MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_014834	CCA	2	6	5039852	5039857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133002	NC_014834	CAT	2	6	5039897	5039902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133003	NC_014834	GCC	2	6	5039999	5040004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133004	NC_014834	GGC	2	6	5040068	5040073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935985
133005	NC_014834	CCG	2	6	5040085	5040090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133006	NC_014834	CCG	2	6	5040102	5040107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133007	NC_014834	GAC	2	6	5040164	5040169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935985
133008	NC_014834	GCG	2	6	5040225	5040230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935985
133009	NC_014834	TCG	2	6	5040234	5040239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935985
133010	NC_014834	GCC	2	6	5040278	5040283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133011	NC_014834	GGCGG	2	10	5040296	5040305	0 %	0 %	80 %	20 %	316935985
133012	NC_014834	CGC	2	6	5040325	5040330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133013	NC_014834	CAC	2	6	5040335	5040340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935985
133014	NC_014834	GGC	2	6	5040344	5040349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935985
133015	NC_014834	TCT	2	6	5040370	5040375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935985
133016	NC_014834	CGC	2	6	5040406	5040411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133017	NC_014834	GC	3	6	5040448	5040453	0 %	0 %	50 %	50 %	316935985
133018	NC_014834	CTT	2	6	5040461	5040466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935985
133019	NC_014834	TGG	2	6	5040478	5040483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935985
133020	NC_014834	CA	3	6	5040595	5040600	50 %	0 %	0 %	50 %	316935985
133021	NC_014834	ACC	2	6	5040609	5040614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935985
133022	NC_014834	CCG	2	6	5040644	5040649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133023	NC_014834	CGC	2	6	5040662	5040667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133024	NC_014834	GGC	3	9	5040671	5040679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935985
133025	NC_014834	CTC	2	6	5040716	5040721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935985
133026	NC_014834	GCC	2	6	5040737	5040742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133027	NC_014834	CACCGC	2	12	5040755	5040766	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	316935985
133028	NC_014834	GC	3	6	5040786	5040791	0 %	0 %	50 %	50 %	316935985
133029	NC_014834	AGT	2	6	5040793	5040798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935985
133030	NC_014834	CGT	2	6	5040826	5040831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935985
133031	NC_014834	CGAG	2	8	5040832	5040839	25 %	0 %	50 %	25 %	316935985
133032	NC_014834	CCGC	2	8	5040901	5040908	0 %	0 %	25 %	75 %	316935985
133033	NC_014834	CTG	2	6	5040917	5040922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935985
133034	NC_014834	CGG	2	6	5040971	5040976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935985
133035	NC_014834	GCG	2	6	5040995	5041000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935985
133036	NC_014834	CAG	2	6	5041019	5041024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935985
133037	NC_014834	GC	4	8	5041038	5041045	0 %	0 %	50 %	50 %	316935985
133038	NC_014834	CCGT	2	8	5041053	5041060	0 %	25 %	25 %	50 %	316935985
133039	NC_014834	CTG	2	6	5041069	5041074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935985
133040	NC_014834	TGA	2	6	5041075	5041080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935985
133041	NC_014834	CCG	2	6	5041094	5041099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935985
133042	NC_014834	GCGCC	2	10	5041102	5041111	0 %	0 %	40 %	60 %	316935985
133043	NC_014834	TCG	2	6	5041132	5041137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133044	NC_014834	GCCCG	2	10	5041160	5041169	0 %	0 %	40 %	60 %	316935986
133045	NC_014834	GCG	2	6	5041239	5041244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935986
133046	NC_014834	CG	3	6	5041243	5041248	0 %	0 %	50 %	50 %	316935986
133047	NC_014834	GCA	2	6	5041280	5041285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935986
133048	NC_014834	TGC	2	6	5041366	5041371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935986
133049	NC_014834	TCC	2	6	5041407	5041412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935986
133050	NC_014834	CG	3	6	5041516	5041521	0 %	0 %	50 %	50 %	316935986
133051	NC_014834	CGG	2	6	5041534	5041539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935986
133052	NC_014834	CGA	2	6	5041612	5041617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935986
133053	NC_014834	GCG	2	6	5041708	5041713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133054	NC_014834	GCC	2	6	5041719	5041724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133055	NC_014834	CGG	2	6	5041740	5041745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133056	NC_014834	CCG	2	6	5041752	5041757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133057	NC_014834	GAT	2	6	5041775	5041780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935987
133058	NC_014834	CGC	2	6	5041785	5041790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935987
133059	NC_014834	CCG	2	6	5041798	5041803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935987
133060	NC_014834	GGTCGC	2	12	5041823	5041834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316935987
133061	NC_014834	CGC	2	6	5041862	5041867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935987
133062	NC_014834	AGG	2	6	5041882	5041887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316935987
133063	NC_014834	GCC	2	6	5041896	5041901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935987
