MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014834	CG	5	10	584568	584577	0 %	0 %	50 %	50 %	316931934
15502	NC_014834	CAG	2	6	584587	584592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931934
15503	NC_014834	GTT	2	6	584596	584601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931934
15504	NC_014834	CAC	2	6	584656	584661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931934
15505	NC_014834	CGC	2	6	584666	584671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931934
15506	NC_014834	GCGGGC	2	12	584683	584694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931934
15507	NC_014834	TCG	2	6	584765	584770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931934
15508	NC_014834	CGC	2	6	584787	584792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931934
15509	NC_014834	GC	4	8	584847	584854	0 %	0 %	50 %	50 %	316931934
15510	NC_014834	GAA	2	6	584875	584880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931934
15511	NC_014834	CAG	3	9	584911	584919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931934
15512	NC_014834	GGC	2	6	584929	584934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931934
15513	NC_014834	CAT	2	6	584956	584961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931934
15514	NC_014834	CGG	2	6	584985	584990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931934
15515	NC_014834	GCG	2	6	585006	585011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931934
15516	NC_014834	GTCGG	2	10	585019	585028	0 %	20 %	60 %	20 %	316931934
15517	NC_014834	CG	3	6	585074	585079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15518	NC_014834	CGGC	2	8	585129	585136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15519	NC_014834	CAA	2	6	585182	585187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_014834	TCGC	2	8	585256	585263	0 %	25 %	25 %	50 %	316931935
15521	NC_014834	CGA	2	6	585276	585281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931935
15522	NC_014834	CGG	2	6	585287	585292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15523	NC_014834	CGA	2	6	585345	585350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931935
15524	NC_014834	TTC	2	6	585355	585360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931935
15525	NC_014834	GGC	2	6	585408	585413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15526	NC_014834	GCT	2	6	585414	585419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931935
15527	NC_014834	CGG	2	6	585513	585518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15528	NC_014834	CGG	2	6	585540	585545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15529	NC_014834	GTCGA	2	10	585547	585556	20 %	20 %	40 %	20 %	316931935
15530	NC_014834	CG	3	6	585562	585567	0 %	0 %	50 %	50 %	316931935
15531	NC_014834	CCG	2	6	585608	585613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931935
15532	NC_014834	TCA	2	6	585644	585649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931935
15533	NC_014834	TGA	2	6	585656	585661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931935
15534	NC_014834	AGC	2	6	585662	585667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931935
15535	NC_014834	TCGAT	2	10	585677	585686	20 %	40 %	20 %	20 %	316931935
15536	NC_014834	GAG	2	6	585712	585717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931935
15537	NC_014834	CG	3	6	585728	585733	0 %	0 %	50 %	50 %	316931935
15538	NC_014834	CAG	2	6	585763	585768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931935
15539	NC_014834	CGGCG	2	10	585774	585783	0 %	0 %	60 %	40 %	316931935
15540	NC_014834	CGGC	2	8	585788	585795	0 %	0 %	50 %	50 %	316931935
15541	NC_014834	GAG	2	6	585805	585810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931935
15542	NC_014834	GCGG	2	8	585829	585836	0 %	0 %	75 %	25 %	316931935
15543	NC_014834	GGCCG	2	10	585840	585849	0 %	0 %	60 %	40 %	316931935
15544	NC_014834	CGGC	2	8	585944	585951	0 %	0 %	50 %	50 %	316931935
15545	NC_014834	GCG	2	6	585979	585984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15546	NC_014834	CTG	2	6	585985	585990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931935
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15550	NC_014834	GCC	2	6	586068	586073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931935
15551	NC_014834	GCCT	2	8	586192	586199	0 %	25 %	25 %	50 %	316931935
15552	NC_014834	GAC	2	6	586219	586224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931935
15553	NC_014834	CGG	2	6	586245	586250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15554	NC_014834	GCG	2	6	586283	586288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15555	NC_014834	GCG	2	6	586328	586333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931935
15556	NC_014834	GCGTCG	2	12	586358	586369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931935
15557	NC_014834	TCA	2	6	586469	586474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_014834	CGC	2	6	586491	586496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15559	NC_014834	GCG	2	6	586500	586505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_014834	CG	3	6	586553	586558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15561	NC_014834	CCG	2	6	586586	586591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931936
15562	NC_014834	GAT	3	9	586644	586652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931936
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15564	NC_014834	GAT	2	6	586713	586718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931936
