MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014834	CGC	2	6	547439	547444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931901
14502	NC_014834	CGAT	2	8	547503	547510	25 %	25 %	25 %	25 %	316931901
14503	NC_014834	GCT	2	6	547540	547545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931901
14504	NC_014834	CGACGC	2	12	547560	547571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931901
14505	NC_014834	GCCG	2	8	547584	547591	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
14506	NC_014834	TCA	2	6	547608	547613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931901
14507	NC_014834	GCG	2	6	547648	547653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931901
14508	NC_014834	GGC	2	6	547668	547673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931901
14509	NC_014834	GGT	2	6	547678	547683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931901
14510	NC_014834	TCGA	2	8	547727	547734	25 %	25 %	25 %	25 %	316931901
14511	NC_014834	CGAG	2	8	547803	547810	25 %	0 %	50 %	25 %	316931901
14512	NC_014834	CG	3	6	547823	547828	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
14513	NC_014834	TGG	2	6	547839	547844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931901
14514	NC_014834	ATC	2	6	547847	547852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931901
14515	NC_014834	GAG	2	6	547864	547869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931901
14516	NC_014834	CAG	2	6	547876	547881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931901
14517	NC_014834	GCG	2	6	547903	547908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931901
14518	NC_014834	AGC	2	6	547919	547924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931901
14519	NC_014834	GC	3	6	547923	547928	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
14520	NC_014834	CGGC	2	8	547932	547939	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
14521	NC_014834	GCCG	2	8	547962	547969	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
14522	NC_014834	GC	3	6	547983	547988	0 %	0 %	50 %	50 %	316931901
14523	NC_014834	CGA	2	6	548011	548016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931901
14524	NC_014834	CCG	2	6	548087	548092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931901
14525	NC_014834	CGCGA	2	10	548117	548126	20 %	0 %	40 %	40 %	316931901
14526	NC_014834	TCGA	2	8	548132	548139	25 %	25 %	25 %	25 %	316931901
14527	NC_014834	GAC	2	6	548171	548176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931901
14528	NC_014834	ACG	2	6	548177	548182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931901
14529	NC_014834	CTG	2	6	548213	548218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14530	NC_014834	CG	3	6	548233	548238	0 %	0 %	50 %	50 %	316931902
14531	NC_014834	ACC	2	6	548256	548261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931902
14532	NC_014834	CTTC	2	8	548287	548294	0 %	50 %	0 %	50 %	316931902
14533	NC_014834	CTC	2	6	548318	548323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931902
14534	NC_014834	GC	3	6	548329	548334	0 %	0 %	50 %	50 %	316931902
14535	NC_014834	GGC	2	6	548339	548344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14536	NC_014834	AGG	2	6	548364	548369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931902
14537	NC_014834	CG	4	8	548371	548378	0 %	0 %	50 %	50 %	316931902
14538	NC_014834	CGT	2	6	548380	548385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14539	NC_014834	ATG	3	9	548400	548408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931902
14540	NC_014834	CCG	2	6	548458	548463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931902
14541	NC_014834	CGG	2	6	548483	548488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14542	NC_014834	CAG	2	6	548531	548536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14543	NC_014834	GCA	2	6	548575	548580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14544	NC_014834	GGC	2	6	548645	548650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14545	NC_014834	CGG	2	6	548699	548704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14546	NC_014834	CGT	2	6	548719	548724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14547	NC_014834	GCC	2	6	548738	548743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931902
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14549	NC_014834	GGT	2	6	548774	548779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931902
14550	NC_014834	CGG	3	9	548801	548809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14551	NC_014834	GAT	2	6	548810	548815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931902
14552	NC_014834	CGG	2	6	548821	548826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14553	NC_014834	CG	4	8	548855	548862	0 %	0 %	50 %	50 %	316931902
14554	NC_014834	CGGGCG	2	12	548871	548882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931902
14555	NC_014834	CGA	2	6	549020	549025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14556	NC_014834	CAC	2	6	549032	549037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931902
14557	NC_014834	TGC	2	6	549048	549053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14558	NC_014834	GTTC	2	8	549127	549134	0 %	50 %	25 %	25 %	316931902
14559	NC_014834	GTC	2	6	549239	549244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931902
14560	NC_014834	ATC	2	6	549291	549296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_014834	GGTT	2	8	549313	549320	0 %	50 %	50 %	0 %	316931903
14562	NC_014834	ATC	2	6	549353	549358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931903
14563	NC_014834	CAG	2	6	549376	549381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931903
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14567	NC_014834	ACGTCG	2	12	549476	549487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931903
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14569	NC_014834	CAC	2	6	549556	549561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931903
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14571	NC_014834	CG	3	6	549585	549590	0 %	0 %	50 %	50 %	316931903
14572	NC_014834	CGA	2	6	549609	549614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931903
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14586	NC_014834	TCG	2	6	550164	550169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14587	NC_014834	CCG	2	6	550210	550215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14588	NC_014834	TCGCCG	2	12	550336	550347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931904
