MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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141002	NC_014834	AGC	2	6	5338495	5338500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141003	NC_014834	TCGG	2	8	5338507	5338514	0 %	25 %	50 %	25 %	316936256
141004	NC_014834	GATC	2	8	5338520	5338527	25 %	25 %	25 %	25 %	316936256
141005	NC_014834	GGCC	2	8	5338528	5338535	0 %	0 %	50 %	50 %	316936256
141006	NC_014834	GCC	2	6	5338612	5338617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936256
141007	NC_014834	GCA	2	6	5338622	5338627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141008	NC_014834	GTC	2	6	5338680	5338685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141009	NC_014834	CGCT	2	8	5338711	5338718	0 %	25 %	25 %	50 %	316936256
141010	NC_014834	TTC	2	6	5338719	5338724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936256
141011	NC_014834	CG	3	6	5338727	5338732	0 %	0 %	50 %	50 %	316936256
141012	NC_014834	ATG	2	6	5338741	5338746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936256
141013	NC_014834	CGGG	2	8	5338767	5338774	0 %	0 %	75 %	25 %	316936256
141014	NC_014834	CGG	2	6	5338783	5338788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936256
141015	NC_014834	GCA	2	6	5338814	5338819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141016	NC_014834	TCCAG	2	10	5338820	5338829	20 %	20 %	20 %	40 %	316936256
141017	NC_014834	CAC	2	6	5338830	5338835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936256
141018	NC_014834	CGT	2	6	5338871	5338876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141019	NC_014834	CG	3	6	5338880	5338885	0 %	0 %	50 %	50 %	316936256
141020	NC_014834	GCA	2	6	5338928	5338933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141021	NC_014834	CGT	2	6	5338935	5338940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141022	NC_014834	ACC	2	6	5338960	5338965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936256
141023	NC_014834	GC	3	6	5338971	5338976	0 %	0 %	50 %	50 %	316936256
141024	NC_014834	TCG	2	6	5338982	5338987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936256
141025	NC_014834	CCG	2	6	5339020	5339025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141026	NC_014834	CGG	2	6	5339042	5339047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141027	NC_014834	GTC	2	6	5339084	5339089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936257
141028	NC_014834	CTG	2	6	5339119	5339124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936257
141029	NC_014834	TGG	2	6	5339160	5339165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936257
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141031	NC_014834	CAT	2	6	5339242	5339247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936257
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141034	NC_014834	CGGC	2	8	5339322	5339329	0 %	0 %	50 %	50 %	316936257
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141039	NC_014834	TGC	2	6	5339583	5339588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936257
141040	NC_014834	CG	3	6	5339625	5339630	0 %	0 %	50 %	50 %	316936257
141041	NC_014834	CGA	2	6	5339673	5339678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936257
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141050	NC_014834	TCG	2	6	5339977	5339982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936258
141051	NC_014834	TCG	2	6	5340034	5340039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936258
141052	NC_014834	GCT	3	9	5340089	5340097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936258
141053	NC_014834	TCT	2	6	5340209	5340214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936258
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141072	NC_014834	GC	4	8	5340885	5340892	0 %	0 %	50 %	50 %	316936259
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141083	NC_014834	TGA	2	6	5341135	5341140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936259
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141101	NC_014834	GC	3	6	5341717	5341722	0 %	0 %	50 %	50 %	316936260
141102	NC_014834	ATG	2	6	5341737	5341742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936260
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141109	NC_014834	ATG	2	6	5341893	5341898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936260
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141114	NC_014834	CAG	2	6	5342075	5342080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936260
141115	NC_014834	GCG	2	6	5342102	5342107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936260
141116	NC_014834	GACC	2	8	5342152	5342159	25 %	0 %	25 %	50 %	316936260
141117	NC_014834	ATC	3	9	5342169	5342177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936260
141118	NC_014834	ACG	2	6	5342185	5342190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936260
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141122	NC_014834	CGA	2	6	5342308	5342313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936260
141123	NC_014834	GAT	2	6	5342324	5342329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936260
