MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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137002	NC_014834	GGC	2	6	5189820	5189825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936126
137003	NC_014834	GCG	2	6	5189835	5189840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936126
137004	NC_014834	TG	3	6	5189865	5189870	0 %	50 %	50 %	0 %	316936126
137005	NC_014834	GCT	2	6	5189893	5189898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137006	NC_014834	GAG	2	6	5189905	5189910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936127
137007	NC_014834	GGC	3	9	5189998	5190006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936127
137008	NC_014834	CGC	2	6	5190127	5190132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936127
137009	NC_014834	CGG	2	6	5190213	5190218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936127
137010	NC_014834	GAT	2	6	5190223	5190228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936127
137011	NC_014834	CACCGA	2	12	5190268	5190279	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316936127
137012	NC_014834	CTG	2	6	5190293	5190298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137013	NC_014834	CGG	2	6	5190328	5190333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936127
137014	NC_014834	GCT	2	6	5190361	5190366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137015	NC_014834	TG	3	6	5190383	5190388	0 %	50 %	50 %	0 %	316936127
137016	NC_014834	TGC	2	6	5190465	5190470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137017	NC_014834	CCG	2	6	5190506	5190511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936127
137018	NC_014834	GCC	2	6	5190527	5190532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936127
137019	NC_014834	TCA	2	6	5190543	5190548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936127
137020	NC_014834	TCG	2	6	5190584	5190589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137021	NC_014834	TGT	2	6	5190617	5190622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936127
137022	NC_014834	CGA	2	6	5190678	5190683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137023	NC_014834	CGCTC	2	10	5190721	5190730	0 %	20 %	20 %	60 %	316936127
137024	NC_014834	CGT	2	6	5190771	5190776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137025	NC_014834	TGA	2	6	5190819	5190824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936127
137026	NC_014834	CGGCTG	2	12	5190829	5190840	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316936127
137027	NC_014834	TCG	2	6	5190869	5190874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137028	NC_014834	CGT	2	6	5190897	5190902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137029	NC_014834	CGC	2	6	5190928	5190933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936127
137030	NC_014834	AGC	2	6	5190953	5190958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137031	NC_014834	TGG	2	6	5191005	5191010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936127
137032	NC_014834	CGC	2	6	5191113	5191118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936127
137033	NC_014834	CGT	2	6	5191221	5191226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
137034	NC_014834	ATCGAC	2	12	5191229	5191240	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316936127
137035	NC_014834	TGG	2	6	5191278	5191283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936127
137036	NC_014834	GC	4	8	5191286	5191293	0 %	0 %	50 %	50 %	316936127
137037	NC_014834	TGA	2	6	5191320	5191325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936127
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137040	NC_014834	TGG	2	6	5191524	5191529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936127
137041	NC_014834	GCG	2	6	5191547	5191552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936127
137042	NC_014834	TGC	3	9	5191560	5191568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936127
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137044	NC_014834	GAT	2	6	5191584	5191589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137045	NC_014834	AGC	2	6	5191656	5191661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936128
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137047	NC_014834	GGC	2	6	5191787	5191792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936128
137048	NC_014834	CGA	2	6	5191826	5191831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936128
137049	NC_014834	GTG	2	6	5191917	5191922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936128
137050	NC_014834	GGT	3	9	5192033	5192041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936128
137051	NC_014834	GAC	2	6	5192166	5192171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936128
137052	NC_014834	GC	3	6	5192195	5192200	0 %	0 %	50 %	50 %	316936128
137053	NC_014834	GCC	2	6	5192225	5192230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936128
137054	NC_014834	CGG	2	6	5192233	5192238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936128
137055	NC_014834	TGG	2	6	5192269	5192274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936128
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137064	NC_014834	GAT	2	6	5192480	5192485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137065	NC_014834	GCG	3	9	5192486	5192494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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137068	NC_014834	C	6	6	5192560	5192565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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137088	NC_014834	CG	3	6	5193166	5193171	0 %	0 %	50 %	50 %	316936129
137089	NC_014834	GC	4	8	5193173	5193180	0 %	0 %	50 %	50 %	316936129
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137094	NC_014834	GACCG	2	10	5193528	5193537	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137095	NC_014834	CG	3	6	5193576	5193581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137096	NC_014834	ACT	2	6	5193591	5193596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137097	NC_014834	CGT	2	6	5193608	5193613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137098	NC_014834	CGAT	2	8	5193634	5193641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137099	NC_014834	GACA	2	8	5193731	5193738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137100	NC_014834	TCG	3	9	5193762	5193770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137101	NC_014834	ACG	2	6	5193772	5193777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137102	NC_014834	GCTC	2	8	5193778	5193785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137103	NC_014834	CGC	2	6	5193794	5193799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137104	NC_014834	GAT	2	6	5193853	5193858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936130
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137107	NC_014834	GTCG	2	8	5194066	5194073	0 %	25 %	50 %	25 %	316936130
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137111	NC_014834	TCGC	2	8	5194196	5194203	0 %	25 %	25 %	50 %	316936130
137112	NC_014834	CTG	2	6	5194249	5194254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936130
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137115	NC_014834	GCT	2	6	5194417	5194422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936130
137116	NC_014834	GC	3	6	5194501	5194506	0 %	0 %	50 %	50 %	316936130
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137232	NC_014834	CAG	2	6	5198750	5198755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936133
137233	NC_014834	TGCGCA	2	12	5198788	5198799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316936133
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137334	NC_014834	GA	3	6	5203106	5203111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137335	NC_014834	GC	4	8	5203138	5203145	0 %	0 %	50 %	50 %	316936136
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137348	NC_014834	GGT	2	6	5203463	5203468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936136
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137404	NC_014834	CG	3	6	5205506	5205511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137405	NC_014834	TCG	2	6	5205567	5205572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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137444	NC_014834	CG	4	8	5206596	5206603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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137462	NC_014834	CGC	2	6	5207169	5207174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936138
137463	NC_014834	GGT	2	6	5207208	5207213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936138
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137479	NC_014834	TCA	2	6	5207618	5207623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936138
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137485	NC_014834	AGCG	2	8	5207775	5207782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137486	NC_014834	CAG	2	6	5207794	5207799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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137489	NC_014834	C	6	6	5207987	5207992	0 %	0 %	0 %	100 %	316936139
137490	NC_014834	CAG	2	6	5208031	5208036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137491	NC_014834	GTG	2	6	5208121	5208126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936139
137492	NC_014834	GCT	2	6	5208132	5208137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936139
137493	NC_014834	CGA	2	6	5208142	5208147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936139
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