MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014834	TCG	2	6	565081	565086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15002	NC_014834	CG	3	6	565118	565123	0 %	0 %	50 %	50 %	316931918
15003	NC_014834	TCG	2	6	565192	565197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15004	NC_014834	CGGAGG	2	12	565205	565216	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	316931918
15005	NC_014834	CGT	2	6	565247	565252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15006	NC_014834	GGT	2	6	565254	565259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931918
15007	NC_014834	GCC	2	6	565320	565325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931918
15008	NC_014834	GTC	2	6	565350	565355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15009	NC_014834	TCG	2	6	565369	565374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15010	NC_014834	GTC	2	6	565389	565394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15011	NC_014834	CTT	2	6	565527	565532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931918
15012	NC_014834	GGC	2	6	565533	565538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931918
15013	NC_014834	GTGG	2	8	565540	565547	0 %	25 %	75 %	0 %	316931918
15014	NC_014834	GCG	2	6	565598	565603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931918
15015	NC_014834	CGGT	2	8	565612	565619	0 %	25 %	50 %	25 %	316931918
15016	NC_014834	TCG	2	6	565624	565629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15017	NC_014834	TCG	2	6	565651	565656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931918
15018	NC_014834	CCG	2	6	565692	565697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931918
15019	NC_014834	CGC	2	6	565742	565747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931918
15020	NC_014834	GC	3	6	565746	565751	0 %	0 %	50 %	50 %	316931918
15021	NC_014834	CG	3	6	565956	565961	0 %	0 %	50 %	50 %	316931918
15022	NC_014834	CG	3	6	565977	565982	0 %	0 %	50 %	50 %	316931918
15023	NC_014834	TCGG	2	8	565993	566000	0 %	25 %	50 %	25 %	316931918
15024	NC_014834	CTTC	2	8	566003	566010	0 %	50 %	0 %	50 %	316931918
15025	NC_014834	GGT	2	6	566037	566042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931918
15026	NC_014834	GTG	2	6	566062	566067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931919
15027	NC_014834	TCG	2	6	566076	566081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931919
15028	NC_014834	GC	3	6	566106	566111	0 %	0 %	50 %	50 %	316931919
15029	NC_014834	CGGA	2	8	566274	566281	25 %	0 %	50 %	25 %	316931919
15030	NC_014834	CAG	2	6	566327	566332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931919
15031	NC_014834	GAC	2	6	566342	566347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931919
15032	NC_014834	GCC	2	6	566434	566439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931919
15033	NC_014834	GAG	2	6	566447	566452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931919
15034	NC_014834	GCC	2	6	566494	566499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931919
15035	NC_014834	GCCT	2	8	566565	566572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15036	NC_014834	CTC	2	6	566580	566585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15037	NC_014834	GC	3	6	566586	566591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15038	NC_014834	AGC	2	6	566657	566662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15039	NC_014834	CCA	2	6	566678	566683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931920
15040	NC_014834	TCG	2	6	566698	566703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15041	NC_014834	TTG	2	6	566707	566712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931920
15042	NC_014834	TCA	2	6	566792	566797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931920
15043	NC_014834	TTG	2	6	566857	566862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931920
15044	NC_014834	TCG	2	6	566926	566931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15045	NC_014834	GTG	2	6	566950	566955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931920
15046	NC_014834	TGAT	2	8	566983	566990	25 %	50 %	25 %	0 %	316931920
15047	NC_014834	CTG	2	6	566991	566996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15048	NC_014834	TGA	2	6	567077	567082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931920
15049	NC_014834	AGC	2	6	567097	567102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15050	NC_014834	GTC	2	6	567107	567112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15051	NC_014834	CGGC	2	8	567157	567164	0 %	0 %	50 %	50 %	316931920
15052	NC_014834	TCG	2	6	567172	567177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15053	NC_014834	TGC	2	6	567196	567201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931920
15054	NC_014834	GCCGC	2	10	567335	567344	0 %	0 %	40 %	60 %	316931920
15055	NC_014834	CGG	2	6	567400	567405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931920
15056	NC_014834	GTG	2	6	567436	567441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931920
