MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_014834	GCT	2	6	624231	624236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931972
16502	NC_014834	TCG	2	6	624305	624310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931972
16503	NC_014834	TTGG	2	8	624316	624323	0 %	50 %	50 %	0 %	316931972
16504	NC_014834	CGT	2	6	624353	624358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931972
16505	NC_014834	CGC	2	6	624416	624421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931972
16506	NC_014834	TGA	2	6	624521	624526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931972
16507	NC_014834	TCC	2	6	624541	624546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16508	NC_014834	AAG	2	6	624582	624587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_014834	GAG	2	6	624606	624611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_014834	AAC	2	6	624666	624671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931973
16511	NC_014834	GTT	2	6	624699	624704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931973
16512	NC_014834	GGC	2	6	624774	624779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931973
16513	NC_014834	GCT	2	6	624814	624819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931973
16514	NC_014834	TCGC	2	8	624835	624842	0 %	25 %	25 %	50 %	316931973
16515	NC_014834	GCG	2	6	624849	624854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931973
16516	NC_014834	GAA	2	6	624867	624872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931973
16517	NC_014834	GTTG	2	8	624935	624942	0 %	50 %	50 %	0 %	316931973
16518	NC_014834	CGG	2	6	624956	624961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931973
16519	NC_014834	GATC	2	8	625127	625134	25 %	25 %	25 %	25 %	316931973
16520	NC_014834	GAT	2	6	625313	625318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931973
16521	NC_014834	TAGGT	2	10	625354	625363	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_014834	CCTT	2	8	625405	625412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16523	NC_014834	AGC	2	6	625426	625431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16524	NC_014834	AAG	2	6	625486	625491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_014834	GGA	2	6	625526	625531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_014834	TGC	2	6	625546	625551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16527	NC_014834	CCG	2	6	625577	625582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16528	NC_014834	GA	3	6	625663	625668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_014834	CCCGAA	2	12	625796	625807	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931974
16530	NC_014834	GGT	2	6	625862	625867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931974
16531	NC_014834	GAT	2	6	625974	625979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931974
16532	NC_014834	CTT	2	6	626000	626005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931974
16533	NC_014834	CGA	2	6	626060	626065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931974
16534	NC_014834	GCG	2	6	626159	626164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931974
16535	NC_014834	CGA	2	6	626177	626182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931974
16536	NC_014834	AT	3	6	626284	626289	50 %	50 %	0 %	0 %	316931974
16537	NC_014834	CGG	2	6	626405	626410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931974
16538	NC_014834	GCG	2	6	626483	626488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931974
16539	NC_014834	ACA	2	6	626563	626568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931974
16540	NC_014834	CG	3	6	626576	626581	0 %	0 %	50 %	50 %	316931974
16541	NC_014834	ATG	2	6	626620	626625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931974
16542	NC_014834	GTT	2	6	626742	626747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931974
16543	NC_014834	TGC	2	6	626800	626805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931974
16544	NC_014834	TCGGA	2	10	626823	626832	20 %	20 %	40 %	20 %	316931974
16545	NC_014834	GCG	2	6	626875	626880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931974
16546	NC_014834	CCCA	2	8	626921	626928	25 %	0 %	0 %	75 %	316931974
16547	NC_014834	GAC	2	6	627001	627006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931974
16548	NC_014834	CAC	2	6	627012	627017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931974
16549	NC_014834	TTG	2	6	627046	627051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931974
16550	NC_014834	CCG	2	6	627119	627124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931974
16551	NC_014834	GAA	2	6	627142	627147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931974
16552	NC_014834	AGC	2	6	627166	627171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931974
16553	NC_014834	GCG	2	6	627205	627210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931974
16554	NC_014834	TCC	2	6	627269	627274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931974
16555	NC_014834	CGA	2	6	627293	627298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16556	NC_014834	CGA	2	6	627405	627410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16557	NC_014834	GGA	2	6	627454	627459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931975
16558	NC_014834	CTC	2	6	627477	627482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931975
16559	NC_014834	TGC	2	6	627502	627507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931975
16560	NC_014834	CGA	2	6	627552	627557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931975
16561	NC_014834	GAT	2	6	627605	627610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931976
16562	NC_014834	GCC	2	6	627636	627641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931976
16563	NC_014834	CCTCG	2	10	627682	627691	0 %	20 %	20 %	60 %	316931976
16564	NC_014834	CGG	2	6	627695	627700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931976
16565	NC_014834	CGA	2	6	627748	627753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931976
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16568	NC_014834	GTC	2	6	627897	627902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931976
16569	NC_014834	CGGT	2	8	627957	627964	0 %	25 %	50 %	25 %	316931976
16570	NC_014834	CGG	2	6	628127	628132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931976
16571	NC_014834	TTGG	2	8	628160	628167	0 %	50 %	50 %	0 %	316931976
16572	NC_014834	CAG	2	6	628190	628195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931976
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16574	NC_014834	CGA	2	6	628288	628293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931976
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16577	NC_014834	TCA	2	6	628354	628359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931976
16578	NC_014834	GCC	2	6	628361	628366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931976
16579	NC_014834	ATG	2	6	628446	628451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931976
16580	NC_014834	GC	3	6	628551	628556	0 %	0 %	50 %	50 %	316931976
16581	NC_014834	AT	3	6	628582	628587	50 %	50 %	0 %	0 %	316931976
