MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
128001	NC_014834	TCG	2	6	4852852	4852857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128002	NC_014834	CGGCG	2	10	4852874	4852883	0 %	0 %	60 %	40 %	316935818
128003	NC_014834	GCG	2	6	4852888	4852893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128004	NC_014834	CCT	2	6	4852925	4852930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935818
128005	NC_014834	GGC	3	9	4852941	4852949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128006	NC_014834	GC	3	6	4853054	4853059	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128007	NC_014834	GCA	2	6	4853081	4853086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128008	NC_014834	CGG	2	6	4853089	4853094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128009	NC_014834	CAC	2	6	4853115	4853120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935818
128010	NC_014834	GC	3	6	4853123	4853128	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128011	NC_014834	CGG	2	6	4853129	4853134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128012	NC_014834	CTG	2	6	4853170	4853175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128013	NC_014834	GCC	2	6	4853206	4853211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935818
128014	NC_014834	GC	4	8	4853260	4853267	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128015	NC_014834	GCC	2	6	4853280	4853285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935818
128016	NC_014834	CGG	2	6	4853309	4853314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128017	NC_014834	GCT	2	6	4853322	4853327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128018	NC_014834	ATC	2	6	4853383	4853388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935818
128019	NC_014834	CGCTG	2	10	4853402	4853411	0 %	20 %	40 %	40 %	316935818
128020	NC_014834	GCG	2	6	4853419	4853424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128021	NC_014834	ATC	2	6	4853425	4853430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935818
128022	NC_014834	GGCCA	2	10	4853431	4853440	20 %	0 %	40 %	40 %	316935818
128023	NC_014834	GATC	2	8	4853441	4853448	25 %	25 %	25 %	25 %	316935818
128024	NC_014834	CG	3	6	4853500	4853505	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128025	NC_014834	GC	3	6	4853527	4853532	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128026	NC_014834	CAT	2	6	4853553	4853558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935818
128027	NC_014834	CGC	2	6	4853559	4853564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935818
128028	NC_014834	GCCGGA	2	12	4853570	4853581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316935818
128029	NC_014834	GCGCCA	2	12	4853588	4853599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316935818
128030	NC_014834	CGG	2	6	4853604	4853609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128031	NC_014834	TGC	2	6	4853630	4853635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128032	NC_014834	GCCG	2	8	4853646	4853653	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128033	NC_014834	TGA	2	6	4853669	4853674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935818
128034	NC_014834	CAC	2	6	4853691	4853696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935818
128035	NC_014834	CTG	2	6	4853766	4853771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128036	NC_014834	CG	3	6	4853772	4853777	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128037	NC_014834	GGC	2	6	4853853	4853858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128038	NC_014834	CGGCG	2	10	4853888	4853897	0 %	0 %	60 %	40 %	316935818
128039	NC_014834	CGGC	2	8	4853962	4853969	0 %	0 %	50 %	50 %	316935818
128040	NC_014834	GCA	2	6	4853975	4853980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128041	NC_014834	CGA	2	6	4854005	4854010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128042	NC_014834	TGG	2	6	4854022	4854027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935818
128043	NC_014834	CGG	2	6	4854028	4854033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935818
128044	NC_014834	CGC	2	6	4854078	4854083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935818
128045	NC_014834	ACG	2	6	4854091	4854096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128046	NC_014834	GCA	2	6	4854104	4854109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935818
128047	NC_014834	GCGACG	2	12	4854163	4854174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128048	NC_014834	CG	3	6	4854173	4854178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128049	NC_014834	TGG	2	6	4854230	4854235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128050	NC_014834	CGG	2	6	4854271	4854276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128051	NC_014834	CGA	2	6	4854338	4854343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128052	NC_014834	CGG	2	6	4854386	4854391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128053	NC_014834	CGC	2	6	4854392	4854397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128054	NC_014834	CGG	2	6	4854407	4854412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128055	NC_014834	GAC	2	6	4854435	4854440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128056	NC_014834	GGC	2	6	4854451	4854456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935819
128057	NC_014834	GCGA	2	8	4854512	4854519	25 %	0 %	50 %	25 %	316935819
128058	NC_014834	GCC	3	9	4854524	4854532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935819
128059	NC_014834	CGA	2	6	4854541	4854546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935819
128060	NC_014834	CG	3	6	4854612	4854617	0 %	0 %	50 %	50 %	316935819
128061	NC_014834	CTG	2	6	4854622	4854627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935819
128062	NC_014834	GGC	2	6	4854652	4854657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935819
128063	NC_014834	CTG	2	6	4854661	4854666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935819
128064	NC_014834	GGC	2	6	4854688	4854693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935819
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128066	NC_014834	CGG	2	6	4854834	4854839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935819
128067	NC_014834	CCA	2	6	4854840	4854845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935819
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128069	NC_014834	GC	4	8	4854872	4854879	0 %	0 %	50 %	50 %	316935819