15057	NC_014834	GCG	2	6	567595	567600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931920
15058	NC_014834	TCA	2	6	567602	567607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931920
15059	NC_014834	TCC	2	6	567609	567614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15060	NC_014834	GTG	2	6	567647	567652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_014834	CGC	2	6	567707	567712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15062	NC_014834	GCGCG	2	10	567750	567759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15063	NC_014834	CGG	2	6	567786	567791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_014834	CAG	2	6	567818	567823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_014834	GCC	2	6	567843	567848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15066	NC_014834	TCG	2	6	567850	567855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_014834	GTT	2	6	567947	567952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931921
15068	NC_014834	GCTGC	2	10	567957	567966	0 %	20 %	40 %	40 %	316931921
15069	NC_014834	GC	3	6	568027	568032	0 %	0 %	50 %	50 %	316931921
15070	NC_014834	GC	3	6	568087	568092	0 %	0 %	50 %	50 %	316931921
15071	NC_014834	GCC	2	6	568123	568128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931921
15072	NC_014834	TGG	2	6	568180	568185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931921
15073	NC_014834	CTT	2	6	568199	568204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931921
15074	NC_014834	CCG	2	6	568248	568253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931921
15075	NC_014834	CGC	2	6	568297	568302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931921
15076	NC_014834	CTT	2	6	568307	568312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931921
15077	NC_014834	TGC	2	6	568357	568362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931921
15078	NC_014834	GGC	2	6	568373	568378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931921
15079	NC_014834	GGT	2	6	568424	568429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931921
15080	NC_014834	CGGCGC	2	12	568473	568484	0 %	0 %	50 %	50 %	316931921
15081	NC_014834	CA	3	6	568490	568495	50 %	0 %	0 %	50 %	316931921
15082	NC_014834	TAGAG	2	10	568503	568512	40 %	20 %	40 %	0 %	316931921
15083	NC_014834	TGATCC	2	12	568583	568594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15084	NC_014834	ACC	2	6	568635	568640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931922
15085	NC_014834	TGA	2	6	568663	568668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931922
15086	NC_014834	CCA	2	6	568701	568706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931922
15087	NC_014834	AGCGT	2	10	568764	568773	20 %	20 %	40 %	20 %	316931922
15088	NC_014834	GC	3	6	568836	568841	0 %	0 %	50 %	50 %	316931922
15089	NC_014834	CCT	2	6	568843	568848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931922
15090	NC_014834	CGG	2	6	568849	568854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931922
15091	NC_014834	CGG	3	9	568872	568880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931922
15092	NC_014834	CGG	2	6	568915	568920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931922
15093	NC_014834	TGCG	2	8	568942	568949	0 %	25 %	50 %	25 %	316931922
15094	NC_014834	TCA	2	6	569028	569033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931922
15095	NC_014834	GAA	2	6	569048	569053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931922
15096	NC_014834	GC	3	6	569131	569136	0 %	0 %	50 %	50 %	316931922
15097	NC_014834	GCGCG	2	10	569140	569149	0 %	0 %	60 %	40 %	316931922
15098	NC_014834	CG	4	8	569188	569195	0 %	0 %	50 %	50 %	316931922
15099	NC_014834	CG	3	6	569200	569205	0 %	0 %	50 %	50 %	316931922
15100	NC_014834	GAA	2	6	569243	569248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931922
15101	NC_014834	CGT	2	6	569449	569454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931923
15102	NC_014834	CGA	2	6	569455	569460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931923
15103	NC_014834	GCCG	2	8	569492	569499	0 %	0 %	50 %	50 %	316931923
15104	NC_014834	CCG	2	6	569532	569537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931923
15105	NC_014834	CTC	2	6	569585	569590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931923
15106	NC_014834	GCG	2	6	569607	569612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931923
15107	NC_014834	CAAGGC	2	12	569629	569640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931923
15108	NC_014834	TCT	2	6	569692	569697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_014834	CCT	2	6	569711	569716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15110	NC_014834	AGCGC	2	10	569737	569746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15111	NC_014834	CCTCGC	2	12	569801	569812	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	316931924