14589	NC_014834	GCGAAG	2	12	550351	550362	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	316931904
14590	NC_014834	CCG	3	9	550363	550371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931904
14591	NC_014834	CGC	2	6	550374	550379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931904
14592	NC_014834	GCCG	2	8	550408	550415	0 %	0 %	50 %	50 %	316931904
14593	NC_014834	GCG	2	6	550484	550489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931904
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14598	NC_014834	GCT	2	6	550631	550636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931904
14599	NC_014834	CGA	2	6	550656	550661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931904
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14601	NC_014834	CGG	2	6	550709	550714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931904
14602	NC_014834	ACC	2	6	550852	550857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931904
14603	NC_014834	GCC	2	6	550888	550893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931904
14604	NC_014834	GGTC	2	8	550919	550926	0 %	25 %	50 %	25 %	316931904
14605	NC_014834	TCT	2	6	550955	550960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931904
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14607	NC_014834	GCG	2	6	551035	551040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931904
14608	NC_014834	TCT	2	6	551042	551047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931904
14609	NC_014834	GCC	2	6	551086	551091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931904
14610	NC_014834	CGA	2	6	551103	551108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931904
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14612	NC_014834	CGG	2	6	551189	551194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931904
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14614	NC_014834	ATC	2	6	551248	551253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931904
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14619	NC_014834	GCGAC	2	10	551534	551543	20 %	0 %	40 %	40 %	316931904
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14858	NC_014834	GCG	2	6	560072	560077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931912
14859	NC_014834	CGA	2	6	560080	560085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931912
14860	NC_014834	CCG	2	6	560098	560103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931912
14861	NC_014834	GCG	2	6	560122	560127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931912
14862	NC_014834	CGG	2	6	560174	560179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931912
14863	NC_014834	GTC	2	6	560202	560207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931912
14864	NC_014834	GTC	2	6	560251	560256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931913
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14870	NC_014834	GCC	2	6	560500	560505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931913
14871	NC_014834	CCTCGA	2	12	560547	560558	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316931913
14872	NC_014834	CGG	2	6	560571	560576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931913
14873	NC_014834	CG	3	6	560577	560582	0 %	0 %	50 %	50 %	316931913
14874	NC_014834	CAG	2	6	560590	560595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931913
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14884	NC_014834	CGG	2	6	560817	560822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931913
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14886	NC_014834	CGC	2	6	560900	560905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931913
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14892	NC_014834	GCT	3	9	561168	561176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931914
14893	NC_014834	ACG	2	6	561199	561204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931914
14894	NC_014834	GGC	2	6	561266	561271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931914
14895	NC_014834	TGC	2	6	561290	561295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931914
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14899	NC_014834	GCCC	2	8	561413	561420	0 %	0 %	25 %	75 %	316931915
14900	NC_014834	GCG	2	6	561449	561454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931915
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14911	NC_014834	TGA	2	6	561719	561724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931915
14912	NC_014834	CAG	2	6	561807	561812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931915
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14927	NC_014834	GCG	2	6	562322	562327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931916
14928	NC_014834	CAG	2	6	562340	562345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931916
14929	NC_014834	CCA	2	6	562360	562365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931916
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14932	NC_014834	CCCAG	2	10	562455	562464	20 %	0 %	20 %	60 %	316931916
14933	NC_014834	CGC	2	6	562482	562487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931916
14934	NC_014834	CAG	2	6	562523	562528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931916
14935	NC_014834	CCG	2	6	562561	562566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931916
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14939	NC_014834	TCGA	2	8	562704	562711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14940	NC_014834	CGG	2	6	562750	562755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14941	NC_014834	GTC	2	6	562800	562805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14942	NC_014834	GCGAA	2	10	562825	562834	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14943	NC_014834	TG	3	6	562921	562926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14944	NC_014834	GCA	3	9	563007	563015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931917
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14946	NC_014834	GTC	2	6	563041	563046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931917
14947	NC_014834	TGT	2	6	563106	563111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931917
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14971	NC_014834	CGG	2	6	564157	564162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931918
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14973	NC_014834	CGC	2	6	564233	564238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931918
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