MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014834	CGC	2	6	438445	438450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931794
11502	NC_014834	GC	3	6	438449	438454	0 %	0 %	50 %	50 %	316931794
11503	NC_014834	CGT	2	6	438595	438600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931794
11504	NC_014834	CCA	2	6	438605	438610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931794
11505	NC_014834	GCC	2	6	438666	438671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931794
11506	NC_014834	GCG	2	6	438678	438683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931794
11507	NC_014834	CG	4	8	438691	438698	0 %	0 %	50 %	50 %	316931794
11508	NC_014834	CGG	2	6	438751	438756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931794
11509	NC_014834	GCA	2	6	438757	438762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931794
11510	NC_014834	CG	3	6	438783	438788	0 %	0 %	50 %	50 %	316931794
11511	NC_014834	AAC	2	6	438804	438809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931794
11512	NC_014834	GCG	2	6	438815	438820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931794
11513	NC_014834	C	6	6	438837	438842	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11514	NC_014834	GCC	2	6	438880	438885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_014834	GC	4	8	438939	438946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_014834	TCGCA	2	10	438956	438965	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11517	NC_014834	CCA	2	6	438990	438995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_014834	GA	3	6	438998	439003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_014834	CCGA	2	8	439072	439079	25 %	0 %	25 %	50 %	316931795
11520	NC_014834	GGTGAT	2	12	439125	439136	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	316931795
11521	NC_014834	GCT	2	6	439139	439144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931795
11522	NC_014834	GCCGG	2	10	439180	439189	0 %	0 %	60 %	40 %	316931795
11523	NC_014834	GTG	2	6	439201	439206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931795
11524	NC_014834	CGG	2	6	439245	439250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931795
11525	NC_014834	GTG	2	6	439312	439317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931795
11526	NC_014834	GCG	2	6	439334	439339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931795
11527	NC_014834	CGC	2	6	439367	439372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931795
11528	NC_014834	GTC	2	6	439429	439434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931795
11529	NC_014834	GCA	2	6	439499	439504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931795
11530	NC_014834	TGA	2	6	439514	439519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931795
11531	NC_014834	CGGC	2	8	439551	439558	0 %	0 %	50 %	50 %	316931795
11532	NC_014834	AGCA	2	8	439621	439628	50 %	0 %	25 %	25 %	316931795
11533	NC_014834	GGT	2	6	439647	439652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931795
11534	NC_014834	CCG	2	6	439718	439723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_014834	CG	3	6	439722	439727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11536	NC_014834	GGAT	2	8	439740	439747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_014834	CGG	2	6	439797	439802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_014834	GCC	2	6	439810	439815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931796
11539	NC_014834	GTC	2	6	439819	439824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931796
11540	NC_014834	GATG	2	8	439881	439888	25 %	25 %	50 %	0 %	316931796
11541	NC_014834	AGCCA	2	10	439895	439904	40 %	0 %	20 %	40 %	316931796
11542	NC_014834	TGGTC	2	10	439908	439917	0 %	40 %	40 %	20 %	316931796
11543	NC_014834	CAG	2	6	439981	439986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931796
11544	NC_014834	GAT	2	6	440149	440154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931796
11545	NC_014834	AGC	2	6	440198	440203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931796
11546	NC_014834	CAG	2	6	440218	440223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931796
11547	NC_014834	CAG	2	6	440227	440232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931796
11548	NC_014834	CAGC	2	8	440266	440273	25 %	0 %	25 %	50 %	316931796
11549	NC_014834	TGG	2	6	440316	440321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931796
11550	NC_014834	GGA	2	6	440323	440328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931796
11551	NC_014834	CGG	2	6	440335	440340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931796
11552	NC_014834	GGTC	2	8	440349	440356	0 %	25 %	50 %	25 %	316931796
11553	NC_014834	GCG	2	6	440485	440490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_014834	GCC	2	6	440497	440502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931797
11555	NC_014834	CTT	2	6	440505	440510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931797
11556	NC_014834	GCGCC	2	10	440564	440573	0 %	0 %	40 %	60 %	316931797
11557	NC_014834	CAC	2	6	440596	440601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931797
11558	NC_014834	CGG	2	6	440666	440671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931797
11559	NC_014834	GCC	2	6	440691	440696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931797
11560	NC_014834	CG	3	6	440747	440752	0 %	0 %	50 %	50 %	316931797
11561	NC_014834	TCG	2	6	440755	440760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931797
11562	NC_014834	CGCA	2	8	440824	440831	25 %	0 %	25 %	50 %	316931797
11563	NC_014834	TCT	2	6	440864	440869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931797
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11567	NC_014834	TCG	2	6	440983	440988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931797
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11569	NC_014834	CCA	2	6	441116	441121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931797
11570	NC_014834	GAT	2	6	441153	441158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931797
11571	NC_014834	TTC	2	6	441160	441165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931797
11572	NC_014834	CGG	3	9	441176	441184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931797
11573	NC_014834	ATCC	2	8	441225	441232	25 %	25 %	0 %	50 %	316931797
11574	NC_014834	CGA	2	6	441240	441245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931797
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11578	NC_014834	CCGA	2	8	441403	441410	25 %	0 %	25 %	50 %	316931797
11579	NC_014834	GCG	2	6	441411	441416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931797
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11584	NC_014834	CGC	2	6	441666	441671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931798
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11588	NC_014834	CGC	2	6	441813	441818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931798
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11593	NC_014834	CGG	2	6	441951	441956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931798
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11600	NC_014834	CGGC	2	8	442211	442218	0 %	0 %	50 %	50 %	316931798
11601	NC_014834	GTG	2	6	442244	442249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931798
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11603	NC_014834	TGC	2	6	442301	442306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931798
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11606	NC_014834	GC	3	6	442367	442372	0 %	0 %	50 %	50 %	316931798
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11611	NC_014834	GCG	2	6	442566	442571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_014834	GCC	2	6	442638	442643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931799
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11981	NC_014834	GCT	2	6	456418	456423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931812
11982	NC_014834	CGA	2	6	456454	456459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931812
11983	NC_014834	CAT	2	6	456520	456525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931812
11984	NC_014834	TCAAGC	2	12	456582	456593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316931812
11985	NC_014834	GC	3	6	456615	456620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11986	NC_014834	GTTTT	2	10	456661	456670	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11987	NC_014834	GCGA	2	8	456695	456702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11988	NC_014834	GCG	2	6	456739	456744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11989	NC_014834	CTC	2	6	456753	456758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11990	NC_014834	TTGCC	2	10	456779	456788	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11991	NC_014834	TCG	2	6	456801	456806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11992	NC_014834	CGC	2	6	456822	456827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11993	NC_014834	GCA	2	6	456878	456883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931813
11994	NC_014834	TGA	2	6	456895	456900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931813
11995	NC_014834	AGA	2	6	456901	456906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931813
11996	NC_014834	CG	3	6	456928	456933	0 %	0 %	50 %	50 %	316931813
11997	NC_014834	GCC	2	6	456963	456968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931813
11998	NC_014834	GAG	2	6	457029	457034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931813
11999	NC_014834	ATC	2	6	457045	457050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931813
12000	NC_014834	GC	3	6	457078	457083	0 %	0 %	50 %	50 %	316931813

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