15112	NC_014834	GCA	2	6	569861	569866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15113	NC_014834	GGT	2	6	569949	569954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931924
15114	NC_014834	CG	3	6	569985	569990	0 %	0 %	50 %	50 %	316931924
15115	NC_014834	ACG	2	6	570064	570069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15116	NC_014834	TCG	2	6	570076	570081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15117	NC_014834	CGA	2	6	570092	570097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15118	NC_014834	TCG	2	6	570148	570153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15119	NC_014834	ACC	2	6	570154	570159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931924
15120	NC_014834	CGG	2	6	570234	570239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931924
15121	NC_014834	CGG	2	6	570281	570286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931924
15122	NC_014834	GCA	2	6	570299	570304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15123	NC_014834	GCA	2	6	570317	570322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15124	NC_014834	ATG	2	6	570328	570333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931924
15125	NC_014834	TCG	2	6	570400	570405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15126	NC_014834	GGC	2	6	570406	570411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931924
15127	NC_014834	ACCATC	2	12	570424	570435	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	316931924
15128	NC_014834	CGGTG	2	10	570437	570446	0 %	20 %	60 %	20 %	316931924
15129	NC_014834	GCC	2	6	570489	570494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931924
15130	NC_014834	CGC	2	6	570521	570526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931924
15131	NC_014834	GTG	2	6	570531	570536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931924
15132	NC_014834	CCGCG	2	10	570548	570557	0 %	0 %	40 %	60 %	316931924
15133	NC_014834	CAG	2	6	570576	570581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15134	NC_014834	AGC	2	6	570610	570615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15135	NC_014834	CAC	2	6	570645	570650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931924
15136	NC_014834	AGCACC	2	12	570664	570675	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931924
15137	NC_014834	CAC	2	6	570762	570767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931924
15138	NC_014834	TCA	2	6	570776	570781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931924
15139	NC_014834	GTT	2	6	570867	570872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931924
15140	NC_014834	AGC	3	9	570877	570885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15141	NC_014834	GC	3	6	570884	570889	0 %	0 %	50 %	50 %	316931924
15142	NC_014834	ATC	2	6	570892	570897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931924
15143	NC_014834	GCCG	2	8	570917	570924	0 %	0 %	50 %	50 %	316931924
15144	NC_014834	TGC	2	6	570938	570943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931924
15145	NC_014834	CAT	2	6	570963	570968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931924
15146	NC_014834	GC	3	6	570973	570978	0 %	0 %	50 %	50 %	316931924
15147	NC_014834	GAA	2	6	571011	571016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931924
15148	NC_014834	GCCGA	2	10	571018	571027	20 %	0 %	40 %	40 %	316931924
15149	NC_014834	CAGG	2	8	571029	571036	25 %	0 %	50 %	25 %	316931924
15150	NC_014834	CGCT	2	8	571075	571082	0 %	25 %	25 %	50 %	316931925
15151	NC_014834	GCTG	2	8	571099	571106	0 %	25 %	50 %	25 %	316931925
15152	NC_014834	TTG	2	6	571140	571145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931925
15153	NC_014834	CG	3	6	571154	571159	0 %	0 %	50 %	50 %	316931925
15154	NC_014834	CGC	2	6	571192	571197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931925
15155	NC_014834	CTT	2	6	571205	571210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931925
15156	NC_014834	GTCGGC	2	12	571238	571249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931925
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15158	NC_014834	CAT	2	6	571346	571351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931925
15159	NC_014834	AGC	2	6	571476	571481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931925
15160	NC_014834	GC	3	6	571480	571485	0 %	0 %	50 %	50 %	316931925
15161	NC_014834	TCG	2	6	571503	571508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931925
15162	NC_014834	CGA	2	6	571513	571518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931925
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15164	NC_014834	GCC	2	6	571568	571573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931925
15165	NC_014834	TCG	2	6	571620	571625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931925
15166	NC_014834	GC	3	6	571630	571635	0 %	0 %	50 %	50 %	316931925
15167	NC_014834	CCAGCA	2	12	571708	571719	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931925
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15174	NC_014834	CGC	3	9	571885	571893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931925
