MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131001	NC_014834	CTTC	2	8	4964106	4964113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131002	NC_014834	TCG	2	6	4964138	4964143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131003	NC_014834	TTC	2	6	4964150	4964155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131004	NC_014834	CGT	2	6	4964163	4964168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131005	NC_014834	GCC	2	6	4964186	4964191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131006	NC_014834	CGC	2	6	4964203	4964208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131007	NC_014834	TCA	2	6	4964235	4964240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131008	NC_014834	TCGT	2	8	4964277	4964284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131009	NC_014834	TCC	2	6	4964286	4964291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131010	NC_014834	CAG	2	6	4964389	4964394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935922
131011	NC_014834	CTT	2	6	4964424	4964429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935922
131012	NC_014834	ATCGG	2	10	4964450	4964459	20 %	20 %	40 %	20 %	316935922
131013	NC_014834	AAAC	2	8	4964511	4964518	75 %	0 %	0 %	25 %	316935922
131014	NC_014834	CGC	2	6	4964526	4964531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935922
131015	NC_014834	CGT	2	6	4964533	4964538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935922
131016	NC_014834	GAA	2	6	4964626	4964631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935922
131017	NC_014834	CAT	2	6	4964674	4964679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935922
131018	NC_014834	CG	4	8	4964710	4964717	0 %	0 %	50 %	50 %	316935923
131019	NC_014834	GC	3	6	4964746	4964751	0 %	0 %	50 %	50 %	316935923
131020	NC_014834	ATG	2	6	4964757	4964762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935923
131021	NC_014834	CGG	3	9	4964773	4964781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935923
131022	NC_014834	GCCG	2	8	4964801	4964808	0 %	0 %	50 %	50 %	316935923
131023	NC_014834	TCA	2	6	4964824	4964829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935923
131024	NC_014834	AGC	3	9	4964874	4964882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935923
131025	NC_014834	AGA	2	6	4964905	4964910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935923
131026	NC_014834	CGC	2	6	4964912	4964917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935923
131027	NC_014834	GAA	2	6	4964960	4964965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935923
131028	NC_014834	TCG	2	6	4965000	4965005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935923
131029	NC_014834	GCGCCA	2	12	4965076	4965087	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316935923
131030	NC_014834	GAA	2	6	4965131	4965136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935923
131031	NC_014834	CGGC	2	8	4965154	4965161	0 %	0 %	50 %	50 %	316935923
131032	NC_014834	CAG	2	6	4965176	4965181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935923
131033	NC_014834	AGA	2	6	4965184	4965189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935923
131034	NC_014834	CGC	2	6	4965233	4965238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935923
131035	NC_014834	TGA	2	6	4965271	4965276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935923
131036	NC_014834	CAG	2	6	4965446	4965451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935923
131037	NC_014834	GCG	2	6	4965470	4965475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935923
131038	NC_014834	CGGC	2	8	4965507	4965514	0 %	0 %	50 %	50 %	316935924
131039	NC_014834	CGT	2	6	4965515	4965520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131040	NC_014834	TCA	2	6	4965537	4965542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935924
131041	NC_014834	GAT	4	12	4965565	4965576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935924
131042	NC_014834	TCGA	2	8	4965647	4965654	25 %	25 %	25 %	25 %	316935924
131043	NC_014834	GGT	2	6	4965661	4965666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935924
131044	NC_014834	CGC	2	6	4965681	4965686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935924
131045	NC_014834	GAC	2	6	4965691	4965696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131046	NC_014834	GCA	3	9	4965735	4965743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131047	NC_014834	CAG	2	6	4965751	4965756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131048	NC_014834	GCC	2	6	4965824	4965829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935924
131049	NC_014834	ATA	2	6	4965832	4965837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316935924
131050	NC_014834	CCA	2	6	4965879	4965884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935924
131051	NC_014834	CAC	3	9	4965910	4965918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935924
131052	NC_014834	GTAATT	2	12	4965949	4965960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	316935924
131053	NC_014834	GGC	2	6	4966005	4966010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935924
131054	NC_014834	CAGA	2	8	4966075	4966082	50 %	0 %	25 %	25 %	316935924
131055	NC_014834	CCA	2	6	4966119	4966124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935924
131056	NC_014834	GAA	2	6	4966192	4966197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935924
131057	NC_014834	GCC	2	6	4966201	4966206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935924
