MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014834	GCG	2	6	37543	37548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931426
1002	NC_014834	CAG	2	6	37615	37620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_014834	GAG	2	6	37621	37626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014834	CGC	2	6	37630	37635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_014834	CG	3	6	37643	37648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_014834	CGA	2	6	37708	37713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014834	GAA	2	6	37737	37742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014834	GCC	2	6	37791	37796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931427
1009	NC_014834	CCG	2	6	37797	37802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931427
1010	NC_014834	GC	3	6	37829	37834	0 %	0 %	50 %	50 %	316931427
1011	NC_014834	GCCGAA	2	12	37839	37850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931427
1012	NC_014834	CGC	2	6	37854	37859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931427
1013	NC_014834	GCC	2	6	37866	37871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931427
1014	NC_014834	GC	4	8	37884	37891	0 %	0 %	50 %	50 %	316931427
1015	NC_014834	GCATC	2	10	37954	37963	20 %	20 %	20 %	40 %	316931427
1016	NC_014834	CGG	2	6	38022	38027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014834	TCC	2	6	38029	38034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_014834	TGC	2	6	38160	38165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931428
1019	NC_014834	GGC	2	6	38244	38249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931428
1020	NC_014834	GC	3	6	38248	38253	0 %	0 %	50 %	50 %	316931428
1021	NC_014834	GCC	3	9	38429	38437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931428
1022	NC_014834	GCT	2	6	38452	38457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931428
1023	NC_014834	ACA	2	6	38481	38486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931428
1024	NC_014834	CCA	2	6	38529	38534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931428
1025	NC_014834	GC	3	6	38556	38561	0 %	0 %	50 %	50 %	316931428
1026	NC_014834	CGG	2	6	38569	38574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931428
1027	NC_014834	G	6	6	38594	38599	0 %	0 %	100 %	0 %	316931428
1028	NC_014834	GCG	2	6	38710	38715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931429
1029	NC_014834	ATC	2	6	38738	38743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931429
1030	NC_014834	CGG	2	6	38747	38752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931429
1031	NC_014834	CGGTTT	2	12	38780	38791	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	316931429
1032	NC_014834	CAC	2	6	38843	38848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931429
1033	NC_014834	CG	3	6	38875	38880	0 %	0 %	50 %	50 %	316931429
1034	NC_014834	CGA	2	6	38891	38896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931429
1035	NC_014834	CGG	2	6	38919	38924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931429
1036	NC_014834	GCC	2	6	38925	38930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931429
1037	NC_014834	GCCC	2	8	38936	38943	0 %	0 %	25 %	75 %	316931429
1038	NC_014834	GAT	2	6	39008	39013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931429
1039	NC_014834	GGTCG	2	10	39017	39026	0 %	20 %	60 %	20 %	316931429
1040	NC_014834	ATC	2	6	39042	39047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931429
1041	NC_014834	CGG	2	6	39048	39053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931429
1042	NC_014834	AGCCGA	2	12	39121	39132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931429
1043	NC_014834	GGC	2	6	39190	39195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931429
1044	NC_014834	GCG	2	6	39229	39234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931429
1045	NC_014834	TGA	2	6	39361	39366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931429
1046	NC_014834	CAG	2	6	39395	39400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931429
1047	NC_014834	ATG	2	6	39417	39422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931429
1048	NC_014834	CTTC	2	8	39472	39479	0 %	50 %	0 %	50 %	316931429
1049	NC_014834	CAC	2	6	39518	39523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931429
1050	NC_014834	TTG	2	6	39551	39556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014834	TCG	2	6	39576	39581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_014834	TCG	2	6	39586	39591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014834	CAC	2	6	39646	39651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_014834	GCCG	2	8	39660	39667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_014834	CGGC	2	8	39695	39702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_014834	GACG	2	8	39726	39733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_014834	ACC	2	6	39816	39821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_014834	GCC	2	6	39851	39856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_014834	CCATG	2	10	39870	39879	20 %	20 %	20 %	40 %	316931430
1060	NC_014834	GCT	2	6	39909	39914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1061	NC_014834	TGC	2	6	39938	39943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1062	NC_014834	G	7	7	39951	39957	0 %	0 %	100 %	0 %	316931430
1063	NC_014834	CGC	2	6	39966	39971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931430
1064	NC_014834	CG	3	6	39977	39982	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1065	NC_014834	CGGCGC	2	12	40002	40013	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1066	NC_014834	CGG	2	6	40025	40030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1067	NC_014834	CGG	2	6	40033	40038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1068	NC_014834	GGC	2	6	40044	40049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1069	NC_014834	GCC	2	6	40075	40080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931430
1070	NC_014834	CGG	2	6	40089	40094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1071	NC_014834	GC	4	8	40142	40149	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1072	NC_014834	CTGG	2	8	40182	40189	0 %	25 %	50 %	25 %	316931430
1073	NC_014834	CGC	2	6	40249	40254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931430
