MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
137501	NC_014834	CGG	2	6	5208571	5208576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936139
137502	NC_014834	ACC	2	6	5208617	5208622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936139
137503	NC_014834	GCA	2	6	5208672	5208677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137504	NC_014834	TGG	2	6	5208714	5208719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936139
137505	NC_014834	CGA	2	6	5208730	5208735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137506	NC_014834	GCA	2	6	5208795	5208800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137507	NC_014834	GC	3	6	5208809	5208814	0 %	0 %	50 %	50 %	316936139
137508	NC_014834	GCA	2	6	5208852	5208857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137509	NC_014834	TGC	2	6	5208879	5208884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137510	NC_014834	AGC	2	6	5208956	5208961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137511	NC_014834	GCAGC	2	10	5208972	5208981	20 %	0 %	40 %	40 %	316936139
137512	NC_014834	CGACAC	2	12	5209008	5209019	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316936139
137513	NC_014834	GATG	2	8	5209025	5209032	25 %	25 %	50 %	0 %	316936139
137514	NC_014834	CGT	2	6	5209166	5209171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137515	NC_014834	GCA	2	6	5209231	5209236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137516	NC_014834	TCG	2	6	5209306	5209311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137517	NC_014834	CTC	2	6	5209317	5209322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137518	NC_014834	TAC	2	6	5209336	5209341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936140
137519	NC_014834	CGA	2	6	5209373	5209378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936140
137520	NC_014834	GCTTCG	2	12	5209396	5209407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936140
137521	NC_014834	GCG	2	6	5209449	5209454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936140
137522	NC_014834	CGC	2	6	5209551	5209556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936140
137523	NC_014834	ACC	2	6	5209583	5209588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936140
137524	NC_014834	TCG	2	6	5209603	5209608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936140
137525	NC_014834	GCA	2	6	5209721	5209726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936140
137526	NC_014834	GCG	2	6	5209727	5209732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936140
137527	NC_014834	TCA	2	6	5209747	5209752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936140
137528	NC_014834	GAT	2	6	5209761	5209766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936140
137529	NC_014834	GGCC	2	8	5209817	5209824	0 %	0 %	50 %	50 %	316936140
137530	NC_014834	CCA	2	6	5209889	5209894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936140
137531	NC_014834	TTC	2	6	5209900	5209905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936140
137532	NC_014834	CGC	2	6	5209932	5209937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936140
137533	NC_014834	GGA	2	6	5209938	5209943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936140
137534	NC_014834	CGT	2	6	5209970	5209975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936140
137535	NC_014834	CAG	2	6	5210031	5210036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137536	NC_014834	GTC	2	6	5210045	5210050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137537	NC_014834	GCA	2	6	5210053	5210058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137538	NC_014834	CGC	2	6	5210069	5210074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936141
137539	NC_014834	GCA	2	6	5210197	5210202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137540	NC_014834	TGT	2	6	5210206	5210211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936141
137541	NC_014834	GCC	2	6	5210222	5210227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936141
137542	NC_014834	ATG	2	6	5210289	5210294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936141
137543	NC_014834	CGG	2	6	5210309	5210314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
137544	NC_014834	CCA	2	6	5210332	5210337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936141
137545	NC_014834	GAT	2	6	5210428	5210433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936141
137546	NC_014834	CGA	2	6	5210506	5210511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137547	NC_014834	TCGG	2	8	5210574	5210581	0 %	25 %	50 %	25 %	316936141
137548	NC_014834	GGC	2	6	5210600	5210605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
137549	NC_014834	CG	3	6	5210623	5210628	0 %	0 %	50 %	50 %	316936141
137550	NC_014834	GCC	2	6	5210681	5210686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936141
137551	NC_014834	CG	3	6	5210707	5210712	0 %	0 %	50 %	50 %	316936141
137552	NC_014834	CG	3	6	5210749	5210754	0 %	0 %	50 %	50 %	316936141
137553	NC_014834	CGG	2	6	5210770	5210775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
137554	NC_014834	TGA	2	6	5210785	5210790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936141
137555	NC_014834	CTG	2	6	5210822	5210827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137556	NC_014834	CAT	2	6	5210837	5210842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936141
137557	NC_014834	GTC	2	6	5210940	5210945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137558	NC_014834	CGG	3	9	5210990	5210998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
137559	NC_014834	CG	3	6	5211139	5211144	0 %	0 %	50 %	50 %	316936141
137560	NC_014834	GCG	2	6	5211202	5211207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
137561	NC_014834	CGAA	2	8	5211250	5211257	50 %	0 %	25 %	25 %	316936141
137562	NC_014834	GCT	2	6	5211302	5211307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936141
137563	NC_014834	GAT	2	6	5211308	5211313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936141
137564	NC_014834	GCG	2	6	5211316	5211321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936141
137565	NC_014834	GTC	2	6	5211339	5211344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137566	NC_014834	GGC	2	6	5211410	5211415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936142
137567	NC_014834	CGG	2	6	5211436	5211441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936142
137568	NC_014834	ATC	2	6	5211455	5211460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936142
137569	NC_014834	TCG	2	6	5211474	5211479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137570	NC_014834	CG	4	8	5211482	5211489	0 %	0 %	50 %	50 %	316936142
137571	NC_014834	GGCA	2	8	5211501	5211508	25 %	0 %	50 %	25 %	316936142
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137574	NC_014834	CGA	2	6	5211628	5211633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137575	NC_014834	CG	3	6	5211637	5211642	0 %	0 %	50 %	50 %	316936142
137576	NC_014834	CG	3	6	5211658	5211663	0 %	0 %	50 %	50 %	316936142
