MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014834	GAG	2	6	648299	648304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931991
17002	NC_014834	GAT	2	6	648308	648313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931991
17003	NC_014834	CGA	2	6	648388	648393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931991
17004	NC_014834	CCG	2	6	648420	648425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931991
17005	NC_014834	GCGA	2	8	648462	648469	25 %	0 %	50 %	25 %	316931991
17006	NC_014834	AGC	2	6	648471	648476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931991
17007	NC_014834	GCG	2	6	648477	648482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931991
17008	NC_014834	GAA	2	6	648719	648724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931991
17009	NC_014834	TCGG	2	8	648752	648759	0 %	25 %	50 %	25 %	316931991
17010	NC_014834	AGG	2	6	648825	648830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931992
17011	NC_014834	CGA	2	6	648844	648849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17012	NC_014834	GAG	2	6	648881	648886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931992
17013	NC_014834	AGT	2	6	648936	648941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931992
17014	NC_014834	CAG	2	6	648995	649000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17015	NC_014834	CGA	2	6	649015	649020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17016	NC_014834	TCG	2	6	649077	649082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17017	NC_014834	GGC	2	6	649194	649199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931992
17018	NC_014834	AGG	2	6	649218	649223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931992
17019	NC_014834	TCG	2	6	649227	649232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17020	NC_014834	CAC	2	6	649289	649294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931992
17021	NC_014834	GGC	2	6	649314	649319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931992
17022	NC_014834	GAT	2	6	649388	649393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931992
17023	NC_014834	CGA	2	6	649471	649476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17024	NC_014834	CT	3	6	649488	649493	0 %	50 %	0 %	50 %	316931992
17025	NC_014834	AGCG	2	8	649503	649510	25 %	0 %	50 %	25 %	316931992
17026	NC_014834	CAT	3	9	649640	649648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931992
17027	NC_014834	CGCT	2	8	649696	649703	0 %	25 %	25 %	50 %	316931992
17028	NC_014834	CGA	2	6	649734	649739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931992
17029	NC_014834	GC	3	6	649775	649780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17030	NC_014834	CAC	2	6	649810	649815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17031	NC_014834	CT	3	6	649826	649831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17032	NC_014834	TCA	2	6	649859	649864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_014834	A	6	6	649864	649869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_014834	GGC	2	6	649946	649951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_014834	TGT	2	6	649966	649971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_014834	GACC	2	8	650017	650024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17037	NC_014834	CTA	2	6	650148	650153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931993
17038	NC_014834	GAAG	2	8	650162	650169	50 %	0 %	50 %	0 %	316931993
17039	NC_014834	AGC	2	6	650240	650245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17040	NC_014834	GGA	2	6	650337	650342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931993
17041	NC_014834	TACG	2	8	650379	650386	25 %	25 %	25 %	25 %	316931993
17042	NC_014834	AAG	2	6	650431	650436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931993
17043	NC_014834	CGT	2	6	650445	650450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17044	NC_014834	CG	3	6	650459	650464	0 %	0 %	50 %	50 %	316931993
17045	NC_014834	GAA	2	6	650467	650472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931993
17046	NC_014834	ATGC	2	8	650513	650520	25 %	25 %	25 %	25 %	316931993
17047	NC_014834	GGC	2	6	650530	650535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931993
17048	NC_014834	CGG	2	6	650550	650555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931993
17049	NC_014834	GTC	2	6	650590	650595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17050	NC_014834	CAA	2	6	650616	650621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931993
17051	NC_014834	GC	3	6	650651	650656	0 %	0 %	50 %	50 %	316931993
17052	NC_014834	GAA	2	6	650689	650694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931993
17053	NC_014834	GAC	2	6	650815	650820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17054	NC_014834	TGG	2	6	650822	650827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931993
17055	NC_014834	CGG	2	6	650849	650854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931993
17056	NC_014834	CCG	2	6	650868	650873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931993
17057	NC_014834	CAT	2	6	650940	650945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931993
17058	NC_014834	CCGT	2	8	651035	651042	0 %	25 %	25 %	50 %	316931993
17059	NC_014834	CCG	2	6	651158	651163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931993
17060	NC_014834	CGT	2	6	651222	651227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17061	NC_014834	GGC	2	6	651293	651298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931993
17062	NC_014834	CG	3	6	651332	651337	0 %	0 %	50 %	50 %	316931993
17063	NC_014834	GAA	2	6	651394	651399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931993
17064	NC_014834	GGC	3	9	651451	651459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931993
17065	NC_014834	TCCT	2	8	651478	651485	0 %	50 %	0 %	50 %	316931993
17066	NC_014834	ACGC	2	8	651532	651539	25 %	0 %	25 %	50 %	316931993
17067	NC_014834	ACG	2	6	651569	651574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931993
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17069	NC_014834	GTT	2	6	651672	651677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931993
17070	NC_014834	CCG	2	6	651678	651683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931993
17071	NC_014834	GCC	2	6	651694	651699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931993
17072	NC_014834	CAG	2	6	651755	651760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17073	NC_014834	TCG	2	6	651770	651775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931993
17074	NC_014834	GAT	2	6	651792	651797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931994
