MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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134731	NC_014834	GCCGA	2	10	5102637	5102646	20 %	0 %	40 %	40 %	316936045
134732	NC_014834	CCT	2	6	5102660	5102665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936045
134733	NC_014834	CCG	2	6	5102771	5102776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936046
134734	NC_014834	GCC	2	6	5102784	5102789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936046
134735	NC_014834	GGCG	2	8	5102796	5102803	0 %	0 %	75 %	25 %	316936046
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134737	NC_014834	TCA	2	6	5102816	5102821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936046
134738	NC_014834	TGC	2	6	5102847	5102852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936046
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134742	NC_014834	GCC	2	6	5103014	5103019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936046
134743	NC_014834	GTC	2	6	5103109	5103114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936046
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134753	NC_014834	GCG	2	6	5103591	5103596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936046
134754	NC_014834	CCG	2	6	5103630	5103635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936046
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134757	NC_014834	GCT	2	6	5103705	5103710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936046
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134760	NC_014834	CGT	2	6	5103786	5103791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936046
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134765	NC_014834	TCGGT	2	10	5103882	5103891	0 %	40 %	40 %	20 %	316936046
134766	NC_014834	CGT	2	6	5103897	5103902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936046
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134797	NC_014834	GATC	2	8	5104907	5104914	25 %	25 %	25 %	25 %	316936047
134798	NC_014834	CG	3	6	5104928	5104933	0 %	0 %	50 %	50 %	316936047
134799	NC_014834	CGC	2	6	5104991	5104996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936047
134800	NC_014834	TGG	2	6	5105003	5105008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936047
134801	NC_014834	CTT	2	6	5105031	5105036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936047
134802	NC_014834	TTC	2	6	5105044	5105049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936047
134803	NC_014834	GTGACG	2	12	5105065	5105076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316936047
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134809	NC_014834	CG	3	6	5105452	5105457	0 %	0 %	50 %	50 %	316936048
134810	NC_014834	GGC	2	6	5105475	5105480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936048
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134813	NC_014834	GCG	2	6	5105575	5105580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936048
134814	NC_014834	TTC	2	6	5105623	5105628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936048
134815	NC_014834	GCC	2	6	5105641	5105646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936048
134816	NC_014834	GCAG	2	8	5105741	5105748	25 %	0 %	50 %	25 %	316936048
134817	NC_014834	CCG	2	6	5105749	5105754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316936048
134818	NC_014834	CCATCG	2	12	5105813	5105824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316936048
134819	NC_014834	CCA	2	6	5105846	5105851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936048
134820	NC_014834	TCC	2	6	5105866	5105871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936048
134821	NC_014834	GCA	2	6	5105894	5105899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936048
134822	NC_014834	CAC	2	6	5105979	5105984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316936048
134823	NC_014834	GCG	2	6	5106011	5106016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936048
134824	NC_014834	CG	5	10	5106081	5106090	0 %	0 %	50 %	50 %	316936048
134825	NC_014834	CGA	2	6	5106125	5106130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936048
134826	NC_014834	CTT	2	6	5106138	5106143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936048
134827	NC_014834	TCA	2	6	5106185	5106190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134828	NC_014834	GCC	2	6	5106213	5106218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134829	NC_014834	CAA	2	6	5106247	5106252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316936049
134830	NC_014834	CGGG	2	8	5106284	5106291	0 %	0 %	75 %	25 %	316936049
134831	NC_014834	GTC	2	6	5106373	5106378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936049
134832	NC_014834	GTC	2	6	5106451	5106456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936049
134833	NC_014834	TTC	2	6	5106500	5106505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316936049
134834	NC_014834	TCG	2	6	5106512	5106517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936049
134835	NC_014834	GCT	2	6	5106540	5106545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936049
134836	NC_014834	GAA	2	6	5106565	5106570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316936049
134837	NC_014834	TGC	2	6	5106602	5106607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936049
134838	NC_014834	CCT	2	6	5106720	5106725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316936049
134839	NC_014834	GTA	2	6	5106727	5106732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316936049
134840	NC_014834	GGT	2	6	5106778	5106783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316936049
134841	NC_014834	TGC	2	6	5106800	5106805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316936049
134842	NC_014834	CGG	2	6	5106897	5106902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936049
134843	NC_014834	CAG	2	6	5106922	5106927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936049
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134985	NC_014834	GAC	2	6	5111812	5111817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936052
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134987	NC_014834	AGC	2	6	5111951	5111956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936052
134988	NC_014834	GCA	2	6	5111979	5111984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936052
134989	NC_014834	CG	3	6	5112015	5112020	0 %	0 %	50 %	50 %	316936052
134990	NC_014834	CCGGCA	2	12	5112045	5112056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316936052
134991	NC_014834	CAG	2	6	5112116	5112121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134992	NC_014834	GTT	2	6	5112127	5112132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134993	NC_014834	GGC	2	6	5112200	5112205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936053
134994	NC_014834	CGG	2	6	5112206	5112211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316936053
134995	NC_014834	CGA	2	6	5112230	5112235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936053
134996	NC_014834	ATCCG	2	10	5112337	5112346	20 %	20 %	20 %	40 %	316936053
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134998	NC_014834	TCA	2	6	5112374	5112379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936053
134999	NC_014834	ATC	2	6	5112385	5112390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316936053
135000	NC_014834	ACG	2	6	5112478	5112483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316936053

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