131058	NC_014834	GAC	2	6	4966214	4966219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131059	NC_014834	AGC	2	6	4966226	4966231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131060	NC_014834	AGA	2	6	4966257	4966262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935924
131061	NC_014834	GTT	2	6	4966267	4966272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316935924
131062	NC_014834	CAC	2	6	4966300	4966305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935924
131063	NC_014834	TCA	2	6	4966308	4966313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935924
131064	NC_014834	GCA	2	6	4966353	4966358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131065	NC_014834	GAC	2	6	4966381	4966386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935924
131066	NC_014834	CGA	2	6	4966424	4966429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131067	NC_014834	TCG	2	6	4966483	4966488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131068	NC_014834	CG	4	8	4966514	4966521	0 %	0 %	50 %	50 %	316935925
131069	NC_014834	TCG	2	6	4966573	4966578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131070	NC_014834	GACG	2	8	4966640	4966647	25 %	0 %	50 %	25 %	316935925
131071	NC_014834	CGATCT	2	12	4966649	4966660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316935925
131072	NC_014834	G	6	6	4966665	4966670	0 %	0 %	100 %	0 %	316935925
131073	NC_014834	GC	3	6	4966686	4966691	0 %	0 %	50 %	50 %	316935925
131074	NC_014834	CGGC	2	8	4966739	4966746	0 %	0 %	50 %	50 %	316935925
131075	NC_014834	ACG	2	6	4966747	4966752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131076	NC_014834	CGA	2	6	4966781	4966786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131077	NC_014834	GGGCG	2	10	4966793	4966802	0 %	0 %	80 %	20 %	316935925
131078	NC_014834	TTC	2	6	4966812	4966817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935925
131079	NC_014834	CAC	2	6	4966833	4966838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935925
131080	NC_014834	CGT	2	6	4966844	4966849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131081	NC_014834	CAC	2	6	4966854	4966859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935925
131082	NC_014834	ATC	2	6	4966909	4966914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935925
131083	NC_014834	CG	3	6	4966926	4966931	0 %	0 %	50 %	50 %	316935925
131084	NC_014834	GATC	2	8	4966976	4966983	25 %	25 %	25 %	25 %	316935925
131085	NC_014834	TCG	2	6	4966996	4967001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131086	NC_014834	CGT	2	6	4967018	4967023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131087	NC_014834	CGAG	2	8	4967042	4967049	25 %	0 %	50 %	25 %	316935925
131088	NC_014834	TCT	2	6	4967051	4967056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935925
131089	NC_014834	CGG	2	6	4967066	4967071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935925
131090	NC_014834	CGC	2	6	4967162	4967167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935925
131091	NC_014834	TTC	2	6	4967170	4967175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935925
131092	NC_014834	CG	3	6	4967303	4967308	0 %	0 %	50 %	50 %	316935925
131093	NC_014834	GAT	2	6	4967328	4967333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935925
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131095	NC_014834	AGC	2	6	4967371	4967376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131096	NC_014834	GCC	2	6	4967385	4967390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935925
131097	NC_014834	GCC	2	6	4967393	4967398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935925
131098	NC_014834	GCG	2	6	4967432	4967437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935925
131099	NC_014834	GTC	2	6	4967442	4967447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131100	NC_014834	CGA	2	6	4967474	4967479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935925
131101	NC_014834	GC	3	6	4967487	4967492	0 %	0 %	50 %	50 %	316935925
131102	NC_014834	CGGCG	2	10	4967520	4967529	0 %	0 %	60 %	40 %	316935926
131103	NC_014834	CGAACA	2	12	4967549	4967560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	316935926
131104	NC_014834	GCA	2	6	4967621	4967626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935926
131105	NC_014834	GTC	2	6	4967640	4967645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935926
131106	NC_014834	TGA	2	6	4967749	4967754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935926
131107	NC_014834	CGC	2	6	4967822	4967827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935926
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131109	NC_014834	CGA	2	6	4967864	4967869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935926
131110	NC_014834	GCG	2	6	4967876	4967881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935926
131111	NC_014834	CCG	2	6	4967986	4967991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935926
131112	NC_014834	AGC	3	9	4967992	4968000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935926
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131114	NC_014834	TCG	2	6	4968115	4968120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935926
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131205	NC_014834	GAG	2	6	4971217	4971222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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131339	NC_014834	CG	4	8	4976030	4976037	0 %	0 %	50 %	50 %	316935932
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