MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130001	NC_014834	GCGA	2	8	4926355	4926362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130002	NC_014834	GCG	2	6	4926423	4926428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130003	NC_014834	GGC	2	6	4926505	4926510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935889
130004	NC_014834	TCC	2	6	4926570	4926575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935889
130005	NC_014834	GCCCG	2	10	4926589	4926598	0 %	0 %	40 %	60 %	316935889
130006	NC_014834	TGG	2	6	4926619	4926624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935889
130007	NC_014834	GGC	2	6	4926640	4926645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935889
130008	NC_014834	CCG	2	6	4926705	4926710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935889
130009	NC_014834	AGC	2	6	4926726	4926731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130010	NC_014834	CACCGC	2	12	4926746	4926757	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	316935889
130011	NC_014834	CTC	2	6	4926800	4926805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935889
130012	NC_014834	CG	3	6	4926810	4926815	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130013	NC_014834	CGA	2	6	4926847	4926852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130014	NC_014834	CAG	2	6	4926863	4926868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130015	NC_014834	GATC	2	8	4926946	4926953	25 %	25 %	25 %	25 %	316935889
130016	NC_014834	TGCG	2	8	4927002	4927009	0 %	25 %	50 %	25 %	316935889
130017	NC_014834	GCA	2	6	4927011	4927016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130018	NC_014834	CGC	2	6	4927091	4927096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935889
130019	NC_014834	ACG	2	6	4927114	4927119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130020	NC_014834	GCC	2	6	4927130	4927135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935889
130021	NC_014834	CG	3	6	4927154	4927159	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130022	NC_014834	CGG	2	6	4927175	4927180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935889
130023	NC_014834	GCT	2	6	4927211	4927216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130024	NC_014834	CG	3	6	4927246	4927251	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130025	NC_014834	CCTT	2	8	4927257	4927264	0 %	50 %	0 %	50 %	316935889
130026	NC_014834	GC	3	6	4927282	4927287	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130027	NC_014834	AAC	2	6	4927371	4927376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316935889
130028	NC_014834	CCA	2	6	4927378	4927383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935889
130029	NC_014834	CG	3	6	4927396	4927401	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130030	NC_014834	AGT	2	6	4927405	4927410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935889
130031	NC_014834	GGC	2	6	4927418	4927423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935889
130032	NC_014834	GC	3	6	4927422	4927427	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130033	NC_014834	GGC	2	6	4927459	4927464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935889
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130035	NC_014834	GC	3	6	4927624	4927629	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130036	NC_014834	GC	4	8	4927657	4927664	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130037	NC_014834	GCC	2	6	4927711	4927716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935889
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130039	NC_014834	GCCTCG	2	12	4927734	4927745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316935889
130040	NC_014834	CGGC	2	8	4927831	4927838	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130041	NC_014834	GTG	2	6	4927905	4927910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935889
130042	NC_014834	CGC	2	6	4927951	4927956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935889
130043	NC_014834	TCG	3	9	4927989	4927997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935889
130044	NC_014834	CGCGAG	2	12	4928024	4928035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316935889
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130047	NC_014834	ATCG	2	8	4928129	4928136	25 %	25 %	25 %	25 %	316935889
130048	NC_014834	CAC	2	6	4928156	4928161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935889
130049	NC_014834	GCCG	2	8	4928166	4928173	0 %	0 %	50 %	50 %	316935889
130050	NC_014834	CCA	2	6	4928176	4928181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935889
130051	NC_014834	GCG	2	6	4928237	4928242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130052	NC_014834	AGG	2	6	4928278	4928283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130053	NC_014834	TCCCC	2	10	4928307	4928316	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
130054	NC_014834	G	6	6	4928357	4928362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130055	NC_014834	CGGC	2	8	4928408	4928415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130056	NC_014834	GGGGA	2	10	4928431	4928440	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
130057	NC_014834	TCG	2	6	4928453	4928458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935890
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130062	NC_014834	CTT	2	6	4928521	4928526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935890
130063	NC_014834	CGAGC	2	10	4928527	4928536	20 %	0 %	40 %	40 %	316935890
130064	NC_014834	GGCGC	2	10	4928548	4928557	0 %	0 %	60 %	40 %	316935890
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130067	NC_014834	TTG	2	6	4928618	4928623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316935890
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130071	NC_014834	GCC	2	6	4928759	4928764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935890
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130081	NC_014834	CCCG	2	8	4929074	4929081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130082	NC_014834	CG	4	8	4929104	4929111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130083	NC_014834	CGG	3	9	4929208	4929216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935891
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130114	NC_014834	GCA	2	6	4930179	4930184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935891
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130116	NC_014834	AAT	2	6	4930236	4930241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316935891
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130118	NC_014834	TCG	2	6	4930325	4930330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935891
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130173	NC_014834	ATG	2	6	4932181	4932186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935893
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130222	NC_014834	CGC	2	6	4933542	4933547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130223	NC_014834	CG	3	6	4933588	4933593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130224	NC_014834	GC	3	6	4933601	4933606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130225	NC_014834	GC	4	8	4933628	4933635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130226	NC_014834	CGC	2	6	4933638	4933643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130227	NC_014834	G	6	6	4933697	4933702	0 %	0 %	100 %	0 %	316935895
130228	NC_014834	ACC	2	6	4933786	4933791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935895
130229	NC_014834	CGGC	2	8	4933829	4933836	0 %	0 %	50 %	50 %	316935895
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130461	NC_014834	CGG	2	6	4942979	4942984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935903
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130488	NC_014834	ACG	2	6	4944157	4944162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935903
130489	NC_014834	ACG	2	6	4944183	4944188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935903
130490	NC_014834	CTG	2	6	4944201	4944206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935903
130491	NC_014834	GC	4	8	4944253	4944260	0 %	0 %	50 %	50 %	316935903
130492	NC_014834	TCG	2	6	4944277	4944282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935903
130493	NC_014834	CAA	2	6	4944284	4944289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316935903
130494	NC_014834	CTG	2	6	4944291	4944296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935903
130495	NC_014834	CCT	2	6	4944319	4944324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935903
130496	NC_014834	AGCG	2	8	4944421	4944428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130497	NC_014834	GTT	2	6	4944445	4944450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130498	NC_014834	GCT	2	6	4944473	4944478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130499	NC_014834	CAG	2	6	4944589	4944594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935904
130500	NC_014834	TCT	2	6	4944642	4944647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935904

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