15565	NC_014834	ATC	2	6	586747	586752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931936
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15568	NC_014834	GTG	3	9	586855	586863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931936
15569	NC_014834	CGA	2	6	586866	586871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931936
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15571	NC_014834	CCGA	2	8	586897	586904	25 %	0 %	25 %	50 %	316931936
15572	NC_014834	GCCGAA	2	12	587007	587018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931936
15573	NC_014834	GAT	2	6	587025	587030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931936
15574	NC_014834	GAC	2	6	587037	587042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931936
15575	NC_014834	GGTC	2	8	587063	587070	0 %	25 %	50 %	25 %	316931936
15576	NC_014834	TCA	2	6	587078	587083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931936
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15580	NC_014834	AGC	2	6	587203	587208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931936
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15587	NC_014834	GTA	2	6	587391	587396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931936
15588	NC_014834	ACC	2	6	587404	587409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931936
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15590	NC_014834	CGC	2	6	587462	587467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931936
15591	NC_014834	GAA	2	6	587613	587618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931936
15592	NC_014834	CAT	2	6	587682	587687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931936
15593	NC_014834	GC	3	6	587719	587724	0 %	0 %	50 %	50 %	316931936
15594	NC_014834	GCG	2	6	587776	587781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931936
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15599	NC_014834	TGG	2	6	588035	588040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931936
15600	NC_014834	TCG	2	6	588059	588064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931936
15601	NC_014834	CGCC	2	8	588128	588135	0 %	0 %	25 %	75 %	316931936
15602	NC_014834	CGG	2	6	588164	588169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931937
15603	NC_014834	CTT	2	6	588252	588257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931937
15604	NC_014834	ATC	2	6	588259	588264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931937
15605	NC_014834	GTCGTT	2	12	588267	588278	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	316931937
15606	NC_014834	CAC	2	6	588306	588311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931937
15607	NC_014834	GCG	2	6	588338	588343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931937
15608	NC_014834	GCA	2	6	588344	588349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
15609	NC_014834	ACG	2	6	588380	588385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931937
15610	NC_014834	CGTCGA	2	12	588419	588430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931937
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15614	NC_014834	TTGA	2	8	588702	588709	25 %	50 %	25 %	0 %	316931937
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15617	NC_014834	GCCC	2	8	588798	588805	0 %	0 %	25 %	75 %	316931937
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15730	NC_014834	CGTT	2	8	593051	593058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15735	NC_014834	GACGC	2	10	593162	593171	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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15980	NC_014834	GCA	2	6	602692	602697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931953
15981	NC_014834	GGC	2	6	602715	602720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931953
15982	NC_014834	TGC	2	6	602733	602738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931953
15983	NC_014834	GTTC	2	8	602816	602823	0 %	50 %	25 %	25 %	316931953
15984	NC_014834	AAG	2	6	602845	602850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931953
15985	NC_014834	CAA	2	6	602886	602891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931953
15986	NC_014834	TGCG	2	8	603008	603015	0 %	25 %	50 %	25 %	316931953
15987	NC_014834	TCG	2	6	603043	603048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931953
15988	NC_014834	GCGCTG	2	12	603124	603135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931953
15989	NC_014834	CGG	2	6	603147	603152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931953
15990	NC_014834	CG	5	10	603282	603291	0 %	0 %	50 %	50 %	316931953
15991	NC_014834	GTG	2	6	603292	603297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931953
15992	NC_014834	CGA	2	6	603309	603314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931953
15993	NC_014834	CGG	2	6	603351	603356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931953
15994	NC_014834	GCG	3	9	603409	603417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15995	NC_014834	CG	3	6	603456	603461	0 %	0 %	50 %	50 %	316931954
15996	NC_014834	GCT	2	6	603502	603507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931954
15997	NC_014834	TGA	2	6	603513	603518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931954
15998	NC_014834	CGC	2	6	603553	603558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931954
15999	NC_014834	CG	3	6	603604	603609	0 %	0 %	50 %	50 %	316931954
16000	NC_014834	GC	3	6	603622	603627	0 %	0 %	50 %	50 %	316931954

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