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137580	NC_014834	CGA	2	6	5211796	5211801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137581	NC_014834	CGA	2	6	5211841	5211846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137582	NC_014834	CTG	2	6	5212013	5212018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137583	NC_014834	CTC	2	6	5212025	5212030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936142
137584	NC_014834	GAT	2	6	5212058	5212063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936142
137585	NC_014834	ACG	2	6	5212122	5212127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137586	NC_014834	CGT	2	6	5212219	5212224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137587	NC_014834	CGA	2	6	5212228	5212233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936142
137588	NC_014834	CCG	2	6	5212237	5212242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936142
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137590	NC_014834	CTT	2	6	5212304	5212309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936142
137591	NC_014834	GGT	2	6	5212322	5212327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936142
137592	NC_014834	AGCG	2	8	5212397	5212404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137593	NC_014834	CCG	2	6	5212432	5212437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137594	NC_014834	GC	3	6	5212479	5212484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137595	NC_014834	CG	3	6	5212521	5212526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137596	NC_014834	CGC	2	6	5212537	5212542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137597	NC_014834	CCA	2	6	5212560	5212565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936143
137598	NC_014834	AGATCG	2	12	5212601	5212612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316936143
137599	NC_014834	TCG	2	6	5212667	5212672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936143
137600	NC_014834	CGA	2	6	5212692	5212697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936143
137601	NC_014834	GCA	2	6	5212709	5212714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936143
137602	NC_014834	GTC	2	6	5212807	5212812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936144
137603	NC_014834	GCG	2	6	5212828	5212833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936144
137604	NC_014834	GCA	2	6	5212850	5212855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936144
137605	NC_014834	TCG	2	6	5212906	5212911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936144
137606	NC_014834	GCG	2	6	5212916	5212921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936144
137607	NC_014834	TCG	2	6	5212924	5212929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936144
137608	NC_014834	GC	3	6	5212981	5212986	0 %	0 %	50 %	50 %	316936144
137609	NC_014834	GCC	3	9	5213001	5213009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936144
137610	NC_014834	TCAG	2	8	5213026	5213033	25 %	25 %	25 %	25 %	316936144
137611	NC_014834	GC	3	6	5213042	5213047	0 %	0 %	50 %	50 %	316936144
137612	NC_014834	GCG	2	6	5213063	5213068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936144
137613	NC_014834	CA	3	6	5213107	5213112	50 %	0 %	0 %	50 %	316936144
137614	NC_014834	GCG	2	6	5213132	5213137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936144
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137718	NC_014834	TCC	2	6	5216777	5216782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936147
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137958	NC_014834	GTC	2	6	5225654	5225659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137959	NC_014834	CGC	2	6	5225696	5225701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936153
137960	NC_014834	ACAGCG	2	12	5225722	5225733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137961	NC_014834	CTC	2	6	5225759	5225764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936153
137962	NC_014834	TCT	2	6	5225797	5225802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936153
137963	NC_014834	GTC	2	6	5225810	5225815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137964	NC_014834	CGG	2	6	5225843	5225848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936153
137965	NC_014834	GCC	2	6	5225852	5225857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936153
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137967	NC_014834	CGCT	2	8	5226009	5226016	0 %	25 %	25 %	50 %	316936153
137968	NC_014834	TCG	2	6	5226027	5226032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137969	NC_014834	CAT	2	6	5226055	5226060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936153
137970	NC_014834	CGA	2	6	5226064	5226069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
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137972	NC_014834	GGA	2	6	5226109	5226114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936153
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137975	NC_014834	GCA	2	6	5226154	5226159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137976	NC_014834	AGC	2	6	5226198	5226203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
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137979	NC_014834	GC	3	6	5226282	5226287	0 %	0 %	50 %	50 %	316936153
137980	NC_014834	TTG	2	6	5226297	5226302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936153
137981	NC_014834	CGAA	2	8	5226310	5226317	50 %	0 %	25 %	25 %	316936153
137982	NC_014834	TTC	2	6	5226366	5226371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936153
137983	NC_014834	CAG	2	6	5226374	5226379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137984	NC_014834	GTC	2	6	5226425	5226430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137985	NC_014834	CAG	2	6	5226440	5226445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137986	NC_014834	GTC	2	6	5226461	5226466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936153
137987	NC_014834	GTG	2	6	5226498	5226503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936153
137988	NC_014834	CG	3	6	5226504	5226509	0 %	0 %	50 %	50 %	316936153
137989	NC_014834	GC	5	10	5226607	5226616	0 %	0 %	50 %	50 %	316936153
137990	NC_014834	GCC	2	6	5226706	5226711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137991	NC_014834	GC	3	6	5226889	5226894	0 %	0 %	50 %	50 %	316936154
137992	NC_014834	CAA	2	6	5226906	5226911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936154
137993	NC_014834	ATCGC	2	10	5226951	5226960	20 %	20 %	20 %	40 %	316936154
137994	NC_014834	CGC	2	6	5226979	5226984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936154
137995	NC_014834	CG	3	6	5226995	5227000	0 %	0 %	50 %	50 %	316936154
137996	NC_014834	GC	3	6	5227145	5227150	0 %	0 %	50 %	50 %	316936154
137997	NC_014834	ATA	2	6	5227172	5227177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316936154
137998	NC_014834	GCG	2	6	5227210	5227215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936154
137999	NC_014834	GAT	2	6	5227232	5227237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936154
138000	NC_014834	CGC	2	6	5227243	5227248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936154

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