MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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138002	NC_014834	CG	4	8	5227328	5227335	0 %	0 %	50 %	50 %	316936154
138003	NC_014834	CCG	2	6	5227354	5227359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936154
138004	NC_014834	CGG	2	6	5227388	5227393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936154
138005	NC_014834	GCC	2	6	5227453	5227458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936154
138006	NC_014834	GGC	2	6	5227532	5227537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936154
138007	NC_014834	GCG	2	6	5227608	5227613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936154
138008	NC_014834	A	7	7	5227629	5227635	100 %	0 %	0 %	0 %	316936154
138009	NC_014834	CGG	2	6	5227669	5227674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936154
138010	NC_014834	GACC	2	8	5227736	5227743	25 %	0 %	25 %	50 %	316936155
138011	NC_014834	ACGAT	2	10	5227756	5227765	40 %	20 %	20 %	20 %	316936155
138012	NC_014834	GCG	2	6	5227772	5227777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138013	NC_014834	GAT	2	6	5227782	5227787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936155
138014	NC_014834	ATG	3	9	5227855	5227863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936155
138015	NC_014834	GCG	2	6	5227879	5227884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138016	NC_014834	GAT	2	6	5227896	5227901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936155
138017	NC_014834	CGG	3	9	5227904	5227912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138018	NC_014834	CGAC	2	8	5227915	5227922	25 %	0 %	25 %	50 %	316936155
138019	NC_014834	ACG	2	6	5227944	5227949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936155
138020	NC_014834	CTGC	2	8	5227961	5227968	0 %	25 %	25 %	50 %	316936155
138021	NC_014834	GCT	2	6	5227988	5227993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936155
138022	NC_014834	GCG	3	9	5227998	5228006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138023	NC_014834	CCA	2	6	5228051	5228056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936155
138024	NC_014834	CGA	2	6	5228066	5228071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936155
138025	NC_014834	GAG	2	6	5228118	5228123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936155
138026	NC_014834	CGA	2	6	5228126	5228131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936155
138027	NC_014834	GCC	2	6	5228134	5228139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936155
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138029	NC_014834	GGC	2	6	5228180	5228185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138030	NC_014834	CTG	3	9	5228268	5228276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936155
138031	NC_014834	CTGA	2	8	5228364	5228371	25 %	25 %	25 %	25 %	316936155
138032	NC_014834	GCC	2	6	5228420	5228425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936155
138033	NC_014834	GGC	2	6	5228440	5228445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138034	NC_014834	CGG	2	6	5228459	5228464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
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138041	NC_014834	GCG	2	6	5228646	5228651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936155
138042	NC_014834	TCGG	2	8	5228670	5228677	0 %	25 %	50 %	25 %	316936155
138043	NC_014834	CGA	2	6	5228750	5228755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936155
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138047	NC_014834	GCCG	2	8	5228961	5228968	0 %	0 %	50 %	50 %	316936155
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138050	NC_014834	TGC	2	6	5229142	5229147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936155
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138052	NC_014834	CTG	2	6	5229399	5229404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936155
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138054	NC_014834	GCT	2	6	5229440	5229445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936155
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138086	NC_014834	GCC	2	6	5230558	5230563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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138098	NC_014834	CG	3	6	5231284	5231289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138099	NC_014834	GTC	2	6	5231301	5231306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138100	NC_014834	TCCA	2	8	5231309	5231316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138101	NC_014834	CCGAAT	2	12	5231319	5231330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138102	NC_014834	CGG	2	6	5231363	5231368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138103	NC_014834	GC	3	6	5231377	5231382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138104	NC_014834	CGA	2	6	5231419	5231424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138106	NC_014834	TAG	2	6	5231444	5231449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138107	NC_014834	GGT	2	6	5231613	5231618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138108	NC_014834	GA	3	6	5231659	5231664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138109	NC_014834	CGA	2	6	5231703	5231708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138110	NC_014834	GCCA	2	8	5231743	5231750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138111	NC_014834	ATC	2	6	5231765	5231770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138112	NC_014834	CAA	2	6	5231777	5231782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138113	NC_014834	GCC	2	6	5231914	5231919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936158
138114	NC_014834	TTGA	2	8	5231923	5231930	25 %	50 %	25 %	0 %	316936158
138115	NC_014834	CG	4	8	5231935	5231942	0 %	0 %	50 %	50 %	316936158
138116	NC_014834	CGC	2	6	5231992	5231997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936158
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138220	NC_014834	CG	3	6	5235721	5235726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138221	NC_014834	TCG	2	6	5235736	5235741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138227	NC_014834	CGG	2	6	5235895	5235900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936161
138228	NC_014834	CGGGCG	2	12	5235981	5235992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936161
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138230	NC_014834	GCAC	2	8	5236004	5236011	25 %	0 %	25 %	50 %	316936161
138231	NC_014834	GCC	2	6	5236024	5236029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936161
138232	NC_014834	ACG	2	6	5236037	5236042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936161
138233	NC_014834	GCT	2	6	5236048	5236053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936161
