MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014834	GCC	2	6	603637	603642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931954
16002	NC_014834	CGGT	2	8	603654	603661	0 %	25 %	50 %	25 %	316931954
16003	NC_014834	CGG	2	6	603664	603669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931954
16004	NC_014834	GCC	2	6	603715	603720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931954
16005	NC_014834	GCT	2	6	603733	603738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16006	NC_014834	GCT	2	6	603754	603759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16007	NC_014834	TCG	2	6	603773	603778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16008	NC_014834	CTG	2	6	603779	603784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16009	NC_014834	GCT	2	6	603823	603828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16010	NC_014834	TGT	2	6	603849	603854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931954
16011	NC_014834	CGGCG	2	10	603865	603874	0 %	0 %	60 %	40 %	316931954
16012	NC_014834	CGC	3	9	603901	603909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931954
16013	NC_014834	TCG	2	6	603912	603917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16014	NC_014834	CCGA	2	8	603971	603978	25 %	0 %	25 %	50 %	316931954
16015	NC_014834	GCT	2	6	604009	604014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16016	NC_014834	CGC	2	6	604015	604020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931954
16017	NC_014834	GCG	2	6	604112	604117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931954
16018	NC_014834	GCG	2	6	604146	604151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931954
16019	NC_014834	ACGCC	2	10	604179	604188	20 %	0 %	20 %	60 %	316931954
16020	NC_014834	GCT	2	6	604189	604194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16021	NC_014834	TCG	2	6	604212	604217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16022	NC_014834	GGC	2	6	604252	604257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931954
16023	NC_014834	GCT	2	6	604258	604263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
16024	NC_014834	CGG	3	9	604270	604278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931954
16025	NC_014834	TCG	2	6	604444	604449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931955
16026	NC_014834	CCG	2	6	604486	604491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931955
16027	NC_014834	GC	4	8	604513	604520	0 %	0 %	50 %	50 %	316931955
16028	NC_014834	GTG	2	6	604555	604560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931955
16029	NC_014834	CGC	2	6	604565	604570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931955
16030	NC_014834	GACG	2	8	604573	604580	25 %	0 %	50 %	25 %	316931955
16031	NC_014834	GCC	2	6	604594	604599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931955
16032	NC_014834	CGTC	2	8	604669	604676	0 %	25 %	25 %	50 %	316931955
16033	NC_014834	CG	3	6	604691	604696	0 %	0 %	50 %	50 %	316931955
16034	NC_014834	GCG	2	6	604719	604724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931955
16035	NC_014834	CCG	2	6	604726	604731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931955
16036	NC_014834	GGC	2	6	604737	604742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931955
16037	NC_014834	TGCGCC	2	12	604774	604785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931955
16038	NC_014834	CAC	2	6	604833	604838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931955
16039	NC_014834	CCGT	2	8	604886	604893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16040	NC_014834	CG	3	6	604913	604918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16041	NC_014834	GCCGGC	2	12	604990	605001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_014834	CGG	2	6	605024	605029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16043	NC_014834	CGG	2	6	605032	605037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16044	NC_014834	ATGG	2	8	605061	605068	25 %	25 %	50 %	0 %	316931956
16045	NC_014834	AGC	2	6	605171	605176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931956
16046	NC_014834	CGC	2	6	605196	605201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931956
16047	NC_014834	GATG	2	8	605214	605221	25 %	25 %	50 %	0 %	316931956
16048	NC_014834	ATCG	2	8	605281	605288	25 %	25 %	25 %	25 %	316931956
16049	NC_014834	GCA	2	6	605361	605366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931956
16050	NC_014834	TCA	2	6	605370	605375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931956
16051	NC_014834	CCAG	2	8	605439	605446	25 %	0 %	25 %	50 %	316931956
16052	NC_014834	GGC	2	6	605467	605472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16053	NC_014834	GCT	2	6	605544	605549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931956
16054	NC_014834	CGG	2	6	605574	605579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16055	NC_014834	GCGCCA	2	12	605622	605633	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931956
16056	NC_014834	GCG	2	6	605634	605639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16057	NC_014834	CGG	3	9	605669	605677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16058	NC_014834	TCG	2	6	605717	605722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931956
16059	NC_014834	TGATC	2	10	605730	605739	20 %	40 %	20 %	20 %	316931956
16060	NC_014834	CAGC	2	8	605778	605785	25 %	0 %	25 %	50 %	316931956
16061	NC_014834	GAG	2	6	605947	605952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931956
16062	NC_014834	CTCCC	2	10	605968	605977	0 %	20 %	0 %	80 %	316931956
16063	NC_014834	GGGGGT	2	12	605995	606006	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	316931956
16064	NC_014834	C	7	7	606033	606039	0 %	0 %	0 %	100 %	316931956
16065	NC_014834	G	6	6	606060	606065	0 %	0 %	100 %	0 %	316931956
16066	NC_014834	GCG	2	6	606090	606095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16067	NC_014834	GCCT	2	8	606125	606132	0 %	25 %	25 %	50 %	316931956
16068	NC_014834	CG	3	6	606155	606160	0 %	0 %	50 %	50 %	316931956
16069	NC_014834	CG	3	6	606166	606171	0 %	0 %	50 %	50 %	316931956
