MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
126001	NC_014834	GCG	2	6	4779859	4779864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126002	NC_014834	TCGC	2	8	4779891	4779898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126003	NC_014834	CCT	2	6	4779964	4779969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126004	NC_014834	CGC	2	6	4779978	4779983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126005	NC_014834	CCA	2	6	4780027	4780032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126006	NC_014834	CAG	2	6	4780150	4780155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935750
126007	NC_014834	GCC	2	6	4780181	4780186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935750
126008	NC_014834	GGC	2	6	4780246	4780251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935750
126009	NC_014834	CCG	2	6	4780275	4780280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935750
126010	NC_014834	GAA	2	6	4780322	4780327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935750
126011	NC_014834	TGC	2	6	4780420	4780425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935750
126012	NC_014834	TTGG	2	8	4780521	4780528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126013	NC_014834	GCT	2	6	4780604	4780609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126014	NC_014834	CGG	2	6	4780654	4780659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126015	NC_014834	GCC	2	6	4780704	4780709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126016	NC_014834	GCC	2	6	4780833	4780838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126017	NC_014834	GTA	2	6	4780888	4780893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126018	NC_014834	AAAG	2	8	4780928	4780935	75 %	0 %	25 %	0 %	316935751
126019	NC_014834	GAA	2	6	4780970	4780975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935751
126020	NC_014834	AAG	2	6	4780980	4780985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935751
126021	NC_014834	GTG	2	6	4780986	4780991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935751
126022	NC_014834	GCG	2	6	4781001	4781006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935751
126023	NC_014834	CCAAGG	2	12	4781017	4781028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935751
126024	NC_014834	AAG	2	6	4781034	4781039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935751
126025	NC_014834	CGC	2	6	4781052	4781057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935751
126026	NC_014834	GC	3	6	4781103	4781108	0 %	0 %	50 %	50 %	316935751
126027	NC_014834	TCGGCC	2	12	4781185	4781196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316935751
126028	NC_014834	TCA	2	6	4781275	4781280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935752
126029	NC_014834	CTT	2	6	4781308	4781313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316935752
126030	NC_014834	TTG	2	6	4781324	4781329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316935752
126031	NC_014834	CGC	2	6	4781338	4781343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935752
126032	NC_014834	ACC	2	6	4781344	4781349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935752
126033	NC_014834	GCG	2	6	4781352	4781357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935752
126034	NC_014834	TCC	2	6	4781395	4781400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316935752
126035	NC_014834	GC	3	6	4781406	4781411	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126036	NC_014834	CAC	2	6	4781437	4781442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935752
126037	NC_014834	CAC	2	6	4781506	4781511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316935752
126038	NC_014834	CGT	2	6	4781544	4781549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935752
126039	NC_014834	GGAT	2	8	4781552	4781559	25 %	25 %	50 %	0 %	316935752
126040	NC_014834	GCTCG	2	10	4781566	4781575	0 %	20 %	40 %	40 %	316935752
126041	NC_014834	CG	3	6	4781580	4781585	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126042	NC_014834	TGG	2	6	4781640	4781645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316935752
126043	NC_014834	TGC	2	6	4781660	4781665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935752
126044	NC_014834	GACGTT	2	12	4781746	4781757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	316935752
126045	NC_014834	CG	3	6	4781821	4781826	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126046	NC_014834	GCC	2	6	4781875	4781880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935752
126047	NC_014834	GCT	2	6	4781887	4781892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935752
126048	NC_014834	CG	3	6	4781916	4781921	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126049	NC_014834	CG	3	6	4781960	4781965	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126050	NC_014834	GCA	2	6	4781973	4781978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935752
126051	NC_014834	CGG	2	6	4782004	4782009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935752
126052	NC_014834	CCGA	2	8	4782026	4782033	25 %	0 %	25 %	50 %	316935752
126053	NC_014834	CCG	3	9	4782047	4782055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935752
126054	NC_014834	GCA	2	6	4782093	4782098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316935752
126055	NC_014834	CAA	2	6	4782147	4782152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316935752
126056	NC_014834	GTC	2	6	4782157	4782162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935752
126057	NC_014834	GAA	2	6	4782385	4782390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935752
126058	NC_014834	CCG	2	6	4782426	4782431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935752
126059	NC_014834	CAGCG	2	10	4782439	4782448	20 %	0 %	40 %	40 %	316935752
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126061	NC_014834	GAA	2	6	4782499	4782504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316935752
126062	NC_014834	GC	3	6	4782637	4782642	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126063	NC_014834	GAT	2	6	4782727	4782732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935752
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126067	NC_014834	TCG	2	6	4782963	4782968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935752
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126070	NC_014834	CG	3	6	4783139	4783144	0 %	0 %	50 %	50 %	316935752
126071	NC_014834	GCG	2	6	4783171	4783176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935752
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126076	NC_014834	GGCT	2	8	4783379	4783386	0 %	25 %	50 %	25 %	316935752
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126080	NC_014834	GCCG	2	8	4783474	4783481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126081	NC_014834	GAC	2	6	4783526	4783531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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126084	NC_014834	C	6	6	4783607	4783612	0 %	0 %	0 %	100 %	316935753
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126088	NC_014834	CGG	2	6	4783857	4783862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935753
126089	NC_014834	TAG	2	6	4783884	4783889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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126102	NC_014834	CTTC	2	8	4784481	4784488	0 %	50 %	0 %	50 %	316935754
126103	NC_014834	GAGC	2	8	4784508	4784515	25 %	0 %	50 %	25 %	316935754
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126107	NC_014834	GTC	3	9	4784609	4784617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935754
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126109	NC_014834	CGAC	2	8	4784689	4784696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126110	NC_014834	AGG	2	6	4784711	4784716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126111	NC_014834	CAT	2	6	4784775	4784780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126112	NC_014834	GTT	3	9	4784792	4784800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126113	NC_014834	GCGG	2	8	4784820	4784827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126114	NC_014834	CGATG	2	10	4784830	4784839	20 %	20 %	40 %	20 %	316935755
126115	NC_014834	GCG	2	6	4784853	4784858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316935755
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126463	NC_014834	CTG	2	6	4797894	4797899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935765
126464	NC_014834	GCT	2	6	4797917	4797922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935765
126465	NC_014834	TGGCG	2	10	4797965	4797974	0 %	20 %	60 %	20 %	316935765
126466	NC_014834	CAT	2	6	4798026	4798031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316935765
126467	NC_014834	GTA	2	6	4798059	4798064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316935765
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126469	NC_014834	CGC	2	6	4798086	4798091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316935765
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126475	NC_014834	CGC	2	6	4798256	4798261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126476	NC_014834	CGC	2	6	4798291	4798296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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126478	NC_014834	CCG	2	6	4798333	4798338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126479	NC_014834	AT	3	6	4798347	4798352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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126481	NC_014834	TCG	2	6	4798427	4798432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935766
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126491	NC_014834	GC	4	8	4798676	4798683	0 %	0 %	50 %	50 %	316935766
126492	NC_014834	CTG	2	6	4798890	4798895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935766
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126494	NC_014834	GC	4	8	4798915	4798922	0 %	0 %	50 %	50 %	316935766
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126496	NC_014834	CGT	2	6	4798968	4798973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935766
126497	NC_014834	ACGAGG	2	12	4798982	4798993	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	316935766
126498	NC_014834	TCG	2	6	4799011	4799016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935766
126499	NC_014834	CTG	2	6	4799023	4799028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316935766
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