MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
136001	NC_014834	GGT	2	6	5151283	5151288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936090
136002	NC_014834	GCA	2	6	5151363	5151368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936090
136003	NC_014834	CCT	2	6	5151483	5151488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936091
136004	NC_014834	CG	3	6	5151518	5151523	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136005	NC_014834	TCG	2	6	5151531	5151536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136006	NC_014834	GGC	2	6	5151545	5151550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936091
136007	NC_014834	GC	3	6	5151555	5151560	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136008	NC_014834	CGG	2	6	5151584	5151589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936091
136009	NC_014834	CGA	2	6	5151652	5151657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136010	NC_014834	ATCC	2	8	5151701	5151708	25 %	25 %	0 %	50 %	316936091
136011	NC_014834	CGA	2	6	5151730	5151735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136012	NC_014834	GCC	2	6	5151746	5151751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936091
136013	NC_014834	ACA	2	6	5151754	5151759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936091
136014	NC_014834	CTT	2	6	5151775	5151780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936091
136015	NC_014834	CG	3	6	5151799	5151804	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136016	NC_014834	TCG	2	6	5151813	5151818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136017	NC_014834	TGG	2	6	5151822	5151827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936091
136018	NC_014834	CTT	2	6	5151875	5151880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936091
136019	NC_014834	CGA	2	6	5151892	5151897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136020	NC_014834	CCT	2	6	5151910	5151915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936091
136021	NC_014834	GCC	2	6	5151921	5151926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936091
136022	NC_014834	ACC	2	6	5151927	5151932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936091
136023	NC_014834	CTT	2	6	5151968	5151973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936091
136024	NC_014834	CGC	2	6	5152004	5152009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936091
136025	NC_014834	CG	3	6	5152027	5152032	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136026	NC_014834	CG	3	6	5152048	5152053	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136027	NC_014834	CAG	2	6	5152085	5152090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136028	NC_014834	CG	3	6	5152092	5152097	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136029	NC_014834	GC	3	6	5152181	5152186	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136030	NC_014834	ATC	2	6	5152194	5152199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936091
136031	NC_014834	CAT	2	6	5152214	5152219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936091
136032	NC_014834	GGC	2	6	5152220	5152225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936091
136033	NC_014834	GC	3	6	5152259	5152264	0 %	0 %	50 %	50 %	316936091
136034	NC_014834	GACAG	2	10	5152276	5152285	40 %	0 %	40 %	20 %	316936091
136035	NC_014834	TCG	2	6	5152302	5152307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136036	NC_014834	AGC	2	6	5152308	5152313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136037	NC_014834	GAT	2	6	5152355	5152360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936091
136038	NC_014834	TCGCC	2	10	5152420	5152429	0 %	20 %	20 %	60 %	316936091
136039	NC_014834	TTG	2	6	5152437	5152442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936091
136040	NC_014834	TTC	2	6	5152449	5152454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936091
136041	NC_014834	CGA	2	6	5152459	5152464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136042	NC_014834	GAT	2	6	5152475	5152480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936091
136043	NC_014834	GCC	2	6	5152509	5152514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936091
136044	NC_014834	CGA	2	6	5152528	5152533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136045	NC_014834	TCG	2	6	5152536	5152541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136046	NC_014834	CAT	2	6	5152544	5152549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936091
136047	NC_014834	CGGG	2	8	5152582	5152589	0 %	0 %	75 %	25 %	316936091
136048	NC_014834	GAT	2	6	5152601	5152606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936091
136049	NC_014834	CGC	2	6	5152636	5152641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936091
136050	NC_014834	CGT	2	6	5152651	5152656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136051	NC_014834	GGT	2	6	5152670	5152675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936091
136052	NC_014834	CGA	2	6	5152703	5152708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136053	NC_014834	GAA	2	6	5152731	5152736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936091
136054	NC_014834	CGA	2	6	5152777	5152782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136055	NC_014834	ACC	2	6	5152820	5152825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936091
136056	NC_014834	C	6	6	5152833	5152838	0 %	0 %	0 %	100 %	316936091
136057	NC_014834	TGC	2	6	5152852	5152857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936091
136058	NC_014834	CTT	2	6	5152862	5152867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936091
136059	NC_014834	GGC	2	6	5152942	5152947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936091
136060	NC_014834	GCG	2	6	5152952	5152957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136061	NC_014834	GAT	2	6	5152996	5153001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936092
136062	NC_014834	TCG	2	6	5153051	5153056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136063	NC_014834	GGT	3	9	5153121	5153129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936092
136064	NC_014834	CAG	2	6	5153239	5153244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136065	NC_014834	CGA	2	6	5153302	5153307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136066	NC_014834	AGC	2	6	5153312	5153317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136067	NC_014834	TTG	2	6	5153342	5153347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936092
136068	NC_014834	CCG	2	6	5153378	5153383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936092
