MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014834	GCC	2	6	474219	474224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931831
12502	NC_014834	GGCCGG	2	12	474267	474278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931831
12503	NC_014834	CCG	2	6	474365	474370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931831
12504	NC_014834	GCG	2	6	474391	474396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931831
12505	NC_014834	CGG	2	6	474451	474456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931831
12506	NC_014834	CGG	2	6	474463	474468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931831
12507	NC_014834	GGC	2	6	474530	474535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_014834	TC	3	6	474571	474576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_014834	CAAAA	2	10	474594	474603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12510	NC_014834	CAG	2	6	474683	474688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12511	NC_014834	TGA	2	6	474700	474705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931832
12512	NC_014834	ACAGCG	2	12	474715	474726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12513	NC_014834	GGC	2	6	474737	474742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931832
12514	NC_014834	TTC	2	6	474792	474797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931832
12515	NC_014834	ACC	2	6	474846	474851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931832
12516	NC_014834	GCA	2	6	474865	474870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12517	NC_014834	CGA	2	6	474872	474877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12518	NC_014834	CGA	2	6	474880	474885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12519	NC_014834	ACG	2	6	474909	474914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12520	NC_014834	TGG	2	6	474964	474969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931832
12521	NC_014834	CGC	3	9	474998	475006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931832
12522	NC_014834	TGA	2	6	475009	475014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931832
12523	NC_014834	CGA	2	6	475058	475063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12524	NC_014834	CAGAA	2	10	475095	475104	60 %	0 %	20 %	20 %	316931832
12525	NC_014834	GAAA	2	8	475139	475146	75 %	0 %	25 %	0 %	316931832
12526	NC_014834	GCG	2	6	475248	475253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931832
12527	NC_014834	GCA	2	6	475348	475353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931832
12528	NC_014834	GC	3	6	475359	475364	0 %	0 %	50 %	50 %	316931832
12529	NC_014834	CGG	2	6	475399	475404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931832
12530	NC_014834	CGCTC	2	10	475666	475675	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12531	NC_014834	GCC	2	6	475738	475743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12532	NC_014834	GC	3	6	475759	475764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12533	NC_014834	GCCGC	2	10	475778	475787	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12534	NC_014834	CAG	2	6	475837	475842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12535	NC_014834	GAC	2	6	475870	475875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12536	NC_014834	GCC	3	9	475880	475888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12537	NC_014834	ACC	2	6	475889	475894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931833
12538	NC_014834	CGG	2	6	475896	475901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
12539	NC_014834	TCA	2	6	475932	475937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931833
12540	NC_014834	GCC	2	6	475961	475966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12541	NC_014834	CGT	2	6	476079	476084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12542	NC_014834	CGG	2	6	476103	476108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
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12544	NC_014834	CGCCAG	2	12	476170	476181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931833
12545	NC_014834	CAGCG	2	10	476269	476278	20 %	0 %	40 %	40 %	316931833
12546	NC_014834	GCG	2	6	476286	476291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
12547	NC_014834	GCG	2	6	476328	476333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
12548	NC_014834	CGC	2	6	476334	476339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12549	NC_014834	TGC	2	6	476397	476402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12550	NC_014834	GCG	2	6	476511	476516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
12551	NC_014834	GCC	2	6	476518	476523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
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12554	NC_014834	GCCG	2	8	476563	476570	0 %	0 %	50 %	50 %	316931833
12555	NC_014834	GCA	2	6	476607	476612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12556	NC_014834	GCC	2	6	476627	476632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12557	NC_014834	CTC	2	6	476641	476646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931833
12558	NC_014834	CGC	2	6	476655	476660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12559	NC_014834	GC	3	6	476659	476664	0 %	0 %	50 %	50 %	316931833
12560	NC_014834	CGA	2	6	476667	476672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
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12562	NC_014834	GAA	2	6	476773	476778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931833
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12564	NC_014834	GCC	2	6	476817	476822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12565	NC_014834	ACA	2	6	476880	476885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931833
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12567	NC_014834	GCA	2	6	476937	476942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12568	NC_014834	GCC	2	6	476964	476969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12569	NC_014834	GCG	3	9	476987	476995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
12570	NC_014834	CGC	2	6	476997	477002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931833
12571	NC_014834	GCA	2	6	477003	477008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12572	NC_014834	ACC	2	6	477035	477040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931833
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12574	NC_014834	CAG	2	6	477085	477090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
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12585	NC_014834	GCG	2	6	477521	477526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
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12587	NC_014834	GCG	2	6	477579	477584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
12588	NC_014834	TGC	2	6	477591	477596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931833
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12590	NC_014834	GTC	2	6	477640	477645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931833
12591	NC_014834	GTC	2	6	477667	477672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931833
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12594	NC_014834	CAG	2	6	477766	477771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931833
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12599	NC_014834	AGCGGC	2	12	477953	477964	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931833
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12605	NC_014834	GGC	2	6	478120	478125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
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12608	NC_014834	GGC	2	6	478204	478209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931833
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12611	NC_014834	CG	4	8	478382	478389	0 %	0 %	50 %	50 %	316931834
12612	NC_014834	GCG	3	9	478391	478399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931834
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12619	NC_014834	CGC	2	6	478638	478643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931834
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12974	NC_014834	TCG	2	6	492398	492403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931846
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12976	NC_014834	GCT	2	6	492534	492539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931846
12977	NC_014834	GCC	2	6	492580	492585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931846
12978	NC_014834	CCAAGC	2	12	492629	492640	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	316931846
12979	NC_014834	TGC	2	6	492641	492646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931846
12980	NC_014834	CGC	2	6	492660	492665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931846
12981	NC_014834	GC	3	6	492690	492695	0 %	0 %	50 %	50 %	316931846
12982	NC_014834	TCG	2	6	492710	492715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931846
12983	NC_014834	GCT	2	6	492753	492758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931846
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12986	NC_014834	TCCG	2	8	492841	492848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12987	NC_014834	CGG	2	6	492855	492860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12988	NC_014834	GGC	2	6	492893	492898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12989	NC_014834	GC	3	6	492897	492902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12990	NC_014834	CAGG	2	8	492925	492932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12991	NC_014834	CGG	2	6	492940	492945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12992	NC_014834	GGC	3	9	492968	492976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931847
12993	NC_014834	GCT	2	6	493002	493007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931847
12994	NC_014834	CCG	2	6	493034	493039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931847
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12996	NC_014834	GCT	2	6	493131	493136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931847
12997	NC_014834	TGG	2	6	493142	493147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931847
12998	NC_014834	CGT	2	6	493164	493169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931847
12999	NC_014834	GGC	3	9	493182	493190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931847
13000	NC_014834	ATC	2	6	493207	493212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931847

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