MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014834	CGA	2	6	457121	457126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931813
12003	NC_014834	GTG	2	6	457169	457174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931813
12004	NC_014834	GAT	2	6	457185	457190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931813
12005	NC_014834	GAT	2	6	457271	457276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931813
12006	NC_014834	CGC	3	9	457280	457288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931813
12007	NC_014834	TGG	2	6	457292	457297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931813
12008	NC_014834	CGC	3	9	457387	457395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931814
12009	NC_014834	GCC	2	6	457403	457408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931814
12010	NC_014834	CCGA	2	8	457425	457432	25 %	0 %	25 %	50 %	316931814
12011	NC_014834	GCC	2	6	457433	457438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931814
12012	NC_014834	AGC	2	6	457444	457449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931814
12013	NC_014834	CAATCC	2	12	457457	457468	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	316931814
12014	NC_014834	CGC	2	6	457477	457482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931814
12015	NC_014834	GAG	2	6	457488	457493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931814
12016	NC_014834	CCG	2	6	457503	457508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931814
12017	NC_014834	CGAA	2	8	457513	457520	50 %	0 %	25 %	25 %	316931814
12018	NC_014834	CGC	2	6	457558	457563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931814
12019	NC_014834	CCGGG	2	10	457564	457573	0 %	0 %	60 %	40 %	316931814
12020	NC_014834	GTC	2	6	457622	457627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12022	NC_014834	ACG	2	6	457660	457665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12025	NC_014834	ATT	2	6	457741	457746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_014834	CGG	2	6	457807	457812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_014834	CG	3	6	457831	457836	0 %	0 %	50 %	50 %	316931815
12028	NC_014834	TGA	2	6	457865	457870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931815
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12039	NC_014834	CCGCC	2	10	458144	458153	0 %	0 %	20 %	80 %	316931815
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12053	NC_014834	CGT	2	6	458362	458367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931815
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12088	NC_014834	TCG	2	6	459332	459337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931816
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12106	NC_014834	CGC	2	6	459912	459917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12121	NC_014834	CGCGG	2	10	460414	460423	0 %	0 %	60 %	40 %	316931817
12122	NC_014834	CGAA	2	8	460473	460480	50 %	0 %	25 %	25 %	316931817
12123	NC_014834	TC	3	6	460498	460503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12124	NC_014834	AACC	2	8	460571	460578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12125	NC_014834	GT	3	6	460580	460585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_014834	GAC	2	6	460590	460595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12128	NC_014834	CCGG	2	8	460663	460670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12129	NC_014834	GGC	2	6	460735	460740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12130	NC_014834	CGG	2	6	460776	460781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12131	NC_014834	CGG	2	6	460848	460853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12132	NC_014834	GTC	2	6	460931	460936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931818
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12189	NC_014834	GTGC	2	8	463142	463149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12211	NC_014834	CGAA	2	8	463932	463939	50 %	0 %	25 %	25 %	316931819
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12239	NC_014834	GGC	2	6	464936	464941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931820
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12241	NC_014834	TCGGCG	2	12	464988	464999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931820
12242	NC_014834	CGA	2	6	465007	465012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931820
12243	NC_014834	CG	4	8	465028	465035	0 %	0 %	50 %	50 %	316931820
12244	NC_014834	CGA	2	6	465075	465080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931821
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12252	NC_014834	GAT	2	6	465219	465224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931821
12253	NC_014834	GGT	3	9	465276	465284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931821
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12272	NC_014834	GCC	2	6	465933	465938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931822
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12350	NC_014834	CGG	2	6	468382	468387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931826
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12352	NC_014834	AGC	2	6	468420	468425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931826
12353	NC_014834	GC	3	6	468424	468429	0 %	0 %	50 %	50 %	316931826
12354	NC_014834	CAC	3	9	468500	468508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931826
12355	NC_014834	GAA	2	6	468515	468520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931826
12356	NC_014834	GC	3	6	468535	468540	0 %	0 %	50 %	50 %	316931826
12357	NC_014834	CGC	3	9	468538	468546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931826
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12359	NC_014834	GCT	2	6	468618	468623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931827
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12480	NC_014834	ACAA	2	8	473176	473183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12481	NC_014834	A	6	6	473182	473187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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