128070	NC_014834	TGG	2	6	4854996	4855001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935819
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128073	NC_014834	CGGTGG	2	12	4855089	4855100	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	316935819
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128082	NC_014834	TCG	2	6	4855394	4855399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935819
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128085	NC_014834	CAC	2	6	4855615	4855620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935819
128086	NC_014834	TCG	2	6	4855712	4855717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935819
128087	NC_014834	CAC	2	6	4855720	4855725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935819
128088	NC_014834	CGC	2	6	4855783	4855788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935819
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128098	NC_014834	CGT	2	6	4856220	4856225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935819
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128102	NC_014834	CG	3	6	4856390	4856395	0 %	0 %	50 %	50 %	316935819
128103	NC_014834	CCTT	2	8	4856462	4856469	0 %	50 %	0 %	50 %	316935819
128104	NC_014834	CTG	2	6	4856473	4856478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935819
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128108	NC_014834	GAACGA	2	12	4856626	4856637	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	316935819
128109	NC_014834	GAC	2	6	4856726	4856731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128110	NC_014834	CGA	2	6	4856754	4856759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128111	NC_014834	CGG	2	6	4856764	4856769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128112	NC_014834	CCG	2	6	4856779	4856784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935820
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128114	NC_014834	CGA	2	6	4856897	4856902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935820
128115	NC_014834	ACC	2	6	4856905	4856910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935820
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128220	NC_014834	TCCTGC	2	12	4861106	4861117	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316935823
128221	NC_014834	TCG	2	6	4861187	4861192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935823
128222	NC_014834	GC	3	6	4861260	4861265	0 %	0 %	50 %	50 %	316935823
128223	NC_014834	TGC	2	6	4861281	4861286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935823
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128225	NC_014834	GCA	2	6	4861452	4861457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935823
128226	NC_014834	TGC	2	6	4861464	4861469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935823
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128330	NC_014834	GC	3	6	4865138	4865143	0 %	0 %	50 %	50 %	316935825
128331	NC_014834	CGA	2	6	4865205	4865210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935825
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128335	NC_014834	TCA	2	6	4865397	4865402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935825
128336	NC_014834	GAT	2	6	4865404	4865409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935825
128337	NC_014834	CGC	2	6	4865422	4865427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935825
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128339	NC_014834	CGT	2	6	4865538	4865543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935825
128340	NC_014834	GAT	2	6	4865551	4865556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935825
128341	NC_014834	CGG	2	6	4865634	4865639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935825
128342	NC_014834	CCCTC	2	10	4865697	4865706	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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128344	NC_014834	CACCC	2	10	4865791	4865800	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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128442	NC_014834	GAT	2	6	4869446	4869451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935829
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128450	NC_014834	GCG	2	6	4869677	4869682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935829
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128457	NC_014834	CGA	2	6	4869882	4869887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935830
128458	NC_014834	CGC	2	6	4869898	4869903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935830
128459	NC_014834	TGC	2	6	4869908	4869913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935830
128460	NC_014834	TCG	2	6	4869965	4869970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935830
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128469	NC_014834	CCGC	2	8	4870501	4870508	0 %	0 %	25 %	75 %	316935831
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128475	NC_014834	GAC	2	6	4870915	4870920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935831
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128480	NC_014834	GCT	2	6	4871196	4871201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128481	NC_014834	GCG	2	6	4871208	4871213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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128483	NC_014834	CGGCG	2	10	4871333	4871342	0 %	0 %	60 %	40 %	316935832
128484	NC_014834	CGT	2	6	4871389	4871394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935832
128485	NC_014834	CTTGAA	2	12	4871408	4871419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	316935832
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128487	NC_014834	TGG	2	6	4871428	4871433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935832
128488	NC_014834	TCG	3	9	4871596	4871604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935832
128489	NC_014834	CG	3	6	4871655	4871660	0 %	0 %	50 %	50 %	316935832
128490	NC_014834	CGA	2	6	4871677	4871682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935832
128491	NC_014834	CAC	2	6	4871694	4871699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935832
128492	NC_014834	GC	3	6	4871782	4871787	0 %	0 %	50 %	50 %	316935832
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128500	NC_014834	GCG	2	6	4872052	4872057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935832

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