1074	NC_014834	CG	3	6	40265	40270	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1075	NC_014834	GCG	2	6	40387	40392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1076	NC_014834	GC	4	8	40437	40444	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1077	NC_014834	CG	3	6	40461	40466	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1078	NC_014834	ACCGC	2	10	40475	40484	20 %	0 %	20 %	60 %	316931430
1079	NC_014834	CTG	2	6	40516	40521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1080	NC_014834	CGGC	2	8	40610	40617	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1081	NC_014834	GC	5	10	40625	40634	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1082	NC_014834	CAT	2	6	40635	40640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931430
1083	NC_014834	CGC	2	6	40716	40721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931430
1084	NC_014834	GCA	2	6	40739	40744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1085	NC_014834	CG	3	6	40790	40795	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1086	NC_014834	CAT	2	6	40803	40808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931430
1087	NC_014834	GAC	2	6	40819	40824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1088	NC_014834	CGG	2	6	40854	40859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1089	NC_014834	TCG	2	6	40861	40866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1090	NC_014834	CGC	2	6	40908	40913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931430
1091	NC_014834	CGG	3	9	41048	41056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1092	NC_014834	CGG	2	6	41061	41066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931430
1093	NC_014834	CCAC	2	8	41126	41133	25 %	0 %	0 %	75 %	316931430
1094	NC_014834	GC	3	6	41178	41183	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
1095	NC_014834	CGCTG	2	10	41190	41199	0 %	20 %	40 %	40 %	316931430
1096	NC_014834	CGCA	2	8	41241	41248	25 %	0 %	25 %	50 %	316931430
1097	NC_014834	AGC	2	6	41285	41290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1098	NC_014834	GCCC	2	8	41291	41298	0 %	0 %	25 %	75 %	316931430
1099	NC_014834	CGT	2	6	41318	41323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931430
1100	NC_014834	GCC	2	6	41356	41361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1101	NC_014834	TCT	2	6	41364	41369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931431
1102	NC_014834	CG	3	6	41433	41438	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1103	NC_014834	CTT	2	6	41467	41472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931431
1104	NC_014834	TGCCCT	2	12	41484	41495	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316931431
1105	NC_014834	CTT	2	6	41530	41535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931431
1106	NC_014834	CG	3	6	41604	41609	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1107	NC_014834	GCT	2	6	41661	41666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1108	NC_014834	TCT	2	6	41679	41684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931431
1109	NC_014834	CCA	2	6	41703	41708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1110	NC_014834	GCCG	2	8	41866	41873	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1111	NC_014834	CAGC	2	8	41874	41881	25 %	0 %	25 %	50 %	316931431
1112	NC_014834	CGC	2	6	41967	41972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1113	NC_014834	GGC	2	6	41986	41991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931431
1114	NC_014834	GCA	2	6	42086	42091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1115	NC_014834	GCC	3	9	42169	42177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1116	NC_014834	GCC	2	6	42239	42244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1117	NC_014834	GC	4	8	42246	42253	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1118	NC_014834	GCG	2	6	42259	42264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931431
1119	NC_014834	CTT	2	6	42363	42368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931431
1120	NC_014834	CGA	2	6	42369	42374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1121	NC_014834	CAC	2	6	42424	42429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1122	NC_014834	CGA	2	6	42473	42478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1123	NC_014834	GTC	2	6	42547	42552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1124	NC_014834	ACC	2	6	42569	42574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1125	NC_014834	GCC	2	6	42592	42597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1126	NC_014834	GCA	2	6	42639	42644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1127	NC_014834	CGC	2	6	42660	42665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1128	NC_014834	GC	3	6	42679	42684	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
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1251	NC_014834	CGCCGG	2	12	48072	48083	0 %	0 %	50 %	50 %	316931437
1252	NC_014834	G	6	6	48147	48152	0 %	0 %	100 %	0 %	316931437
1253	NC_014834	ATC	2	6	48222	48227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931437
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1255	NC_014834	CCGA	2	8	48335	48342	25 %	0 %	25 %	50 %	316931437
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1360	NC_014834	TCGCG	2	10	52630	52639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1361	NC_014834	GGC	2	6	52660	52665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1362	NC_014834	GTG	2	6	52826	52831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931442
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1374	NC_014834	CG	3	6	53375	53380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1375	NC_014834	CTC	2	6	53397	53402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1376	NC_014834	CGGC	2	8	53428	53435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1377	NC_014834	GGC	2	6	53493	53498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1378	NC_014834	CGG	3	9	53502	53510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1379	NC_014834	AGC	2	6	53563	53568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1380	NC_014834	CGG	2	6	53574	53579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_014834	GTC	2	6	53587	53592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931443
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