MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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138502	NC_014834	CTG	2	6	5246151	5246156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936172
138503	NC_014834	CGGC	2	8	5246182	5246189	0 %	0 %	50 %	50 %	316936172
138504	NC_014834	GCG	2	6	5246219	5246224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936172
138505	NC_014834	GCC	2	6	5246285	5246290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936172
138506	NC_014834	CGCC	3	12	5246294	5246305	0 %	0 %	25 %	75 %	316936172
138507	NC_014834	CCG	2	6	5246306	5246311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936172
138508	NC_014834	CAG	2	6	5246322	5246327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936172
138509	NC_014834	CG	3	6	5246410	5246415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138510	NC_014834	TGC	2	6	5246419	5246424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936173
138511	NC_014834	CGC	2	6	5246450	5246455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936173
138512	NC_014834	GTTC	2	8	5246506	5246513	0 %	50 %	25 %	25 %	316936173
138513	NC_014834	CCG	2	6	5246523	5246528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936173
138514	NC_014834	GCG	2	6	5246614	5246619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936173
138515	NC_014834	TCGG	2	8	5246655	5246662	0 %	25 %	50 %	25 %	316936173
138516	NC_014834	ATC	2	6	5246742	5246747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936173
138517	NC_014834	ATC	2	6	5246841	5246846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936173
138518	NC_014834	CGG	2	6	5246852	5246857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936173
138519	NC_014834	TTC	2	6	5246862	5246867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936173
138520	NC_014834	GTG	2	6	5246898	5246903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936173
138521	NC_014834	TCG	3	9	5246974	5246982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936173
138522	NC_014834	TCT	2	6	5247019	5247024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138523	NC_014834	CCG	2	6	5247027	5247032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138524	NC_014834	GGC	2	6	5247090	5247095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936174
138525	NC_014834	TGC	2	6	5247125	5247130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936174
138526	NC_014834	GC	3	6	5247146	5247151	0 %	0 %	50 %	50 %	316936174
138527	NC_014834	GCG	2	6	5247157	5247162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936174
138528	NC_014834	GCC	2	6	5247177	5247182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936174
138529	NC_014834	TCC	2	6	5247204	5247209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936174
138530	NC_014834	CGA	2	6	5247237	5247242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936174
138531	NC_014834	TCG	2	6	5247268	5247273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936174
138532	NC_014834	GCT	2	6	5247291	5247296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936174
138533	NC_014834	ACA	2	6	5247314	5247319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936174
138534	NC_014834	CGC	2	6	5247326	5247331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936174
138535	NC_014834	CAG	2	6	5247358	5247363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936174
138536	NC_014834	CGC	3	9	5247377	5247385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936174
138537	NC_014834	GCC	2	6	5247393	5247398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936174
138538	NC_014834	CCG	2	6	5247406	5247411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936174
138539	NC_014834	GCC	2	6	5247474	5247479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936174
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138541	NC_014834	GGC	2	6	5247537	5247542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936174
138542	NC_014834	CG	3	6	5247644	5247649	0 %	0 %	50 %	50 %	316936174
138543	NC_014834	GGC	2	6	5247702	5247707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936174
138544	NC_014834	CGA	2	6	5247720	5247725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138545	NC_014834	ACGC	2	8	5247727	5247734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138546	NC_014834	GCTT	2	8	5247788	5247795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138547	NC_014834	CGC	2	6	5247802	5247807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138548	NC_014834	GCCGC	2	10	5247809	5247818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138549	NC_014834	ACA	2	6	5247824	5247829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138550	NC_014834	GCC	2	6	5247872	5247877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936175
138551	NC_014834	TCA	2	6	5247908	5247913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936175
138552	NC_014834	GGTCG	2	10	5247957	5247966	0 %	20 %	60 %	20 %	316936175
138553	NC_014834	GC	3	6	5247982	5247987	0 %	0 %	50 %	50 %	316936175
138554	NC_014834	CGG	2	6	5247989	5247994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936175
138555	NC_014834	GCT	2	6	5247996	5248001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936175
138556	NC_014834	CGA	2	6	5248002	5248007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936175
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138558	NC_014834	CGC	2	6	5248035	5248040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936175
138559	NC_014834	CGTC	2	8	5248063	5248070	0 %	25 %	25 %	50 %	316936175
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138562	NC_014834	CTCG	2	8	5248170	5248177	0 %	25 %	25 %	50 %	316936175
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138567	NC_014834	CGG	2	6	5248311	5248316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936175
138568	NC_014834	CG	3	6	5248358	5248363	0 %	0 %	50 %	50 %	316936175
138569	NC_014834	CG	3	6	5248411	5248416	0 %	0 %	50 %	50 %	316936175
138570	NC_014834	ATCGG	2	10	5248456	5248465	20 %	20 %	40 %	20 %	316936175
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138584	NC_014834	CGT	2	6	5248825	5248830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138585	NC_014834	CTC	2	6	5248831	5248836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138586	NC_014834	GAG	2	6	5248855	5248860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138587	NC_014834	ACG	2	6	5248865	5248870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138588	NC_014834	TTGCT	2	10	5248902	5248911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138589	NC_014834	CGC	2	6	5248962	5248967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138590	NC_014834	GGCCG	2	10	5249024	5249033	0 %	0 %	60 %	40 %	316936176
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138599	NC_014834	CGCCC	2	10	5249282	5249291	0 %	0 %	20 %	80 %	316936176
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138606	NC_014834	GC	3	6	5249501	5249506	0 %	0 %	50 %	50 %	316936176
138607	NC_014834	CGC	2	6	5249513	5249518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936176
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138613	NC_014834	CG	3	6	5249709	5249714	0 %	0 %	50 %	50 %	316936176
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138615	NC_014834	AGC	2	6	5249734	5249739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936176
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