136069	NC_014834	CTT	2	6	5153443	5153448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936092
136070	NC_014834	GAG	2	6	5153465	5153470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316936092
136071	NC_014834	GCCG	2	8	5153490	5153497	0 %	0 %	50 %	50 %	316936092
136072	NC_014834	CGGT	2	8	5153561	5153568	0 %	25 %	50 %	25 %	316936092
136073	NC_014834	GGT	2	6	5153586	5153591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936092
136074	NC_014834	TCG	2	6	5153625	5153630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136075	NC_014834	TCG	2	6	5153667	5153672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936092
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136080	NC_014834	CGA	2	6	5153934	5153939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136081	NC_014834	CGA	2	6	5153979	5153984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136082	NC_014834	GACC	2	8	5154025	5154032	25 %	0 %	25 %	50 %	316936092
136083	NC_014834	TGA	2	6	5154051	5154056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936092
136084	NC_014834	GTC	2	6	5154067	5154072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136085	NC_014834	GGT	2	6	5154094	5154099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936092
136086	NC_014834	ATC	2	6	5154110	5154115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936092
136087	NC_014834	TGT	2	6	5154159	5154164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936092
136088	NC_014834	CCG	2	6	5154170	5154175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936092
136089	NC_014834	CGA	2	6	5154199	5154204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936092
136090	NC_014834	ATA	2	6	5154253	5154258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316936092
136091	NC_014834	TCT	2	6	5154297	5154302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936092
136092	NC_014834	CCG	2	6	5154312	5154317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936092
136093	NC_014834	TGA	2	6	5154357	5154362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936092
136094	NC_014834	CTTGGT	2	12	5154400	5154411	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	316936092
136095	NC_014834	CG	4	8	5154423	5154430	0 %	0 %	50 %	50 %	316936092
136096	NC_014834	TTC	2	6	5154461	5154466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936092
136097	NC_014834	TCT	2	6	5154528	5154533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936092
136098	NC_014834	TGG	2	6	5154549	5154554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936092
136099	NC_014834	CGG	2	6	5154589	5154594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136100	NC_014834	CGT	2	6	5154703	5154708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936093
136101	NC_014834	CGGAA	2	10	5154750	5154759	40 %	0 %	40 %	20 %	316936093
136102	NC_014834	TCT	2	6	5154766	5154771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936093
136103	NC_014834	TCT	2	6	5154820	5154825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936093
136104	NC_014834	CGA	2	6	5154826	5154831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936093
136105	NC_014834	CGT	3	9	5154856	5154864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936093
136106	NC_014834	GTG	2	6	5154894	5154899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936093
136107	NC_014834	GTC	2	6	5154908	5154913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936093
136108	NC_014834	GCC	2	6	5154995	5155000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936093
136109	NC_014834	CTT	2	6	5155016	5155021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936093
136110	NC_014834	CCTT	2	8	5155098	5155105	0 %	50 %	0 %	50 %	316936093
136111	NC_014834	GTC	2	6	5155112	5155117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936093
136112	NC_014834	GAA	2	6	5155166	5155171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936093
136113	NC_014834	CCAC	2	8	5155180	5155187	25 %	0 %	0 %	75 %	316936093
136114	NC_014834	TTC	2	6	5155334	5155339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936093
136115	NC_014834	CGC	2	6	5155366	5155371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936093
136116	NC_014834	TGT	2	6	5155375	5155380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936093
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136118	NC_014834	CGT	2	6	5155399	5155404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936093
136119	NC_014834	TTC	2	6	5155428	5155433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936093
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136123	NC_014834	GAT	2	6	5155532	5155537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936093
136124	NC_014834	CGT	2	6	5155546	5155551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936093
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136134	NC_014834	TGA	2	6	5156152	5156157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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136143	NC_014834	CTG	2	6	5156347	5156352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936094
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136170	NC_014834	CTT	2	6	5157108	5157113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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136174	NC_014834	CCGG	2	8	5157365	5157372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136175	NC_014834	CGT	2	6	5157418	5157423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136177	NC_014834	CG	4	8	5157525	5157532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136178	NC_014834	GCGAA	2	10	5157549	5157558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136179	NC_014834	GTT	2	6	5157606	5157611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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136181	NC_014834	GCG	2	6	5157642	5157647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136182	NC_014834	CGCA	2	8	5157679	5157686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136183	NC_014834	GCC	2	6	5157745	5157750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136184	NC_014834	CGA	2	6	5157819	5157824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936095
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136219	NC_014834	GCC	2	6	5159195	5159200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136220	NC_014834	GCG	2	6	5159201	5159206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136221	NC_014834	CGC	2	6	5159331	5159336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936098