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141128	NC_014834	CGC	2	6	5342590	5342595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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141130	NC_014834	GC	3	6	5342627	5342632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141131	NC_014834	GA	3	6	5342699	5342704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141132	NC_014834	GCGA	2	8	5342707	5342714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141133	NC_014834	GAC	2	6	5342731	5342736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936261
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141161	NC_014834	CCCCG	2	10	5343779	5343788	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
141162	NC_014834	CGGT	2	8	5343797	5343804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141163	NC_014834	TGA	2	6	5343823	5343828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141168	NC_014834	GCCG	2	8	5343950	5343957	0 %	0 %	50 %	50 %	316936262
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141211	NC_014834	GTA	2	6	5345361	5345366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936263
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141217	NC_014834	CCG	2	6	5345458	5345463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936263
141218	NC_014834	TGGC	2	8	5345470	5345477	0 %	25 %	50 %	25 %	316936263
141219	NC_014834	ACG	2	6	5345518	5345523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936263
141220	NC_014834	CGA	2	6	5345585	5345590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936263
141221	NC_014834	CCGATC	2	12	5345593	5345604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316936263
141222	NC_014834	GCA	2	6	5345606	5345611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936263
141223	NC_014834	GCC	2	6	5345622	5345627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936263
141224	NC_014834	GAT	2	6	5345709	5345714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936263
141225	NC_014834	CAG	2	6	5345715	5345720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936263
141226	NC_014834	GGC	2	6	5345743	5345748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936263
141227	NC_014834	CCG	2	6	5345759	5345764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936263
141228	NC_014834	GAT	2	6	5345777	5345782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936263
141229	NC_014834	ACGCC	2	10	5345783	5345792	20 %	0 %	20 %	60 %	316936263
141230	NC_014834	GCACC	2	10	5345900	5345909	20 %	0 %	20 %	60 %	316936263
141231	NC_014834	GC	3	6	5345918	5345923	0 %	0 %	50 %	50 %	316936263
141232	NC_014834	GGC	2	6	5345961	5345966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936263
141233	NC_014834	CGT	2	6	5345990	5345995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936263
141234	NC_014834	ACGG	2	8	5346009	5346016	25 %	0 %	50 %	25 %	316936263
141235	NC_014834	CGG	2	6	5346050	5346055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936263
141236	NC_014834	CGA	2	6	5346056	5346061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936263
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141243	NC_014834	GGCC	2	8	5346323	5346330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141244	NC_014834	TCG	2	6	5346467	5346472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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141331	NC_014834	GGC	2	6	5349592	5349597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936267
141332	NC_014834	CGA	2	6	5349616	5349621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936267
141333	NC_014834	CGA	2	6	5349672	5349677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936267
141334	NC_014834	GCTG	2	8	5349694	5349701	0 %	25 %	50 %	25 %	316936267
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141338	NC_014834	CGA	2	6	5349775	5349780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936267
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141342	NC_014834	CGG	2	6	5349992	5349997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936267
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141344	NC_014834	CG	3	6	5350078	5350083	0 %	0 %	50 %	50 %	316936267
141345	NC_014834	GCCG	3	12	5350114	5350125	0 %	0 %	50 %	50 %	316936267
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141350	NC_014834	CGG	2	6	5350216	5350221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936267
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141352	NC_014834	CCG	2	6	5350286	5350291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141353	NC_014834	GCT	2	6	5350325	5350330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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141355	NC_014834	CG	3	6	5350345	5350350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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141357	NC_014834	CGGC	2	8	5350445	5350452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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141454	NC_014834	CG	3	6	5354394	5354399	0 %	0 %	50 %	50 %	316936270
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141458	NC_014834	TCG	2	6	5354529	5354534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936270
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141461	NC_014834	GATC	2	8	5354691	5354698	25 %	25 %	25 %	25 %	316936270
141462	NC_014834	CACGG	2	10	5354704	5354713	20 %	0 %	40 %	40 %	316936270
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