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15179	NC_014834	GC	3	6	572256	572261	0 %	0 %	50 %	50 %	316931926
15180	NC_014834	ATAG	2	8	572265	572272	50 %	25 %	25 %	0 %	316931926
15181	NC_014834	TGG	2	6	572273	572278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931926
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15184	NC_014834	TCT	2	6	572304	572309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931926
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15194	NC_014834	GCA	2	6	572816	572821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931926
15195	NC_014834	TAC	2	6	572878	572883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15196	NC_014834	CGC	2	6	572890	572895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15197	NC_014834	C	6	6	572941	572946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15198	NC_014834	CGC	2	6	572959	572964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15199	NC_014834	CGG	2	6	573021	573026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931927
15200	NC_014834	CGA	2	6	573146	573151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15204	NC_014834	CCG	3	9	573343	573351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931928
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15207	NC_014834	GCT	2	6	573580	573585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931928
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15220	NC_014834	GCCA	2	8	574004	574011	25 %	0 %	25 %	50 %	316931928
15221	NC_014834	TGC	2	6	574014	574019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931928
15222	NC_014834	GCT	2	6	574051	574056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931928
15223	NC_014834	ACC	2	6	574076	574081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931928
15224	NC_014834	GAG	2	6	574103	574108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931928
15225	NC_014834	AT	3	6	574196	574201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15226	NC_014834	TGA	2	6	574227	574232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15227	NC_014834	CAT	2	6	574338	574343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931929
15228	NC_014834	GCG	2	6	574375	574380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931929
15229	NC_014834	GGA	2	6	574385	574390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931929
15230	NC_014834	CGG	2	6	574397	574402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931929
15231	NC_014834	GGTC	2	8	574403	574410	0 %	25 %	50 %	25 %	316931929
15232	NC_014834	GCG	2	6	574432	574437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931929
15233	NC_014834	CGG	2	6	574440	574445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931929
15234	NC_014834	GCT	4	12	574469	574480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931929
15235	NC_014834	CGG	2	6	574544	574549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931929
15236	NC_014834	AGC	2	6	574621	574626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931929
15237	NC_014834	CGC	2	6	574652	574657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931929
15238	NC_014834	CGG	2	6	574660	574665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931929
15239	NC_014834	CGC	2	6	574682	574687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931929
15240	NC_014834	CGC	2	6	574691	574696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931929
15241	NC_014834	CGC	2	6	574703	574708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931929
15242	NC_014834	ATC	2	6	574710	574715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931929
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15245	NC_014834	CGG	3	9	574918	574926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15247	NC_014834	GCGAC	2	10	574972	574981	20 %	0 %	40 %	40 %	316931930
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15272	NC_014834	CGG	2	6	576146	576151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15273	NC_014834	CGC	2	6	576165	576170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15314	NC_014834	TCTT	2	8	577891	577898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15346	NC_014834	CTCGAT	2	12	579233	579244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316931932
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15361	NC_014834	TCG	2	6	579723	579728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931932
15362	NC_014834	TCG	2	6	579732	579737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931932
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15364	NC_014834	TCG	2	6	579801	579806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931932
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15403	NC_014834	CCCGA	2	10	581134	581143	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15404	NC_014834	GGC	2	6	581150	581155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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