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136223	NC_014834	CGT	2	6	5159379	5159384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936098
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136225	NC_014834	CCT	2	6	5159453	5159458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936099
136226	NC_014834	GCT	2	6	5159459	5159464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136227	NC_014834	ACG	2	6	5159496	5159501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136228	NC_014834	CGA	2	6	5159510	5159515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136229	NC_014834	CTG	2	6	5159556	5159561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136230	NC_014834	GAC	2	6	5159580	5159585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136231	NC_014834	TCG	2	6	5159593	5159598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136232	NC_014834	TTC	2	6	5159602	5159607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936099
136233	NC_014834	CGT	2	6	5159645	5159650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936099
136234	NC_014834	CGG	2	6	5159697	5159702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936099
136235	NC_014834	CGA	2	6	5159714	5159719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936099
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136237	NC_014834	GCTGCG	2	12	5159792	5159803	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316936100
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136239	NC_014834	AGC	2	6	5159838	5159843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936100
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136249	NC_014834	TCG	2	6	5160117	5160122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936100
136250	NC_014834	TCG	3	9	5160141	5160149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936100
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136254	NC_014834	GCA	2	6	5160268	5160273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936100
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136262	NC_014834	GTC	2	6	5160519	5160524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936100
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136265	NC_014834	CGG	2	6	5160563	5160568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936101
136266	NC_014834	GTCG	2	8	5160579	5160586	0 %	25 %	50 %	25 %	316936101
136267	NC_014834	TCGAGC	2	12	5160589	5160600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316936101
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136270	NC_014834	GCA	2	6	5160692	5160697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936101
136271	NC_014834	CGA	2	6	5160752	5160757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936101
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136282	NC_014834	ACC	2	6	5161338	5161343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936102
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136285	NC_014834	GCG	2	6	5161368	5161373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936102
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136287	NC_014834	TCG	2	6	5161502	5161507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936103
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136290	NC_014834	TCG	2	6	5161657	5161662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136291	NC_014834	CGC	2	6	5161708	5161713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936104
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136293	NC_014834	CGG	2	6	5161876	5161881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936104
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136299	NC_014834	GCT	2	6	5162119	5162124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936104
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136307	NC_014834	CG	4	8	5162521	5162528	0 %	0 %	50 %	50 %	316936104
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136309	NC_014834	CGG	2	6	5162595	5162600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936104
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136314	NC_014834	GACA	2	8	5162733	5162740	50 %	0 %	25 %	25 %	316936104
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136316	NC_014834	GC	3	6	5162879	5162884	0 %	0 %	50 %	50 %	316936104
136317	NC_014834	AGT	2	6	5162959	5162964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936104
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136321	NC_014834	GCC	2	6	5163122	5163127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936104
136322	NC_014834	TGC	3	9	5163130	5163138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936104
136323	NC_014834	GAC	2	6	5163144	5163149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936104
136324	NC_014834	TCG	2	6	5163168	5163173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936104
136325	NC_014834	GCA	2	6	5163211	5163216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936104
136326	NC_014834	CGC	2	6	5163245	5163250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136327	NC_014834	GGC	2	6	5163257	5163262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136328	NC_014834	GGTG	2	8	5163268	5163275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136329	NC_014834	TGC	2	6	5163280	5163285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136330	NC_014834	GCG	2	6	5163322	5163327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136331	NC_014834	TGC	2	6	5163602	5163607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136332	NC_014834	T	6	6	5163663	5163668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136333	NC_014834	GACA	2	8	5163789	5163796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136334	NC_014834	CG	3	6	5163799	5163804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136335	NC_014834	GAG	2	6	5163810	5163815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136336	NC_014834	CG	3	6	5163819	5163824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136337	NC_014834	GAT	2	6	5163832	5163837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136338	NC_014834	CG	3	6	5163847	5163852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136339	NC_014834	TGT	2	6	5163873	5163878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316936106
136340	NC_014834	CTT	2	6	5163880	5163885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936106
136341	NC_014834	GCG	2	6	5163906	5163911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936106
136342	NC_014834	GCGG	2	8	5163925	5163932	0 %	0 %	75 %	25 %	316936106
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