MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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139002	NC_014834	GTG	2	6	5263546	5263551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936188
139003	NC_014834	CGG	2	6	5263578	5263583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
139004	NC_014834	GTG	2	6	5263711	5263716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936188
139005	NC_014834	GACCGC	2	12	5263719	5263730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316936188
139006	NC_014834	GAA	2	6	5263749	5263754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936188
139007	NC_014834	TCG	2	6	5263780	5263785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139008	NC_014834	CGG	2	6	5263787	5263792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
139009	NC_014834	CGA	2	6	5263998	5264003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139010	NC_014834	GGC	2	6	5264005	5264010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
139011	NC_014834	GCCG	2	8	5264040	5264047	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
139012	NC_014834	GAA	2	6	5264094	5264099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936188
139013	NC_014834	CGA	2	6	5264121	5264126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139014	NC_014834	CG	3	6	5264148	5264153	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
139015	NC_014834	AAG	2	6	5264194	5264199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936188
139016	NC_014834	GTCG	2	8	5264211	5264218	0 %	25 %	50 %	25 %	316936188
139017	NC_014834	GTG	2	6	5264227	5264232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936188
139018	NC_014834	CGA	2	6	5264304	5264309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139019	NC_014834	GCA	3	9	5264337	5264345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139020	NC_014834	CTCG	2	8	5264376	5264383	0 %	25 %	25 %	50 %	316936188
139021	NC_014834	CG	4	8	5264391	5264398	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
139022	NC_014834	GGC	2	6	5264412	5264417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
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139024	NC_014834	CGG	2	6	5264432	5264437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
139025	NC_014834	GGC	2	6	5264440	5264445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
139026	NC_014834	GC	3	6	5264450	5264455	0 %	0 %	50 %	50 %	316936188
139027	NC_014834	TGA	2	6	5264456	5264461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936188
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139031	NC_014834	GGC	2	6	5264518	5264523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936188
139032	NC_014834	GCCGA	2	10	5264530	5264539	20 %	0 %	40 %	40 %	316936188
139033	NC_014834	CGA	2	6	5264547	5264552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139034	NC_014834	GCT	2	6	5264585	5264590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139035	NC_014834	TCG	3	9	5264627	5264635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936188
139036	NC_014834	TGC	2	6	5264791	5264796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936189
139037	NC_014834	CAG	2	6	5264802	5264807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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139039	NC_014834	AGC	2	6	5264884	5264889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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139041	NC_014834	CAG	2	6	5264982	5264987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
139042	NC_014834	CAC	3	9	5265008	5265016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936189
139043	NC_014834	CGA	2	6	5265041	5265046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
139044	NC_014834	CGA	2	6	5265052	5265057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
139045	NC_014834	TCA	2	6	5265106	5265111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936189
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139047	NC_014834	GC	3	6	5265218	5265223	0 %	0 %	50 %	50 %	316936189
139048	NC_014834	CGA	2	6	5265335	5265340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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139051	NC_014834	CGGCAA	2	12	5265437	5265448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
139052	NC_014834	CCTG	2	8	5265590	5265597	0 %	25 %	25 %	50 %	316936189
139053	NC_014834	GCCG	2	8	5265639	5265646	0 %	0 %	50 %	50 %	316936189
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139074	NC_014834	CG	3	6	5266276	5266281	0 %	0 %	50 %	50 %	316936189
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139104	NC_014834	GCA	2	6	5267290	5267295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936189
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139106	NC_014834	CGC	2	6	5267320	5267325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936189
139107	NC_014834	TGA	2	6	5267326	5267331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936189
139108	NC_014834	GCGG	2	8	5267333	5267340	0 %	0 %	75 %	25 %	316936189
139109	NC_014834	TGG	2	6	5267398	5267403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936189
139110	NC_014834	GCG	2	6	5267419	5267424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936189
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139112	NC_014834	AAG	3	9	5267568	5267576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936189
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139114	NC_014834	TC	3	6	5267674	5267679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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139231	NC_014834	TTC	2	6	5272039	5272044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936192
139232	NC_014834	AAG	2	6	5272051	5272056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936192
139233	NC_014834	GC	3	6	5272070	5272075	0 %	0 %	50 %	50 %	316936192
139234	NC_014834	GTCG	2	8	5272080	5272087	0 %	25 %	50 %	25 %	316936192
139235	NC_014834	TCG	2	6	5272133	5272138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936192
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139241	NC_014834	GGT	2	6	5272395	5272400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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139265	NC_014834	TCGC	2	8	5273375	5273382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139266	NC_014834	CG	3	6	5273416	5273421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139267	NC_014834	GA	3	6	5273425	5273430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139292	NC_014834	A	7	7	5274228	5274234	100 %	0 %	0 %	0 %	316936195
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139332	NC_014834	CGA	2	6	5275714	5275719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936195
139333	NC_014834	CAG	3	9	5275781	5275789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936195
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139335	NC_014834	TGGCGC	2	12	5275818	5275829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316936195
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139337	NC_014834	GC	3	6	5275869	5275874	0 %	0 %	50 %	50 %	316936195
139338	NC_014834	GGC	2	6	5276014	5276019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936195
139339	NC_014834	ATC	2	6	5276045	5276050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936195
139340	NC_014834	ACG	2	6	5276061	5276066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936195
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139342	NC_014834	AAC	2	6	5276081	5276086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936195
139343	NC_014834	CGG	2	6	5276098	5276103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936195
139344	NC_014834	GGT	2	6	5276113	5276118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936195
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