MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
140501	NC_014834	CG	3	6	5320277	5320282	0 %	0 %	50 %	50 %	316936240
140502	NC_014834	CG	3	6	5320299	5320304	0 %	0 %	50 %	50 %	316936240
140503	NC_014834	GCC	2	6	5320314	5320319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936240
140504	NC_014834	GAA	2	6	5320347	5320352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936240
140505	NC_014834	CCA	2	6	5320379	5320384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936240
140506	NC_014834	CGG	2	6	5320406	5320411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936240
140507	NC_014834	CGG	2	6	5320419	5320424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936240
140508	NC_014834	CTTC	2	8	5320436	5320443	0 %	50 %	0 %	50 %	316936240
140509	NC_014834	GCCGC	2	10	5320493	5320502	0 %	0 %	40 %	60 %	316936240
140510	NC_014834	GCC	2	6	5320533	5320538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936240
140511	NC_014834	GCG	2	6	5320539	5320544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936240
140512	NC_014834	CGA	2	6	5320586	5320591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936240
140513	NC_014834	CGC	2	6	5320634	5320639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936240
140514	NC_014834	TCG	2	6	5320654	5320659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936240
140515	NC_014834	TGGCC	2	10	5320715	5320724	0 %	20 %	40 %	40 %	316936240
140516	NC_014834	GCA	2	6	5320763	5320768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936240
140517	NC_014834	GCG	2	6	5320839	5320844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936240
140518	NC_014834	GCCG	2	8	5320880	5320887	0 %	0 %	50 %	50 %	316936240
140519	NC_014834	GGC	2	6	5320905	5320910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936240
140520	NC_014834	AGC	2	6	5320945	5320950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936240
140521	NC_014834	TCG	2	6	5321020	5321025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936240
140522	NC_014834	TCCGC	2	10	5321027	5321036	0 %	20 %	20 %	60 %	316936240
140523	NC_014834	GC	3	6	5321068	5321073	0 %	0 %	50 %	50 %	316936240
140524	NC_014834	CGA	2	6	5321132	5321137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936240
140525	NC_014834	CGC	2	6	5321175	5321180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936240
140526	NC_014834	CGTCGG	2	12	5321204	5321215	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316936240
140527	NC_014834	GGA	2	6	5321328	5321333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140528	NC_014834	GTG	2	6	5321354	5321359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140529	NC_014834	GCCG	2	8	5321366	5321373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140530	NC_014834	T	7	7	5321453	5321459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140531	NC_014834	GC	3	6	5321482	5321487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140532	NC_014834	GTT	2	6	5321611	5321616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936241
140533	NC_014834	GC	3	6	5321660	5321665	0 %	0 %	50 %	50 %	316936241
140534	NC_014834	CGA	2	6	5321674	5321679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140535	NC_014834	AGC	2	6	5321730	5321735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140536	NC_014834	GCC	2	6	5321762	5321767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936241
140537	NC_014834	CGCCAC	2	12	5321770	5321781	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	316936241
140538	NC_014834	GCC	2	6	5321789	5321794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936241
140539	NC_014834	GC	3	6	5321821	5321826	0 %	0 %	50 %	50 %	316936241
140540	NC_014834	CGT	2	6	5321836	5321841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140541	NC_014834	TCG	2	6	5321877	5321882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140542	NC_014834	CTG	2	6	5321888	5321893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140543	NC_014834	TCTCGA	2	12	5321929	5321940	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316936241
140544	NC_014834	GC	3	6	5321950	5321955	0 %	0 %	50 %	50 %	316936241
140545	NC_014834	CGG	2	6	5322052	5322057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936241
140546	NC_014834	CG	3	6	5322058	5322063	0 %	0 %	50 %	50 %	316936241
140547	NC_014834	CGT	2	6	5322127	5322132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936241
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140552	NC_014834	TGC	2	6	5322276	5322281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140553	NC_014834	CGC	2	6	5322331	5322336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936241
140554	NC_014834	GGCC	2	8	5322355	5322362	0 %	0 %	50 %	50 %	316936241
140555	NC_014834	GCC	2	6	5322413	5322418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936241
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140559	NC_014834	CGA	2	6	5322570	5322575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936241
140560	NC_014834	GC	4	8	5322602	5322609	0 %	0 %	50 %	50 %	316936241
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140563	NC_014834	GAG	2	6	5322737	5322742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140564	NC_014834	CGGT	2	8	5322798	5322805	0 %	25 %	50 %	25 %	316936242
140565	NC_014834	AGCGA	2	10	5322849	5322858	40 %	0 %	40 %	20 %	316936242
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140572	NC_014834	CAC	2	6	5323091	5323096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936242
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140583	NC_014834	GC	3	6	5323412	5323417	0 %	0 %	50 %	50 %	316936242
140584	NC_014834	GC	3	6	5323477	5323482	0 %	0 %	50 %	50 %	316936242
140585	NC_014834	TCG	2	6	5323506	5323511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936242
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140589	NC_014834	CAG	2	6	5323622	5323627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936242
140590	NC_014834	TCC	2	6	5323707	5323712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936242
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140597	NC_014834	CG	3	6	5323947	5323952	0 %	0 %	50 %	50 %	316936242
140598	NC_014834	GCTG	2	8	5323993	5324000	0 %	25 %	50 %	25 %	316936242
140599	NC_014834	AGC	2	6	5324052	5324057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936242
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140601	NC_014834	ATC	2	6	5324088	5324093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936242
140602	NC_014834	GCG	2	6	5324094	5324099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936243
140603	NC_014834	TGTGGA	2	12	5324163	5324174	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	316936243
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140606	NC_014834	GC	3	6	5324234	5324239	0 %	0 %	50 %	50 %	316936243
140607	NC_014834	GCA	2	6	5324274	5324279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936243
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140611	NC_014834	CG	3	6	5324407	5324412	0 %	0 %	50 %	50 %	316936243
140612	NC_014834	TCG	2	6	5324459	5324464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936243
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