16070	NC_014834	CGG	2	6	606185	606190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16071	NC_014834	CGG	2	6	606200	606205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16072	NC_014834	CGC	2	6	606225	606230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931956
16073	NC_014834	CGT	2	6	606270	606275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931956
16074	NC_014834	GGCG	2	8	606288	606295	0 %	0 %	75 %	25 %	316931956
16075	NC_014834	CGA	2	6	606300	606305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931956
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16077	NC_014834	TCG	2	6	606356	606361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931956
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16080	NC_014834	CTTC	2	8	606414	606421	0 %	50 %	0 %	50 %	316931956
16081	NC_014834	GCG	3	9	606432	606440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16082	NC_014834	GAC	2	6	606458	606463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931956
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16088	NC_014834	CGG	2	6	606630	606635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
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16091	NC_014834	GCG	2	6	606901	606906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16092	NC_014834	GCG	2	6	606996	607001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16093	NC_014834	ACC	2	6	607061	607066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931956
16094	NC_014834	TCG	2	6	607211	607216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931956
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16099	NC_014834	CCG	2	6	607408	607413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931956
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16104	NC_014834	GC	3	6	607536	607541	0 %	0 %	50 %	50 %	316931956
16105	NC_014834	GA	3	6	607544	607549	50 %	0 %	50 %	0 %	316931956
16106	NC_014834	ATCG	2	8	607564	607571	25 %	25 %	25 %	25 %	316931956
16107	NC_014834	GGC	2	6	607602	607607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931956
16108	NC_014834	GAT	2	6	607740	607745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_014834	AAC	2	6	607765	607770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_014834	CA	3	6	607786	607791	50 %	0 %	0 %	50 %	316931957
16111	NC_014834	CGG	2	6	607807	607812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931957
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16120	NC_014834	TCT	2	6	608196	608201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931957
16121	NC_014834	TCG	2	6	608202	608207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931957
16122	NC_014834	GCT	2	6	608236	608241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931957
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16144	NC_014834	GAG	2	6	608857	608862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16145	NC_014834	CTC	2	6	608941	608946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16147	NC_014834	TCG	2	6	609007	609012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16149	NC_014834	TTG	2	6	609034	609039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16150	NC_014834	TCG	2	6	609070	609075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16152	NC_014834	AGG	2	6	609140	609145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16153	NC_014834	CGT	2	6	609166	609171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16154	NC_014834	CGG	2	6	609178	609183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16155	NC_014834	GGC	2	6	609357	609362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
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16158	NC_014834	TCT	3	9	609432	609440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931958
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16164	NC_014834	GC	3	6	609593	609598	0 %	0 %	50 %	50 %	316931958
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16193	NC_014834	ACG	2	6	610659	610664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931958
16194	NC_014834	CT	3	6	610797	610802	0 %	50 %	0 %	50 %	316931958
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16201	NC_014834	ATC	2	6	610957	610962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931958
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16203	NC_014834	CGG	2	6	611004	611009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931958
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16212	NC_014834	GTT	2	6	611366	611371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931959
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16214	NC_014834	CGC	3	9	611523	611531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931959
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16220	NC_014834	AGAC	2	8	611698	611705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16221	NC_014834	CTT	2	6	611719	611724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16222	NC_014834	CG	3	6	611851	611856	0 %	0 %	50 %	50 %	316931960
16223	NC_014834	TGC	2	6	611870	611875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931960
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16226	NC_014834	CGCGT	2	10	612046	612055	0 %	20 %	40 %	40 %	316931960
16227	NC_014834	CG	3	6	612134	612139	0 %	0 %	50 %	50 %	316931960
16228	NC_014834	TGGCG	2	10	612155	612164	0 %	20 %	60 %	20 %	316931960
16229	NC_014834	GCG	3	9	612162	612170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931960
16230	NC_014834	GGC	2	6	612313	612318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931960
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16235	NC_014834	GTT	2	6	612608	612613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931960
16236	NC_014834	CGGAG	2	10	612650	612659	20 %	0 %	60 %	20 %	316931960
16237	NC_014834	GTG	2	6	612669	612674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931960
16238	NC_014834	CCG	2	6	612810	612815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931960
16239	NC_014834	TTGG	2	8	612859	612866	0 %	50 %	50 %	0 %	316931960
16240	NC_014834	CGAT	2	8	612916	612923	25 %	25 %	25 %	25 %	316931960
16241	NC_014834	GTCC	2	8	612932	612939	0 %	25 %	25 %	50 %	316931960
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