16582	NC_014834	GGGC	2	8	628673	628680	0 %	0 %	75 %	25 %	316931976
16583	NC_014834	TCG	2	6	628695	628700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931976
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16585	NC_014834	ACTA	2	8	628878	628885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16586	NC_014834	TGC	2	6	628917	628922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16587	NC_014834	GAA	2	6	628990	628995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16588	NC_014834	GGA	2	6	629052	629057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16589	NC_014834	TCG	2	6	629122	629127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16590	NC_014834	ACG	2	6	629151	629156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16591	NC_014834	CCG	2	6	629232	629237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16592	NC_014834	CT	3	6	629275	629280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16593	NC_014834	AGA	2	6	629287	629292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16594	NC_014834	CAG	2	6	629347	629352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16595	NC_014834	GATC	2	8	629355	629362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16596	NC_014834	CTG	2	6	629404	629409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16597	NC_014834	GGT	2	6	629434	629439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_014834	CG	3	6	629464	629469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16599	NC_014834	TCC	2	6	629492	629497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16600	NC_014834	CGA	2	6	629499	629504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16601	NC_014834	AGA	2	6	629547	629552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_014834	CGA	2	6	629582	629587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16603	NC_014834	ATCGT	2	10	629633	629642	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16604	NC_014834	TGAT	2	8	629750	629757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_014834	GC	3	6	629780	629785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16606	NC_014834	CGG	2	6	629799	629804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16607	NC_014834	TGCC	2	8	629819	629826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16608	NC_014834	GC	3	6	629886	629891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16609	NC_014834	GC	3	6	629942	629947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16610	NC_014834	CAA	2	6	629976	629981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_014834	CG	3	6	629986	629991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16612	NC_014834	GGGC	2	8	630017	630024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16613	NC_014834	CG	3	6	630071	630076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16614	NC_014834	CGA	2	6	630104	630109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16615	NC_014834	GA	3	6	630129	630134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_014834	GC	3	6	630159	630164	0 %	0 %	50 %	50 %	316931977
16617	NC_014834	ATCG	2	8	630191	630198	25 %	25 %	25 %	25 %	316931977
16618	NC_014834	GCG	2	6	630199	630204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931977
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16621	NC_014834	TCG	3	9	630381	630389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931977
16622	NC_014834	GTG	2	6	630405	630410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931977
16623	NC_014834	GGC	2	6	630427	630432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931977
16624	NC_014834	CGG	2	6	630465	630470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931977
16625	NC_014834	A	6	6	630536	630541	100 %	0 %	0 %	0 %	316931977
16626	NC_014834	G	6	6	630737	630742	0 %	0 %	100 %	0 %	316931977
16627	NC_014834	CCA	2	6	630771	630776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931977
16628	NC_014834	GAC	2	6	630824	630829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931977
16629	NC_014834	CGT	2	6	630838	630843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931977
16630	NC_014834	GACC	2	8	630867	630874	25 %	0 %	25 %	50 %	316931977
16631	NC_014834	GCTGA	2	10	630944	630953	20 %	20 %	40 %	20 %	316931977
16632	NC_014834	CCTTCG	2	12	631098	631109	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316931977
16633	NC_014834	GGC	2	6	631144	631149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931977
16634	NC_014834	GCTG	2	8	631191	631198	0 %	25 %	50 %	25 %	316931977
16635	NC_014834	ATC	2	6	631263	631268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931977
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16637	NC_014834	CGA	2	6	631290	631295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931977
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16639	NC_014834	CGT	2	6	631365	631370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931977
16640	NC_014834	TGC	2	6	631419	631424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931977
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16649	NC_014834	TGC	2	6	631763	631768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931978
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16652	NC_014834	GCCT	2	8	631876	631883	0 %	25 %	25 %	50 %	316931978
16653	NC_014834	TCC	2	6	632171	632176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931978
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16690	NC_014834	CCGCG	2	10	634052	634061	0 %	0 %	40 %	60 %	316931980
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16693	NC_014834	CCTG	2	8	634215	634222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16694	NC_014834	GATTTC	2	12	634239	634250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16695	NC_014834	GGA	2	6	634296	634301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16727	NC_014834	TCGA	2	8	635805	635812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16728	NC_014834	GC	4	8	635834	635841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16729	NC_014834	GCG	2	6	635847	635852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16730	NC_014834	GAG	2	6	635964	635969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16731	NC_014834	GAA	2	6	635990	635995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16732	NC_014834	CCA	2	6	636004	636009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931982
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16735	NC_014834	TGG	3	9	636205	636213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931982
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16737	NC_014834	TGA	2	6	636277	636282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931982
16738	NC_014834	CGG	2	6	636367	636372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931982
16739	NC_014834	TGC	2	6	636380	636385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931982
16740	NC_014834	CGGCG	2	10	636393	636402	0 %	0 %	60 %	40 %	316931982
16741	NC_014834	GAG	2	6	636471	636476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931982
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