA	2	6	708352	708357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316932053
18486	NC_014834	CGG	2	6	708380	708385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932053
18487	NC_014834	CAA	2	6	708401	708406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316932053
18488	NC_014834	CGG	2	6	708425	708430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932053
18489	NC_014834	ATC	2	6	708438	708443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316932053
18490	NC_014834	CCGG	2	8	708461	708468	0 %	0 %	50 %	50 %	316932053
18491	NC_014834	GAT	2	6	708488	708493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932053
18492	NC_014834	CGA	2	6	708502	708507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932053
18493	NC_014834	AGC	2	6	708553	708558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932053
18494	NC_014834	GCA	2	6	708571	708576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932053
18495	NC_014834	CGGC	2	8	708672	708679	0 %	0 %	50 %	50 %	316932053
18496	NC_014834	GC	3	6	708706	708711	0 %	0 %	50 %	50 %	316932053
18497	NC_014834	CGCGA	2	10	708735	708744	20 %	0 %	40 %	40 %	316932053
18498	NC_014834	CGGCAA	2	12	708749	708760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932053
18499	NC_014834	GCT	3	9	708761	708769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932053
18500	NC_014834	TCGATC	2	12	708784	708795	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316932053

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