17075	NC_014834	AGC	2	6	651834	651839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931994
17076	NC_014834	CAA	2	6	651978	651983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931994
17077	NC_014834	TATC	2	8	652017	652024	25 %	50 %	0 %	25 %	316931994
17078	NC_014834	TC	4	8	652047	652054	0 %	50 %	0 %	50 %	316931994
17079	NC_014834	ACG	2	6	652105	652110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931994
17080	NC_014834	CAC	2	6	652135	652140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931994
17081	NC_014834	ACA	2	6	652211	652216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931994
17082	NC_014834	GGGC	2	8	652385	652392	0 %	0 %	75 %	25 %	316931994
17083	NC_014834	GAAGC	2	10	652423	652432	40 %	0 %	40 %	20 %	316931994
17084	NC_014834	GAA	2	6	652449	652454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931994
17085	NC_014834	CAA	2	6	652480	652485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17086	NC_014834	AGCG	2	8	652492	652499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17087	NC_014834	CAG	2	6	652563	652568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931995
17088	NC_014834	GCG	2	6	652606	652611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931995
17089	NC_014834	GCG	2	6	652734	652739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931995
17090	NC_014834	CAG	2	6	652750	652755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931995
17091	NC_014834	G	6	6	652862	652867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_014834	CGA	2	6	652868	652873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_014834	TG	3	6	652885	652890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_014834	CCGCT	2	10	652915	652924	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17095	NC_014834	AGG	2	6	652943	652948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_014834	GGT	2	6	653002	653007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931996
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17098	NC_014834	TCG	2	6	653159	653164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931996
17099	NC_014834	GAC	2	6	653202	653207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931996
17100	NC_014834	CTT	2	6	653265	653270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931996
17101	NC_014834	AAG	2	6	653311	653316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931996
17102	NC_014834	GGT	2	6	653351	653356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931996
17103	NC_014834	CCG	2	6	653413	653418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931996
17104	NC_014834	GAT	2	6	653431	653436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931996
17105	NC_014834	CG	5	10	653535	653544	0 %	0 %	50 %	50 %	316931996
17106	NC_014834	ATT	2	6	653654	653659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316931996
17107	NC_014834	AAG	2	6	653701	653706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931996
17108	NC_014834	GACC	2	8	653757	653764	25 %	0 %	25 %	50 %	316931996
17109	NC_014834	GAT	2	6	653805	653810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931996
17110	NC_014834	GGC	2	6	653993	653998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931996
17111	NC_014834	GC	3	6	654064	654069	0 %	0 %	50 %	50 %	316931996
17112	NC_014834	TTC	2	6	654097	654102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931996
17113	NC_014834	CGA	2	6	654126	654131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931996
17114	NC_014834	ACT	2	6	654236	654241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931996
17115	NC_014834	GAT	2	6	654388	654393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931997
17116	NC_014834	AGA	2	6	654446	654451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931997
17117	NC_014834	GAC	2	6	654525	654530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931997
17118	NC_014834	AT	3	6	654559	654564	50 %	50 %	0 %	0 %	316931997
17119	NC_014834	CAT	2	6	654666	654671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931997
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17121	NC_014834	TACG	2	8	654726	654733	25 %	25 %	25 %	25 %	316931997
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17242	NC_014834	C	6	6	661005	661010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17243	NC_014834	TAT	2	6	661035	661040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17244	NC_014834	GAT	2	6	661069	661074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17245	NC_014834	CTGA	2	8	661132	661139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17246	NC_014834	CT	3	6	661142	661147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17247	NC_014834	CGA	2	6	661304	661309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17364	NC_014834	TCG	2	6	666223	666228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932009
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17481	NC_014834	TCGGC	2	10	670051	670060	0 %	20 %	40 %	40 %	316932014
17482	NC_014834	CGC	2	6	670078	670083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932015
17483	NC_014834	AGC	2	6	670103	670108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932015
17484	NC_014834	CG	3	6	670122	670127	0 %	0 %	50 %	50 %	316932015
17485	NC_014834	GCCG	2	8	670174	670181	0 %	0 %	50 %	50 %	316932015
17486	NC_014834	TGCC	2	8	670198	670205	0 %	25 %	25 %	50 %	316932015
17487	NC_014834	GGC	2	6	670236	670241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932015
17488	NC_014834	CG	3	6	670274	670279	0 %	0 %	50 %	50 %	316932015
17489	NC_014834	CCG	2	6	670284	670289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932015
17490	NC_014834	AGC	2	6	670298	670303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932015
17491	NC_014834	GCC	2	6	670381	670386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932015
17492	NC_014834	CAG	3	9	670402	670410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316932015
17493	NC_014834	TCG	2	6	670445	670450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316932015
17494	NC_014834	CGGTCG	2	12	670509	670520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316932015
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17496	NC_014834	CGCGGG	2	12	670539	670550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316932015
17497	NC_014834	CAGC	2	8	670558	670565	25 %	0 %	25 %	50 %	316932015
17498	NC_014834	GCCG	2	8	670578	670585	0 %	0 %	50 %	50 %	316932015
17499	NC_014834	GCC	2	6	670594	670599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316932015
17500	NC_014834	GTA	2	6	670639	670644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316932015

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