133064	NC_014834	CGC	2	6	5041952	5041957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935987
133065	NC_014834	CAG	2	6	5042013	5042018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935987
133066	NC_014834	AAG	2	6	5042034	5042039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935987
133067	NC_014834	GGC	3	9	5042099	5042107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935987
133068	NC_014834	GAC	2	6	5042139	5042144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935987
133069	NC_014834	ACC	2	6	5042211	5042216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935987
133070	NC_014834	AGC	2	6	5042218	5042223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935987
133071	NC_014834	GGCC	2	8	5042243	5042250	0 %	0 %	50 %	50 %	316935987
133072	NC_014834	GCCT	2	8	5042271	5042278	0 %	25 %	25 %	50 %	316935987
133073	NC_014834	GCT	2	6	5042291	5042296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935987
133074	NC_014834	CGC	2	6	5042306	5042311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935987
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133079	NC_014834	GCT	2	6	5042429	5042434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935987
133080	NC_014834	GAA	2	6	5042438	5042443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935987
133081	NC_014834	CT	3	6	5042461	5042466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133082	NC_014834	CAG	2	6	5042476	5042481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133083	NC_014834	GC	3	6	5042483	5042488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133084	NC_014834	CCA	2	6	5042496	5042501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133085	NC_014834	GC	3	6	5042560	5042565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133086	NC_014834	CGC	2	6	5042592	5042597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133087	NC_014834	CGC	2	6	5042694	5042699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133088	NC_014834	GGGGCG	2	12	5042755	5042766	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
133089	NC_014834	CGC	2	6	5042767	5042772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133090	NC_014834	TGG	2	6	5042785	5042790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133091	NC_014834	GC	3	6	5042833	5042838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133092	NC_014834	GCG	2	6	5042845	5042850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133093	NC_014834	TTC	2	6	5042871	5042876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133094	NC_014834	CGT	2	6	5042907	5042912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133095	NC_014834	CCGTC	2	10	5042914	5042923	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133096	NC_014834	GTA	2	6	5042948	5042953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133097	NC_014834	GCG	2	6	5042954	5042959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133098	NC_014834	TTTGC	2	10	5042969	5042978	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133099	NC_014834	CGC	2	6	5043053	5043058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133100	NC_014834	CCGG	2	8	5043104	5043111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133101	NC_014834	GAT	2	6	5043122	5043127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133102	NC_014834	CTC	2	6	5043159	5043164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133103	NC_014834	GAC	2	6	5043173	5043178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133104	NC_014834	AAG	2	6	5043209	5043214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133105	NC_014834	TGC	2	6	5043227	5043232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133106	NC_014834	C	8	8	5043232	5043239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133107	NC_014834	ACA	2	6	5043290	5043295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133108	NC_014834	TGT	2	6	5043300	5043305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133109	NC_014834	TCAA	2	8	5043326	5043333	50 %	25 %	0 %	25 %	316935988
133110	NC_014834	AGC	2	6	5043377	5043382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935988
133111	NC_014834	CGA	2	6	5043442	5043447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935988
133112	NC_014834	AGG	3	9	5043458	5043466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316935988
133113	NC_014834	GGC	2	6	5043470	5043475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935988
133114	NC_014834	AAAC	2	8	5043542	5043549	75 %	0 %	0 %	25 %	316935988
133115	NC_014834	ATT	2	6	5043568	5043573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316935988
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133117	NC_014834	TCT	2	6	5043615	5043620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935988
133118	NC_014834	AGC	2	6	5043632	5043637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935988
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133234	NC_014834	GCC	3	9	5048534	5048542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935990
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133315	NC_014834	G	6	6	5051223	5051228	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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133340	NC_014834	GCG	3	9	5052015	5052023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935993
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133343	NC_014834	GCT	2	6	5052070	5052075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935993
133344	NC_014834	GGT	2	6	5052082	5052087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935993
133345	NC_014834	GTCGCG	2	12	5052100	5052111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316935993
133346	NC_014834	CGATG	2	10	5052157	5052166	20 %	20 %	40 %	20 %	316935993
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133460	NC_014834	CGC	2	6	5056492	5056497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935997
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