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138239	NC_014834	CAT	2	6	5236243	5236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936161
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138242	NC_014834	GCT	2	6	5236354	5236359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936161
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138258	NC_014834	CGG	2	6	5237119	5237124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936162
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138281	NC_014834	CCTG	2	8	5237812	5237819	0 %	25 %	25 %	50 %	316936163
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138333	NC_014834	GCT	2	6	5239814	5239819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936164
138334	NC_014834	CAA	2	6	5239835	5239840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936164
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138337	NC_014834	CTA	2	6	5239973	5239978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936164
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138339	NC_014834	CGA	2	6	5240008	5240013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936164
138340	NC_014834	AGC	2	6	5240032	5240037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936164
138341	NC_014834	CGCC	2	8	5240054	5240061	0 %	0 %	25 %	75 %	316936164
138342	NC_014834	GTAA	2	8	5240101	5240108	50 %	25 %	25 %	0 %	316936164
138343	NC_014834	TCGC	2	8	5240154	5240161	0 %	25 %	25 %	50 %	316936165
138344	NC_014834	GC	3	6	5240271	5240276	0 %	0 %	50 %	50 %	316936165
138345	NC_014834	CCG	2	6	5240289	5240294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
138346	NC_014834	TGC	3	9	5240301	5240309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
138347	NC_014834	GAT	2	6	5240326	5240331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936165
138348	NC_014834	CGT	2	6	5240365	5240370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
138349	NC_014834	CGG	2	6	5240385	5240390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936165
138350	NC_014834	CGAC	2	8	5240394	5240401	25 %	0 %	25 %	50 %	316936165
138351	NC_014834	CTT	2	6	5240404	5240409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936165
138352	NC_014834	CTG	2	6	5240417	5240422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
138353	NC_014834	CCA	2	6	5240424	5240429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936165
138354	NC_014834	GC	3	6	5240445	5240450	0 %	0 %	50 %	50 %	316936165
138355	NC_014834	ATC	2	6	5240459	5240464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936165
138356	NC_014834	GCTCG	2	10	5240557	5240566	0 %	20 %	40 %	40 %	316936165
138357	NC_014834	GGT	2	6	5240578	5240583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936165
138358	NC_014834	CGC	2	6	5240584	5240589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
138359	NC_014834	GC	3	6	5240592	5240597	0 %	0 %	50 %	50 %	316936165
138360	NC_014834	GTG	2	6	5240615	5240620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936165
138361	NC_014834	GAC	2	6	5240630	5240635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936165
138362	NC_014834	CGT	2	6	5240638	5240643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936165
138363	NC_014834	GGT	2	6	5240644	5240649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936165
138364	NC_014834	CGC	2	6	5240653	5240658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936165
138365	NC_014834	GGC	2	6	5240671	5240676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936165
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138368	NC_014834	GCG	2	6	5240733	5240738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936165
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138372	NC_014834	GC	3	6	5240883	5240888	0 %	0 %	50 %	50 %	316936166
138373	NC_014834	GAT	2	6	5240929	5240934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936166
138374	NC_014834	CGG	2	6	5240937	5240942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936166
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138376	NC_014834	TCG	2	6	5240986	5240991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936166
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138399	NC_014834	GGCGAA	2	12	5241705	5241716	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	316936166
138400	NC_014834	GCG	2	6	5241749	5241754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138401	NC_014834	TCCCCC	2	12	5241789	5241800	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
138402	NC_014834	ACCCCC	2	12	5241868	5241879	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
138403	NC_014834	GGGGA	2	10	5241896	5241905	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138404	NC_014834	AC	3	6	5241925	5241930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138405	NC_014834	CGG	2	6	5242070	5242075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936167
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138425	NC_014834	TAA	2	6	5243009	5243014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138426	NC_014834	CAC	2	6	5243075	5243080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936168
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138445	NC_014834	CGT	2	6	5243881	5243886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936169
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138451	NC_014834	GAA	2	6	5244097	5244102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936169
138452	NC_014834	GGCT	2	8	5244127	5244134	0 %	25 %	50 %	25 %	316936169
138453	NC_014834	CG	4	8	5244166	5244173	0 %	0 %	50 %	50 %	316936169
138454	NC_014834	CGG	2	6	5244193	5244198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936169
138455	NC_014834	GGT	2	6	5244374	5244379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936170
138456	NC_014834	GCC	2	6	5244391	5244396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936170
138457	NC_014834	AAG	2	6	5244423	5244428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936170
138458	NC_014834	ATGC	2	8	5244516	5244523	25 %	25 %	25 %	25 %	316936170
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138460	NC_014834	GC	3	6	5244545	5244550	0 %	0 %	50 %	50 %	316936170
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138485	NC_014834	GCC	2	6	5245340	5245345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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138492	NC_014834	CGGCG	2	10	5245624	5245633	0 %	0 %	60 %	40 %	316936171
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138496	NC_014834	CTA	2	6	5245767	5245772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936171
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138499	NC_014834	GGC	2	6	5245994	5245999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936172
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